Chapitre 8 - Écologie microbienne et microbiologie environnementale Flashcards
Quelles caractéristiques permettent aux micro-organismes de vivre dans des habitats variés.
-Capable d’utiliser une grande variété de sources de carbone et d’énergie.
-Capables de croître sous différentes conditions environnementales.
Quels sont les postulats de Van Niel?
Ils portent sur l’importances des micro-organismes dans le maintien de la vie
-Chaque composant ou produit de cellules vivantes peut être utilisé
comme source de carbone ou d’énergie par un micro-organisme
-Les micro-organismes occupent tous les environnements sur Terre.
Qu’est-ce que des organismes extrêmophiles?
Vivent dans des conditions extrêmes de pH, température et salinité
Quelle est la différence entre l’écologie microbienne et la microbiologie environnementale
L’écologie microbienne est l’étude du comportement et des activités des micro-organismes dans leur environnement naturel. La microbiologie environnementale s’agit de l’étude des processus microbiens globaux (large échelle)
Vrai ou faux? Les micro-organismes sont à l’origine des cycles biogéochimiques et responsables de leur évolution.
Vrai
Quel élément est l’élément de base pour les organismes vivants?
Le carbone
Nommez des formes réduites de carbone et des formes oxydées.
Réduites: Méthane et matière organique
Oxydée: Monoxyde de carbone et CO2
De quoi dépendent les échanges air-mer de CO2?
la teneur en carbone inorganique dissous sous les eaux de surface, la température et l’intensité du vent.
Par quoi est gouverné le flux de carbone inorganique dissous et nutrilite vers la surface?
Les courants
Par quoi le carbone est-il fixé dans la couche éclairée des océans? Peux-t-il encore être échangé avec l’atmosphère à ce moment?
Le phytoplancton. non
Voir diapo 15, cycle du carbone dans les océans.
:)))))
Vrai ou faux: tous les organismes ont besoin d’azote.
Vrai, il est essentiel pour la synthèse de protéines et d’acides nucléiques.
Quels organismes utilisent l’azote minéral et lesquels utilisent l’azote organique?
Minéral: Végétaux (ammoniac et nitrate)
Organique: animaux (de la digestion des tissus végétaux et animaux).
Sous quel forme les bactéries consomment-elles généralement l’azote?
Ammoniac, nitrate.
Vrai ou faux? Certaines bactéries requièrent l’apport d’un ou plusieurs acides aminés dans le milieu nutritif.
Vrai, les bactéries lactiques.
Nommez des rôles des bactéries dans le cycle azote.
Dénitrifier, nitrifiantes, fixer l’axote.
Nommez des sources d’azote.
Fertilisants (inorganiques et organiques), fixation d’azote, résidus d’animaux et résidus de récolte.
Nommez des formes de l’azote.
Urée (CO(NH2)2), ammoniac (NH3), ammonium (NH4), nitrate (NO3), nitrite (NO2), azote gazeux (N2), azote organique.
Quel est le plus grand réservoir d’azote?
L’atmosphère
Nommez des réservoirs d’azote.
Atmosphère, océan (MOD, MOP, Sels solubles, N2 dissous, Biomasse), terre (MO, biote, croûte terrestre)
Qu’est-ce que la fixation de l’azote?
N2 en NH4, seulement fait par les organismes procaryotes. Peut requière une nitrogénase.
Pourquoi le processus de fixation est fondamental?
Parce que l’azote est souvent limitant.
Pourquoi les bactéries fixatrices d’azote forment-elles des associations symbiotiques avec les plantes?
Parce que la fixation de l’azote est très coûteuse.
Quelle association est la plus efficace pour fixer l’azote?
Rhizobium-légumineuse suivi de cyanobactéries-lichen, puis des associations dans la rhizosphère, puis les libres.
Qu’est-ce que la nitrification?
NH4 en NO2 en NO3. C’est l’oxydation de l’azote.
Vrai ou faux?. L’ammoniac produit par ammonification peut être utilisé par plusieurs plantes comme source d’azote pour la synthèse d’acides aminés et autres composés azotés.
Vrai
Nommer les deux étapes de la nitrification.
NH4-NO2, par nitrosomonas et NO2 et NO3 par nitrobacter.
Qu’est ce que la dénitrification?
Lorsque les bactéries respirent du nitrate, une anaérobiose a lieu où le nitrate est transformé en azote gazeux. Dans les zones humides fermées.
Vrai ou faux, la dénitrification est favorable du point de vue agricole.
Faux, perte d’azote fixé.
Quelle est la formule de la dénitrification?
4NO3 + C6H12O6 = 2N2 + 6 H2O
Qu’est-ce que l’assimilation/ammonification?
Assimilation de l’ammonium par les cellules en acides aminés pour former des protéines. L’ammonification est l’inverse de l’assimilation, une minéralisation de l’ammoniac fait par l’activité des bactéries pourvues de désaminases qui le groupement amine des composés organiques.
Que se passe-t-il à la mort d’une plante?
Libération d’azote organique qui devient de l’azote inorganique (NH3). Quand le pH est acide (<7,5), il y a conversion rapide en NH4.
Nommez les étapes du cycle de l’azote.
Décomposition microbienne (protéines et déchets azotés en acides aminés)
Ammonification microbienne (acides aminés en ammoniac)
Nitrosomonas (Ammonium en nitrite): nitrification 1
Nitrobacter (nitrite en nitrate): nitrification 2
Dénitrification par pseudomonas (nitrate en N2)
Fixation de l’azote (N2 en ammoniac)
Qu’est-ce que l’écosphère?
Équivalent de la biosphère, ensemble des écosystèmes de la planète qui comprennent tous les êtres vivants et leur milieu.
Quelles sont les 3 divisions de l’écosphère?
Atmo-écosphère, litho-écosphère, hydro-écosphère.
Quels sont les 3 types de mouvement de l’eau dans l’hydro-écospère?
infiltration, précipitations et ruissellement.
En quoi diffèrent les environnements aquatiques?
Origine de l’eau et salinité.
Qu’est-ce qui fait que les milieux de lù,hydro-écosphère sont en constante fluctuation?
Les courants, les vents, la sédimentation des particules, la stratification et els interfaces.
Définir un neuston.
Ensemble des micro-organismes de petite et de moyenne taille qui vivent dans la phase aqueuse (hyponeuston) ou aérienne (épineuston), de part et d’autre de cette couche limite.
Nommez les trois couches d’un lac.
Épilimnion, thermocline et hypolimnion.
Vrai ou faux? On retrouve près de 10x plus de bactéries dans le neuston que dans la colonne d’eau.
Faux, de 10 à 100 fois!!!
Vrai ou faux? En plus d’être une bonne source de production primaire, le neuston est protégé de l’accumulation de métaux lourds.
Faux! C’est un habitat favorable pour l’accumulation de substances toxiques (métaux lourds, pesticides, etc.)
Vrai ou faux? Le neuston est intolérant à l’accumulation de métaux lourds.
Faux, il développe des stratégies pour cataboliser les produits toxiques et résister aux métaux.
Qu’est-ce qui permet aux bactéries de neuston de s’installer?
La forte tension de surface.
Nommer les mécanismes de transfert de matière entre la microcouche de surface et les milieux sous-jacents.
Le soleil passe au travers, les bactéries et les protozoaires bougent au travers, les arthropodes font des trous qui permettent des échanges, des agrégats se forment et tombent dans la colonne d’eau, des bulles montent du fond et des particules tombent sur le neuston.
Quelle est la différence entre le phytoplancton et le zooplancton?
Phyto: autotrophe et zoo: hétérotrophe.
De quoi se nourrissent les bactéries bactériovores?
de bactéries lol
Quelle est la chaîne trophique classique en milieu aquatique?
Phytoplancton-herbivores-zooplancton-carnivores-poissons
Qu’est-ce que Steele, en 1974, soutient sur le réseau trophique en mer du Nord6
le système marin est tout à fait différent, le phytoplancton est mangé aussi vite qu’il est produit, les animaux vivants au fond dépendent des excréments des herbivores plutôt que de la retombée des plantes.
Quelle est la vision des bactéries à al fin des années 1970?
Elles sont intéressantes, mais pas importantes. Elles ne sont pas prises en compte dans les cycles biogéochimiques car elles sont:
trop peu nombreuses
dormantes (trop diluées)
et utilisent directement la DOM
À quel moment la boucle microbienne a-t-elle été découverte et par qui?
En 1983 par Azam et al.
Qui a dit que les bactéries étaient abondantes et en quelle année?
1977, Hobbie.
Qui a soutenu que les bactéries avaient une forte production microbienne et en quelle année?
Hagstrom et Fuhrman, 1979-1980
Connaître diapo 55 svp
oui
Qu’est-ce que l’environnement benthique?
La zone de transition entre la colonne d’eau et la subsurface minérale.
Qu’est-ce qui se retrouve à l’interface de l’environnement benthique?
la matière organique de la colonne d’eau ou de l’environnement terrestre. mélange diffus et non-compact de matière organique, minérale et d’eau.
De quoi est fonction la concentration de microbes hétérotrophes de l’environnement benthique?
disponibilité de matière organique et d’oxygène.
Pourquoi est-ce que l’environnement benthique est une composante importante de l’environnement aquatique?
Il y a des cycles de nutriments essentiels tels que le C, l’N et le S dans les sédiments; ces cycles dépendent de combinaisons de transformations microbiennes aérobies et anaérobies.
Vrai ou faux, dans la couche superficielle, O2 est un accepteur d’électrons?
Vrai
Vrai ou faux? Sous la zone oxygénée, NO3- est un donneur d’électrons.
faux
Vrai ou faux? SO42- est un accepteur d’électrons dans la couche du milieu.
vrai
Où est confinée la méthanogénèse?
Dans les couches de sédiments appauvries en SO42-
Quel est le dernier accepteur d’électrons dans la respiration anaérobie.
Le Co2, mène à la formation de méthane.
Quelles sont les deux sources de matière nutritive dans un lac?
Allochtone et autochtone.
Connaître le graphique de la diapo 59.
Explique la réponse microbienne en fonction du temps et de la distance d’un site de pollution.
Qu’est-ce que l’aérobiologie? Qui l’a définie?
Étude de la vie dans l’air. (F. C. Meier, 1980). L’étude de l’aérosolisation, de la
transmission par l’air et du dépôt des matières biologiques
Qu’est-ce que l’aéromicrobiologie?
Études des microorganismes vivants en suspension dans l’air. Plus précis = études des maladies pouvant être transmises par voies respiratoires.
Différencier aérosol et bio-aérosol.
Aérosol: tout ensemble de particules solides ou liquides en suspension dans un milieu gazeux. Les particules sont considérées en suspension si sa vitesse de chute <0,25m/s.
Bio-aérosol: Aérosol composé de particules d’origine biologique. 0,02 à 100um de diamètre.
par quoi sont définies les régions de l’atmosphère?
Des minimas et maximas de température.
Quel est le nom de la région de l’atmosphère la plus près de nous?
Troposphère. C’est l’interface de l’hydrosphère avec la lithosphère.
Quelle région se retrouve au dessus de la tropsphère?
La stratosphère.
Vrai ou faux? Les paramètres physiques et chimiques de l’atmosphère sont favorables à la croissance de micro-organismes.
Faux.
Qu’ont pour effet les UV dans l’atmosphère sur les bactéries?
Mutations léthales.
Vrai ou faux? L’atmo-écosphère s’étend au delà de la troposhère.
faux
Qu’est-ce que la couche limite?
Nom donné à l’atmosphère terrestre qui s’étend à une altitude d’environ 0,1 km à partir de la surface du globe. Elle est responsable du transport de particules sur des courtes ou longues distances.
Où se trouvent la majorité des bactéries dans l’atmosphère?
Dans la couche limite.
Nommer les différents types de couche limite.
Couche limite laminaire, couche limite turbulente, couche de tourbillons
Qu’est-ce que la couche limite laminaire?
Couche d’air immobile associée à la terre ou la surface qui lui appartient. Quelques microns à quelques mètres.
Qu’est-ce que la couche limite turbulente?
Elle est toujours en mouvement et responsable des phénomènes et transports horizontaux.
Qu’est-ce que la couche de tourbillon locale
Zone de transition entre couche limitante laminaire et couche limite turbulente.
Vrai ou faux? la composition des organismes aériens varie avec les saisons.
Faux, il s’agit du nombre. (mais selon moi, la composition également)
Qu’est-ce que la circulation des micro-organismes dans l’air?
L’émission des bio-aérosols, le transport des bio-aérosols (diffusion et dispersion) et le dépot des bio-aérosols.
Vrai ou faux? L’émission des bio-aérosols est principalement d’origine terrestre.
Vrai, mais également anthropique.
Nommer des mécanismes responsables de l’émission de bio-aérosols dans les couches limites de surfacede l’atmosphère.
Turbulence de l’air générée par les mouvements des humains, animaux et machines;
- Activités menant à la formation, au stockage, au traitement et à l’élimination des déchets;
- Les processus naturels tels que l’action de l’eau et du vent sur des surfaces contaminées, qu’elles soient liquides ou solides;
- La libération de spores fungiques au cours du cycle de vie.
Qu’est-ce qu’une source ponctuelle?
Site d’émission isolé et bien défini.
Nommer les deux types de sources ponctuelles
instantanée et continue
Qu’est-ce qu’une source diffuse?
Zones larges et moins bien définies. Plutôt une dispersion par vague.
Donner des exemples pour les deux types de sources diffuses.
Ponctuelle (aérosols des avions) et continue (champ avec aérosols) surface.
