Chromatographie Flashcards

1
Q

Quelles sont les deux phases en chromtaographie ?

A

Mobile et stationnaire

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Q

Quelles propriétés sont utilisées pour effectuer le fractionnement avec chromatographie?

A

Interactions inoniques
Taille
Spécificité

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3
Q

Comment nomme-t-on le support insoluble auxquels les ions sont liés dans une chromatographie par échange d’ions ?

A

Échangeur d’anions et de cations

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4
Q

De quels paramètres l’affinité avec une laquelle une protéine se lie à l’échangeur d’ion dépend?

A

le pH
la nature et de la concentration des autres ions en solution

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5
Q

Comment choisit-on un échangeur d’ions ?

A

La nature de leur matrice
Le type de groupement fonctionnel utilisé pour favoriser l’attachement de la protéine

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6
Q

Quels polymères sont souvent utilisés

A

Polysaccharides (cellulose, agarose, etc.)

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7
Q

Quelle charge possède un échangeur anionique ?

A

Positive

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8
Q

Décrire un échangeur fort et un échangeur faible

A

Fort : pleinement chargé entre pH 3 et 10 ishh
Faible : chargé dans une gamme plus restreinte

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9
Q

Quelle est la condition pour qu’une protéine prenne la place du contre-ions ?

A

Que son affinité soit supérieure

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10
Q

Comment choisit-on la concentration saline et le pH lors d’une chromatographie par échange d’ions ?

A

Pour que la protéine se trouve immobilisée sur l’échangeur d’ion

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11
Q

Avec quoi lave-t-on la colonne contenant l’échangeur ?

A

Solution tampon

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12
Q

Qu’est-ce que l’élution ?

A

On augmente la concentration de sel (NaCl et KCl) et le pH pour diminuer l’affinité et permettre aux protéines de se libérer

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13
Q

Différence élution fractionnée vs par gradient

A

Fractionnée, les paramètres sont changés d’un coup vs graduellement =>plus rapide, mais moins précis selon l’affinité

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14
Q

Que permet la chromatographie par gel-flitration ?

A

Séparer les molécules selon leur taille et leur forme

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15
Q

Qu’est-ce que la limite d’exclusion dans une chromatographie par gel-filtration ?

A

La taille des pores

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16
Q

Vrai ou Faux, les protéines qui ne passent pas par les pores, sortent plus vites

A

Vrai

17
Q

Donner 2 exemples de matrices de chromatographies gel-filtration

A

Polyacrylamide, agarose

18
Q

2 paramètres qui définissent la taille des pores de la matrice

A

masse moléculaire du polymère<
Nombre de liaisons croisées

19
Q

Quelles sont les limites d’exclusion pour le Sephadex et le Sepharose

A

Sephadex (0,8-800)kDa
Sepharose (jusqu’à 40 000kDa)

20
Q

Comment peut-on améliorer la séparation des colonnes de chromatographie ?

A

Colonne plus longue

21
Q

Qu’est-ce que le volume d’élution ?

A

La quantité de solvant nécessaire pour faire sortir la protéine de la colonne

22
Q

Formule volume élution total

A

Vt=Vx(V occupé par les billes) + Vo(V de solvant qui entoure les billes )

23
Q

V ou F, les volume d’élution relatif est constant à chaque protéine ?

A

V, elle permet d’estimer la masse moléculaire d’une protéine

23
Q

Quels sont les axes du graphique permettant de trouver la masse moléculaire avec une chromatographie par gel filtration ?

A

V d’élution relatif, log de la masse moléculaire

23
Q

Qu’est-ce que la dialyse ? et pourquoi on l’utilise ?

A

ON utilise une membrane (cellulose) semi-perméable qui sépare les molécules selon leurs tailles

Pour se débarasser des sels

24
Q

Quel polymère utilise-t-on pour la liaison d’un ligand à une matrice ?

A

Agarose

24
Q

Qu’est-ce que la chromatographie d’affinité ?

A

Un ligand spécifique à la protéine d’intérêt est fixé de manière covalente à une matrice poreuse inerte

25
Q

Comment peut-on récupérer la protéine désirée après une chromatographie d’affinité ?

A

En modifiant les condidtions d’élution

26
Q

Décrire la liaison du ligand sur l’agarose

A

1) Activation de l’agarose avec le bromure de cyanogène
2)Introduction du ligand

27
Q

Que peut-on ajouter à une protéine pour limiter l’interférence stérique avec la matrice d’agarose ?

A

un bras “espaceur”

28
Q

Comment peut-on détecter la présence d’une protéine après une élution ?

A

Spectrophotomètre (absorption)
Essai colorimétrique (On met un produit qui réagit au contact d’une autre substance, avec spectro on peut trouver la concentration)
Essai enzymatique
SDS-PAGE
Détection de la protéine avec un anticorps