Chapitre 8 - Identification Bactérienne Flashcards
Que signifie identification bactérienne?
Cela signifie de trouver l’identité d’un microorganisme isolé, donc le nom de l’espèce.
Que permettent de caractériser les méthodes classiques?
- Fonction métabolique
- Structure
- Caractéristiques biochimique
Quels sont les deux prémisses des méthodes d’identification classique?
- Le microorganisme doit être en culture pure
- La morphologie cellulaire et la coloration de Gram jouent un rôle clé
Qu’elle est l’exception qui ne nécessite plus les pré-tests de morphologie et de coloration de Gram et pourquoi?
Le système Biolog, car il permet d’identifier sur une même plateforme les bactéries Gram+ et Gram -.
Pour quelle raison l’identification à l’aide des activités métabolique est possible?
Car chaque genre bactérien possède son empreinte digitale biochimique.
Sur quoi reposent essentiellement les méthodes biochimiques?
La recherche d’enzyme responsable de certaines réactions biochimiques.
Avant les années 1970, comment était fait les test biochimiques?
Tube par tube ou pétri par pétri.
Quels sont les méthodes de tests biochimiques les plus connues aujourd’hui?
- Galerie API
- Système Vitek
- Système BIOLOG
Comment fonctionne la galerie API?
Elle contient 20 test biochimiques miniaturisés avec une base de données correspondante.
Combien d’espèces de bactéries peuvent être identifié grâce au galerie API?
Plus de 550.
Qu’apporte de système Vitek de plus à l’identification bactérienne par les tests biochimiques?
Il supprime les manipulations répétitives, donc rend les test plus sécuritaire.
Il permet de rendre les résultats plus rapidement.
Comment fonctionne l’automate Vitek?
Le système est basée sur une carte d’identification VITEK qui automatise toutes les étapes des tests.
Combien de tests biochimiques sont faits dans une carte Vitek?
30
Combien d’espèce peuvent être identifié par le système Vitek?
Plus de 330
En plus de l’identification, le système Vitek permet une autre détection, laquelle?
Il possède un système d’antibiogramme qui permet de détecter les résistances aux antibiotiques.
Quels sont les composantes du système Vitek?
- Préparateur
- Incubateur/ lecteur
- Ordinateur
- Imprimante
Combien d’espèces peuvent être détectés par le système Biolog?
Pus de 2500
Le système Biolog est basée sur quoi?
Les réactions d’oxydoréductions lorsqu’il y a croissance à partir de 71 sources de carbones et de la sensibilité ou la résistance à 23 agents chimiques ( NaCl, acide lactique, antibiotique)
Vrai ou faux, l’identification à l’aide de la morphologie et des structures est encore fréquament utilisées?
Faux, dans la plupart des cas elle à été emplacé par les études moléculaires.
Qu’est-ce qui influence les tests biochimiques, mais pas la composition en acide gars membranaire?
Le gain ou la perte d’un plasmide et les mutations génomiques.
De quelle façon s’y faite l’analyse des acides gars membranaires?
Par chromatographie en phase gazeuse très rapidement.
Que permet l’analyse des acides gars membranaires?
Elle permet de différencier les souches.
Pourquoi la nature de la paroi bactérienne est très importante?
Car elle permet de séparer les bactéries en grands groupes.
Chez quel type de bactérie la paroi est absente?
Les mycoplasmes
Chez quels bactéries le peptidoglycane est-il absent?
Les mycoplasmes et les archébactéries.
Comment est le peptidoglycane est bactérie Gram négatif?
Uniforme
Comment est le peptidoglycane des bactérie Gram positive?
Varier en qualité et en quantité.
Pour quel type de bactéries l’information sur la nature du peptidoglycane est-elle utilisé fréquament?
Les actinomycètes.
Comment se fait l’analyse du peptidoglycane?
Par chromatographie.
Quel type de bactéries peuvent être identifié grâce aux acides mycoliques?
Les mycobactéries.
Qu’est-ce que les acides mycoliques?
Ce sont les lipides membranaires qui confèrent l’acido-alcoolo-résistances aux mycobactéries.
Comment sont analyser les acides mycoliques?
Par chromatographie sur couche mince et par HPLC
Que permet la technique de spectrométrie de masse?
Identifier les molécules en fonction de leur masse.
Quel est la technique la plus utilisé pour analyser les protéines totales ou de leur acides nucléiques?
La spectrométrie de masse MALDI-TOF.
Dans quel application la méthode à montré des résultats satisfaisant?
Le domaine des hôpitaux.
Quel sont les désavantages de la spectrométrie de masse?
Appareillage coûteux
Bonne standardisation
Base de données fiables et représentatives
Quel sont les avantages des méthodes moléculaires?
- Gain de temps
- Gain de spécificiter
- Gain de sensibilité
Quelle est la fonction du PCR?
Obtenir une quantité appréciable de matériel afin de procéder au séquençage.
Quelle est la première étape du PCR?
La dénature de l’ADN à 94 degrés
Quel est la deuxième étape du PCR?
L’hybridation de 40 à 65 degrés
Quel est la troisième étape du PCR?
Élongation des amorces à 72 degrés
Quel est la cible principale du séquençage?
L’ARN 16S
Est-ce que le séquençage permet ?
L’identification de l’espèce
Qu’est-ce que le séquençage?
La détermination de l’ordre des nucléotides
Comment ce nomme les nucléotides particuliers utilisés pour le séquençage et qu’on t’il de particulier?
Les didésoxynucléotides il n’ont pas de groupement hydroxyle.
Quels sont les raisons qui portent à vouloir identifier au delà de l’espèce?
- Relier un cas individuel à une épidémie
- Établir une association entre une épidémie d’empoisonnement alimentaire et un aliment
- Étudier les variations dans la pathogénicité
- Tracer la source de contaminant dans un processus manufacturier
- Étudier l’écologie microbienne d’environnement complexe
- Caractériser le microorganisme associés à des processus ou application industriels.
Quels sont les méthodes de tapages?
- Sérotypages
- Phagotypages
Dans quels circonstances le sérotypage est une étape qui permet de poursuive et raffiner la procédure d’identification?
Lorsque les antigènes de surface sont des indicateurs de la virulence.
Qu’est-ce qui est nécessaire pour utiliser le sérotypage?
L’identité de l’espèce est déjà obtenue.
Sur quoi repose le sérotypage?
Sur l’utilisation d’anticorps pour la détection de molécule de surface particulière et spécifiques a certaine souches bactérienne appelées antigènes.
Si les molécules de surface sont détectées, qu’est-ce que cela veut dire?
Cela veut dire que le microorganisme qui le porte est présent.
Quel phénomène permet de détecter la formation de complexe anticorps-antigènes?
Des agglutinations de cellule.
Quel type de bactérie peut-être sérotypée?
Les bactéries pathogènes dont les antigènes de surface sont connus et caractérisés.
Pour quel type de souche le phagotypage est utilisé?
Pou des souches d’un espèce déjà identifiée.
Quels sont les méthodes de génotypages?
- L’électophorèse en champ pulsé
- Typage génomique multi-locus
- Analyse multiloculaire du nombre variable de répétition en tandem
- Ribotypage
- L’amplification PCR de séquence répétées
- Puce à ADN
- Patron de digestion aux enzymes de restriction
- Patron d’amplification aléatoire
