Chapitre 6 - Transport vésiculaire Flashcards
Définissez l’endocytose et l’exocytose.
Endocytose: Voie allant de la membrane vers les endosmose et les lysosomes pour la dégradation
Exocytose: voie allant du RE vers l’extérieur
Comment peut on qualifier la transport vésiculaire dans une cellule?
Hautment organisé
Donnez les deux caractéristiques qui rendent les vésicules sélectives.
- Chaque vésicule transporte la cargaison appropriée
- Chaque vésicule fusionne avec la membrane cible appropriée
Quelles sont les trois fonctions du manteau d’une vésicule?
- concentrer les protéines membranaires spécifiques
- Faciliter la sélection des molécules pour le transport
- Mouler la vésicule en un treillis en forme de panier
Quelles sont les trois différents types de vésicules en fonction de la composition de leur manteau?
- Clathrine
- COP1 et COP2
- Retromer
Donnez les points de départ/d’arrivée des trois types de vésicules.
Clathrine: de la membrane plasmique vers les endosomes
COP1 et COP2: Partent du Golgi
Retromer: entre l’endosome et le Golgi
Expliquez l’organisation de la clathrine
Composée de trois peptides qui forment une structure à trois bras nommée triskelion assemblé en forme de panier
Les protéines adaptatrices sont liés à deux choses différentes. Quelle sont-elles?
La clathrine et les récepteurs de chargement
Donnez un synonyme des protéines adaptatrices
L’adaptine
Vrai ou faux. Les adaptines ne sont pas spécifiques.
Faux, elle le sont.
Expliquez les étapes de la formation d’une vésicule à clathrine
- La protéine cargo va se lier au récepteur de chargement. Ce récepteur se lie aussi aux molécules de clathrine par l’intermédiaire de l’adaptine
- L’assemblage successif de complexes protéine cargo-récepteur-adaptine-clathrine génère des forces et la vésicule est formée
- Une fois la vésicule formée, le manteau est éliminé
Expliquez la liaison de l’adaptine AP2
- AP2 va lier un PIP(PI4,5P2)
- La liaison au PIP va exposer le site de liaison pour le récepteur de chargement qui possède des signaux d’endocytose
- La liaison au récepteur amplifie la liaison de AP2 à la membrane
- La liaison de AP2 à la membrane stimuler sa courbure par les clathrines
Quelle est la particularité d’un PIP?
Il peut être phosphorylé/déphosphorylé sur les positions 3’, 4’ et 5’ de l’inositol
Qu’est ce qui rend les adaptines spécifiques?
Chaque adaptante possède des protéines spécifiques qui reconnaissent des PIP spécifiques
Expliquez le fonctionnement de la dynamine
- La dynamine contient un domaine de liaison au PI(4,5)P2
- La liaison au PI(4,5)P2 recrute d’autres protéines cytosoliques
- Ces protéines s’assemblent autour du col du bourgeon de la vésicule
- La vésicule est séparée par pincement
Expliquez comment la vésicule perd sont manteau de clathrine grâce a la PIP phosphatase
- Une fois la vésicule libérée, la PIP phosphatase élimine le PI(4,5)P2
- Le complexe adaptine-récepteur est déstabilisé
- Perte des protéines adaptatrices
- Perte du manteau de clathrine
Quelle sont les deux voies de régulation de l’assemblage des vésicules?
- Les PIP
- Les GTPases de recrutement
Que font les GTPases de recrutement Arf?
Assemblage des vésicules COP1
Que font les GTPases de recrutement Sar1?
Assemblage des vésicules COP2
Expliquez la formation d’une vésicule COP2 avec Sar1
- Sar1-GDP est dans le cytosol sous forme inactive. Il se lie à Sar-GEF
- Sar-GEF échange le GDP pour un GTP
- L’hélice amphiphile de Sar1 est exposée et s’insère dans la membrane
- Sar1-GTP inséré dans la membrane recrute les complexes Sec23/24 et Sec13/31. Sec23 se lie à Car-GTP alors que Sec24 qui lui est associé se lie au récepteur. Sec13/31 forme les protéines du manteau COP2.
- Bourgeonnement de la vésicule
- Séparation par pincement par la dynamine liée au PI(4,5)P2)
- Les vésicules COP2 ne perdent pas leur manteau immédiatement.
Vrai ou faux. Les vésicules à clathrines et COP2 perdent leur manteau après leur séparation de la membrane par la dynamine. Expliquez.
Faux, les vésicules à clathrine oui, mais les vésicules COP2 ne les perdent pas tout de suite
Expliquez la dissociation du manteau avec les GTPase Sar1
- Sar1-GAP va hydrolyser Sar1-GTP (qui est alors lié dans la membrane par son hélice amphiphile) en Sar1-GDP.
- Cette hydrolyse provoque la dissociation de Sar1 (associé au GDP à ce moment)
- Sar1-GDP part aussi avec les complexes Sec23/24 et Sec13/31 (manteau COP2)
Pourquoi dit on que les GTPases agissent comme des minuteurs dans le cas de la dissociation du manteau des vésicules COP2?
Car elle hydrolysent le GTP lentement: il faut que le recrutement de Sar1-GTP soit plus rapide que sa dissociation (cette dissociation est triggered par l’hydrolyse du GTP en GDP
Par quoi est assuré la spécificité de reconnaissance des vésicules sur la membrane cible?
Par les marqueurs de surface sur la vésicule et les récepteurs complémentaires sur la membrane cible
Quel est la fonction de Rab? Et de Snare?
Rab: dirige les vésicules vers la cible spécifique
Snare: Intermédiaire de fusion des bicouches lipidiques
Vrai ou faux. Seulement quelques organises possèdent une protéine Rab sur sa face cytoplasmique. Explqiuez.
Faux, ce sont tous les organises qui en possèdent et c’est sur leur face cytosolique.
Quelles sont les deux formes de Rab? Expliquez aussi les implications de chacune des formes.
Rab-GDP: inactif dans le cytosol grâce a la liaison à GDI (inhibiteur)
Rab-GTP: active et liées à une membrane et aux effecteurs Rab
À quoi servent les protéines Snare?
À catalyser la fusion membranaires des deux bicouches (permettent le déplacement de l’eau présente a la surface des bicouches)
Vrai ou faux. Les Snares sont les mêmes pour la plupart des vésicules. Expliquez.
Faux, il existe près de 35 Snare ce qui contribue à leur spécificité.
Quel sont les deux ensembles possibles des protéines SNARE? Donnez aussi leur emplacement.
SNARE-v, habituellement sur les vésicules et composé d’un seul SNARE
SNARE-t, habituellement sur les cibles et composé de 3 SNARE
Expliquez brièvement l’interaction entre SNARE-v et SNARE-t
Les deux possèdent des domaines hélicoïdaux particuliers. Cela fait entre sorte que les deux se lient ensemble en s’enroulant pour créer de l’énergie
D’ou provient l’énergie nécéssaire à la fusion de la vésicule a la membrane?
Par l’interaction entre les SNARE-v et les SNARE-t
À quoi servent les effecteurs Rab?
Ils interagissent entre les protéines Rab sur la vésicule et celles sur la membrane cible
Expliquez l’amarrage d’une vésicule à la membrane cible
- Les effecteurs Rab vont lier les Rab-GTP ( par Rab-GEF) sur la vésicule et la membrane cible
- L’effecteur Rab “recrute” donc la vésicule et l’approche de la membrane
- Les protéines SNARE-v de la vésicule vont interagir avec les SNARE-t de la membrane cible, catalysant la fusion des deux bicouches
- Rab-GAP va hydrolyser Rab-GTP en Rab-GDP
- Rab-GDP se dissocie de la vésicule (maintenant en fusion) et retourne au cytosol associé au GDI
Comment se nomme le transport du Golgi vers le RE?
Récupération rétrograde
Nommez trois fonctions du golgi
- Tri des protéines venant du RE
- Site de synthèse des glucides
- Site d’addition d’oligosacharrides
Quel type de vésicules se rendent au Golgi ?
COP2
Quelles sont les trois protéines exportés du RE pour aller dans le Golgi ?
- Membranaires
- Cargaison (cargo)
- Résidentes du RE
Vrai ou faux. Les protéines de chargement retournent au RE.
Faux
Dans le cas des vésicules COP2 qui partent du RE pour le Golgi, à quoi se lie les protéines cargo?
Aux récepteurs de chargement
À quel moment le récepteur de chargement des vésicules COP2 retrouvé au RE?
Une fois que la protéine cargo qui lui était liée a été libérée
Comment appele-t-on les structures que les vésicules forment après la sortie du RE et la dissociation de leur manteau en direction du Golgi?
Des agrégats tubulaires vésiculaires
Quelle est la différence entre une fusion homotypique et hétérotypique?
Homotypique: vésicules issues d’un même compartiment
Hétérotypique: Vésicules issues de compartiments différents
À quoi sert NSF?
Utilise l’ATP pour séparer les SNARE-v et les SNARE-t. Processus mal connu
Lors de la formation d”agrégats tubulaires vésiculaires, à quoi servent les vésicules COP1 qui sont formées?
Ces vésicules ramènent au RE les protéines échappées du RE.
Comment nomme-t-on le transport créé par les vésicules COP1 pour ramener les protéines échappées du RE?
Le transport de recapture ou rétrograde
Expliquez le principe de base des signaux de recapture d’une protéine
Les protéines résidentes du RE contiennent des signaux qui vont lier les manteaux de COP1. Ce protéines se retrouvent donc dans les vésicules COP1 dans le transport rétrograde.
Quel est le signal de recapture dans le cas des protéines membranaires? Comment fonctionne-t-il?
Les protéines membranaires possèdent une séquence Lys-Lys-X-X en C-terminal. Cette séquence lie directement le manteau de COP1
Quelle est la fonction principale des effecteurs RAB?
Le déplacement des vésicules le long des microtubules du microsquelette d’actine de la membrane
Quel est le signal de recapture dans le cas des protéines solubles? Comment fonctionne-t-il?
Les protéines solubles on une séquence Lys-Asn-Glu-Leu en C terminal (KDEL) qui va lier le récepteur KDEL. Ce récepteur fait la navette entre le RE et le golgi en plaçant les protéines KDEL dans les COP1