Code génétique Flashcards
combien de nucléotides constituent un codon?
3 nucléotides
combien de possibilités pour chaque codon consitiué de 3 nucléotides?
64 possibilités (4x4x4)
Quels sont les fonctions des codons?
- 3 codons signalent la fin de la traduction
(recconu par des facteurs de terminaison protéiques soit RF1 et RF2 chez les bactéries et eRF1 chez les eucaryotes)
- 61 codons spécifient les 20 a.a protéiques
(reconnu par des ARNt, un a.a peut donc être spécifié par plusieurs codons)
nommer les deux choses qui peuvent reconnaitre les codons
- facteurs de terminaison protéiques
- ARNt
nommer les facteurs de terminaison des bactéries
RF1 et RF2 (RELEASE FACTOR)
nommer les facteurs protéiques de terminaison des eucaryotes
eRF1 (eucaryote realase factor)
vrai ou faux le code génétique est redondant
vrai on dit dégénéré
comment on nomme les codons qui désignent le même a.a
des synonymes
quels sont les codons STOP
UAA
UAG
UGA
Quels sont les trois règles qui gouvernent le code génétique?
- les codons sont lus du 5’ au 3’
- les codons ne se chevauchent pas et le message ne contient pas d’espace (les codons successifs sont spécifiés par des trinucléotides adjacents
- le message est traduit dans un cadre de lecture fixe (débutant à un codon initiateur situé à l’extrémité 5’ de la séquence codante)
par quoi sont spécifiés les codons successifs?
par des trinucléotides adjacents
que permet le codon initiateur?
dicte quel cadre de lecture doit être utilisé
quel organisme peut avoir des codons qui se chevauche
virus mais EXCEPTION très rare
que signifie dégenerencese
redondant
d’où vient une partie importante de la desgenerescence
de la flexibilité de pairage du premier nucléotide des anticodons avec le troisieme nucléotide des codons
donner un exemple que la desgenerescence vient de la flexibilité de pairage du premier nucléotide des anticodons avec le troisieme nucléotide des codons
CUU, CUUC, CUA et CUG
encode le même a.a
vrai ou faux la desgenerescence estbasé sur l’équivalence des 2 premiers nucléotides
faux
Qu’est-ce que la leucine démontre?
que la la desgenerescence n’est pas basé sur l’équivalence des 2 premiers nucléotides
en effet le premier peut être
U ou C
donc minimalement deux ARNt différent mais peut être plus
vrai ou faux le même ARNt (anticodon) peut reconnaitre différents codons de l’ARNm
vrai
où peut-il y avoir de la méthylation sur l’anticodon
en N1 de G
qu’à permie l’évolution du code
minimiser les effets délètère de mutations
comment l’évolution du code à minimiser les effets déleterent du code?
en faisant que les mutations en première position du codon donnent souvent des a.a similaires
(même famille)
quels sont les mutations les plus fréquemment observé et permet quoi?
mutations ponctuelles par transition
l’évolution du code minimisant les effets déleterent du code
que se passe-t-il lors d’une mutation en 2e position d’un codon
remplacera un a.a par un a.a très similaire
(puisque la mutation la plus commune est la transition)
qu’est-ce qu’une transition? (mutation)
pyrimidine par pyrimidine
purien par purine
les codons avec des pyrimidines en 2e position codent majoritairement?
des a.a hydrophobes
les codons avec des purines en deuxième position codent majoritairement
des a.a polaires
vrai ou faux quand on a un U en deuxième position c’est toujours hydrophobe
vrai
vrai ou faux quand on a un C en deuxième position c’est toujours hydrophobe
faux, 1/2
vrai ou faux quand on a un A en deuxième position c’est toujours hydrophile
vrai
vrai ou faux quand on a un G en deuxième position c’est toujours hydrophile
faux, 1 seule exception hihi
vrai ou faux il y a moins d’impact lors d’un transition de purine que de pyrimidine
vrai
vrai ou faux les codons ayant subi une mutation (transition ou tranversion) à la troisième position spécifient rarement un a.a différent
vrai
vrai ou faux les ARNm ont des paires de bases oscillatoires
faux, ARNt
qu’elle(s) bases de l’anticodon est moins contrainte
la première base (5’) de l’anitcodon est moins contrainte dans l’espace que les 2 autres bases de l’anticodon
Que permet le fait que la première base (5’) de l’anitcodon est moins contrainte dans l’espace que les 2 autres bases de l’anticodon
- permet à G,U et I de former des liaisons H avec plus d’un type de base
- donc les appariments bancal sont ceux qui permettent de conserver une distance entre les 2 riboses similaire à la distance existant dans les appariment standart (A:U et G:C)
vrai ou faux il peut y avoir appariment bancal entre deux pyrimidines
faux car donnent des distances trop longues ou trop courtes
vrai ou faux il peut y avoir appariment bancal entre deux purines
vrai entre A:I seulement!!!
qu’est-ce que l’inosine
hypoxanthine
un dérivé de l’adénine (désamination du carbone 6 pour donner un groupement céto)
Nommer les appariment bancal possible pour G
U
C
Nommer les appariment bancal possible pour C
G
Nommer les appariment bancal possible pour A
U
Nommer les appariment bancal possible pour C
A
G
Nommer les appariment bancal possible pour I
A
U
C
L’ARNt peut reconnaitre au max combien de codons et quand?
max 3 codons lorsque l’inosine se trouve à la première position de l’anticodon
vrai ou faux un seul ARNt est nécessaire pour reconnaire les 6 codons de la sérine
faux, plusieurs car un ARNt max 3 !!
idem pour les 6 codons de leucine et de l’arginine
quel est la conformation de l’anticodon de l’ARNt
boucle
quels bases de l’anticodon on a peu près la même orientation
les 3 bases de l’anticodon et les 2 suivantes en 3’ de la boucle
par quoi est influencé la conformation des 3 bases de l’anticodon et les 2 suivantes en 3’ de la boucle
par les interactions d’empilement des bases planes les unes sur les autres
quel base l’anticodon est moins restreinte en mouvement, permet quoi?
la première base (5’) de l’anticodon permettant l’appariment bancal avec la 3e base du codon
vrai ou faux la 2,3 base de l’anticodon sont restreinte en mouvement
vrai
donc pas d’appariement bancal
quel est l’identité de la base adjacente à la 3e base de l’anticodon
une purine modifiée et encombrante
toujours
où se retrouve l’anticodon dans la structure de l’ARNt
dans la boucle de l’anticodon
qu’est-ce que les mutations ponctuelles altèrent?
le code génétique
définir une mutation ponctuelle
modification chimique touchant 1 seul nucléotide ou quelques nucléotides d’un gène
vrai ou faux la mutation ponctuelle est synonyme de mutation chromosomique comme pour la trisomie 21
faux
sur quoi les mutations ponctuelles peuvent avoir un impact?
sur la synthèse d’une protéine
il peut y avoir une répercussion qui sera soit neutre, bénéfique ou délétère pour l’organisme
Nommer les 3 types de mutations ponctuelles
- mutation faux-sens
- mutation non-sens
- mutation par décalage du cadre de lecture
décrire la mutation faux-sens
substitution d’un a.a pour un autre
décrire la mutation non-sens
création d’un codon de terminaison prématuré
Nommer les catégories de mutations ponctuelles
- substitution d’une paire de bases
- délétion ou insertion de paires de base
Définir une substitution d’une paire de bases et les sous-catégories
une paire de base différente a pris la place de la paire de base originale
- mutation silencieuse
- mutation faux sens bénéfique
- mutation faux sens néfaste
- mutation non sens
à quoi peuvent etre du les mutations silencieuses
- due à la redondance du code génétique
- due à une substitution sans effet sur la protéine
Décrire un délétion ou insertion de pb avec les sous-catégories
perte (délétion) ou addition (insertion) d’une ou plusieurs paires de bases. Si le nombre de nucléotides enlevées ou insérés n’est pas un multiple de 3 il y a décalage du cadre de lecture
- décalage du cadre de lecture avec faux sens
- décalage du cadre de lecture avec non sens immédiat
- décalage restreint du cadre de lecture
vrai ou faux une mutation silencieuse est du à une mutation par substitution d’une paire de bases
vrai
Décrie deux raison d’une mutation silencieuse avec exemples
- redondance du code génétique qui fait en sorte que l’a.a codé sera le même
ex: un triplet 3’ GGA 5’ du brin d’ADN transcrit en ARNm subit une substitution d’un G à la position du A
ARNm 3’ -CCC- 5’ au lieu de 3’- CCU- 5’
mais les deux donne la proline!!
- due à une substitution qui est sans effet sur la fonction de la protéine
(un changement de nucléotide commandant la mise en place d’un a.a différent mais non essentiel à la fonction de la protéine)
ex: un a.a hydrophile changé pour un autre a.a hydrophile
vrai ou faux la mutation faux-sens est une mutation par substitution d’une paire de base
vrai
vrai ou faux la mutation faux sens est néfaste
vrai/faux car peut aussi etre bénéfique
Quand une mutation faux sens peut être bénéfique, avec exemple
quand la substitution d’une pb entraine la mise en place d’un a.a qui améliore la performance de la protéine (rare mais à l’origine de l’évolution )
ex: enzyme dont le site actif est amélioré
Quand une mutation faux sens peut être néfaste, avec exemple
lorsque la substitution d’une pb entraine la mise en place d’un autre a.a qui a une répercussion néfaste sur le fonctionnement de la protéines
ex: a.a hydrophile changé par un a.a hydrophobe
vrai ou faux la mutation faux sens bénéfique est rare
vrai
vrai ou faux la mutation non sene est une mutation par substitution d’une pb
vrai
Décrire une mutation non sens et ses impacts
la substitution d’une pb modifiant un codon codant pour un a.a en un codon STOP
- arrêt prématuré de la synthèse de la protéine
- la protéine plus courte que celle codé normalement ser probablement non fonctionnelle (cela dépend de l’endroit où a lieu la mutation non-sens (au début de l’ARNm (5’) ou fin (3’))
lors de la mutation non sens du au codon STOP la protéine plus courte que celle codé normalement sera probablement non fonctionnelle, cela dépend de quoi?
-cela dépend de l’endroit où a lieu la mutation non-sens: au début de l’ARNm (5’) ou vers la fin (3’)
vrai ou faux le décalage du cadre de lecture avec faux sens provient d’une mutation par substitution d’une pb
faux, d’une mutation par délétion ou insertion de pb
Décrire le décalage du cadre de lecture avec faux-sens
- tous les nucléotides en aval de la mutation sont regroupés différement et codent ainsi de nouveaux a.a
- la traduction se poursuit ainsi jusqu’à un non-sens (codon STOP) qui met fin prématurément à la synthèse de la protéine
Lors du décalage du cadre de lecture avec faux-sens la traduction se poursuit ainsi jusqu’à un non-sens (codon STOP) qui met fin prématurément à la synthèse de la protéine, cette protéine est fonctionnelle?
la protéine pourra être fonctionnelle ou non selon le site où débute le décalage de la lecture
plus la site où à lieu le décalage de lecture est près de la fin du gène : meilleures sont les chances d’obtenir une protéine fonctionnelle
vrai ou faux le décalage du cadre de lecture est une mutation par délétion ou insertion de pb
vrai
quels sont les types de décalage du cadre de lecture
- avec non-sens immédiat
- restreint
Décrire le décalage du cadre de lecture avec non-sens immédiat
- le décalage de lecture provoque très tôt au début de la traduction un codon STOP qui met fin à la synthèse de la protéine
LA PROTÉINE NE SERA PAS FONCTIONNELLE
Décrire le cadre de lecture restreint
si un ou plusieurs triplets sont enlevés ou insérés, il yb a perte ou addition d’un ou plusieurs a.a , mais tous les codons sont lus correctement
LA PROTÉINE POURRA OU NON ETRE FONCTIONNELLE
vrai ou faux lors d’un décalage du cadre de lecture avec non-sens immédiat la protéine pourra être ou non fonctionnelle
faux !! pas fonctionnelle
regarder les types de mutations ponctuelles et leurs conséquences
qu’est-ce qu’un suprreseur de mutation?
mutation à un site B qui suppriment l’effet d’une première mutation à un site A
Combien de types de supresseurs de mutations? Les décrires
suppression intragénique
- les mutations ont lieu à l’intérieur du même gène
suppression intergénique
- les mutations ont lieu dans un autre gène
(les gènes qui causent une supression de mutation dans d’autres gènes se nommen gènes suppresseurs)
Les gènes qui causent une supression de mutation dans d’autres gènes se nomment?
gènes suppresseurs
Quel est le résultat d’une suppression de mutation
- production d’une copie fonctionnelle ou partiellement fonctionnelle de la protéine devenue inactive suite à la mutation originale qu’elle a subie
Donner un exemple de suppression intragénique d’une mutation changeant le cadre de lecture
1ere mutation: deletion d’un nucléotide pendant la réplication
= codon faux sens avec codon non sens
2ieme mutation: ajout d’un nucléotide pendant la réplication
= reste slm un peu de codon faux sens
donc suppression intragénique de la mutation
= protéine en partie foncionnelle (retrouve une partie de son activité) dans ce cas la
Lors d’un exemple de suppression intragénique d’une mutation changeant le cadre de lecture est-ce que la protéine peut redevenir totalement active
oui mais peut aussi slm retrouvé une petite partie de son activité
Donner un exemple de suppression intergénique d’une mutation non sens
il faut qu’il y est une mutation autant dans l’ARNm que dans l’ARNt pour que l’anticodon puisse recconnaitre le codon de l’ARN
dans ce cas c’est un gène codant pour la tyrosine, mais lors de la mutation sur l’ARNm celui-ci mène a un non-sens (codon STOP) alors l’ARNt mineur codant tyrosine est aussi muté afin que celui-ci puisse modifié la mutation. Le codon non sens est suppressed mais une tyrosine es ajouté à la position du codon non sens afin de permetrre une chaine complete du polypeptide.
combien de gènes distincts codent pour des ARNT tyrosine
3 :
1 ARNt majeur
2 ARNt mineur
que se passe-t-il si problème dans ARNt mineur de la tyrosine
moins problématique mais si majeur bcp plus problématique
comment l’ARNt mutant lie l’ARNm lors d’une suppression intergénique d’une mutation non sens, et quel effet?
L’ARNt mutant lie un codon STOP (venant d’une mutation non sens) comme s’il spécifiait un a.a
alors permet d’ajouté l’a.a pour lequel l’ARNt code plutôt que d’arrêter la synthèse de l’ARNm donc moins pire même si ajout d’un a.a qui n’a pas rapport
vrai ou faux le code génétique est universelle
presque vrai sauf que quelques exceptions comme:
- quelques codons STOP diffèrent d’un espèce à l’autre
MAIS GÉNÉRALEMENT UNIVERSELLE!!!
