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Chapitre 8 - Identification Bactérienne Flashcards

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1
Q

Que signifie identification bactérienne?

A

Cela signifie de trouver l’identité d’un microorganisme isolé, donc le nom de l’espèce.

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Q

Que permettent de caractériser les méthodes classiques?

A
  • Fonction métabolique
  • Structure
  • Caractéristiques biochimique
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3
Q

Quels sont les deux prémisses des méthodes d’identification classique?

A
  • Le microorganisme doit être en culture pure

- La morphologie cellulaire et la coloration de Gram jouent un rôle clé

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Q

Qu’elle est l’exception qui ne nécessite plus les pré-tests de morphologie et de coloration de Gram et pourquoi?

A

Le système Biolog, car il permet d’identifier sur une même plateforme les bactéries Gram+ et Gram -.

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5
Q

Pour quelle raison l’identification à l’aide des activités métabolique est possible?

A

Car chaque genre bactérien possède son empreinte digitale biochimique.

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6
Q

Sur quoi reposent essentiellement les méthodes biochimiques?

A

La recherche d’enzyme responsable de certaines réactions biochimiques.

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7
Q

Avant les années 1970, comment était fait les test biochimiques?

A

Tube par tube ou pétri par pétri.

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8
Q

Quels sont les méthodes de tests biochimiques les plus connues aujourd’hui?

A
  • Galerie API
  • Système Vitek
  • Système BIOLOG
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9
Q

Comment fonctionne la galerie API?

A

Elle contient 20 test biochimiques miniaturisés avec une base de données correspondante.

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10
Q

Combien d’espèces de bactéries peuvent être identifié grâce au galerie API?

A

Plus de 550.

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11
Q

Qu’apporte de système Vitek de plus à l’identification bactérienne par les tests biochimiques?

A

Il supprime les manipulations répétitives, donc rend les test plus sécuritaire.
Il permet de rendre les résultats plus rapidement.

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12
Q

Comment fonctionne l’automate Vitek?

A

Le système est basée sur une carte d’identification VITEK qui automatise toutes les étapes des tests.

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13
Q

Combien de tests biochimiques sont faits dans une carte Vitek?

A

30

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14
Q

Combien d’espèce peuvent être identifié par le système Vitek?

A

Plus de 330

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15
Q

En plus de l’identification, le système Vitek permet une autre détection, laquelle?

A

Il possède un système d’antibiogramme qui permet de détecter les résistances aux antibiotiques.

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16
Q

Quels sont les composantes du système Vitek?

A
  • Préparateur
  • Incubateur/ lecteur
  • Ordinateur
  • Imprimante
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17
Q

Combien d’espèces peuvent être détectés par le système Biolog?

A

Pus de 2500

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18
Q

Le système Biolog est basée sur quoi?

A

Les réactions d’oxydoréductions lorsqu’il y a croissance à partir de 71 sources de carbones et de la sensibilité ou la résistance à 23 agents chimiques ( NaCl, acide lactique, antibiotique)

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19
Q

Vrai ou faux, l’identification à l’aide de la morphologie et des structures est encore fréquament utilisées?

A

Faux, dans la plupart des cas elle à été emplacé par les études moléculaires.

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20
Q

Qu’est-ce qui influence les tests biochimiques, mais pas la composition en acide gars membranaire?

A

Le gain ou la perte d’un plasmide et les mutations génomiques.

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21
Q

De quelle façon s’y faite l’analyse des acides gars membranaires?

A

Par chromatographie en phase gazeuse très rapidement.

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22
Q

Que permet l’analyse des acides gars membranaires?

A

Elle permet de différencier les souches.

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23
Q

Pourquoi la nature de la paroi bactérienne est très importante?

A

Car elle permet de séparer les bactéries en grands groupes.

24
Q

Chez quel type de bactérie la paroi est absente?

A

Les mycoplasmes

25
Q

Chez quels bactéries le peptidoglycane est-il absent?

A

Les mycoplasmes et les archébactéries.

26
Q

Comment est le peptidoglycane est bactérie Gram négatif?

A

Uniforme

27
Q

Comment est le peptidoglycane des bactérie Gram positive?

A

Varier en qualité et en quantité.

28
Q

Pour quel type de bactéries l’information sur la nature du peptidoglycane est-elle utilisé fréquament?

A

Les actinomycètes.

29
Q

Comment se fait l’analyse du peptidoglycane?

A

Par chromatographie.

30
Q

Quel type de bactéries peuvent être identifié grâce aux acides mycoliques?

A

Les mycobactéries.

31
Q

Qu’est-ce que les acides mycoliques?

A

Ce sont les lipides membranaires qui confèrent l’acido-alcoolo-résistances aux mycobactéries.

32
Q

Comment sont analyser les acides mycoliques?

A

Par chromatographie sur couche mince et par HPLC

33
Q

Que permet la technique de spectrométrie de masse?

A

Identifier les molécules en fonction de leur masse.

34
Q

Quel est la technique la plus utilisé pour analyser les protéines totales ou de leur acides nucléiques?

A

La spectrométrie de masse MALDI-TOF.

35
Q

Dans quel application la méthode à montré des résultats satisfaisant?

A

Le domaine des hôpitaux.

36
Q

Quel sont les désavantages de la spectrométrie de masse?

A

Appareillage coûteux
Bonne standardisation
Base de données fiables et représentatives

37
Q

Quel sont les avantages des méthodes moléculaires?

A
  • Gain de temps
  • Gain de spécificiter
  • Gain de sensibilité
38
Q

Quelle est la fonction du PCR?

A

Obtenir une quantité appréciable de matériel afin de procéder au séquençage.

39
Q

Quelle est la première étape du PCR?

A

La dénature de l’ADN à 94 degrés

40
Q

Quel est la deuxième étape du PCR?

A

L’hybridation de 40 à 65 degrés

41
Q

Quel est la troisième étape du PCR?

A

Élongation des amorces à 72 degrés

42
Q

Quel est la cible principale du séquençage?

A

L’ARN 16S

43
Q

Est-ce que le séquençage permet ?

A

L’identification de l’espèce

44
Q

Qu’est-ce que le séquençage?

A

La détermination de l’ordre des nucléotides

45
Q

Comment ce nomme les nucléotides particuliers utilisés pour le séquençage et qu’on t’il de particulier?

A

Les didésoxynucléotides il n’ont pas de groupement hydroxyle.

46
Q

Quels sont les raisons qui portent à vouloir identifier au delà de l’espèce?

A
  • Relier un cas individuel à une épidémie
  • Établir une association entre une épidémie d’empoisonnement alimentaire et un aliment
  • Étudier les variations dans la pathogénicité
  • Tracer la source de contaminant dans un processus manufacturier
  • Étudier l’écologie microbienne d’environnement complexe
  • Caractériser le microorganisme associés à des processus ou application industriels.
47
Q

Quels sont les méthodes de tapages?

A
  • Sérotypages

- Phagotypages

48
Q

Dans quels circonstances le sérotypage est une étape qui permet de poursuive et raffiner la procédure d’identification?

A

Lorsque les antigènes de surface sont des indicateurs de la virulence.

49
Q

Qu’est-ce qui est nécessaire pour utiliser le sérotypage?

A

L’identité de l’espèce est déjà obtenue.

50
Q

Sur quoi repose le sérotypage?

A

Sur l’utilisation d’anticorps pour la détection de molécule de surface particulière et spécifiques a certaine souches bactérienne appelées antigènes.

51
Q

Si les molécules de surface sont détectées, qu’est-ce que cela veut dire?

A

Cela veut dire que le microorganisme qui le porte est présent.

52
Q

Quel phénomène permet de détecter la formation de complexe anticorps-antigènes?

A

Des agglutinations de cellule.

53
Q

Quel type de bactérie peut-être sérotypée?

A

Les bactéries pathogènes dont les antigènes de surface sont connus et caractérisés.

54
Q

Pour quel type de souche le phagotypage est utilisé?

A

Pou des souches d’un espèce déjà identifiée.

55
Q

Quels sont les méthodes de génotypages?

A
  • L’électophorèse en champ pulsé
  • Typage génomique multi-locus
  • Analyse multiloculaire du nombre variable de répétition en tandem
  • Ribotypage
  • L’amplification PCR de séquence répétées
  • Puce à ADN
  • Patron de digestion aux enzymes de restriction
  • Patron d’amplification aléatoire

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