Classification et taxonomie Flashcards
Définition de taxonomie
Science de la classification des formes de vie
Sur quoi se base la taxonomie?
sur les caractéristiques communes partagées entre les organismes pour les regrouper en taxons
À quoi sert la classification?
- Regrouper les organismes qui sont similaires
- Identifier les organismes déjà classés
- Établir des critères d’identification de nouvelles espèces est les nommer
- Obtenir des infos sur la proximité évolutive des organismes
Qu’est-ce que la systématique?
Étude de la diversité via le classement des taxons
comment la phylogénie est-elle organisée?
Classe les taxons en hiérarchie démontrant leur parenté évolutive (arbre)
Qui est le père de la taxonomie?
Carl Von Linné
Qui a eu l’idée de l’arbre phylogénique?
Ernst Haeckel
Quel système suggère les domaines (supérieurs aux règnes)?
Le système de Woese (1990)
Qu’est-ce que Woese a étudié?
Les archées
Quelles sont les observations de Woese?
- Les eucaryotes sont évolutivement éloignés des procaryotes
- Les archées sont plus près évolutivement des eucaryotes
Quels sont les 3 domaines venant du système de Woese?
- Bactérie
- Archée
- Eucaryote
Sur quoi s’est basés les recherches de Woese?
Sur l’ARN ribosomal
Qu’est-ce que l’ARN?
Copie d’un segment d’ADN
Quels sont les 3 types d’ARN?
- Ribosomal
- Messager
- Transfert
Pourquoi l’ARN ribosomal est-il idéal pour comparer et classifier les organismes?
- très conservé
- petit et facile à séquencer
Définition d’espèce virale
Population de virus présentant des caractéristiques similaires et ayant une niche écologique spécifique
Que stipule la théorie de l’évolution endosymbiotique?
Hypothèse que les êtres vivants descendent d’un ancêtre commun il y des milliards d’années
Nommez deux exemples qui confirme la théorie de l’évolution par endosymbiose
- Mitochondries et chloroplastes ont la même taille que les bactéries
- Ils ont des ribosomes 70s (vs 80s chez les eucaryotes)
Hiérarchie taxinomique - Définition de genre
Composé d’espèces génétiquement apparentées, mais qui présentent des différences
Hiérarchie taxinomique - Définition d’espèce eucaryote
Ensemble d’organismes étroitement apparentés et pouvant produire des descendants fertiles
Hiérarchie taxinomique - Définition d’espèce procaryote
Population de cellules bactériennes ayant des caractéristiques semblables
Comment pouvons-nous classifier des procaryotes?
- Distinction entre les espèces procaryotes
- Distinction entre les membres d’une espèce procaryote
- Nomenclature des souches
Quelles sont les règles de la nomenclature scientifique?
Chaque organisme possède un nom latin unique
- genre et espèce
- nomenclature binomiale
- Genre: prend toujours une majuscule
- Espèce: toujours en minuscule
- Écrit en italique ou soulignée
Possibilité d’abréger le genre par sa première lettre s’il a été écrit au moins une fois au complet
Quelles sont les 2 méthodes de classification et d’identification?
- Méthodes traditionnelles
- Méthodes moléculaires
Quelles sont les 6 types d’épreuves de la méthode traditionnelle?
- Caractères morphologiques
- Caractères tinctoriaux
- Épreuves biochimiques
- Épreuves sérologiques
- Lysotopie
- Combinaison d’épreuves pour identifier
Qu’est-ce que la méthode des caractères morphologiques?
Étude non formelle de bactérie individuelle d’une culture pure avec microscope (forme, taille structure)
Qu’est-ce que la méthode des caractères tinctoriaux?
Utilisation de colorants pour faire ressortir des particularités
Quels sont des exemples de coloration pour la méthode des caractères tinctoriaux?
Coloration différentielle
- de Gram
- acido-alcoolo-résistante
Les résultats de la méthode de caractères tinctoriaux dépendent de quoi?
Les résultats seront en fonction de la composition chimique de la paroi
Qu’est-ce que la méthode des épreuves biochimiques?
Tests faisant ressortir la présence d’enzymes spécifiques (rapidement)
Qu’est-ce que la méthode des épreuves sérologiques?
Étude du sérum sanguin et des réponses immunitaires (présence d’anticorps, identifie antigène (capsule, flagelle)
En quoi permet la méthode des épreuves sérologiques?
Identifier les souches (ex: par test d’agglutination sur lames)
Qu’est-ce que la méthode de lysotopie?
Analyse des bactériophages (virus de bactérie) (très spécifiques, souche bactérie)
Dans quel domaine scientifique la méthode de lysotopie est-elle particulièrement utile?
L’épidémologie
Quelles sont les 2 types d’épreuves de la méthode moléculaire?
- Composition des bases de l’ADN
- Séquençage de l’ARN ribosomal
Qu’est-ce que la méthode de la composition des bases de l’ADN?
Évaluation de la teneur en G+C de l’ADN
- non interprétée seule
Quels sont les avantages d’utilisé l’ARN ribosomal dans la méthode de séquençage de l’ARN ribosomal?
- Présent dans toutes les cellules de microorganismes
- Peu de variation temporelle
- On peut analyser sans faire croître les microorganismes
Quelle est LA référence pour la classification des bactéries?
Bergey’s Manuel of Systematic Bacteriology
