Chapitre 3 - Réplication de l'ADN Flashcards
Qu’est-ce que le dogme de la biologie moléculaire?
- Réplication
- Transcription
- Traduction
Combien de temps dure la réplication cellulaire?
Environ 16 heures
Combien de temps dure la réplication de l’ADN?
Environ 10 heures
Comment nomme-t’on le brin d’ADN qui sert de moule?
Brin mère
Quels éléments sont nécessaires à la réplication de l’ADN?
- dNTPs
- Jonction amorce matrice
Vrai ou faux.
C’est l’extrémité 3’-OH qui est en croissance lors de la réplication ?
Vrai
L’attaque nucléophile du 3’-OH se fait à quel endroit lors de l’appariement des bases?
Sur le premier phosphate attaché au sucre
Les 2 phosphates issues de l’attaque nucléophile lors de l’appariement des bases sont séparés en phosphate distinct par quelle enzyme ?
La pyrophosphatase
Vrai ou faux.
L’ADN polymérase catalyse l’appariement des bases en discriminant les mauvaises bases.
Faux.
L’ADN polymérase catalyse sans discrimination des bases.
Est-ce que l’ADN polymérase peut quand même ajouter une base comme par exemple G:T?
Oui. L’appariement, même incorect peut se faire. L’attaque nucléophile sera seulement vraiment moins efficace.
Quelle est la principale cause de mutations dans l’ADN ?
Dommages à l’ADN (mésappariement)
À quoi servent les 2 ions métalliques divalents ?
- Modifient l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
- Un des ions réduit le 3’-OH en O-
- L’autre stabilise les phosphates B et Y
À quoi sert l’exonucléase?
Lorsqu’il y a des base mal appariées, l’affinité de l’ADN polymérase pour la jonction amorce:matrice diminue ce qui force la sortie de l’amorce du site actif.
L’amorce va se lier à l’exonucléase et l’ADN mésapparié est enlevé.
Vrai ou Faux.
Les doigts de la main vont venir se fermer de 40 degrés pour approcher le phosphate.
Vrai.
Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP. Ça aura pour effet de :
- Rapprocher le nucléotide des ions métalliques
- Augmente la vitesse de catalyse.
Qu’est-ce qui empêche l’appariement d’un dNTP avec la 2eme base ou une autre base plus loins. Autrement dit, comment l’ADN polymérase ajouter les dNTPs successivement un à un?
Les doigts induisent une rotation de 90 deg. entre la 1ere et la 2eme base de la matrice. Ça va permettre un meilleur appariement.
Vrai ou Faux.
Le pouce aide à la catalyse.
Faux.
Il stabilise le complexe.
Il maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale.
Il permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat.
Dans un tube, on veut répliquer un fragment d’ADN. Qu’a-t-on besoin?
- Polymérase
- dNTPs
- Amorce
- Matrice
Que veut-on dire par : L’ADN polymérase est processive?
Elle ne va pas se détacher après un seul nucléotide.
Quelle est l’étape limitante de la réplication de l’ADN?
La liaison de la polymérase à sa jonction amorce:matrice.
Comment se nomme l’endroit ou l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires ?
La fourche de réplication
Où se trouvent les fragments d’Okazaki ?
Sur le brin discontinu
Vrai ou faux.
L’ADN polymérase peut créer des amorces.
Faux.
L’ARN polymérase peut.
Quelles sont les étapes d’élimination des amorces d’ARN ?
- RNase H
- dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN
- Enlève tout, sauf le dernier ribonucléotide - Exonucléase 5’
- Enlève le dernier ribonucléotide - ADN polymérase remplit la brèche
- La césure est réparée par une ADN ligase
Vrai ou Faux.
Les hélicases sont processives.
Vrai
Vrai ou Faux.
Les hélicases fonctionnent avec la polarité 5’ vers 3’ seulement.
Faux.
5’ vers 3’ ou 3’ vers 5’
Qu’est-ce que les SSB ?
Single strand binding protein
À quoi servent les protéines SSB ?
Empêche le réappariement, la dégradation, et la formation de boucles.
Vrai ou Faux.
Les SSB se recrutent de manière coopérative.
Vrai.
Les topoisomérases enroulent l’ADN de quelle façon ?
Ils déroulent l’ADN enroulé positivement pour le rendre avec un enroulement négatif
Quelles sont les protéines de la fourche ?
- Hélicase
- Les SSB
- La primase
- ADN polymérase
- La Topoisomérase
Quelles sont les polymérases qui participent à la réplication chez les eucaryotes ?
Pol a, pol d, et pol e
Vrai ou faux.
Les ADN polymérase nommé en lettres sont procaryotes.
Faux.
Les ADN polymérase avec des chiffres sont procaryotes. Celles avec des lettres appartiennent aux Eucaryotes.
Si la processivité de la pol a est faible, quel est son rôle ?
Elle participe à l’initiation des brins neufs en commencant la réplication de quelques nucléotides.
Sur quel brin agit la pol d ?
Le brin discontinu
Sur quel brin agit la pol e ?
Le brin continu
Qu’est-ce qui augment la processivité de l’ADN polymérase ?
L’anneau coulissant
Vrai ou Faux.
L’anneau coulissant est présent en plus grande importance sur le brin discontinu.
Vrai.
Vrai ou Faux.
L’ADN polymérase a, en tout temps, une forte affinité pour l’anneau coulissant.
Faux.
Seulement lorsque l’ADN pol est dans sa jonction amorce:matrice
Quelle est l’autre fonction des anneaux coulissants ?
Recruter des protéines ( RNase H, etc)
Comment se nomme le complexe qui régule les anneaux coulissants, les hélicases et les ADN pol lors de la réplication ?
L’holoenzyme de l’ADN polymérase
De quoi est composé le Replisome ?
- ADN polymérase holoenzyme
- Hélicase
- Primase
Qu’est-ce que le réplicateur ?
Région avec séquences d’ADN suffisante pour initier la réplication. (AT riches)
Qu’est-ce que l’initiateur ?
Protéine qui reconnait spécifiquement une séquence du réplicateur.
Active l’initiation de la réplication.
Quelles sont les étapes de la réplication ?
- Réplicateur
- Initiateur
- Poseur d’hélicase
- Primase
- Holoenzyme pol
Vrai ou Faux.
La sélection des réplicateurs se fait en phase G1.
Vrai.
Vrai ou faux.
L’activation des origines de réplications se fait en phase G2.
Faux.
En phase S
Où s’installe le complexe réplicatif ?
Sur plusieurs millier d’origines de réplication en attendant la phase S
Quelles sont les étapes de formation du complexe réplicatif ?
- Reconnaissance du réplicateur par l’initiateur (ORC)
- ORC recrute 2 poseurs d’hélicases (Cdc6 et Cdt1)
- Ce complexe recrute l’ADN hélicase
Vrai ou faux.
En phase G1, le niveau de kinase est bas. Il va donc y avoir formation des pré-rc.
Vrai.
Le niveau cdk bas va inhiber l’activation des pré-rc mais va favoriser leur formation.
Quelle est la séquence des télomères ?
5’TTAGGG répété des milliers de fois
Quelle est la particularité des télomères ?
Répétitions bicaténaires possédant une extrémité 3’ monocaténaire.
Qu’est-ce qu’est la télomérase ?
Ribonucléoprotéine possèdant une matrice interne
Qu’est-ce que la TERT ?
C’est une sous unité catalytique qui sert de polymérase. C’est une réverse-transcriptase. Elle rétro transcrit l’ARN en ADN
Qu’est-ce qui inhibe l’élongation réalisée par les télomérases ?
Des protéines qui vont s’accumuler derrière la TERT et favoriser l’arrêt de l’élogation.
À quoi sert le boucle-T ?
Protéger le bout d’ADN simple brin laissé par la télomérase et ainsi empêcher la dégradation.
