Chapitre 8 Flashcards

1
Q

À quoi sert un PCR

A

Amplifier un segment d’ADN particulier dans génome

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2
Q

Formule

A
y = x 2^n
y= nb finale de copies
x= nb initial de copies
n= nb de cycles
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3
Q

Nom de la polymérase

A

ADN polymerase Taq

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4
Q

Taille max des fragments pouvant être amplifier par Taq

A

4 kb

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5
Q

Nom bactérie de l’ADN polymerase Taq

A

Thermus aquaticus

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6
Q

Pourquoi nombre théorique de copies n’est pas le même que nombre expérimental

A

Épuisement et dégradation de polymérase et amorces

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7
Q

Étape 1 d’un PCR

A

Dénaturation (95 pendant 30 à 60s)

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8
Q

Étape 2 d’un PCR

A

Hybridation (appariement des amorces) (à Tm-5 pendant 30 à 60s)

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9
Q

Comment trouve t-on Tm

A

(4 x (G+C)) + (2 x (A+T))

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10
Q

Que signifie Tm

A

Température de fusion: température à laquelle 50% des molécules sont associées à la matrice

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11
Q

Étape 3 d’un PCR

A

Élongation (72 pendant 30 à 60s)

Durée dépend de longueur (4000b = 4min)

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12
Q

Que se passe t’il à la fin du dernier cycle

A

Étape d’élongation additionnelle pour s’assurer que la synthèse de tous les brins est complète

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13
Q

Nombre total de cycles

A

Plus petit ou égal à 30

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14
Q

Longueur des amorces

A

15 à 35 nucléotides

17 pour génome humain

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15
Q

Plus amorces est … plus l’hybridation est spécifique

A

Longue

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16
Q

2 choses à éviter pour le choix d’une amorce

A
  • Séquences complémentaires à l’intérieur d’une même amorce (hairpin)
  • Complémentarité de bases entre les 2 amorces
17
Q

Applications du PCR

A
  • Détection organismes pathogènes ou virus
  • Analyse de l’expression de gènes spécifiques (suivre développement cancer)
  • Identification d’individus par analyse de polymorphisme
18
Q

Nommer types de polymorphismes

A
  • Variations ponctuelles SNP
  • STR
  • VNTR
19
Q

Nombre d’allèles de chaque individus

A
  • Maternelle
  • Paternelle
    Donc 2 allèles