CM2-Classification bactéries Flashcards
Quel est la nomenclature des bactéries, mycoses et parasites
➢Genre (commence par une Majuscule)
➢Espèce (commence par une minuscule)
➢Italique ou souligné dans les textes
Comment on nomme les nomme staphylocoques à coagulase négative ?
Staphylococcus spp. species
Qu’est ce qu’une bactérie anaréobie facultative?
croit en présence d’oxygène ou en absence
Qu’est ce qu’une bactérie anaréobie scrite?
Doit absolument être dans un environnement SANS oxygène, sinon elle meurt
Qu’est-ce qu’une bactérie aérobie stricte ?
À besoin d’oxygène pour survivre.
Quels sont les éléments de structure d’une bactérie?
- Paroi cellulaire : différence fondamentale avec nous
- Membrane cytoplasmique
- Chromosome (ADN)
- Ribosomes (synthèse de protéines à partir de l’ARN);
La membrane des gram + est composé de quoi?
1) Principalement composée d’une couche épaisse de peptidoglycan
2) Acide lipoteichoïque ( polysaccharide)
• La paroi cellulaire épaisse des Gram positifs, leurs confère de la résistance et une survie plus facile dans l’environnement
La membrane des gram - est composé de quoi?
- Couche mince de peptidoglycan
- Porines
- Lipopolysaccharides (LPS)
- Protéines
De quelle couleur sont les bactéries gram négatifs et positive à la coloration? Et pourquoi?
gram + : bleu (parce que épaisse couche de peptidoglycan qui retient la coloration bleu)
gram -: rouge
Quel sont les rôles de la coloration de Gram ? (3)
1) Permet de détecter des bactéries dans un échantillon clinique (ex. : expectoration, ponction articulaire, écouvillonnage de conjonctive).
2) Aide à l’identification d’une bactérie présente dans un bouillon d’enrichissement ou une bouteille d’hémoculture.
•3)Aide à l’identification d’une bactérie capable de croître sur des milieux de laboratoire, sur une gélose (ex.: gélose au sang de mouton).
Vrai ou faux : L’absence de bactérie sur une coloration gram signifie que l’échantillon ne contient aucune bactérie
FAUX!
L’absence de bactérie à la coloration de Gram d’un échantillon clinique ne signifie pas que l’échantillon ne contient aucune bactérie . En faible quantité, la coloration de Gram pourrait être négative (absence de bactéries vues à l’examen microscopique ) et la culture bactérienne pourrait montrer la présence de bactéries
•Certaines bactéries ne sont pas visibles à la coloration de Gram 1 (ex. : Treponema palidum, Mycoplasma pneumoniae , Chlamydia trachomatis = LES 2 n’ont pas de paroi cellulaire
Nomme les cocci gram + (en amas, en paires, en chainettes)
Amas: Staphylococcus
En paire: Streptococcus pneunomiae
En chainette: Streptococcus et enterococcus
Nomme les cocci gram négatif
1) Neisseria
• meningitidis
• gonorrhoeae
**Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes
On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses
2) Moraxella catarrhalis
- Cause des infections des voies respiratoires (otite, pneumonie)
Quels sont les 4 classes de bâtonnets gram positif?
1) Sporulés
2) Lettre chinoises
3) Longues et minces
4) Embranchés
Quels sont les batonnêts gram positif sporulés et lettres chinoises? (3)
1) Sporulés:
- Bacillus spp.
- Clostridium spp.
2) Lettre chinoise:
- Corynebacterium spp
Quels sont les batônnets gram positif :
1) longues et minces
2) Embranchés
1) longues et minces
- Listeria monocytogenes
- Lactobacillus spp.
- Erysipelothrix spp.
2) Embranchés
- Nocardias pp.
- Actinomyces spp
Que permet la spore au bactérie gram + ?
Avec quoi les spores sont détruites?
- La spore permet une survie prolongée dans l’environnement.
* Les spores sont détruites par la stérilisation, l’eau de javel et le peroxyde d’hydrogène
Quels sont les bactéries clostrodium? Et elles sont responsables de quoi? (5)
Clostridium difficile: Colite (diarrhée)
Clostridium perfringens: Gangrène gazeuse
Clostridium botulinum : Botulisme : empêche les muscles de se contracter
Clostridium tetani : Tétanos : cause la contraction des muscles
Clostridium spp. : Flore normale du colon
Nomme les types de bacillus et leur causes de maladies (3)
Bacillus anthracis :Agent de l’anthrax
Bacillus cereus :Intoxication alimentaire (dans le riz)
Bacillus spp. :Flore normale de la peau
Les entérobactéries font partie de quelle classe de gram ? (cocci, bâtonnets)
Bâtonnets gram néagtif
Nomme les 7 entérobactéries
1) Escherichia coli
2) Klebsiella pneumoniae
3) Proteus mirabilis
4) Salmonella spp.
5) Shigellas pp.
6) Yersinia enterocolitica
7) Enterobacter spp.
Outre les entérobactéries, nomme les 7 autres bâtonnets gram négatif
1)Haemophilus influenzae
2)Pseudomonas aeruginosa (atteint ceux avec la fibrose kystique)
3)Campylobacter spp. (1ère cause de diarhée bactérienne)
4)Vibriocholerae
5)Pasteurella multocida
6)Bordetella pertusis : coqueluche
7)Bacteroides fragilis
• Bactérie anaréobie stricte
Quels sont les 3 bactéries anaréobies strictes?
Clostridium spp.
Bacteroides fragilis
Streptococcus anaerobius
Rappel: Les bactéries anaérobies strictes sont tuées par l’oxygène. Il faut les mettre dans un lieu où l’on aura remplacé l’oxygène par de l’azote pour leur croissance.
Nomme les 6 bactéries Anaérobies facultatives
Entérobactéries Bacillus anthracis Streptocoques β-hémolytiques (groupe A, B, C, G) Streptococcus viridans Enterococcus spp. Staphylococcus spp
Rappel: Les bactéries anaérobies facultatives peuvent croître en présence ou en l’absence d’oxygène
Qu’est-ce qui est compris dans les pratiques de bases dans la prévention et le contrôle des infections?
- Hygiène des mains
- Hygiène respiratoire
- Équipement de protection individuel (EPI) lors de situations particulières
- Utilisation des objets tranchants :
À quel moment on doit faire l’hygiène des mains? Avec quoi?
- Avant de toucher au patient
- Avant une intervention aseptique
- Après un risque de contact avec un liquide biologique
- Après tout contact avec un patient ou son environnement
• La plupart du temps: Solutions hydroalcooliques ou eau/savon
Dans une précaution de contact, qu’est-ce qu’on doit mettre?
Nomme des bactéries qui pour la précaution de contact
- En plus des pratiques de base, On ajoute
- Gants
- Jaquettes
Exemple de bactérie pour contact : •SARM •ERV •Clostridium difficile •Gastro entérites
Dans une précautions par gouttelettes (respiratoires), qu’elle pratique doit être mise en place?
Nomme des exemples d’agents transmis par goutelette
- Gouttelettes >5 microns (1 mètre)
- Ajout d’un masque de procédure + protection oculaire
- Chambre individuelle
Exemple: •Covid 19 •Infections invasives à Streptococcus pyogenes •Influenza/autres virus respiratoires •Méningite
Quels ont les précautions arériennes?
Nomme des exemples
- Particules < 5 microns
- Chambre à pression négative
- Chambre individuelle avec salle de bain
- Masque N 95
Exemples •COVID 19? •Tuberculose •VZV •Rougeole •MRSI (maladie respiratoire sévère infectieuse)
Qu’elle est le but des hémocultures?
But : rechercher la présence de bactéries (parfois de levures) dans la circulation sanguine
Quelles sont les indications d’une prescription d’hémoculture?
Patient qui présente de la fièvre avec signes d’atteinte systémique sévères
•Atteinte de l’état général
•Frissons solennels
•Tension artérielle basse
- Lorsque certains diagnostics graves sont évoqués:
- Méningite
- Endocardite
- Infection rénale
- Pneumonie avec dyspnée
- Tableau de fièvre chez la femme enceinte (pour trouver listeria)
- Tableau de fièvre chez un hôte immuno-supprimé (cancer, VIH +, greffé)
- Tableau de fièvre ou hypothermie chez la personne âgée
Pourquoi prélever 2 hémocultures i.e. 40 ml de sang? *examen
La probabilité de trouver la bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé.
• Plus le volume est grand, plus la probabilité est haute
• Risque « coût bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL
o 2e hémoculture : sensibilité de 90-95%
o 3e hémoculture : sensibilité de 98%
Quel est le facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si elles sont présentes
o Le volume de sang prélevé!!
Quand prescrire plus que 2 hémocultures (>40 mL de sang)?
Si elle sont négative, on doit en refaire combien ?
Endocardite subaiguë (germe en général peu virulent, patient non instable):
• Obtenir 3 hémocultures en 30 –60 minutes
•Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après 24 heures
Pourquoi prélever en 2 temps les hémocultures?
1) Évaluer la contamination cutanée :
•Parce que si l’étape de nettoyage de la peau n’a pas été bien réalisée ou si le prélèvement a été difficile à faire, le risque de contamination du sang par des bactéries de la peau est grand.
•En conséquence, l’isolement d’une bactérie peu pathogène et reconnue comme colonisant la peau dans une seule hémoculture sera interprété par le MD comme un contaminant.
2) Évaluer le caractère continu de la bactériémie
•Si S. aureus dans une seule hémoculture sur deux (bien prélevées), bactériémie continue peu probable
•Si S. aureus dans deux hémocultures sur deux, bactériémie continue plus probable
•Plus de délai entre les deux HC est grand, plus la probabilité de bactériémie continue est grande.
Est- ce important de savoir quelle(s) bouteille(s) est(sont)+?
Pas vraiment
- Un S. epidermidis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture n’est pas plus significatif que s’il était retrouvé dans une seule bouteille (contaminant probable)
- Même si on trouve un BGN seulement dans la bouteille anaérobie, probabilité demeure élevée que ça sera une bactérie aérobie.
Quels sont les pathogènes colonisant la peau? (3)
- Staphylococcus à coagulase négative
- Corynebactérium sp.
- Bacillus sp
Que signifie si l’hémoculture est positive 2/2?
• Si le même germe est isolé dans les deux hémocultures prélevées à 20 minutes d’intervalle , il s’agit probablement d’une bactériémie
•Si le germe est isolé dans une hémoculture sur deux ET que le germe est un représentant de la flore normale de la peau , ça veut dire quoi?
il s’agit probablement d’un contaminant.
3) Après combien d’heures d’incubation , l’appareil a t il détecté la croissance bactérienne?
•En présence d’une bactériémie , la majorité des hémocultures seront positives en moins de 24 heures
Quels sont les Agents infectieux significatifs qui pourraient croitre après 24 heures :
1) Bactéries anaérobies
2) les levures
3) certaines bactéries aérobies fastidieuses (ex.: HACEK).
Quels sont les pathogènes fréquents dans les hémocultures?
- Staphylococcus aureus
- Pneumocoque
- Entérocoque
- Streptococcus pyogenes(groupeA)
- E. coli
- Pseudomonas aeruginosa
- Candida
•Les infections de cathéter (veineux ou artériel ) peuvent être attribuables à quoi?
à des bactéries de la flore normale de la peau
Dans quel cas on devrait évoquer une infection de cathéter vasculaire?
•La présence de 2/2 hémocultures positives à un germe de la flore normale de la peau staphylocoque à coagulase négative , Corynebacterium sp , Bacillus sp.) devrait évoquer une infection de cathéter vasculaire
Qu’est qu’une bactériémie communautaire?
- Est attribuable à une infection acquise dans la communauté
- Ex. : Patient sans antécédents médicaux , admis il y a 48 heures pour une pneumonie au lobe inférieur droit. Les hémocultures prélevées à l’arrivée à l’hôpital montrent la présence de Streptococcus pneumoniae
Qu’est-qu’une bactériémie nocosomiale? (2 critères)
•Elle survient plus de 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
ET
•Elle est attribuable à une condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital
• Ex.: Accidenté de la route intubé aux soins intensifs depuis 5 jours qui développe une pneumonie du lobe inférieur droit. Les hémocultures et les sécrétions trachéales prélevées il y a 48 heures montrent du Staphylococcus aureus
Diagnostic de diarrhée à Clostridioides difficile, se fait sur quel type de selle? Et il est basé sur la recherche de quoi?
- Selles non formées
* Basée sur la recherche de toxines
Quels sont les 3 techniques possibles FACILEMENT disponibles pour diagnostic de diarrhée à Clostridioides difficile ?
- Test rapide EIA
- Recherche de toxine sur culture cellulaire
- Recherche de toxine par TAAN
La recherche de toxine sur culture cellulaire est plus sensible ou moins sensible que EIA? Elle est disponible en combien de temps?
a. Plus sensible que le test rapide EIA
b. Résultat final après 24 heures
La recherche de toxine par TAAN pour le C difficile, est plus moins sensible que EIA?
Quels est sont risques à cause de sa sensibilité?
a. TAAN plus sensible que culture cellulaire et que test rapide EIA
b. Trop sensible?
c. Risque de traiter des porteurs sains de souches toxinogènes
d. De plus en plus de laboratoires utilisent cette méthode
Pourquoi la culture toxigénique de C. difficile est peu utiliser au QC?
o •Gélose CCFA
o •Besoin de plusieurs jours
o •Besoin d’identifier la bactérie
o Besoin de faire une culture cellulaire pour prouver que la souche produit de la toxine.
o DONC, long, coûteux et peu utiliser hors de la recherche
La recherche de pseudomenbranes pour le C, difficile, est
- Rapide/ lent?
- Peu spécifique ou très spécifique?
- Peu sensible ou très sensible?
1)Examen assez rapide
o Le gastro entérologue va voir avec un colonoscope
2)Examen très spécifique
oLe diagnostic différentiel est très limité
3) Examen peu sensible
• La plupart des patients n’auront PAS de pseudomembranes
• Associé à formes plus sévères
Quels sont les 3 classes d’agents infectieux qui peuvent donner la diarrhée?
1) Bactéries entéropathogènes
2) Virus
3) Protozoaires
Quels sont les Bactéries entéropathogènes qui donnent la diarrhée ? (5)
- Salmonella
- Shigella
- Yersinia enterocolitica
- E. coli
- Campylobacter
Quels sont les virus et les protozoaires qui donnent la diarrhée ? (3)
1)Virus
•Norovirus (diarrhée épidémique)
•Rotavirus (enfants surtout)
2) Parasites
- Au Québec, giardiase surtout
Comment expliquer inflammation avec culture d’urine négative?
- Culture faite après le début des antibiotiques
- L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, la prostate?)
- L’inflammation est causée par un microorganisme non cultivable
Quels sont les principaux agents responsable des infections urinaires?
- E. coli : majorité des causes!!
- Proteus mirabilis
- Klebsiella pneumoniae
- Enterocococcus spp.
- Staphylococcus saprophyticus
- Pseudomonas aeruginosa
Quels bactéries ne sont pas visibles au gram?
- Treponema palidum,
- Mycoplasma pneumoniae
- Chlamydia trachomatis
= LES 2 derniers n’ont pas de paroi cellulaire
Concernant la pénicilline, quelle est sa classe? Ses voies d’administration?
•Classe : β-lactamines
Voies d’administration :
• Orale (V)
• Intraveineuse (G)
• Intramusculaire (benzathine
Quelle est le spectre des Pénicillines? (6 groupes)
1) Streptocoques β hémolytiques
- Tous : A, B, C et G
2) Streptococcus pneumoniae : La majorité
3) Streptococcus groupe viridans : La majorité
4) Streptococcus anaérobies : La majorité
5) Treponema pallidum: Tous
6) Bactéries anaérobies de la flore ORL : Plusieurs
Quelle est le spectre des ampicilline (sous classe des pénicillines)?
Nomme les ajouts et les retrait par rapport à la pénicillines
Ajouts
1) Enterococcus faecalis
2) Listeria monocytogenes
3) Certaines entérobactéries ( E. coli , Salmonella spp ., Shigella spp . Proteus, mirabilis
4) Haemophilus influenzae non producteur de B lactamase
Retrait:
-Treponema pallidum
Quels sont les bactéries productrices de ß-lactamases?
- Staphylococcus aureus (non SARM)
- Environ 35% des Haemophilus influenzae
- La plupart des Moraxella catarrhalis
- Tous les Klebsiella pneumoniae
- Environ 30% des E. coli
Quels sont les antibiotiques qui résistent aux ß lactamases
- Cloxacilline / méthicilline
* Céfazoline
Quels sont les inhibiteurs de ß lactamases?
- Acide clavulanique
* Tazobactam
La cloxacilline fait partie de quelle classe?
Péniciline résistante à la pénicillinase
La cloxacilline est donné pour quelles bactéries?
•Staphylococcus aureus
Staphylococcus spp. sensibles à la méthicilline
•Streptococcus sensible à la pénicilline
•Cocci Gram positif anaérobie
La céfazoline est donné pour quelles bactéries?
- Streptococcus ß-hémolytiques (tous)
- Streptococcus viridans (majorité)
- Staphylococcus aureus (excluant SARM)
- Quelques entérobactéries (ex. : E. coli, Proteus, Klebsiella)
Quels bactéries cibles le Pipéracilline/ tazobactam? Ajouts et perte
Comme l’amoxicilline/ ampiciline
Ajouts
-Staphylococcus aureus (Non SARM): Produit pénicillinase
- E. coli , K. pneumoniae , P. mirabilis : Produisent ß lactamases
- Haemophilus influenzae : Produisent ß lactamases
- Moraxella catarrhalis
- Pseudomonas aeruginosa
-Anaérobies ( B. fragilis , Clostridium sp . autres que Cd.): Produisent
ß lactamases
Perte: *Perte du Listeria monocytogenes
Quels sont les effets secondaires des B-lactamase
Effets secondaires •Allergie (fièvre et/ou éruption) •Néphrite interstitielle •Gastro intestinal (diarrhée, nausée, colite à Cd) •Surinfection à Candida
Quel antibiotiques ont donne pour le SARM?
Vancomycine
Quelle est la classe et la voie d’adminsitration de la vancomycine?
- Classe : Glycopeptide
- Voies d’administration :
- •Intraveineuse (pour les infections autres que Cd)
- •Orale (pour le traitement de la diarrhée à Cd)
Quel est le spectre de la vancomycine?
Staphylococcus aureus: Incluant le SARM Staphylocoques à coagulase négative: Incluant les souches résistantes à la méthicilline Streptocoques Entérocoques: Sauf ERV Bâtonnets Gram positif (incluant le Cd)
DONC couvre les gram positif seulement!!!
Nomme les effets secondaires de la vancomycine IV
1)Réaction liée à la perfusion : red man syndrome
2) Néphrotoxicité :
o donne des Insuffisance rénale, on doit l’ajuster en insuffisance rénale!
o Antibiotique qu’on dose, avant la 4e dose.
3)Leucopénie