Chapitre 6 Flashcards
Qu’est-ce qui est responsable de l’initiation de la réplication?
des séquences spécifiques d’ADN
Qu’est-ce que la réplication?
Ouverture du duplexe d’ADN pour permettre à l’hélicase de se lier autour d’un simple brin et que ce ddernier serve de matrice pour la synthèse d’une amorce d’ARN pour les fragments précoce et tardif
Où la synthèse de l’ADN commence généralement?
Aux régions internes
Combien y a-t-il d’origine de réplication chez les bactéries?
une seul car l’ADN est circulaire
Quel est le réplicon chez la bactérie?
Le chromosome entier
Qu’est-ce qui stimule l’initiation de la réplication et duplication de l’ADN?
La liaison de l’initiateur sur le réplicateur
Qu’est-ce que le réplicateur?
un ensemble de séquences en CIS de l’origine de réplication qui dirigent l’initiation
Est-ce que l’origine de réplication est synonyme de site d’ouverture du duplexe d’ADN?
Non. L’origine de réplication n’est qu’une petite partie du réplicateur
Qu’est-ce que l’initateur?
une protéine qui, en reconnaissant spécifiquement une partie de l’ensemble des séquences du réplicateur, active l’initiation de la réplication
Quelle est la caractéristique unique de l’initiateur?
c’est la seule protéine dont le domaine de liaison protéine-ADN est spécifique aux motifs de la séquence du réplicateur.
Comment les protéines autres que le réplicateur sont recrutées?
grâce à une combinaison d’interactions entre les protéines liées à l’initiateur
Quelles sont les 3 fonctions des protéines initiatrices?
- Liaison à l’ADN
- Séparation des brins
- Recrutement de 2 réplisomes
Que contiennent les 2 réplisomes?
2 holoenzymes pol III
2 hélicases
primases
pinces coulissantes
Par quoi l’action des protéines du réplicon sont elles régulées?
L’hydrolyse de l’ATP
Quelle est la seule protéine de liaison à l’ADN impliquée dans l’initiation de la réplication?
L’initiateur
Quelles 2 caractéristiques tous les réplicateurs connus partagent?
1 site de liaison à l’initiateur qui noyaute l’assemblage de la machinerie d’initation de la réplication
une série de régions riches en liaisons A-T qui favorisent la séparation des deux brins (sans la provoquer)
Donnez un adjectif qualificatif pour la régulation de l’action des protéines d’initiation.
très précise
Quels sont les 2 motifs répétés cruciaux du réplicateur d’E. coli?
1 nonamère
1 tridécamère
Qu’est-ce qu’un nonamère?
Site de liaison à l’initiateur DnaA, répété 5X
Qu’est-ce qu’un tridécamère?
Site d’ouverture de l’origine de réplication, répété 3X
Comment se déroule la sélection de l’origine de réplication?
1) Liaison de l’initiateur à une séquence spécifique du réplicateur
2) l’initiateur fixé sur le réplicateur recrute d’autres facteurs d’initiation de la réplication
À quoi le mécanisme de sélection de l’origine de réplication fait essentiellement appel?
Liaisons protéines-ADN
Séquences spécifiques
interactions protéines-protéines
Lorsque DnaA de E. coli se lie sur les nonamères de oriC, par quoi DnaA est régulé?
liaison à l’ATP
Avec quoi DnaA-ATP intéragit?
les 3 répétitions du tridécamère du site d’ouverture de l’origine de la réplication et induit la séparation des deux brins sur plus de 20 pb dans la région de répétition du tridécamère
Que génère l’ouverture formée par DnaA-ATP?
un ADN simple brin de taille suffisante pour recruter d’autres protéines de réplication (hélicase..) et servir de matrice à la synthèse d’une amorce ARN
à quoi conduisent les liaisons protéines-ADN à des séquences spécifiques et les interactions protéines-protéines?
à l’assemblage de 2 réplisomes
Dès que la matrice simple brin est prête, DnaA recrute un complexe de 2 protéines. Lequel?
L’hélicase DnaB lié à son proteur DnaC
Quel est le rôle du proteur?
Empêcher l’hélicase de se fixer n’importe où
Que fait DnaC une fois liée à l’ADN simple brin?
Elle dirige et assure la bonne fixation de l’hélicase autour du simple brin
Que possède DnaC?
Un site de liaison à L’ATP
un site d’hydrolyse de l’ATP
Que favorise la liaison DnaC-ATP?
l’interaction Hélicase-ADNsb
Que permet l’hydrolyse de l’ATP dans la liaisons DnaC-ATP?
Permet de décrocher DnaC du complexe DnaB-ADNsb seulement après sa mise en place
Pourquoi DnaA hydrolyse son ATP?
Pour aider la mise en place de l’hélicase
Que fait le mouvement de l’hélicase?
il fait décrocher les DnaA
Quand l’holoenzyme ADN Pol II est-il recruté à l’origine?
dès que le complexe matrice-amorce est formé et encore associé à l’hélicase
Qu’arrive-t-il lorsque 2 holoenzymes ADN pol III sont en place?
2 pinces coulissantes sont attachées autour des 2 complexes matrices-amorce
Avec quoi la synthèse de chacun des 2 brins précoces commence?
un des 2 coeurs pol III
Après une progression de combien de pb une nouvelle amorce d’ARN est-elle synthétisée sur le brin tardif?
environ 1000 bases
Qu’arrive-t-il lorsqu’une nouvelle amorce d’ARN est synthétisée?
une nouvelle pince coulissante est refermée sur le complexe matrice-amorce du brin tardif
Par qui est reconnu la nouvelle pince coulissante refermée sur le nouveau complexe matrice-amorce?
Par le 2e coeur de Pol III.
Il y a synthèse du brin tardif
Combien de fois par cycle cellulaire y a-t-il réplication
1 fois ni plus ni moins
Qu’arrive-t-il si la réplication est incomplète?
- Pas de séparation des chromatides soeurs
- cassures
Pourquoi la réplication représente-t-elle un défi pour les eucaryotes?
1) un nombre suffisant d’origines de réplication doit être activé pour assurer la réplication du chromosome en entier lors de la phase S
2) les origines répliquées passivement ne doivent pas s’activer non plus pour ne pas répliquer l’ADN plus d’une fois!!
Quelle est la première étape de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes?
1) sélection du réplicateur en phase G1
Quelle est la deuxième étape de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes?
2) Activation de l’origine en phase S
Que signifie AAA+ lorsqu’on parle de protéines?
Elles fonctionnent avec de l’ATP
ORC et Cdc6 sont-elles des protéines de type AAA+?
Oui
Lors de la sélection du réplicateur en G1: de quoi sont constitués le scomplexes pré-réplication?
4 protéines distinctes qui s’assemblent selon un ordre prédéfini à chaque réplicateur
Orc reconnait et se lie au réplicateur. Que recrute-t-il?
2 proteurs d’hélicase (Cdc6 et Cdt1)
Y a-t-il séparation des brins au stade de la sélection du réplicateur?
non il faut attendre la phase S
Qu’arrive-t-il lors de l’activation de l’origine en phase S?
- 2 protéines kinases CdK et Dk s’activent en phosphorylant le compexe pre-RC ( OCR, Cdc6, Cdt1 et hélicase Mcm2-7) ce qui provoque leur relargage dans le nucléoplasme (sauf Mcm 2-7)
- Cdk et Ddk phosphorylent également d’autres protéines de réplication
- lorsque le complexe matrice-amorce est formé, la pince coulissante (PCNA) est ajouté par son porteur
- L’ADN pol epsilon reconnait l’amorce ARN et commence la synthèse du brin précoce
Qu’est-ce qu’une kinase?
une protéine qui attache avec une liaison covalente un groupement phosphate sur une protéine cible
Que signifie Cdk?
Cycline dependent kinase
Que signifie Ddk?
Dbf4 Dependent Kinase
Que permet le fait que Cdk et Ddk phosphorylent d’autres protéines de réplication?
Permet aux protéines de réplication de s’assembler à l’origine suivant un ordre précis avant que la synthèse de la première amorce d’ARN ne commence
Dans quel ordre sont associées les protéines suivantes: ADN pol epsilon, ADN pol alpha/ primase, ADN pol delta?
1) ADN pol delta et epsilon
2) ADP pol alpha/ primase
Que cause l’intéraction ADN pol alpha/primase avec l’hélicase?
Synthèse de l’amorce ARN
Qu’arrive-t-il après la synthèse d’environ 1000 bases?
L’ADN pol alpha/primase synthétise d’autres amorces d’ARN qui serviront à la synthèse dubrin tardif par la polymérase delta
Quels sont les rôles des kinases Cdk?
1) Activation des pre-RCs
2) Inhibition des nouveaux pre-RCS
Dans quelle phase les pre-RCs peuvent être formés?
seulement G1
Dans quelle phase les pre-RCs peuvent être activés?
seulement S
Comment est le taux de Cdk en phase G1?
Bas
Comment est le taux de Cdk en phase S?
Élevé
Quand la formation de noueaux pre-RCs se fera-t-elle?
Pas avant la prochaine phase G1
