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Biologie moléculaire > Chapitre 6 > Flashcards

Chapitre 6 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui est responsable de l’initiation de la réplication?

A

des séquences spécifiques d’ADN

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Q

Qu’est-ce que la réplication?

A

Ouverture du duplexe d’ADN pour permettre à l’hélicase de se lier autour d’un simple brin et que ce ddernier serve de matrice pour la synthèse d’une amorce d’ARN pour les fragments précoce et tardif

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3
Q

Où la synthèse de l’ADN commence généralement?

A

Aux régions internes

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4
Q

Combien y a-t-il d’origine de réplication chez les bactéries?

A

une seul car l’ADN est circulaire

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5
Q

Quel est le réplicon chez la bactérie?

A

Le chromosome entier

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6
Q

Qu’est-ce qui stimule l’initiation de la réplication et duplication de l’ADN?

A

La liaison de l’initiateur sur le réplicateur

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7
Q

Qu’est-ce que le réplicateur?

A

un ensemble de séquences en CIS de l’origine de réplication qui dirigent l’initiation

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8
Q

Est-ce que l’origine de réplication est synonyme de site d’ouverture du duplexe d’ADN?

A

Non. L’origine de réplication n’est qu’une petite partie du réplicateur

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9
Q

Qu’est-ce que l’initateur?

A

une protéine qui, en reconnaissant spécifiquement une partie de l’ensemble des séquences du réplicateur, active l’initiation de la réplication

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10
Q

Quelle est la caractéristique unique de l’initiateur?

A

c’est la seule protéine dont le domaine de liaison protéine-ADN est spécifique aux motifs de la séquence du réplicateur.

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11
Q

Comment les protéines autres que le réplicateur sont recrutées?

A

grâce à une combinaison d’interactions entre les protéines liées à l’initiateur

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12
Q

Quelles sont les 3 fonctions des protéines initiatrices?

A
  • Liaison à l’ADN
  • Séparation des brins
  • Recrutement de 2 réplisomes
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13
Q

Que contiennent les 2 réplisomes?

A

2 holoenzymes pol III
2 hélicases
primases
pinces coulissantes

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14
Q

Par quoi l’action des protéines du réplicon sont elles régulées?

A

L’hydrolyse de l’ATP

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15
Q

Quelle est la seule protéine de liaison à l’ADN impliquée dans l’initiation de la réplication?

A

L’initiateur

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16
Q

Quelles 2 caractéristiques tous les réplicateurs connus partagent?

A

1 site de liaison à l’initiateur qui noyaute l’assemblage de la machinerie d’initation de la réplication
une série de régions riches en liaisons A-T qui favorisent la séparation des deux brins (sans la provoquer)

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17
Q

Donnez un adjectif qualificatif pour la régulation de l’action des protéines d’initiation.

A

très précise

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18
Q

Quels sont les 2 motifs répétés cruciaux du réplicateur d’E. coli?

A

1 nonamère

1 tridécamère

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19
Q

Qu’est-ce qu’un nonamère?

A

Site de liaison à l’initiateur DnaA, répété 5X

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20
Q

Qu’est-ce qu’un tridécamère?

A

Site d’ouverture de l’origine de réplication, répété 3X

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21
Q

Comment se déroule la sélection de l’origine de réplication?

A

1) Liaison de l’initiateur à une séquence spécifique du réplicateur
2) l’initiateur fixé sur le réplicateur recrute d’autres facteurs d’initiation de la réplication

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22
Q

À quoi le mécanisme de sélection de l’origine de réplication fait essentiellement appel?

A

Liaisons protéines-ADN
Séquences spécifiques
interactions protéines-protéines

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23
Q

Lorsque DnaA de E. coli se lie sur les nonamères de oriC, par quoi DnaA est régulé?

A

liaison à l’ATP

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24
Q

Avec quoi DnaA-ATP intéragit?

A

les 3 répétitions du tridécamère du site d’ouverture de l’origine de la réplication et induit la séparation des deux brins sur plus de 20 pb dans la région de répétition du tridécamère

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25
Q

Que génère l’ouverture formée par DnaA-ATP?

A

un ADN simple brin de taille suffisante pour recruter d’autres protéines de réplication (hélicase..) et servir de matrice à la synthèse d’une amorce ARN

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26
Q

à quoi conduisent les liaisons protéines-ADN à des séquences spécifiques et les interactions protéines-protéines?

A

à l’assemblage de 2 réplisomes

27
Q

Dès que la matrice simple brin est prête, DnaA recrute un complexe de 2 protéines. Lequel?

A

L’hélicase DnaB lié à son proteur DnaC

28
Q

Quel est le rôle du proteur?

A

Empêcher l’hélicase de se fixer n’importe où

29
Q

Que fait DnaC une fois liée à l’ADN simple brin?

A

Elle dirige et assure la bonne fixation de l’hélicase autour du simple brin

30
Q

Que possède DnaC?

A

Un site de liaison à L’ATP

un site d’hydrolyse de l’ATP

31
Q

Que favorise la liaison DnaC-ATP?

A

l’interaction Hélicase-ADNsb

32
Q

Que permet l’hydrolyse de l’ATP dans la liaisons DnaC-ATP?

A

Permet de décrocher DnaC du complexe DnaB-ADNsb seulement après sa mise en place

33
Q

Pourquoi DnaA hydrolyse son ATP?

A

Pour aider la mise en place de l’hélicase

34
Q

Que fait le mouvement de l’hélicase?

A

il fait décrocher les DnaA

35
Q

Quand l’holoenzyme ADN Pol II est-il recruté à l’origine?

A

dès que le complexe matrice-amorce est formé et encore associé à l’hélicase

36
Q

Qu’arrive-t-il lorsque 2 holoenzymes ADN pol III sont en place?

A

2 pinces coulissantes sont attachées autour des 2 complexes matrices-amorce

37
Q

Avec quoi la synthèse de chacun des 2 brins précoces commence?

A

un des 2 coeurs pol III

38
Q

Après une progression de combien de pb une nouvelle amorce d’ARN est-elle synthétisée sur le brin tardif?

A

environ 1000 bases

39
Q

Qu’arrive-t-il lorsqu’une nouvelle amorce d’ARN est synthétisée?

A

une nouvelle pince coulissante est refermée sur le complexe matrice-amorce du brin tardif

40
Q

Par qui est reconnu la nouvelle pince coulissante refermée sur le nouveau complexe matrice-amorce?

A

Par le 2e coeur de Pol III.

Il y a synthèse du brin tardif

41
Q

Combien de fois par cycle cellulaire y a-t-il réplication

A

1 fois ni plus ni moins

42
Q

Qu’arrive-t-il si la réplication est incomplète?

A
  • Pas de séparation des chromatides soeurs

- cassures

43
Q

Pourquoi la réplication représente-t-elle un défi pour les eucaryotes?

A

1) un nombre suffisant d’origines de réplication doit être activé pour assurer la réplication du chromosome en entier lors de la phase S
2) les origines répliquées passivement ne doivent pas s’activer non plus pour ne pas répliquer l’ADN plus d’une fois!!

44
Q

Quelle est la première étape de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes?

A

1) sélection du réplicateur en phase G1

45
Q

Quelle est la deuxième étape de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes?

A

2) Activation de l’origine en phase S

46
Q

Que signifie AAA+ lorsqu’on parle de protéines?

A

Elles fonctionnent avec de l’ATP

47
Q

ORC et Cdc6 sont-elles des protéines de type AAA+?

A

Oui

48
Q

Lors de la sélection du réplicateur en G1: de quoi sont constitués le scomplexes pré-réplication?

A

4 protéines distinctes qui s’assemblent selon un ordre prédéfini à chaque réplicateur

49
Q

Orc reconnait et se lie au réplicateur. Que recrute-t-il?

A

2 proteurs d’hélicase (Cdc6 et Cdt1)

50
Q

Y a-t-il séparation des brins au stade de la sélection du réplicateur?

A

non il faut attendre la phase S

51
Q

Qu’arrive-t-il lors de l’activation de l’origine en phase S?

A
  • 2 protéines kinases CdK et Dk s’activent en phosphorylant le compexe pre-RC ( OCR, Cdc6, Cdt1 et hélicase Mcm2-7) ce qui provoque leur relargage dans le nucléoplasme (sauf Mcm 2-7)
  • Cdk et Ddk phosphorylent également d’autres protéines de réplication
  • lorsque le complexe matrice-amorce est formé, la pince coulissante (PCNA) est ajouté par son porteur
  • L’ADN pol epsilon reconnait l’amorce ARN et commence la synthèse du brin précoce
52
Q

Qu’est-ce qu’une kinase?

A

une protéine qui attache avec une liaison covalente un groupement phosphate sur une protéine cible

53
Q

Que signifie Cdk?

A

Cycline dependent kinase

54
Q

Que signifie Ddk?

A

Dbf4 Dependent Kinase

55
Q

Que permet le fait que Cdk et Ddk phosphorylent d’autres protéines de réplication?

A

Permet aux protéines de réplication de s’assembler à l’origine suivant un ordre précis avant que la synthèse de la première amorce d’ARN ne commence

56
Q

Dans quel ordre sont associées les protéines suivantes: ADN pol epsilon, ADN pol alpha/ primase, ADN pol delta?

A

1) ADN pol delta et epsilon

2) ADP pol alpha/ primase

57
Q

Que cause l’intéraction ADN pol alpha/primase avec l’hélicase?

A

Synthèse de l’amorce ARN

58
Q

Qu’arrive-t-il après la synthèse d’environ 1000 bases?

A

L’ADN pol alpha/primase synthétise d’autres amorces d’ARN qui serviront à la synthèse dubrin tardif par la polymérase delta

59
Q

Quels sont les rôles des kinases Cdk?

A

1) Activation des pre-RCs

2) Inhibition des nouveaux pre-RCS

60
Q

Dans quelle phase les pre-RCs peuvent être formés?

A

seulement G1

61
Q

Dans quelle phase les pre-RCs peuvent être activés?

A

seulement S

62
Q

Comment est le taux de Cdk en phase G1?

A

Bas

63
Q

Comment est le taux de Cdk en phase S?

A

Élevé

64
Q

Quand la formation de noueaux pre-RCs se fera-t-elle?

A

Pas avant la prochaine phase G1

Biologie moléculaire (6 decks)

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