Control postranscripcional de regulación génica

Question 1

Cuál es la región 5’UTR?

Answer 1

De la caperuza al codón de inicio

Question 2

Cuál es la región 3’UTR?

Answer 2

Del codón de paro a la cola de poli A

Question 3

Cuál es el objetivo del corte y empalme ?

Answer 3

eliminar los intrones y mantener los intrones del hnRNA/pre-mRNA

Question 4

Cómo funciona el corte y empalme (mayor)?

Answer 4

• proteínas SR: identifican exones
• proteínas hnRNP: identifican intrones
• U1: identifica extremo 5’ del intrón
• U2AF: se une al extremo 3’ del intón
• U2: se une a una adenina
• U4 + U6 y U5: se unen al hnRNA –> quitan U2
• U4: se libera de U6 (lo inhibia)
• U6 suelta el extremo 5’ del intrón del exón 1 y lo une a la adenina
• U5: mantiene exones unidos
• U6: con el extremo 3’ del exón 1 ataca la unión intrón-exón 2 –> une ambos exones y libera intron

Question 5

Cuáles son las snRNP del espliceosoma menor equivaentes a las snRNP del espliceosoma mayor?

Answer 5

U11 <–> U1
U12 <–> U2
U4atac <–> U4
U5 <–> U5
U6atac <–> U6

Question 6

Qué secuencias identifica el espliceosoma mayor?

Answer 6

• extremo 5’: GU
• extremo 3’: AG

Question 7

Qué secuencias identifica el espliceosoma menor?

Answer 7

• extremo 5’: A/G U
• extremo 3’ A C/G

Question 8

Qué tipo de ediciones puede sufrir el mRNA?

Answer 8

Desaminaciones
- adenina –> inosina
- citocina –> uracilo

Question 9

Cuáles son los 3 requisitos para que el mRNA pueda salir del nucleo?

Answer 9

• metilguanosina en extremo 5’ (CAP)
• cola de poli A en extremo 3’
• eliminación de intrones

Question 10

Qué determina la región 3’UTR

Answer 10

la localización del mRNA antes de iniciar traducción

Question 11

Qué es la búsqueda de escape del mRNA?

Answer 11

proteínas de inhibición de la traducción se unen en la región 5’UTR y tapan el primer AUG´
Produce misma proteína con diferentes cola señal N terminal

Question 12

Cómo se puede bloquear la traducción del mRNA?

Answer 12

fosforilación del eIF2

Question 13

De qué depende la vida media de un mRNA?

Answer 13

la longitud de la cola de poli A
(es proporcional)

Question 14

Cómo se degradan los mRNA?

Answer 14

Deadenilasa degrada la cola de poli A –> enzima de descapsulación o exosoma
- enzima de descapsulación corta la CAP –> degradación por exonucleasas por ambos extremos
- exosoma: muchas exonucleasas juntas –> degradan mRNA desde el extremo 3’

Question 15

Qué es el miRNA?

Answer 15

Un micro RNA no codificante que regula la expresión de genes

Question 16

Quién sintetiza los miRNAs?

Answer 16

RNA polimerasa II

Question 17

Cómo se sintetiza un miRNA?

Answer 17

• RNA pol II: sintetiza pre-miRNA
• pre-miRNA se autocompleta –> forma bucle
• Drosha corta CAP y cola de poli A –> sale pre-miRNA del nucleo
• se corta el bucle –> quedan dos hebras (miRNA - miRNA)
• RISC se asocia con una de las 2 hebras –> miRNA

Question 18

Cómo regula la expresión génica un miRNA?

Answer 18

Identifica secuencia complementaria en región 3’UTR del mRNA
- si se complementa total –> Argonauta (ribonucleasa en el RISC) corta el mRNA
- se complementa parcailmente –> lleva mRNA a los cuerpos P

Question 19

Qué son los cuerpos P de la célula?

Answer 19

regiones con muchas deadenilasas y exonucleasas

Question 20

Porque se pueden utilizar los miRNA como biomarcadores?

Answer 20

Son específicos de cada tejido y enfermedad

Question 21

Qué son los siRNAs?

Answer 21

RNA pequeños interferentes de doble cadena.
regulan la expresión de genes

Question 22

De dónde vienen los siRNAs?

Answer 22

transposones o dsRNA virales

Question 23

Qué es un transposon?

Answer 23

Secuencia de nucleótidos que se puede mover dentro del genoma y se puede heredar

Question 24

Cómo regulan la expresión de genes los siRNAs?

Answer 24

• se cortan y una sola hebra se asocia con RISC
• identifica secuencia complementaria en región 3’UTR de un mRNA
• existe match perfecto –> argonauta (ribonucleasa del RISC) corta el mRNA

Question 25

Cuál es la principal diferencia entre el miRNA y el siRNA?

Answer 25

el siRNA necesita complementarse completamente, el miRNA no por eso el siRNA es específico

Question 26

Qué es un lncRNA ?

Answer 26

RNA largo no codificante

Question 27

Cómo son sintetizados los lncRNAs?

Answer 27

por RNA pol II –> corte y empalme

Question 28

Dónde se encuentran los lncRNAs?

Answer 28

• atados al DNA
• en el núcleo
• citoplasma
• mitocondria
• exosomas

Question 29

Cómo pueden los lncRNAs modificar la expresión de genes a nivel pretranscripcional?

Answer 29

• modulan las histonas y estructura de la cromatina
• interfieren con la maquinaria de transcripción
• reducen la accesibilidad a la cromatina
• unen potenciadores/silenciadores al mediador
• sirven de andamiaje para organizar proteínas y ácidos nucleicos en el núcleo

Question 30

Cómo pueden los lncRNAs modificar la expresión de genes a nivel postranscripcional?

Answer 30

• secuestrar proteínas: factores de splicing, factores de transcripción, etc.
• complementa con el RNA y reclutan proteínas: enzima de degradación o ribosomas u otras
• “sponging” de miRNAs: unen a varios miRNAs y previene que ataquen los mRNA

Question 31

Porqué son útiles sol lncRNAs para el uso terapéutico?

Answer 31

son muy específicos del tejido y vía celular

Question 32

Qué es un piRNA?

Answer 32

un RNA que interactúa con proteínas PIWI (endonucleasa de familia argonauta)

Question 33

Quién sintetiza los piRNA?

Answer 33

no c sabe

Question 34

Cómo funcionan los piRNAs

Answer 34

• silencian genes
• reclutan enzimas modificadoras de histonas para regular la cromatina

Question 35

Cuáles son las funciones de los piRNAs?

Answer 35

• silenciar genes transponibles
• regular expresión de genes
• combatir infecciones virales

Question 36

Qué es la proteína R2D2?

Answer 36

proteína que ayuda a la RNasa III dicer-2 a cortar el dsRNA y producir un siRNA

Question 37

Qué es la proteína C3PO?

Answer 37

component 3 promoter of RISC
mejora la actividad de RISC