Chapitre 6 Flashcards
Combien de codons codent pour les 20 AA ?
61
Qu’est-ce qu’on appelle la dégénérescence génétique ?
Le fait que 61 codons codent pour 22 aa seulement
Nommez les codons stop
UAA, UAG, UGA
Quel codon pour la méthionine?
AUG
V ou F : les organismes vivants ont des code génétiques différents (animaux, homme, algue)
Faux. Tout les êtres vivants ont le même code génétique
Quel est l’effet d’une mutation sur la première base d’un codon?
Induit souvent un changement d’aa ou un codon stop
Quel est l’effet d’une mutation sur la deuxième base d’un codon?
Amène toujours un changement d’acide aminé
Quel est l’effet d’une mutation sur la troisième base d’un codon?
conservatrice en général
Donner le codon initiateur
AUG
Quel est le codon de la sélénocystéine?
UGA (comme un stop)
Comment l’ADN sait si le codon est une sélénocystéine ou un stop?
présence d’une structure spécifique en boucle dans l’ARN messager. Un ARNt spécifique reconnait le codon UGA et interagit avec un complexe protéique qui reconnait la séquence en boucle
Quelle est la structure de la sélénocystéine?
c’est une sérine avec un atome de séléniym (Se)
ou une cystéine avec un Se à la place du soufre
Comment les ARNt reconnaissent-ils les codon?
Via un anti codon
de quel coté les ARNt portent-ils l’acide aminé
extrémité 3’
Qu’est-ce qu’un anticodon
triplet de nucléotides complémentaire au codon (appariemment anti parallèle)
Quelles sont les modifications post transcriptionnelle possible sur un ARNt
Inosine (fréquente en première position) I = hypoxantine (base); inosine (nucléoside)
Methylation (sur les thymines)
Dihydro-uridine (D)
Désamination (adénine –> hypoxanthine)
Isomérisation (pseudo uridine = psy)
ajout du CCA en 3’ (non codé dans le génome)
Quelle est la structure tridimensionnelle de l’ARNt
en L
strabilisé par nucléotides non conventionnels
Quelle est la structure secondaire de l’ARNt? Combien de région d’appariemment?
trèfle
4 régions
Quelle est la structure de la pseudo uridine? de la dihydro uridine? de l’hypoxanthine?
regarder schéma
Qu’est-ce qui remplace les uridines dans un vaccin à ARNmessager?
les pseudo uridines (pour ne pas être reconnues et induire une réaction immunitaire)
V ou F : un ARNt reconnait un seul type de codon
faux, certaines en reconnaissent plusieurs grace à des appariemment inhabituels
V ou F : certains codons peuvent être reconnus par 2 ARNt différents
Vrai (exemple de la valine)
Quel est le codon fréquent et le code rare dans l’ARNm humain?
Fréquent : GUG
Rare : GUA
Que font les aminoacyl-tRNA synthétase?
synthétisent la liaison ESTER entre adénosine 3’ des ARNt et l’acide aminé
20 tRNA synthétase, 1 pour chaque acide aminé
Quelles sont les 2 étapes d’incorporation d’un acide aminé par l’aminoacyl tRNA synthétase
- hydrolyse d’ATP en AMP et liaison de l’AMP sur la fonction acide de l’aa = activation de l’aa
- greffe de l’aa activé au niveau du groupement 3’OH de l’adénosine à l’extrémité 3’ de l’ARNt (liaison ester avec le groupement COOH de l’aa). Liaison riche en énergie et servira pour le transfert de l’aa à une chaine polypeptidique lors de la traduction dans le ribosome
V ou F : les aminoacyl tRNA synthétase ont une fonction de correction d’erreurs
Vrai, ça s’appelle le site d’édition.
Hydrolyse si erreur.
Taux d’erreur : 1/40 000
Cette fiabilité est capitale.
Comment s’appelle un ARNm complexé à de multiples ribosomes?
polysomes
Quelles sont les sous unités du ribosome?
60S et 40S
Combien pèse un ribosome (en Daltons)
Plusieurs millions de Daltons
quels sont les éléments centraux du ribosome?
les ARNr
Quels sont les modifications subies par les ARNr?
> 200 nucléotides modifiés dans les ARNr humains, principalement 2’-0-méthylation des pseudo uridines
ou se fait la maturation des ARNr?
dans le nucléole
qui s’occupe de la transcription de l’ARN pré-ribosomique?
ARN polymérase I
qui s’occupe de la maturation des pré ARNr?
- nombreux snoARN (small nucleolar RNA) : ARN guides pour le ciblage des enzymes de modification des nucléotides
- Clivage pour produire ARN ribosomiques matures
Combien de facteurs d’assemblage pour les ribosomes? Dans quel compartiments?
200 facteurs d’assemblage (protéines) (association transitoire)
Dans 3 compartiments : nucléole, nucléoplasme, cytoplasme
Combien de site de fixation de l’ARNt dans un ribosome? Comment s’appellent-ils?
3 sites
- A : Aminoacyl-tRNA
- P : peptide
- E : Exit
Quel est l’ARNt spécifique de l’initiation de la traduction dans le ribosome?
ARNt-iMet
Quel est l’objectif à atteindre à la fin de l’étape de l’initiation de la traduction par le ribosome?
Positionnement de l’ARNt-iMet au site P en regard du codon initiateur
traduction ARNt grâce ribosome : Comment s’appelle le complexe de pré-initiation ?
complexe de pré-initiation 43S
traduction ARNt grâce ribosome : comment s’appelle le facteur d’initiation reconnaissant la coiffe?
elF4E
traduction ARNt grâce ribosome : de quel coté est recruté l’ARNm au niveau du complexe de pré initiation?
5’
traduction ARNt grâce ribosome : comment dans la grande sous unité ou la petite sous unité?
petite sous unité
Qui est le codon initiateur de la traduction?
premier AUG depuis l’extrémité 5’ de l’ARNm (coiffe)
Nécessité d’un contexte de séquence adéquat
Quelles sont les 4 étapes de l’élongation?
- Fixation de l’ARNt au niveau du site A
- Catalyse nouvelle liaison peptidique
- Déplacement de la grande sous-unité de 3 nucléotides en 3’ de l’ARN
- Translocation de la petite sous unité (ARNt au site P, ARNt précédent au site E, site A libre pour accueillir un nouveau ARNt-aa)
Avec quoi arrivent les ARNt-aa qui s’installent au site A du ribosome?
Des facteurs d’élongations lié à une molécule de GTP. Leur présence empêche la formation de la liaison peptidique (par masquage).
Si l’appariement est correct, le facteur d’élongation utilise sa fonction GTPase, hydrolyse le GTP en GDP et induit la dissociation du facteur d’élongation.
l’aa devient accessible pour la synthèse de la liaison.
L’hydrolyse fourni énergie pour translocation du ribosome.
Quels sont les 2 mécanismes qui garantissent la fiabilité du décryptage du code génétique ?
- correction par les aminoacyl-tRNA transférase
- Contrôle appariement par les facteurs d’élongation
Comment est régulé la traduction?
par certains codons rares avec ARNt peu abondant = reconnaissance lente.
Décrire la terminaison de la traduction
- reconnaissance des codons stop par des facteurs de terminaison qui catalyse l’hydrolyse de la liaison ester entre le dernier aa et son ARNt
- translocation de la grande sous unité du ribosome
- libération du polypeptide et dissociation du ribosome
V ou F : le ribosome est la cible de nombreux antibiotiques
Vrai
différents sites d’interactions, peut inhiber ou altérer la synthèse protéique
La traduction de certaines protéines est compartimentalisées, quelles sont les protéines concernées?
- protéines membranaires ou sécrétées : réticulum endoplasmique
- neurones
- synthèse protéique mitochondriale
Décrire la traduction des protéines membranaires ou sécrétées
débute dans le cytoplasme, synthèse d’un peptide signal
protéine SRP reconnait le signal, arrêt de la traduction
le ribosome s’accroche à la membrane du récitculum endoplasmique, présence protéine ribophorine
Engagement du peptide signal dans un canal membranaire, départ SRP et poursuite traduction
décrire la traduction compartimentalisée dans les neurones
transport de certains ARNm dans les synapses et traduction localisée :
- transcription et formation de particules ribonucléoprotéines (noyau)
- transport de particules ribonucléoprotéiques
- traduction localisées dans les terminaux synaptiques
Combien de protéines sont codées par le génome mitochondrial?
13
Combien d’ARNt et ARNr sont codés par le génome mitochondrial humain?
22 ARNt
2 ARNr
V ou F : le ribosome mitochondrial est différent du ribosome bactérien
Faux. Il est apparenté, les mitochondries sont originellement des bactéries en symbiose avec les cellules eucaryotes
Pourquoi la mitochondrie synthétique ses propres protéines?
les 13 protéines codées par génome mitochondrial sont très hydrophobes et ne pourraient pas se replier correctement dans le cytoplasme. Leur synthèse locale est donc une nécessité.
Quel est le mécanisme de régulation de la traduction au niveau global?
Régulation de la disponibilité de elF4E (facteur d’initiation reconnaissant la coiffe) par liaison avec des protéines 4E-BP qui inhibe.
La phosphorylation des protéines 4E-BP empêche la liaison et donc favorise la traduction.
Quelle utilité pour les séquences 3’ UTR et 5’ UTR?
Reconnaissance de motifs d’ARN spécifiques par des protéines de liaison à l’ARN (RBP)
Inhibition de l’initiation de la traduction
Ex : protéine FMRP, mutée dans syndrome X fragile
à quoi servent les phases ouvertes au sein de la région 5’UTR?
50% des genes contiennent des cadres de lecture ouverts en amont de l’AUG initiateur
initiation de la traduction et dissociation du ribosome avant la vraie phase de lecture: traduction de la protéine codée par le gène inhibée
