Classification des bactéries Flashcards
Quels sont les 4 grandes classes de microorganismes?
- Bactéries
- Virus
- Mycoses (champignons)
- Parasites
Que signie spp.?
Species
Quel est le staphylocoque coagulase positive?
Staphylococcus aureus
Quelles sont les 3 morphologies (formes) de bactéries?
- Cocci
- Bâtonnet
- Spiralée
Quelle structure d’une bactérie se distingue d’une cellule humaine?
Paroi cellulaire/bactérienne
Quelle est la différence entre la paroi cellulaire entre les bactéries gram + et - ?
Gram + : grosse couche de peptidoglycane
Gram - : Mince couche de peptidoglycane entouré d’espaces périplasmique + membrane externe
Image à diapo 14 du cours 1
Vrai ou faux. Les gram - sont plus résistants et survivent plus facilement dans l’environnement à cause du membrane externe.
Faux, les gram + à cause de la paroi cellulaire épaisse
Que contient la paroi cellulaire des gram +?
- Peptidoglycan ++++
- Acide lipoteichoïque (polysaccharides)
Que contient la paroi cellulaire des gram - ?
- Couche mince de peptidoglycan
- Porines
- Lipopolysaccharides (LPS)
- Protéines
À la coloration de gram, on voit quelle couleur pour les gram +? Gram -?
Gram + : bleu/violet
Gram - : rouge/rose
On peut utiliser la coloration de Gram dans quels types d’échantillon (3)?
- Échantillon clinique (ex : expectoration, ponction articulaire, écouvillonnage de conjonctive)
- Bouillon ou bouteille d’hémoculture
- Colonie sur gélose
Quels sont les étapes pour la méthode de coloration de gram (8)?
- Déposer l’échantillon sur lame de microscope
- Laisser sécher
- Fixer à la chaleur (permet de coller spécimen sur lame)
- Recouvrir la lame de plusieurs gouttes de VIOLET DE CRISTAL pendant 30-60 secondes. Rincer à l’eau courante
- Recouvrir lame de plusieurs gouttes de LUGOL (iode) pendant 30-60 secondes. Formation de complexe violet de cristal-iode dans bactérie. Rincer à l’eau courante
- Décolorer la lame avec gouttes d’ACÉTONE-ALCOOL pendant 1-5 secondes. Rincer à l’eau courante
- Contre-coloration avec gouttes de SAFRANINE
- Examen microscopique à immersion i.e. 1000X
À quoi sert l’alcool-acétone dans la coloration de gram?
Retire violet de crystal de la paroi bactérienne des gram - alors que gram + retient violet de crystal
À quoi sert la safranine?
Donner la couleur rouge/rose aux gram -
Quelles sont les limitations de la coloration de gram?
- En faible quantité, la coloration de Gram pourrait être négative (absences de bactéries vues à exam microscopique)
- Certaines bactéries ne sont pas visibles à la coloration de gram
Donner des exemples de bactéries non visibles à la coloration de gram.
- Mycoplasma pneumoniae
- Chlamydia trachomatis
- Treponema palidum
Nommer les trois grandes familles de cocci gram +
- Staphylococcus
- Strptococcus
- Enterococcus
Quels cocci gram + sont en amas?
Staphylococcus (mnémotechnique : staff = amas)
Quel cocci gram + est en paires?
Streptococcus pneumoniae (trick : strep. pneumo = 2 car 2 poumons)
Quels cocci gram + sont en chainettes?
Streptococcus + Enterococcus
Vrai ou faux. La coloration de gram permet d’orienter vers le genre et l’espèce.
Faux. ne permet pas d’établir l’espèce (voir image diapo 28)
Nommer des cocci gram -
- Neisseria meningitidis, gonorrhoeae, spp.
- Moraxella catarrhalis
Vrai ou faux. Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes.
Vrai. On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses
Quelles sont les différentes morphologies des bâtonnets gram + (4)? Donner des exemples de bactéries pour chaque morphologie
- Sporulés : Bacillus spp., Clostridium spp.
- Lettres chinoises : Corynebacterium spp.
- Longs et minces : Listeria monocytogenes, Lactobacillus spp., Erysipelothrix spp.
- Embranchés : Nocardia spp., Actinomyces spp.
Que permet la spore?
Survie prolongée dans environnement
Quels sont les agents qui peuvent détruire les spores (3)?
- Stérilisation
- Eau de javel
- Peroxyde d’hydrogène
Vrai ou faux. On peut retrouver des Clostridium spp. dans la flore intestinale du côlon.
Vrai
Que cause le Clostridium difficile?
Colite (diarrhée)
Que cause le Clostridium perfringens?
Gangrène gazeuse
Que cause le Clostridium botulinum?
Botulisme : empêche muscles de se contracter
Que cause le Clostridium tetani?
Tétanos
Dans quelle flore normale peut-t-on retrouver des Bacillus spp.?
Peau
Quel bâtonnets gram + est un agent de bioterrorisme?
Bacillus anthracis : agent de l’anthrax
Que cause le Bacillus cereus?
Intoxication alimentaire
Les entérobactéries sont des cocci ou bâtonnets? Gram + ou -?
Bâtonnets gram -
Nommer des bâtonnets gram - (autres que les entérobactéries)
- Haemophilus influenzae
- Pseudomonas aeruginosa
- Campylobacter spp.
- Vibrio cholerae
- Pasteurella multocida
- Bordetella pertusis
- Bacteroides fragilis
Nommer des entérobactéries
- Escherichia coli
- Klebsiella pnemoniae
- Proteus mirabilis
- Salmonella spp.
- Shigella spp.
- Yersinia enterocolitica
- Enterobacter spp.
Vrai ou faux. Les Bacteroides fragilis est une bactérie anaérobie facultative.
Faux, anaérobie stricte
Quelle bactérie est la cause #1 de la diarrhée bactérienne au Québec?
Campylobacter spp.
Pour permettre la survie des bactéries anaérobie stricte, il faut remplacer l’oxygène par quoi?
Azote
Nommer 3 exemples de bactéries anaérobies strictes.
Clostridium spp.
Bacteroides fragilis
Streptococcus anaerobius
Quand doit-on pratiquer l’hygiène des mains?
- Avant de toucher au patient
- Avant une intervention aseptique
- Après un risque de contact avec liquide biologique
- Après tout contact avec un patient ou son environnement
Quelles sont les précautions à prendre lors d’un isolement de contact?
En plus des pratiques de base, ajouter gants + jacquettes
Nommer des exemples d’isolement de contact
- SARM
- ERV
- Clostridium difficile
- Gastro-entérites
Quelles sont les précautions respiratoires (gouttelettes)?
Gants, jaquettes, masque de procédure, protection oculaire, chambre individuelle
Vrai ou faux. Les gouttelettes sont >5 microns (2 mètre)
Faux. 1 mètre
Donner des exemples de précautions respiratoires
- COVID-19?
- Infections invasives à Streptococcus pyogenes
- Influenza/autres virus respiratoires
- Méningite
Quelles sont les précautions aériennes (aérosols)?
Chambre individuelle à pression négative avec salle de bain, Masque N-95 + EPI gouttelettes
Donner des exemples de précautions aériennes
- COVID-19?
- Tuberculose
- VZV
- Rougeole
- MRSI (maladie respiratoire sévère infectieuse)
Que signifie une chambre à pression négative?
Pression de la chambre > Pression corridor, donc air passe du corridor vers la chambre
Quand le médecin doit-il prescrire des hémocultures?
- Patient qui présente de la fièvre avec signes d’atteinte systémique sévères (atteinte de l’état général, frissons solennels, TA basse)
- Diagnostics graves évoqués
- Fièvre chez femme enceinte
- Fièvre chez immunosupprimé (cancer, VIH, greffé)
- Fièvre ou hypothermie chez personne âgée
Quels sont les diagnostics graves évoqués qui nécessitent une hémoculture?
- Méningite
- Endocardite
- Infection rénale
- Pneumonie avec dyspnée
Quels sont les étapes d’un prélèvement d’hémoculture?
- Se laver les mains
- Nettoyer peau du patient avec ALCOOL
- Nettoyer bouchons des 2 bouteilles d’hémoculture
- Mettre garrot
- Mettre gant
- Désinfecter peau du patient avec CHLORHEXIDINE
- Ponctionner la veine
- Déposer environ 10 mL de sang dans bouteille aérobie et 10 mL dans anaérobie
- Retirer garrot, puis aiguille
- Enlever gants
- Laver les mains
En général, le médecin prescrit combien d’hémocultures? L’infirmière prélève combien de bouteilles?
2 hémocultures, 4 bouteilles
Combien de temps plus tard après le prélèvement #1 passe-t-on au prélèvement #2?
15 à 20 mins plus tard
Pourquoi prélever 2 hémocultures i.e. 40 mL de sang?
Plus le volume est grand, plus la probabilité de trouver la bactérie dans le sang est haute + risque coût-bénéfice moins intéressant après 40 mL
Quand doit-on prescrire plus que 2 hémocultures (>40 mL de sang)? Combien doit-on prescrire?
Endocardite subaiguë (germe en général peu virulent, patient non stable)
3 hémocultures en 30-60 minutes et 2 autres si la première série est négative après 24h
Pourquoi est-il important de prélever en 2 temps?
- Évaluer la contamination cutanée
- Évaluer le caractère continu de la bactériémie
Vrai ou faux. Le Staphylococcus epidermis est un contaminant cutané.
Vrai
Vrai ou faux. Le Streptococcus pyogenes est un contaminant cutané.
Faux
Pourquoi dans une hémoculture on sépare les bouteilles en aérobie et anaérobie?
Meilleur recouvrement des bactéries
Vrai ou faux. Certaines bactéries aérobies croissent mieux dans les bouteilles anaérobies.
vrai
Comment traite-t-on les hémocultures au laboratoire?
Dépôt dans appareil à 37 degré qui brasse les bouteilles en continue
Appareil détecte croissance bactérienne grâce aux métabolites générés par bactéries
Coloration de Gram sur liquide de bouteille d’hémoculture + et ensemence des géloses pour identifier bactéries et procéder à antibiogramme
Vrai ou faux. Il est important de savoir quelles bouteilles sont +?
Faux.
Vrai ou faux. Généralement après 24h, lorsque la bouteille d’hémoculture devient +, il s’agit d’un contaminant ou d’une bactérie non pathogène.
Vrai, sauf pour bactéries anaérobies, levures, certaines bactéries aérobies fastidieuses (ex : HACEK)
Quels sont les indices qui permettent une bonne interprétation des résultats d’hémoculture?
- Bactérie rapportée = pathogène ou colonisant de la peau?
- Nombre d’hémoculture + (1/2 ou 2/2)
- Après combien d’heures d’incubation, l’appareil a-t-il détecté la croissance bactérienne?
- Lien entre site d’infection et germe identifié = plausible?
Combien de temps doit-on incuber les bouteilles d’hémoculture avant de conclure qu’elles sont négatives?
5 jours
Vrai ou faux. Les bactéries de la flore normale de la peau ne peuvent pas infecter les cathéter.
Faux. Infections de cathéter peuvent être attribuables à bactéries de la flore normale de la peau
Quelles sont les conditions pour caractériser une bactériémie de nosocomiale?
- Survient + de 48h après arrivée à l’hôpital
- Attribuable à une condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital
Combien coûte une hémoculture?
15,20$ par série (1 bouteille aérobie + anaérobie)
Comment diagnostique-t-on la diarrhée à Clostridioides difficile?
- Selles non formées
- Basées sur la recherche de toxines
Quelles sont les 3 techniques possibles facilement disponibles pour le diagnostic de C. difficile? La technique peu utilisée au Québec?
- Test rapide EIA
- Recherche de toxine sur culture cellulaire
- Recherche de toxine par TAAN
-Culture toxigénique de C. difficile
Quels sont les 2 agents recherchés dans la technique EIA?
Ag GDH et toxine
Si dans les résultats d’EIA, l’Ag GDH est + et toxine est -, que doit-on faire?
Recherche toxine par culture cellulaire
Vrai ou faux. TAAN est plus sensible que culture cellulaire et teste rapide EIA pour la recherche de toxines de C. difficile.
Vrai
Quel est le risque de recherche de toxines de C. difficile par TAAN?
Traiter des porteurs sains de souches toxinogènes (huh)
Vrai ou faux. La recherche de pseudomembranes (C. difficile) est spécifique et sensible.
Faux. Très spécifique (diagnostic différentiel très limité), mais peu sensible (la plupart des patients n’auront pas de pseudomembranes)
Pseudomembranes ass. à formes plus sévères de C. difficile
Quels sont les agents autres infectieux pouvant causer la diarrhée?
- Bactéries entéropathogènes (Salmonella, Shingella, Yersinia enterocolitica, E. coli, Campylobacter)
- Virus : norovirus, rotavirus
- Parasites : giardiase
Quels sont les questions à poser pour le diagnostic d’une diarrhée?
- Voyage?
- Poulet mal cuit?
- Contact avec animaux sang froid?
- Consommation de viande crue?
- Hamburger saignant?
Quels sont les 2 types d’examen de laboratoire pouvant être réalisés avec les urines?
- Analyse d’urine
- Culture d’urine
Quelle est la différence entre le prélèvement pour la culture d’urine et gono/chlamydia?
Culture d’urine : mi-jet
Gono/chlamydia : début de jet
Vrai ou faux. L’urètre distale est stérile comme l’urine
Faux, urètre distale n’est pas stérile
Comment faire la différence entre la colonie qui proviennent de l’urètre et cellules qui proviennent de la vessie?
Vessie : mi-jet et culture quantitative (>10^8 UFC/L)
Quels sont les 2 types de gélose utilisés pour la culture d’urine et la température à laquelle on doit les incuber?
Gélose au sang et gélose MacConkey
37 degré
Pourquoi dit-on que la gélose MacConkey est différentielle et sélective?
Différentielle : bactérie qui fermente (lactose +) = rose alors que lactose - = transparent
Sélective : ne laisse pas pousser les gram +
Vrai ou faux. Il faut plus de 100 colonies sur les géloses pour confirmer la présence de bactérie dans une culture d’urine
Vrai
Combien de temps doit-on attendre pour la réponse de l’antibiogramme?
48-72h
Comment peut-on expliquer une inflammation avec une culture d’urine négative (3)?
- Culture faite après début des ATB
- Inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, prostate?)
- Inflammation est causée par microorganisme non cultivable
Quels sont les principaux agents responsables des infections urinaires (6)?
- Escherichia coli +++
- Proteus mirabilis
- Klebsiella pneumoniae
- Enterococcus spp.
- Staphylococcus saprophyticus
- Pseudomonas aeroginosa
Quels sont les symptômes d’infection urinaire basse?
- Brûles mictionnels
- Hématurie macroscopique
- Urgence mictionnelle
Quels sont les symptômes d’une infection urinaire haute?
- Brûles mictionnels
- Hématurie macroscopique
- Urgence mictionnelle
- Douleur loge lombaire
- Fièvre
- Leucocytose
Quel est le mécanisme d’action des béta-lactames?
Empêcher la synthèse de peptidoglycans en bloquant le PBP (penicilline binding protein)
Quels est le spectre de la pénicilline?
- Streptocoques béta-hémolytiques
- Streptococcus pneumoniae
- Streptococcus groupe viridans
- Streptococcus anaérobies
- Treponema pallidum
- Bactéries anaérobies de la flore ORL
Quels sont les ajouts et les retraits de l’ampicilline à comparer de la pénicilline au niveau de son spectre?
Ajout : enterococcus faecalis, Listeria monocytogenes, Certaines entérobactéries (E. coli, Salmonelle, Shigella, Proteus mirabilis), Haemophilus influenzae non producteur de béta-lactamase
Retrait : Treponema pallidum
Nommer des bactéries productrices de béta-lactamases
Staphylococcus aureus Environ 35% des Haemophilus influenzae Plupart des Moraxella catarrhalis Tous les Klebsiella pneumoniae Environ 30% des E. coli
Quelles sont les 2 solutions aux bactéries producteurs de béta-lactamases?
- Antibiotiques résistant aux béta-lactamases
- Inhibiteurs de béta-lactamases
Donner des exemples d’antibiotiques résistant aux béta-lactamases.
Cloxacilline/oxacilline/méthicilline
Céfazoline
Donner des exemples d’antibiotiques inhibiteurs de béta-lactamases.
Acide clavulanique
Tazobactam
Quel est le spectre de la cloxacilline?
- Staphylococcus aureus et autres Staph. spp. sensibles à la méthicilline
- Streptococcus sensible à la pénicilline
- Cocci gram + anaérobies
Quel est le spectre de la céfazoline?
- Streptococcus béta-hémolytiques
- Streptococcus viridans
- Staphylococcus aureus
- Quelques entérobactéries
Quel est le spectre de la pipéraciline/tazobactam (pip-tazo)?
Comme amoxiciline mais
+ : Staphylococcus aureus, +++ (E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis), plusieurs autes entérobactéries, +++ Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, Pseudomonas aeruginosa, Anaérobies (B. fragilis, Clostridium sp. autres que Cd.)
- : Perte de Listeria monocytogenes
Quelles sont les effets secondaires des béta-lactamines?
- Allergie (fièvre et/ou éruption)
- Néphrite interstitielle
- Gastro-intestinal (diarrhée, nausée, colite à C. difficile)
- Surinfection à Candida (vaginose)
Quel est le mécanisme des SARM pour résister contre béta-lactame?
Changement de conformation de PBP qui ne concorde pas avec les béta-lactames
Quelle est la classe de la vancomycine?
Glycopeptide
Quelle est la classe de la vancomycine?
Glycopeptide
Quelle est la classe de la vancomycine?
Glycopeptide
Quelle sont les 2 voies d’administration pour la vancomycine? Laquelle permet de traiter la diarrhée à C. difficile?
IV : pour infections autres que C. difficile
Orale : diarrhée à C. difficile
Quel est le spectre de la vancomycine?
- Staphylococcus aureus (incluant SARM)
- Staph. à coagulase - (incluant soucher RM)
- Streptocoques
- Entérocoques sauf ERV (résistant à vancomycine)
- Bâtonnets Gram +
Vrai ou faux. La vancomycine a une activité contre les gram -
Faux. Aucune activité
Quels sont les effets secondaires à la vancomycine IV?
- Réaction liée à la perfusion : red mine syndrome
- Néphorotoxicité
- Leucopénie
Quel est le spectre de la ceftriaxone?
Comme Pip/tazo
+ : S. pneumoniae, N. gonorrohoeae, N. meningitidis, ↑entérobactéries
- : Pseudomonas aeruginosa