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mol final > Code génétique > Flashcards

Code génétique Flashcards

1
Q

combien de nucléotides constituent un codon?

A

3 nucléotides

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Q

combien de possibilités pour chaque codon consitiué de 3 nucléotides?

A

64 possibilités (4x4x4)

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Q

Quels sont les fonctions des codons?

A
  • 3 codons signalent la fin de la traduction

(recconu par des facteurs de terminaison protéiques soit RF1 et RF2 chez les bactéries et eRF1 chez les eucaryotes)

  • 61 codons spécifient les 20 a.a protéiques

(reconnu par des ARNt, un a.a peut donc être spécifié par plusieurs codons)

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4
Q

nommer les deux choses qui peuvent reconnaitre les codons

A
  • facteurs de terminaison protéiques
  • ARNt
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Q

nommer les facteurs de terminaison des bactéries

A

RF1 et RF2 (RELEASE FACTOR)

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6
Q

nommer les facteurs protéiques de terminaison des eucaryotes

A

eRF1 (eucaryote realase factor)

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7
Q

vrai ou faux le code génétique est redondant

A

vrai on dit dégénéré

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8
Q

comment on nomme les codons qui désignent le même a.a

A

des synonymes

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9
Q

quels sont les codons STOP

A

UAA

UAG

UGA

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10
Q

Quels sont les trois règles qui gouvernent le code génétique?

A
  • les codons sont lus du 5’ au 3’
  • les codons ne se chevauchent pas et le message ne contient pas d’espace (les codons successifs sont spécifiés par des trinucléotides adjacents
  • le message est traduit dans un cadre de lecture fixe (débutant à un codon initiateur situé à l’extrémité 5’ de la séquence codante)
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11
Q

par quoi sont spécifiés les codons successifs?

A

par des trinucléotides adjacents

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12
Q

que permet le codon initiateur?

A

dicte quel cadre de lecture doit être utilisé

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13
Q

quel organisme peut avoir des codons qui se chevauche

A

virus mais EXCEPTION très rare

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14
Q

que signifie dégenerencese

A

redondant

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15
Q

d’où vient une partie importante de la desgenerescence

A

de la flexibilité de pairage du premier nucléotide des anticodons avec le troisieme nucléotide des codons

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16
Q

donner un exemple que la desgenerescence vient de la flexibilité de pairage du premier nucléotide des anticodons avec le troisieme nucléotide des codons

A

CUU, CUUC, CUA et CUG

encode le même a.a

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17
Q

vrai ou faux la desgenerescence estbasé sur l’équivalence des 2 premiers nucléotides

A

faux

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18
Q

Qu’est-ce que la leucine démontre?

A

que la la desgenerescence n’est pas basé sur l’équivalence des 2 premiers nucléotides

en effet le premier peut être

U ou C

donc minimalement deux ARNt différent mais peut être plus

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19
Q

vrai ou faux le même ARNt (anticodon) peut reconnaitre différents codons de l’ARNm

A

vrai

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20
Q

où peut-il y avoir de la méthylation sur l’anticodon

A

en N1 de G

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21
Q

qu’à permie l’évolution du code

A

minimiser les effets délètère de mutations

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22
Q

comment l’évolution du code à minimiser les effets déleterent du code?

A

en faisant que les mutations en première position du codon donnent souvent des a.a similaires

(même famille)

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23
Q

quels sont les mutations les plus fréquemment observé et permet quoi?

A

mutations ponctuelles par transition

l’évolution du code minimisant les effets déleterent du code

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24
Q

que se passe-t-il lors d’une mutation en 2e position d’un codon

A

remplacera un a.a par un a.a très similaire

(puisque la mutation la plus commune est la transition)

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25
Q

qu’est-ce qu’une transition? (mutation)

A

pyrimidine par pyrimidine

purien par purine

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26
Q

les codons avec des pyrimidines en 2e position codent majoritairement?

A

des a.a hydrophobes

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27
Q

les codons avec des purines en deuxième position codent majoritairement

A

des a.a polaires

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28
Q

vrai ou faux quand on a un U en deuxième position c’est toujours hydrophobe

A

vrai

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29
Q

vrai ou faux quand on a un C en deuxième position c’est toujours hydrophobe

A

faux, 1/2

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30
Q

vrai ou faux quand on a un A en deuxième position c’est toujours hydrophile

A

vrai

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31
Q

vrai ou faux quand on a un G en deuxième position c’est toujours hydrophile

A

faux, 1 seule exception hihi

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32
Q

vrai ou faux il y a moins d’impact lors d’un transition de purine que de pyrimidine

A

vrai

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33
Q

vrai ou faux les codons ayant subi une mutation (transition ou tranversion) à la troisième position spécifient rarement un a.a différent

A

vrai

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34
Q

vrai ou faux les ARNm ont des paires de bases oscillatoires

A

faux, ARNt

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35
Q

qu’elle(s) bases de l’anticodon est moins contrainte

A

la première base (5’) de l’anitcodon est moins contrainte dans l’espace que les 2 autres bases de l’anticodon

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36
Q

Que permet le fait que la première base (5’) de l’anitcodon est moins contrainte dans l’espace que les 2 autres bases de l’anticodon

A
  • permet à G,U et I de former des liaisons H avec plus d’un type de base
  • donc les appariments bancal sont ceux qui permettent de conserver une distance entre les 2 riboses similaire à la distance existant dans les appariment standart (A:U et G:C)
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37
Q

vrai ou faux il peut y avoir appariment bancal entre deux pyrimidines

A

faux car donnent des distances trop longues ou trop courtes

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38
Q

vrai ou faux il peut y avoir appariment bancal entre deux purines

A

vrai entre A:I seulement!!!

39
Q

qu’est-ce que l’inosine

A

hypoxanthine

un dérivé de l’adénine (désamination du carbone 6 pour donner un groupement céto)

40
Q

Nommer les appariment bancal possible pour G

A

U

C

41
Q

Nommer les appariment bancal possible pour C

A

G

42
Q

Nommer les appariment bancal possible pour A

A

U

43
Q

Nommer les appariment bancal possible pour C

A

A

G

44
Q

Nommer les appariment bancal possible pour I

A

A

U

C

45
Q

L’ARNt peut reconnaitre au max combien de codons et quand?

A

max 3 codons lorsque l’inosine se trouve à la première position de l’anticodon

46
Q

vrai ou faux un seul ARNt est nécessaire pour reconnaire les 6 codons de la sérine

A

faux, plusieurs car un ARNt max 3 !!

idem pour les 6 codons de leucine et de l’arginine

47
Q

quel est la conformation de l’anticodon de l’ARNt

A

boucle

48
Q

quels bases de l’anticodon on a peu près la même orientation

A

les 3 bases de l’anticodon et les 2 suivantes en 3’ de la boucle

49
Q

par quoi est influencé la conformation des 3 bases de l’anticodon et les 2 suivantes en 3’ de la boucle

A

par les interactions d’empilement des bases planes les unes sur les autres

50
Q

quel base l’anticodon est moins restreinte en mouvement, permet quoi?

A

la première base (5’) de l’anticodon permettant l’appariment bancal avec la 3e base du codon

51
Q

vrai ou faux la 2,3 base de l’anticodon sont restreinte en mouvement

A

vrai

donc pas d’appariement bancal

52
Q

quel est l’identité de la base adjacente à la 3e base de l’anticodon

A

une purine modifiée et encombrante

toujours

53
Q

où se retrouve l’anticodon dans la structure de l’ARNt

A

dans la boucle de l’anticodon

54
Q

qu’est-ce que les mutations ponctuelles altèrent?

A

le code génétique

55
Q

définir une mutation ponctuelle

A

modification chimique touchant 1 seul nucléotide ou quelques nucléotides d’un gène

56
Q

vrai ou faux la mutation ponctuelle est synonyme de mutation chromosomique comme pour la trisomie 21

A

faux

57
Q

sur quoi les mutations ponctuelles peuvent avoir un impact?

A

sur la synthèse d’une protéine

il peut y avoir une répercussion qui sera soit neutre, bénéfique ou délétère pour l’organisme

58
Q

Nommer les 3 types de mutations ponctuelles

A
  • mutation faux-sens
  • mutation non-sens
  • mutation par décalage du cadre de lecture
59
Q

décrire la mutation faux-sens

A

substitution d’un a.a pour un autre

60
Q

décrire la mutation non-sens

A

création d’un codon de terminaison prématuré

61
Q

Nommer les catégories de mutations ponctuelles

A
  • substitution d’une paire de bases
  • délétion ou insertion de paires de base
62
Q

Définir une substitution d’une paire de bases et les sous-catégories

A

une paire de base différente a pris la place de la paire de base originale

  • mutation silencieuse
  • mutation faux sens bénéfique
  • mutation faux sens néfaste
  • mutation non sens
63
Q

à quoi peuvent etre du les mutations silencieuses

A
  • due à la redondance du code génétique
  • due à une substitution sans effet sur la protéine
64
Q

Décrire un délétion ou insertion de pb avec les sous-catégories

A

perte (délétion) ou addition (insertion) d’une ou plusieurs paires de bases. Si le nombre de nucléotides enlevées ou insérés n’est pas un multiple de 3 il y a décalage du cadre de lecture

  • décalage du cadre de lecture avec faux sens
  • décalage du cadre de lecture avec non sens immédiat
  • décalage restreint du cadre de lecture
65
Q

vrai ou faux une mutation silencieuse est du à une mutation par substitution d’une paire de bases

A

vrai

66
Q

Décrie deux raison d’une mutation silencieuse avec exemples

A
  • redondance du code génétique qui fait en sorte que l’a.a codé sera le même
    ex: un triplet 3’ GGA 5’ du brin d’ADN transcrit en ARNm subit une substitution d’un G à la position du A

ARNm 3’ -CCC- 5’ au lieu de 3’- CCU- 5’

mais les deux donne la proline!!

  • due à une substitution qui est sans effet sur la fonction de la protéine

(un changement de nucléotide commandant la mise en place d’un a.a différent mais non essentiel à la fonction de la protéine)

ex: un a.a hydrophile changé pour un autre a.a hydrophile

67
Q

vrai ou faux la mutation faux-sens est une mutation par substitution d’une paire de base

A

vrai

68
Q

vrai ou faux la mutation faux sens est néfaste

A

vrai/faux car peut aussi etre bénéfique

69
Q

Quand une mutation faux sens peut être bénéfique, avec exemple

A

quand la substitution d’une pb entraine la mise en place d’un a.a qui améliore la performance de la protéine (rare mais à l’origine de l’évolution )

ex: enzyme dont le site actif est amélioré

70
Q

Quand une mutation faux sens peut être néfaste, avec exemple

A

lorsque la substitution d’une pb entraine la mise en place d’un autre a.a qui a une répercussion néfaste sur le fonctionnement de la protéines

ex: a.a hydrophile changé par un a.a hydrophobe

71
Q

vrai ou faux la mutation faux sens bénéfique est rare

A

vrai

72
Q

vrai ou faux la mutation non sene est une mutation par substitution d’une pb

A

vrai

73
Q

Décrire une mutation non sens et ses impacts

A

la substitution d’une pb modifiant un codon codant pour un a.a en un codon STOP

  • arrêt prématuré de la synthèse de la protéine
  • la protéine plus courte que celle codé normalement ser probablement non fonctionnelle (cela dépend de l’endroit où a lieu la mutation non-sens (au début de l’ARNm (5’) ou fin (3’))
74
Q

lors de la mutation non sens du au codon STOP la protéine plus courte que celle codé normalement sera probablement non fonctionnelle, cela dépend de quoi?

A

-cela dépend de l’endroit où a lieu la mutation non-sens: au début de l’ARNm (5’) ou vers la fin (3’)

75
Q

vrai ou faux le décalage du cadre de lecture avec faux sens provient d’une mutation par substitution d’une pb

A

faux, d’une mutation par délétion ou insertion de pb

76
Q

Décrire le décalage du cadre de lecture avec faux-sens

A
  • tous les nucléotides en aval de la mutation sont regroupés différement et codent ainsi de nouveaux a.a
  • la traduction se poursuit ainsi jusqu’à un non-sens (codon STOP) qui met fin prématurément à la synthèse de la protéine
77
Q

Lors du décalage du cadre de lecture avec faux-sens la traduction se poursuit ainsi jusqu’à un non-sens (codon STOP) qui met fin prématurément à la synthèse de la protéine, cette protéine est fonctionnelle?

A

la protéine pourra être fonctionnelle ou non selon le site où débute le décalage de la lecture

plus la site où à lieu le décalage de lecture est près de la fin du gène : meilleures sont les chances d’obtenir une protéine fonctionnelle

78
Q

vrai ou faux le décalage du cadre de lecture est une mutation par délétion ou insertion de pb

A

vrai

79
Q

quels sont les types de décalage du cadre de lecture

A
  • avec non-sens immédiat
  • restreint
80
Q

Décrire le décalage du cadre de lecture avec non-sens immédiat

A
  • le décalage de lecture provoque très tôt au début de la traduction un codon STOP qui met fin à la synthèse de la protéine

LA PROTÉINE NE SERA PAS FONCTIONNELLE

81
Q

Décrire le cadre de lecture restreint

A

si un ou plusieurs triplets sont enlevés ou insérés, il yb a perte ou addition d’un ou plusieurs a.a , mais tous les codons sont lus correctement

LA PROTÉINE POURRA OU NON ETRE FONCTIONNELLE

82
Q

vrai ou faux lors d’un décalage du cadre de lecture avec non-sens immédiat la protéine pourra être ou non fonctionnelle

A

faux !! pas fonctionnelle

83
Q

regarder les types de mutations ponctuelles et leurs conséquences

A
84
Q

qu’est-ce qu’un suprreseur de mutation?

A

mutation à un site B qui suppriment l’effet d’une première mutation à un site A

85
Q

Combien de types de supresseurs de mutations? Les décrires

A

suppression intragénique

  • les mutations ont lieu à l’intérieur du même gène

suppression intergénique

  • les mutations ont lieu dans un autre gène

(les gènes qui causent une supression de mutation dans d’autres gènes se nommen gènes suppresseurs)

86
Q

Les gènes qui causent une supression de mutation dans d’autres gènes se nomment?

A

gènes suppresseurs

87
Q

Quel est le résultat d’une suppression de mutation

A
  • production d’une copie fonctionnelle ou partiellement fonctionnelle de la protéine devenue inactive suite à la mutation originale qu’elle a subie
88
Q

Donner un exemple de suppression intragénique d’une mutation changeant le cadre de lecture

A

1ere mutation: deletion d’un nucléotide pendant la réplication

= codon faux sens avec codon non sens

2ieme mutation: ajout d’un nucléotide pendant la réplication

= reste slm un peu de codon faux sens

donc suppression intragénique de la mutation

= protéine en partie foncionnelle (retrouve une partie de son activité) dans ce cas la

89
Q

Lors d’un exemple de suppression intragénique d’une mutation changeant le cadre de lecture est-ce que la protéine peut redevenir totalement active

A

oui mais peut aussi slm retrouvé une petite partie de son activité

90
Q

Donner un exemple de suppression intergénique d’une mutation non sens

A

il faut qu’il y est une mutation autant dans l’ARNm que dans l’ARNt pour que l’anticodon puisse recconnaitre le codon de l’ARN

dans ce cas c’est un gène codant pour la tyrosine, mais lors de la mutation sur l’ARNm celui-ci mène a un non-sens (codon STOP) alors l’ARNt mineur codant tyrosine est aussi muté afin que celui-ci puisse modifié la mutation. Le codon non sens est suppressed mais une tyrosine es ajouté à la position du codon non sens afin de permetrre une chaine complete du polypeptide.

91
Q

combien de gènes distincts codent pour des ARNT tyrosine

A

3 :

1 ARNt majeur

2 ARNt mineur

92
Q

que se passe-t-il si problème dans ARNt mineur de la tyrosine

A

moins problématique mais si majeur bcp plus problématique

93
Q

comment l’ARNt mutant lie l’ARNm lors d’une suppression intergénique d’une mutation non sens, et quel effet?

A

L’ARNt mutant lie un codon STOP (venant d’une mutation non sens) comme s’il spécifiait un a.a

alors permet d’ajouté l’a.a pour lequel l’ARNt code plutôt que d’arrêter la synthèse de l’ARNm donc moins pire même si ajout d’un a.a qui n’a pas rapport

94
Q

vrai ou faux le code génétique est universelle

A

presque vrai sauf que quelques exceptions comme:

  • quelques codons STOP diffèrent d’un espèce à l’autre

MAIS GÉNÉRALEMENT UNIVERSELLE!!!

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