Control postranscripcional de regulación génica Flashcards
Cuál es la región 5’UTR?
De la caperuza al codón de inicio
Cuál es la región 3’UTR?
Del codón de paro a la cola de poli A
Cuál es el objetivo del corte y empalme ?
eliminar los intrones y mantener los intrones del hnRNA/pre-mRNA
Cómo funciona el corte y empalme (mayor)?
- proteínas SR: identifican exones
- proteínas hnRNP: identifican intrones
- U1: identifica extremo 5’ del intrón
- U2AF: se une al extremo 3’ del intón
- U2: se une a una adenina
- U4 + U6 y U5: se unen al hnRNA –> quitan U2
- U4: se libera de U6 (lo inhibia)
- U6 suelta el extremo 5’ del intrón del exón 1 y lo une a la adenina
- U5: mantiene exones unidos
- U6: con el extremo 3’ del exón 1 ataca la unión intrón-exón 2 –> une ambos exones y libera intron
Cuáles son las snRNP del espliceosoma menor equivaentes a las snRNP del espliceosoma mayor?
U11 <–> U1
U12 <–> U2
U4atac <–> U4
U5 <–> U5
U6atac <–> U6
Qué secuencias identifica el espliceosoma mayor?
- extremo 5’: GU
- extremo 3’: AG
Qué secuencias identifica el espliceosoma menor?
- extremo 5’: A/G U
- extremo 3’ A C/G
Qué tipo de ediciones puede sufrir el mRNA?
Desaminaciones
- adenina –> inosina
- citocina –> uracilo
Cuáles son los 3 requisitos para que el mRNA pueda salir del nucleo?
- metilguanosina en extremo 5’ (CAP)
- cola de poli A en extremo 3’
- eliminación de intrones
Qué determina la región 3’UTR
la localización del mRNA antes de iniciar traducción
Qué es la búsqueda de escape del mRNA?
proteínas de inhibición de la traducción se unen en la región 5’UTR y tapan el primer AUG´
Produce misma proteína con diferentes cola señal N terminal
Cómo se puede bloquear la traducción del mRNA?
fosforilación del eIF2
De qué depende la vida media de un mRNA?
la longitud de la cola de poli A
(es proporcional)
Cómo se degradan los mRNA?
Deadenilasa degrada la cola de poli A –> enzima de descapsulación o exosoma
- enzima de descapsulación corta la CAP –> degradación por exonucleasas por ambos extremos
- exosoma: muchas exonucleasas juntas –> degradan mRNA desde el extremo 3’
Qué es el miRNA?
Un micro RNA no codificante que regula la expresión de genes
Quién sintetiza los miRNAs?
RNA polimerasa II
Cómo se sintetiza un miRNA?
- RNA pol II: sintetiza pre-miRNA
- pre-miRNA se autocompleta –> forma bucle
- Drosha corta CAP y cola de poli A –> sale pre-miRNA del nucleo
- se corta el bucle –> quedan dos hebras (miRNA - miRNA)
- RISC se asocia con una de las 2 hebras –> miRNA
Cómo regula la expresión génica un miRNA?
Identifica secuencia complementaria en región 3’UTR del mRNA
- si se complementa total –> Argonauta (ribonucleasa en el RISC) corta el mRNA
- se complementa parcailmente –> lleva mRNA a los cuerpos P
Qué son los cuerpos P de la célula?
regiones con muchas deadenilasas y exonucleasas
Porque se pueden utilizar los miRNA como biomarcadores?
Son específicos de cada tejido y enfermedad
Qué son los siRNAs?
RNA pequeños interferentes de doble cadena.
regulan la expresión de genes
De dónde vienen los siRNAs?
transposones o dsRNA virales
Qué es un transposon?
Secuencia de nucleótidos que se puede mover dentro del genoma y se puede heredar
Cómo regulan la expresión de genes los siRNAs?
- se cortan y una sola hebra se asocia con RISC
- identifica secuencia complementaria en región 3’UTR de un mRNA
- existe match perfecto –> argonauta (ribonucleasa del RISC) corta el mRNA
Cuál es la principal diferencia entre el miRNA y el siRNA?
el siRNA necesita complementarse completamente, el miRNA no por eso el siRNA es específico
Qué es un lncRNA ?
RNA largo no codificante
Cómo son sintetizados los lncRNAs?
por RNA pol II –> corte y empalme
Dónde se encuentran los lncRNAs?
- atados al DNA
- en el núcleo
- citoplasma
- mitocondria
- exosomas
Cómo pueden los lncRNAs modificar la expresión de genes a nivel pretranscripcional?
- modulan las histonas y estructura de la cromatina
- interfieren con la maquinaria de transcripción
- reducen la accesibilidad a la cromatina
- unen potenciadores/silenciadores al mediador
- sirven de andamiaje para organizar proteínas y ácidos nucleicos en el núcleo
Cómo pueden los lncRNAs modificar la expresión de genes a nivel postranscripcional?
- secuestrar proteínas: factores de splicing, factores de transcripción, etc.
- complementa con el RNA y reclutan proteínas: enzima de degradación o ribosomas u otras
- “sponging” de miRNAs: unen a varios miRNAs y previene que ataquen los mRNA
Porqué son útiles sol lncRNAs para el uso terapéutico?
son muy específicos del tejido y vía celular
Qué es un piRNA?
un RNA que interactúa con proteínas PIWI (endonucleasa de familia argonauta)
Quién sintetiza los piRNA?
no c sabe
Cómo funcionan los piRNAs
- silencian genes
- reclutan enzimas modificadoras de histonas para regular la cromatina
Cuáles son las funciones de los piRNAs?
- silenciar genes transponibles
- regular expresión de genes
- combatir infecciones virales
Qué es la proteína R2D2?
proteína que ayuda a la RNasa III dicer-2 a cortar el dsRNA y producir un siRNA
Qué es la proteína C3PO?
component 3 promoter of RISC
mejora la actividad de RISC
