Chapitre 6 - Régulation de la transcription chez les eucaryotes Flashcards
Vrai ou faux.
Il existe chez les eucaryotes des régulateurs individuels ainsi que des séquences régulatrices.
Vrai
Que sont les enhancers ?
Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité. Orientation indépendante et position indépendante
Comment les enhancers peuvent réguler certains gènes spécifiques sans avoir d’effets sur d’autres gènes à proximité ?
Grâce aux isolateurs ou éléments frontières.
Vrai ou faux.
De la levure aux mammifères, tous ont une machinerie transcriptionnelle élaborée, nucléosomes et modificateurs.
vrai
Chez les eucaryotes, comment se nomme la fonction de liaison à l’ADN ?
Domaine de liaison à l’ADN (DLA)
Quel est l’activateur eucaryote le plus étudié ?
Gal4 (active la transcription de gènes galactose chez S. cerevisae)
Vrai ou faux.
La plupart des régulateurs bactériens lient l’ADN sous forme de dimères.
vrai
Quel motif utilisent la grande majorité des protéines régulatrices bactériennes ?
Hélice-coude-hélice comme DLA
Quels types de protéines sont surtout impliquées dans l’embryogenèse ?
Les protéines à homéodomaine
Qu’est-ce que l’homéodomaine ?
Structure Hélice-coude-hélice contenant 60 a.a très conservés identifié dans plusieurs protéines chez les eucaryotes.
Vrai ou faux.
Les homéodomaine sont soit des activateurs, soit des répresseurs.
Vrai.
C’est dicté par l’homéodomaine
Quel est le DLA le plus fréquent ?
Domaine en doigt de zinc
Où a été initialement identifié le domaine en doigt de zinc ?
Chez TFIIIA
De quoi est constitué le domaine en doigt de zinc ?
30 a.a parmi lesquels se trouvent 2 résidus cystéine et 2 résidus histidine.
Vrai ou faux.
Le domaine en doigt de zinc lie l’ADN même en l’absence de zinc.
Faux.
S’il n’y a pas de zinc, il n’est pas possible de lier l’ADN.
Quel activateur permet de lier 3 structures en doigts de zinc consécutives ?
Sp1
Combien de nucléotides peut lier chaque doigt ?
3
Quel autre DLA peuvent utiliser le zinc ?
Les récepteurs des glucocorticoïdes. Il sont constitués de 8 cystéines pouvant lier 2 atomes de zinc
Vrai ou faux.
Les doigts de zinc sont toujours à l’intérieur de la protéine.
vrai
Quel est le 3eme motif de DLA ?
Fermeture à glissière de Leucines
Les fermeture à glissière de leucines forme des homo ou des hétérodimères ?
Les 2.
Le motif de fermeture à glissière de leucine forme quelle structure si 2 protéines on ce motif ?
Coiled-coil
Quel est le 4eme domaine de liaison à l’ADN ?
Le motif Hélice-boucle-hélice
Vrai ou faux.
Le DLA hélice-boucle-hélice a une forte similarité avec la fermeture à glissière de leucine.
vrai
Pourquoi les domaines d’activation n’ont pas de structure prédéfinie ?
Ce sont des recruteurs
Les activateurs Sp1 sont riches en quoi ?
Glutamine
Les activateur CTF1 sont riches en quoi ?
Proline
Les régions activatrices acides sont-elles faibles ou fortes ?
Fortes et fonctionnent dans tous les organismes eucaryotes.
Comment agit un activateur chez les bactéries ? (et aussi a peu près de la même façon chez les eucaryotes)
L’activateur stimule la transcription en liant l’ADN par une surface et interagit avec l’ARN polymérase par une autre face.
Vrai ou faux.
Les activateurs établissent toujours une interaction directe avec l’ARN pol.
Faux.
Généralement, ils recrutent la polymérase indirectement.
Quels sont les 2 types de modificateurs de nucléosomes ?
Les HAT (histone acetyl transférase)
SWI/SNF à activité ATP-dépendante
Sur quoi se fixe les protéines à bromodomaine ?
Sur les nucléosomes acétylés
Quel composant majeur contient des bromodomaines ?
Un des composants de TFIID (TAF1/TAFII250)
Quels sont les 3 composants avec lesquels Gal4 semble interagir ?
Médiateur
SAGA
TFIID (certains de ses TAF)
Quel est le modèle d’activation de SAGA comme coactivateur de Gal4 ?
Gal4 est lié à sa séquence cible UAS par sont DLA. Par contre, le domaine d’activation est bloqué par l’inhibiteur Gal80.
L’addition de galactose va induire l’expression de l’inducteur Gal3 qui va faire changer le complexe Gal80/Gal4. (Gal80 va changer de côté et exposer le domaine d’activation de Gal4)
Gal4 va alors recruter SAGA et SAGA va recruter TBP via son domaine sp3.
Il y aura alors activation de la transcription de Gal1.
Comment se nomme le gène codant pour la protéine de choc thermique chez la drosophile ?
HSP70
Quel est le mode de fonctionnement du promoteur HSP70 ?
Avant le choc thermique, il y a très peu de HSF.
La Pol II est partiellement phosphorylée sur les sérines 5 de la queue CTD.
Complexée avec DSIF et NELF, la pol est en pause en aval du promoteur HSP70.
Lors du choc thermique, Il y aura trimérisation de HSF + liaison à ses sites.
Cela va recruter une protéine kinase (P-TEFb) sur la machinerie arrêtée.
P-TEFb va phosphoryler les sérines 2 + DSIF et NELF ce qui va libérer l’enzyme de sa niche et permettre la transcription du gène.
Vrai ou faux.
Les protéines qui lient les isolateurs répriment directement le promoteur et les activateurs.
Faux.
Ils bloquent la communication entre eux.
Qu’est-ce qu’un LCR ?
Locus control region.
Le répresseur lambda est un exemple de quelle type d’action ?
Action synergique
Vrai ou faux.
La coopérativité est cruciale pour l’intégration du signal par les activateurs.
Vrai
Quels sont les 2 activateurs qui communiquent pour le gène HO chez S. cerevisiae ?
Swi5 et SBF
Vrai ou faux.
Les protéines HMGA1 sont présentes en tout temps.
Faux.
Seulement lors d’infection et vont permettre de modifier la structure de l’ADN pour permettre la transcription des gènes pour les interférons-b
Quels sont les activateurs ciblés par l’infection virale ?
NF-kB, IRF et le complexe AP-1 (Jun/ATF)
Quels sont les 4 modes différents des répresseurs eucaryotes ?
- Compétition
- inhibition
- répression directe
- répression indirecte
Qu’est-ce que le gène Mig1 ?
C’est un répresseur qui recrute Tup1 pour empêcher la transcription du gène Gal1 avec une répression directe et indirecte.
