CM2: microbio médicale partie 1 Flashcards

1
Q

quels sont les trois étapes du traitement des échantillons?

A

pré analytique
analytique
post analytique

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2
Q

décrire étape pré analytique

A

test demandé par professionnel de la santé
échantillon prélevé et acheminé au labo
réception de l’échantillon au labo de microbiologie

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3
Q

qu’est-ce qui est important sur une requête de test?

A

identifier le patient!
dire si allergie pénicilline
identifier l’échantillon

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4
Q

décrire l’étape analytique

A

-étalement échantillon sur une lame microscopique (coloration de GRAM)
-étalement sur gélose mis dans des incubateurs à 37C (gélose=milieux nutritifs pour les bactéries)

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5
Q

nommer les principales gloses

A

-sang de mouton
-de chocolat
(les 2 très générales, voit bcp bactéries)

-macconkey
(plus sélective= inhibe GRAM+)

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6
Q

décrire l’atmosphère d’incubation

A

-étuve air ambiant (21% O2)
-étuve CO2
-tente anaérobique (permet croissance et survie des bactéries anaéorbies strictes)

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7
Q

trois test pouvant être fait à l’étape d’analyse

A

-hémolyse (rapide, voit bêta-gamma-alpha, peut dire si cocci, battonet, en amas etc../ donne beaucoup d’infos vite!)
-coagulase (regarde si coagulation)
-catalase (test rapide, si petite bulle le test est positif)

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8
Q

décrire étape post analytique

A

rapporte résultats
transmettre résultats
interpréter résultats

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9
Q

quand le médecin doit prescrire des hémocultures?

A

-patient présente fièvre avec signes d’atteintes systémiques sévères
-atteinte de l’état générale
-frissons intenses
-TA basse

ou si diagnostic graves évoqués
-méningite
-endocardite

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10
Q

combien d’hémocultures médecin prescrit?

A

en général 2 hémocultures
*chaque hémo= 2 bouteilles (1 aérobie, 1 anaérobe)
*chaque bouteille=10 ml

donc pour 2 hémocultures ont va collecter 4 bouteilles de sang

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11
Q

pourquoi on a besoin de prélever une bouteille aérobie et une autre anaérobie?

A

-volume idéal de sang par hémoculture= 20 mL
-ration bouillon/sang par bouteille= 10 mL
-si 10 mL ana et 10 ml a.= meilleur recouvrement de bactéries (meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les bouteilles anaérobies)

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12
Q

pourquoi prélever 2 hémocultures (soit 40 mL de sang)

A

*probabilité de trouver la bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé!!
-plus le volume est grand et plus la probabilité est haute
-risque cout bénéfice devient moins intéressant après 40 mL
-facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si elles sont présentes

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13
Q

dans quel contexte prescrire plus que 2 hémocultures?

A

-endocardite aigue (3 hémos en bas de 2h avant de commencer traitement)
-endocardite subaigue (germe peu virulent et patient non instable); 3 hémos en bas de 24h, si première série négative prélever 2 autres hémocultures après 24 h

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14
Q

pourquoi prélever en 2 temps?

A

éviter contamination cutanée
évaluer caractère continu de la bactériémie

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15
Q

décrire les étapes du traitement des hémocultures au laboratoire

A

-bouteilles hémocultures déposées dans appareil maitenant température à 37 et qui brasse bouteille de façon continue
-appareil détecte présence de croissance bactérienne grâce aux métabolites généré par les bactéries dans la bouteille
-coloration de gram sur le liquide de la bouteille d’hémoculture positive et ensemence des milieux de cultures (gélose)
=identifer bactérie et procédé à antibiogramme

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16
Q

important de savoir laquelle des 2 bouteilles est +?

A

pas vraiment…
s epidermisis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture est pas plus significatif que s’il était seulement dans une bouteille (contaminant probable)
*même si trouve BGN seulement dans bouteille ana. probabilité demeure élevé qu’elle soit aérobe

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17
Q

le médecin doit analyser quels indices afin de savoir si il y a présence d’une bactériémie ou d’un contaminant?

A

-bactérie est reconnue comme pathogène colonisant la peau?
-nombre d’hémos positives (et non le nombre de bouteilles!); 1/2 vs 2/2
-après combien d’heures d’incubation appareil détecte croissance bactérienne?
-lien entre site infection et le germe identifié est plausible?

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18
Q

que veut dire être un contaminant?

A

la bactérie ne vient pas de la personne!!

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19
Q

quelle bactérie est un contaminant?

A

bacillus spp. (bacille gram +)

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20
Q

quelles bactéries peuvent être des contaminants?

A

staphylocoque à coagulase neg (gram + en amas)
strep groupe viridans (gram + en chaine)

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21
Q

quelles bactéries ne sont jamais des contaminants?

A

s aureus (gram + en amas)
s pneumoniae (gram + en pair)
strep pyogenens groupe A (gram + en chaine)
listeria monocytogenes (gram + bacille)
E coli (gram - bacille)
Candida albicans (levure)

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22
Q

cocci gram + en amas

A

staph

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23
Q

cocci gram + en chainettes

A

strep, entero, pneumocoque

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24
Q

cocci gram + en paires

A

pneumocoque

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25
Q

cocci gram - en paires

A

neisseria, moraxella

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26
Q

bâtonnets gram -

A

e coli, k. pneumoniae, pseudomonas, bacteroides fragilis

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27
Q

cocobaccile gram -

A

haemophilus influenzae

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28
Q

ba^tonnets gram +

A

listeria monocytogenes, clostridium spp, corynebacterium spp, bacillus spp.

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29
Q

si bactériémie, la majorité des hémocultures seront + en…

A

moins de 24h
(on incube les bouteilles d’hémocultures un maximum de 5 jours avant de conclure qu’elles sont négatives)

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30
Q

quels agents infectieux significatifs pourraient croitre après 24h?

A

bactéries anaérobes, levures, certaines bactéries fastidieuses (HACEK)

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31
Q

est-ce que lien est plausible si on trouve présence strep viridans dans une hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite?

A

non!
strep viridians ne cause pas de méningite

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32
Q

nommer des exemples de germe de la flore normale de la peau

A

staph coagulase neg, Corinne bacterium, bacillus

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33
Q

comment savoir si infection cathéter vasculaire?

A

si hémo 2/2 à germe de la flore normale de la peau

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34
Q

bactériemie communautaire est attribuable à?

A

infection acquise dans la communauté
-survient en bas de 48h après arrivée hôpital

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35
Q

bactériémie est qualifiée de nosocomiale si?

A

-condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital
-survient plus de 48 heures après l’arrivée à l’hôpital

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36
Q

nommer 2 types d’examens de laboratoire pour échantillon urinaire

A

-analyse d’urine (labo de biochimie)
-culture d’urine (labo de microbio)

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37
Q

est-ce que l’urètre discale est stérile?

A

non!
mais l’urine est normalement stérile

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38
Q

comment faire différence entre croissance de bactéries provenant urètre et celles provenant vessie?

A

prélèvement mi jet
culture quantitative de bactéries (en haut de 10^8 UFC/L)

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39
Q

décrire l’étape pré analytique avec échantillon d’urine

A

-indication culture d’urine
-clinicien questionne si symptômes ou non
(présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite très rarement un traitement)

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40
Q

décrire la technique de prélèvement mi jet pour femme

A

-écarter genoux
-dégager le méat urinaire avec mains préalablement nettoyée
-nettoyer région vulvaire en commençant au dessus du méat urinaire
-débuter miction dans toilette
-puis transférer pot stérile sous le jet urinaire
-terminer miciton dans toilette

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41
Q

décrire la technique de prélèvement mi jet pour homme

A

-rétracter prépuce si non circoncis
-avec mains préalablement nettoyer, nettoyer région méat urinaire
-miction dans toilettes
-puis transférer pot stérile sous le jet urinaire
-terminer miciton dans toilette

42
Q

quel type de jet pour gonorrhée et chlam ?

A

début jet
(prélèvement requis pour TAAN)

43
Q

quel type de jet pour culture d’urine?

A

mi jet

44
Q

combien de mL pour une culture quantitative urinaire?

A

0.001 mL
**soit sur gélose au sang ou de Mackonkey; voir si plus de 100 colonies sur les géloses et si oui= préparation pour l’antibiogramme!

45
Q

quelle quantité de bactériurie est significative?

A

en haut de 10^8 UFC/mL
-voies urines parfois en haut 10^5 UFC/L

46
Q

est-ce que culture d’urine positive= automatiquement infection urinaire?

A

non!
si faible décompte urinaire: absence de croissance significative (ne veut pas dire que pas de bactéries mais juste dire pas beaucoup)

47
Q

temps de réponse pour un antibiogramme?

A

48-72h
donc souvent commence à traiter avant d’avoir les résultats!

48
Q

comment expliquer une inflammation avec une culture urine neg?

A

si culture faite après début anitbio
inflammation vient d’ailleurs que l’urine
inflammation causée par microorganisme non cultivable

49
Q

nommer les principaux agents responsables infections urinaires

A

E coli (le plus!!!)
proteus mirabilis
klebsiella penumonae
enterococcus spp.
staphylococcus saprophiticus

50
Q

symptômes infections urinaire basse

A

brulement micitonnels
hématurie macroscopique
urgence micitonnelle

51
Q

symptômes infections urinaire haute

A

pareille que symptômes infection urinaire basse mais en plus;
douleur loge lombaire (punch rénal +)
fièvre
leucocytes

52
Q

comment détecter pharyngite à step pyogenes

A

culture de gorge!

53
Q

culture de gorge permet la recherche de… (si pas d’autres précisions)

A

strep bêta hémolytique A, C, G

54
Q

quoi regarder quand examine gorge?

A

inflammation amygdales
pétéchies
sécrétions purulentes/exsudat

55
Q

rôle du labo dans une culture de gorge?

A

enregistre demande analyse
ensemencement gélose sang de mouton
incubation 24h
examine gélose
absence de colonies bêta hémo = négatif
présence de colonies bêta hémo = typage de Lancefield (A, C, G)

56
Q

culture gorge vs test rapide vs TAAN;
sensibilité

A

TAAN> culture > test rapide

57
Q

culture gorge vs test rapide vs TAAN;
quels strep détecter

A

cutlure= ACG
test rapide=A
TAAN= A

58
Q

culture gorge vs test rapide vs TAAN;
résultat après combien de temps?

A

test rapide= en 1 heures
TAAN= résultat rapide mais dépend du type de TAAN
culture= 24-48h

59
Q

culture gorge vs test rapide vs TAAN;
antibiogramme

A

test rapide et TAAN= pas d’antibiogramme
culture= fait sur demande seulement (si patient allergique à la pénicilline)

60
Q

culture gorge vs test rapide vs TAAN;
cout

A

TAAN> test rapide> culture
*encore une fois dépend du type de TAAN utilisé

61
Q

qu’est-ce que la sérologie ASO?

A

anticorps antistreptolysine
-après infection SGA: produit Ac
-Ac détectable après 7-14 jours suite début des symptômes
-utile pour supporter un diagnostique de RAA
**ne pas faire si suspicion infection aigue à strep pyogènes

62
Q

comment faire une culture de plaie de surface?

A

nettoyer plaie
peser sur les tissus au pourtour
prélever des sécrétions purulentes

63
Q

culture de plaie de surface sera de type..

A

aérobe seulement
-faire coloration de gram
*Souvent infecté par les bactéries de la flore normale cutanée

64
Q

avec gram; décrire résultat pour culture de plaie de surface

A

absence de polynucléaire
rare cellules squameuses
présence de bactéries

*on mesure la qualité d’un prélèvement de plaie par;
présence de polynucléaires (ne devrait pas en avoir si bien fait)
absence de cellules squameuses

65
Q

décrie culture de pus profond

A

coloration gram
culture aérobe et anaérobe
(risque de contamination théoriquement moindre que pour une plaie de surface)

66
Q

avec gram; décrire résultat pour culture de plaie profonde

A

présence polynucléaires
présence de bactéries
pas de cellules squameuses

67
Q

que sont les liquides biologiques normalement stériles (LBNS)

A

liquide;
articulaire
péricardique
péritonéal
pleural
céphalo rachidien

68
Q

coloration de gram avec LBNS

A

présence neutrophiles
beaucoup bactéries (réponse rapide)
sensibilité faible à modérée (on pourrait ne pas voir la bactérie)

69
Q

culture LBNS

A

aérobie
anaérobies
même dans bouteilles d’hémocultures
on rapporte tout!

70
Q

comment diagnostiquer c difficile

A

selles non formées
recherches de toxines
-test rapide EIA
-recherche du gène de la toxine par TAAN (donc on ne cherche pas la toxine mais si la bactérie à le gène pour sécréter la toxines)

71
Q

décrie la technique EIA

A

GDH (Ag)= sensible mais non spécifique
toxine=spécifique mais non sensible

72
Q

GDH +
toxine +
conclue que…

A

positif

73
Q

GHD +
toxine -

A

indéterminée (TAAN)

74
Q

GDH -
TOXINES -

A

négatif

75
Q

TAAN détecte quoi?

A

détecte le gène de la toxine et non la toxine
-donc peut être trop sensible?
-risque traiter porteur sains de souches toxinogènes
-de plus en plus de labos utilisent cette méthode
-algorithme diagnostique souvent nécessaire

76
Q

GHD vs EIA (toxine) vs TAAN;
sensibilité

A

TAAN= élevé
GDH= élevé
EIA/toxines= faible/modérée

77
Q

GHD vs EIA (toxine)vs TAAN;
spécificité

A

TAAN=faible-modérée
GDH=faible
EIA/toxines= modéré/élevé

78
Q

GHD vs EIA(toxine) vs TAAN;
substance détectée

A

TAAN=gène de la toxine C diff
GDH=Ag commun pour C diff (toxigénique ou non)
EIA= toxines libres de C diff

79
Q

qu’est-ce que la recherche de pseudomembranes pour c diff?

A

-assez rapide (colonoscope)
-très spécifique (DD très limité)
-peu sensible (plupart des patients n’auront pas de pseudomembranes, associée à des formes plus sévères)

80
Q

quelles autres bactéries peuvent causer la diarrhée?

A

bactéries entéropathogènes;
salmonella
shigella
yersinia enterocolita
e coli
campylobacter

81
Q

quels virus causent diarrhée

A

norovirus (épidémique)
rotavirus (enfant)

82
Q

quel parasite peut causer diarrhée?

A

giardase surtout

83
Q

pratiques de bases pour la prévention des infections

A

hygiènes des mains
hygiène respiratoire
EPI (gants, blousons, protection visage)
utilisation et dispositon adéquate des objets tranchants

84
Q

quand se laver les mains?

A

avant de toucher patient
avant intervention aseptique
après risque de contact avec liquide biologique
après tout contact avec son patient ou son environnement

85
Q

SARM: transmission

A

contact direct et indirect

86
Q

quelle protection pour transmission par contact ?

A

pratiques de base+ gants et jaquettes

87
Q

donner exemples de bactéries qui se transmettent par contact

A

SARM
ERV
C.diff

88
Q

quelle protection pour transmission par goutelettes?

A

2 mètres
masques + protection occulaire (surtout si risque de toux, éclaboussures, projection de goutelettes de sang)
*influenza (se transmet aussi par contact)

89
Q

quelle protection transmission aérienne?

A

plus que 2 mètres
N95
aussi précautions additionnelles contacts (gants et jaquettes)

90
Q

exemple bactéries transmission aérienne?

A

rougeole
covid 19
TB
VZV (Dans les poumons)

91
Q

décrire principe d’une chambre à pression négative

A

-risque de transmission aérienne
-empêche pathogène d’aller infection d’autres personnes à l’étage (filtre HEPA)
**rougeole

une chambre à pression += pour protéger le patient

92
Q

décrire le mécanisme d’action des bêta lactames

A

*structure bactérie;
possède paroi cellulaire avec peptidoglycan
-NAG et NAM de manière alternée

-grâce à PBP, phénomène de transpeptidation soit lier les chaines de peptides (sur les NAM) ensembles
-lien solide (paroi celluliare plus forte)

-penicilline ressemble aux chaines de tri peptides
-PBP se lie par accident aux bêta blactames vu la ressemblance et reste dans PBP pour toujours
-bactérie finit par mourir car PBP deviennent inactif et donc la paroi cellulaire devient de plus en plus faible

93
Q

classe pénicilline

A

bêta lactamines

94
Q

catégorie pénicilline

A

pénicillines

95
Q

voies d’administration pénicilline

A

orale (V)
intraveineuse (G)
intramusculaire (benzathine)

96
Q

spectre pénicillines

A

strep bêta hémo (A,B,C et G)
-strep penumoniae (maj)
-strep groupe viridans (Maj)
-strep anaérobes (maj)
-treponema pallidum (maj)
-bactéries anaérobes de la flore ORL (plusieurs)

97
Q

spectre ampicilline

A

comme pénicilline mais en plus;
enterococcus faecalis
listeria monocytogenes
certains entérobactéries (e.coli, salmonelle, shigella, proteus)
haemophilus influenzae non producteur de bêta lactamase

ne couvre pas;
treponema pallidum

98
Q

quelles bactéries produisent des bêta lactamases (donc résistant bêta lactamine)

A

staph aureus
35% haemophilus influenzae
plupart moraxella catarrhalis
tous les klebsiella pneumoniae
30% des E.coli

99
Q

solutions pour prévenir la résistance aux bêta lactames?

A

-antibiotiques résistant aux bêta lactamases
(cloxacillines, oxacillines, méthicillines, céfazoline)
-inhibiteurs de bêta lactamases (acide clavulanique et tazobactam)

100
Q

mécanisme d’action cloxacillines

A

chaine plus grande qui ne peut rentrer dans les bêta lactamase (donc y résiste)

101
Q

spectre PIPTAZO

A

comme péniclline;
ajout:
-staph aureus non SARM (produit pénicillinase)
-e coli, k pneumoniae, p mirabilis (produisent bêta lactamases)
-plusieurs autres entérobactéries (produisent bêta lactamases)
-haemophilus influenzae (produisent bêta lactamases)
-mortadella catarrhalis (produisent bêta lactamases)
-pseudomonas aeruginosa
-anaérobies (b. fragilis, clostridum sp auters que Cd): (produisent bêta lactamases)

perte:
listeria monocytogenes

102
Q

effets secondaires bêta lactamines

A

allergie (fièvre ou éruption)
néphrite interstitielle
gastro intestinal (diarrhée, nausée, colite C diff)
surinfection candida