Chapitre 9 - Caractérisation Des Environnements Complexes Flashcards
Comment se défini un environnement complexe?
Comme un environnement contenant UNE VARIÉTÉ de microbes, formant une ÉCOLOGIE COMPLEXE dont la nature exacte et les proportions sont souvent inconnues.
Quels sont les étapes nécessaires pour caractériser une environnement?
- Dresser la liste des mo présent
- Définir la proportion relative des mo pour comprendre leur rôle dans l’environnement
- Décrire la biodiversité
- Découvrir de nouveaux taxons
- Rechercher des mo ayant des capacités particulières
Quels sont les deux approches existantes pour caractériser un environnement complexe?
L’approche classique et l’approche moléculaire
Vrai ou faux, les deux approches sont exclusives?
Faux, on peut en n’utiliser qu’un ou bien les deux. Cela se détermine selon le BESOINS
Sur quoi repose les approches classiques?
La cultivabilité des bactéries
Que permet l’approche classique?
L’obtention de culture pure et de mieux comprendre les activités métaboliques et les relations physiologiques entre les bactéries.
Que permettent les approches moléculaires?
La détection
La quantification
L’identification de mo
La détermination des gènes et de leur expression
Quels sont les raisons pour caractérise un environnement complexe?
- Détecter un mo
- Quantifier un mo
- Quantifier tous les mo
- Étudier la biodiversité
- Étudier la métagénomique
- Étudier la métagénomique fonctionnelle
- Étudier la métatranscriptomique
Qu’est-ce que la métagénomique?
C’est l’étude du potentiel génétique d’un environnement
Qu’est-ce que la métatranscriptomique?
C’est l’étude des gènes transcris (exprimés) dans l’environnement étudié
Pour la détection d’un mo, il existe 3 approches. Lequels?
- Par culture
- Reconnaissance immunologique
- PCR
Quels sont les conditions nécessaire à la détection par culture?
On doit être capable de reconnaître la bactérie avec un MILIEUX DIFFÉRENTIEL ou encore par une MORPHOLOGIE UNIQUE
Qu’est-ce qu’une sonde immunologique?
C’est un anticorps couplé avec un fluorochrome
Qu’est-ce qu’une sonde moléculaire?
C’est une courte séquences d’acide nucléique marquées avec un fluorochrome
Quel type de résultats est obtenu par analyse PCR?
Un résultat négatif/positif
