CM2: microbio médicale partie 1 Flashcards
quels sont les trois étapes du traitement des échantillons?
pré analytique
analytique
post analytique
décrire étape pré analytique
test demandé par professionnel de la santé
échantillon prélevé et acheminé au labo
réception de l’échantillon au labo de microbiologie
qu’est-ce qui est important sur une requête de test?
identifier le patient!
dire si allergie pénicilline
identifier l’échantillon
décrire l’étape analytique
-étalement échantillon sur une lame microscopique (coloration de GRAM)
-étalement sur gélose mis dans des incubateurs à 37C (gélose=milieux nutritifs pour les bactéries)
nommer les principales gloses
-sang de mouton
-de chocolat
(les 2 très générales, voit bcp bactéries)
-macconkey
(plus sélective= inhibe GRAM+)
décrire l’atmosphère d’incubation
-étuve air ambiant (21% O2)
-étuve CO2
-tente anaérobique (permet croissance et survie des bactéries anaéorbies strictes)
trois test pouvant être fait à l’étape d’analyse
-hémolyse (rapide, voit bêta-gamma-alpha, peut dire si cocci, battonet, en amas etc../ donne beaucoup d’infos vite!)
-coagulase (regarde si coagulation)
-catalase (test rapide, si petite bulle le test est positif)
décrire étape post analytique
rapporte résultats
transmettre résultats
interpréter résultats
quand le médecin doit prescrire des hémocultures?
-patient présente fièvre avec signes d’atteintes systémiques sévères
-atteinte de l’état générale
-frissons intenses
-TA basse
ou si diagnostic graves évoqués
-méningite
-endocardite
combien d’hémocultures médecin prescrit?
en général 2 hémocultures
*chaque hémo= 2 bouteilles (1 aérobie, 1 anaérobe)
*chaque bouteille=10 ml
donc pour 2 hémocultures ont va collecter 4 bouteilles de sang
pourquoi on a besoin de prélever une bouteille aérobie et une autre anaérobie?
-volume idéal de sang par hémoculture= 20 mL
-ration bouillon/sang par bouteille= 10 mL
-si 10 mL ana et 10 ml a.= meilleur recouvrement de bactéries (meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les bouteilles anaérobies)
pourquoi prélever 2 hémocultures (soit 40 mL de sang)
*probabilité de trouver la bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé!!
-plus le volume est grand et plus la probabilité est haute
-risque cout bénéfice devient moins intéressant après 40 mL
-facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si elles sont présentes
dans quel contexte prescrire plus que 2 hémocultures?
-endocardite aigue (3 hémos en bas de 2h avant de commencer traitement)
-endocardite subaigue (germe peu virulent et patient non instable); 3 hémos en bas de 24h, si première série négative prélever 2 autres hémocultures après 24 h
pourquoi prélever en 2 temps?
éviter contamination cutanée
évaluer caractère continu de la bactériémie
décrire les étapes du traitement des hémocultures au laboratoire
-bouteilles hémocultures déposées dans appareil maitenant température à 37 et qui brasse bouteille de façon continue
-appareil détecte présence de croissance bactérienne grâce aux métabolites généré par les bactéries dans la bouteille
-coloration de gram sur le liquide de la bouteille d’hémoculture positive et ensemence des milieux de cultures (gélose)
=identifer bactérie et procédé à antibiogramme
important de savoir laquelle des 2 bouteilles est +?
pas vraiment…
s epidermisis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture est pas plus significatif que s’il était seulement dans une bouteille (contaminant probable)
*même si trouve BGN seulement dans bouteille ana. probabilité demeure élevé qu’elle soit aérobe
le médecin doit analyser quels indices afin de savoir si il y a présence d’une bactériémie ou d’un contaminant?
-bactérie est reconnue comme pathogène colonisant la peau?
-nombre d’hémos positives (et non le nombre de bouteilles!); 1/2 vs 2/2
-après combien d’heures d’incubation appareil détecte croissance bactérienne?
-lien entre site infection et le germe identifié est plausible?
que veut dire être un contaminant?
la bactérie ne vient pas de la personne!!
quelle bactérie est un contaminant?
bacillus spp. (bacille gram +)
quelles bactéries peuvent être des contaminants?
staphylocoque à coagulase neg (gram + en amas)
strep groupe viridans (gram + en chaine)
quelles bactéries ne sont jamais des contaminants?
s aureus (gram + en amas)
s pneumoniae (gram + en pair)
strep pyogenens groupe A (gram + en chaine)
listeria monocytogenes (gram + bacille)
E coli (gram - bacille)
Candida albicans (levure)
cocci gram + en amas
staph
cocci gram + en chainettes
strep, entero, pneumocoque
cocci gram + en paires
pneumocoque
cocci gram - en paires
neisseria, moraxella
bâtonnets gram -
e coli, k. pneumoniae, pseudomonas, bacteroides fragilis
cocobaccile gram -
haemophilus influenzae
ba^tonnets gram +
listeria monocytogenes, clostridium spp, corynebacterium spp, bacillus spp.
si bactériémie, la majorité des hémocultures seront + en…
moins de 24h
(on incube les bouteilles d’hémocultures un maximum de 5 jours avant de conclure qu’elles sont négatives)
quels agents infectieux significatifs pourraient croitre après 24h?
bactéries anaérobes, levures, certaines bactéries fastidieuses (HACEK)
est-ce que lien est plausible si on trouve présence strep viridans dans une hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite?
non!
strep viridians ne cause pas de méningite
nommer des exemples de germe de la flore normale de la peau
staph coagulase neg, Corinne bacterium, bacillus
comment savoir si infection cathéter vasculaire?
si hémo 2/2 à germe de la flore normale de la peau
bactériemie communautaire est attribuable à?
infection acquise dans la communauté
-survient en bas de 48h après arrivée hôpital
bactériémie est qualifiée de nosocomiale si?
-condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital
-survient plus de 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
nommer 2 types d’examens de laboratoire pour échantillon urinaire
-analyse d’urine (labo de biochimie)
-culture d’urine (labo de microbio)
est-ce que l’urètre discale est stérile?
non!
mais l’urine est normalement stérile
comment faire différence entre croissance de bactéries provenant urètre et celles provenant vessie?
prélèvement mi jet
culture quantitative de bactéries (en haut de 10^8 UFC/L)
décrire l’étape pré analytique avec échantillon d’urine
-indication culture d’urine
-clinicien questionne si symptômes ou non
(présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite très rarement un traitement)
décrire la technique de prélèvement mi jet pour femme
-écarter genoux
-dégager le méat urinaire avec mains préalablement nettoyée
-nettoyer région vulvaire en commençant au dessus du méat urinaire
-débuter miction dans toilette
-puis transférer pot stérile sous le jet urinaire
-terminer miciton dans toilette