Chapitre 6 Flashcards
Quelles sont les deux voies majeures de transport vésiculaire ?
L’exocytose et l’endocytose
Quelle est l’utilité de l’exocytose ?
La biosynthèse (ajout de molécules dans la MP) et la sécrétion extracellulaire.
Quelle est l’utilité de l’endocytose ?
Capter des molécules du milieu extérieur ou de la MP pour qu’elles soient dégradées//réutilisées.
Comment les vésicules de transport sont-elles sélectives ?
Elles transporte une cargaison sélective et elles ont une membrane-cible sélective. Elles maintiennent leur sélectivité (identité) grâce à leurs molécules de membranes et leur interaction avec les marqueurs cytosoliques sur les membranes-cibles.
Comment classe-t-on les vésicules ?
Selon le type de manteau qu’elles ont.
1. Manteau de clathrine
2. COP1
3.COP2
Qu’est-ce que le manteau des vésicules ?
Une cage protéique à la surface cytosolique des vésicules. Il donne la première spécificité des vésicules, mais est éliminé avant la fusion avec la membrane cible = spécificité pour le cargo.
Quelles sont les 3 rôles remplis par le manteau ?
Concentrer les protéines membranaires spécifiques.
Faciliter la sélection des molécules à transporter
Mouler la vésicule grâce à la structure de treillis
Quelles sont les voies typiques des trois classes de vésicules ?
Clathrines : De la membrane plasmique vers les endosomes OU entre le Golgi et les endosomes
COP1 : font le recyclage à partir du Golgi
COP2 : Partent du RE vers le Golgi.
Quelles sont les caractéristiques de la clathrine ?
Une protéine formant une structure à 3 bras (triskelion) qui s’assemble avec d’autres pour faire une structure de panier à l’extérieur de la vésicule. Comporte 3 chaînes lourdes et 3 chaînes légères.
Quel est le rôle des protéines adaptatrices dans le manteau de clathrine ?
Lier la clathrine à la membrane et lier spécifiquement les différents récepteurs de chargement de la membrane qui sont spécifiques à la molécule cargo.
Quelles sont les étapes de formation d’un vésicule clathrine ?
Les molécules cargo se lient aux récepteurs de chargement.
L’adaptine lie les récepteurs et la clathrine.
L’accumulation de clathrine permet la formation de vésicules par bourgeonnement.
La vésicule se détache de la membrane et le manteau est éliminé.
Quelle est la spécificité des adaptines (spécifiques à quoi) ?
Elles sont spécifiques à différents récepteurs de chargements. Leur liaison est contrôlée par d’autres protéines membranaires.
Décrire la liaison de l’adaptine AP2 à la membrane.
AP2 est présente dans le cytosol sous une forme bloquée, où elle ne peut lier le récepteur.
Elle se lie d’abord à une molécule de membrane (PIP 4,5), ce qui l’active.
AP2 peut ensuite lier le récepteur de chargement possédant les bons signaux d’endocytose, ce qui stimule la courbure de la membrane, qui continuera avec la clathrine.
Comment les phospho-inositidines phosphates membranaires amènent de la spécificité au transport vésiculaire ?
Les groupement phosphorylés différemment sont reconnus par des adaptines différentes, spécifiques à cette catégorie seulement. En contrôlant quel PIP se retrouve où, on peut déterminer quelles membranes forment des vésicules de clathrines spécifiques.
Comment contrôle-t-on le type de PIP retrouvés dans les membranes ?
En contrôlant quelles enzymes sont présentes dans les compartiments. Il existe différentes kinases//phosphatases pour chaque PIP, donc en contrôlant leur distribution er leur régulation dans chaque organelle//région, on décide quel PIP y est retrouvé.
Quelle protéine permet le séparation d’une vésicule bourgeonnante ?
La dynamine qui s’enroule autour du col via son domaine de liaison avec PIP 4,5.
Quelles sont les étapes de relargage vésiculaires du manteau de clathrine ?
Une PIP phosphatase élimine le PIP 4,5.
L’adaptine est donc moins fortement liée au récepteur de chargement et se décroche.
Le manteau de clathrine se défait.
Une Hsp70 aide le détachement
Quelle protéine fournit l’énergie nécessaire à la dissociation du manteau de clathrine ?
La chaperonne Hsp70 ATPase.
Quel est le mécanisme d’assemblage du manteau de clathrine sur la membrane plasmique et le Golgi ?
Les PIP.
Quel est le mécanisme d’assemblage du manteau de clathrine sur les endosome ?
Les GTPases de recrutement (moins commun)
Quel est le mécanisme d’assemblage des manteaux COP1 et COP2 sur le Golgi et le RE ?
Les GTPases de recrutement
Quels sont les 2 types de GTPases de recrutement ?
Les Arf qui font l’assemblage des vésicules COP1 et clathrine sur le Golgi.
Sar1 qui fait l’assemblage des vésicules COP2 sur le RE.
Quelle forme des GTPases se retrouvent surtout dans le cytosol ?
La forme inactive, liée au GDP.
Comment la formation d’une vésicule COP2 sur le RE se produit-elle ?
Un signal dans le RE active la protéine membranaire Sar1-GEF
Sar1-GEF active Sar1 en échangeant le GDP -> GTP
Sar1 activé expose son domaine amphiphile qui s’insère dans la membrane du RE
Sar1 recrute les protéines du complexe COP2
La vésicule bourgeonne et se sépare par pincement
Est-ce que les vésicules COP2 perdent leur manteau après le bourgeonnement ?
Oui, mais pas immédiatement après.
Qu’est ce qui contrôle la perte de manteau des vésicules COP2 ?
L’hydrolyse lente du GTP par les GTPases Sar1. Dans sa forme inactivée, le domaine amphiphile est caché et Sar1 se dissocie de la membrane de la vésicule avec les protéines du manteau.
Comment la spécificité d’une vésicule pour une membrane d’arrimage cible est-elle établie ?
Par des marqueurs de surface sur les vésicules (qui changent selon le cargo transporté) et par des récepteurs complémentaires sur les membranes cibles.
Quelles sont les 2 protéines de la membrane cible qui participent à l’arrimage des vésicules ?
Les protéines et effecteurs Rab qui dirigent les vésicules
Les protéines et régulateurs SNARE qui permettent la fusion des bicouches.
Vrai ou Faux. Les différentes protéines de la famille Rab sont spécifiques à au moins une organique.
Vrai
Comment les organites identifient-elles leur membrane ?
Par une distribution et une combinaison des différentes protéines Rab.
À quel endroit se trouvent les Rab-GDP (inactif) ?
Dans le cytosol, car ils sont liés à un inhibiteur (GDI) qui les garde solubles.
Quelle action est provoquée par les Rab-GEF ?
L’activation des protéines Rab en les liant au GTP les dissocie de l’inhibiteur GDI et elles peuvent alors s’associer à la membrane vésiculaire ET la membrane cible.
Vrai ou faux. Après l’arrimage de la vésicule, les protéines Rab sont envoyées vers les endosomes pour être dégradées.
Faux. Les protéines Rab sont retournées au cytosol où elles peuvent être réutilisées pour une prochaine vésicule.
Quelle protéine de la membrane les protéines Rab vont-elles liées ?
Les effecteurs Rab, qui restent toujours liés à la membrane de l’organite.
Quelles sont les fonctions des effecteurs Rab ?
- Protéines motrices : déplacent les vésicules sur les microfilaments et les microtubules.
- Relier 2 membranes à proximité lors de l’arrimage des vésicules
- Interagir avec les protéines SNAREs pour la fusion des bicouches.
Qu’est ce qui empêche de rapprocher deux membranes pour les fusionner en absence de mécanismes de fusion ?
Les molécules d’eau attirées par les têtes polaires des membranes doivent être déplacées, ce qui est défavorable sur le plan énergétique.
Quelles sont les 2 types de SNARE et où les retrouve-t-on ?
SNARE-v ont une chaîne unique et sont sur la membrane des vésicules
SNARE-t ont 2-3 chaînes protéiques et sont sur la membrane des organites cibles.
Comment les protéines SNARE permettent-elles le rapprochement des membranes ?
Les SNARE des 2 membranes interagissent en enroulant leurs domaines hélicoïdaux (hélices) pour faire un faisceau de 4 hélices. Ce complexe verrouille les 2 membranes ensemble à proximité.
Comment s’appelle le complexe SNAREv et -t ?
Le complexe trans-SNARE.
Comment les SNARE contribuent-elles à la spécificité du transport vésiculaire ?
Il existe différentes sortes de SNAREs qui sont associées à des organites spécifiques. Les SNARE-t et -v s’associent très spécifiquement pour s’assurer que les vésicules lient les bonnes cibles.
Quelles sont les étapes de la fusion des membranes ?
- Appariement des SNAREs qui permet d’expulser l’eau
- Les feuillets cytosoliques des membranes fusionnent pour former un pédicule de connexion
- Le complexe trans-SNARE catalyse la fusion grâce à l’énergie libérée lorsque les hélices s’enroulent (réaction favorisée). Les membranes sont tirées l’une vers l’autre.
Comment les SNAREs sont elles déroulées après la fusion ?
Une protéine NSF ATPase (utilise l’ATP)
Quelles sont les étapes globales de l’amarrage d’une vésicule sur une membrane cible et les protéines impliquées ?
Les Rab-GTP (activé par GEF) lié à la vésicules, la cible ou les 2 interagissent avec les Rab effectrices de la cible.
Les SNAREs v et t s’apparient et catalysent la fusion des bicouches.
GAP induit l’hydrolyse en Rab-GDP qui lie l’inhibiteur GDI et revient soluble dans le cytosol (recyclage).
Quelles sont les cargo transportés dans la récupération rétrograde du Golgi vers le RE ?
-Des molécules qui se sont échappées de leur compartiment cible
-Des protéines de transport vésiculaire qui sont réutilisées
Quelles sont les fonctions du Golgi (3) ?
- Station de tri des protéines venant du RE vers les lysosomes et autres membranes
- Site de synthèse des glucides (p. ex. glycosaminoglycane -> GAG)
- Site de glycolisation (addition d’oligosaccharides) sur les protéines et lipides pour leur donner leur fonction complète
Quelles sont les 3 grandes étapes du transport de RE jusqu’à la fin du Golgi ?
- Départ du RE par les vésicules COP2
- Formation d’agrégats tubulaires vésiculaires
- Transport à travers les différents compartiments du Golgi
Quel type de RE retrouve-t-on à la sortie des vésicule COP2, ?
RE lisse -> dépourvu de ribosomes
Quelle est la condition que les protéines doivent remplir avant d’être intégrée aux vésicules ?
Elles doivent être correctement repliées et assemblées (contrôle par la glycolisation). Sinon, elles sont dégradées par le protéasome.
Quels sont les 2 types de protéines transportées du RE au Golgi ?
Des protéines membranaires et des protéines cargo solubles dans la lumière du RE.
Quelle caractéristique possèdent les protéines qui peuvent être transportées à l’extérieur du RE ?
Un signal de sortie qui est reconnue soit par le manteau de COP2 (protéine membranaire//domaine cytosolique d’un récepteur de chargement) soit par un récepteur de chargement de vésicule (si c’est une protéine soluble).
Quels sont les 2 types de protéines membranaires transportées du RE vers le Golgi ?
Les protéines membranaires cargo qui possèdent un signal de sortie sur leur côté cytosolique et les récepteurs de chargement qui lient les protéines cargo solubles et le manteau et qui sont retournée au RE après le transport.
Pourquoi certaines protéines résidentes du RE sont-elles exportées vers le Golgi et qu’advient-il dans ces cas là ?
Elles sont simplement transportées par accident lors de la formation de la vésicule, de manière non spécifique et donc moins fréquente. Elles seront retournées au RE via la récupération rétrograde.
Quelle caractéristique des récepteurs de chargement permet leur retour vers le RE une fois le cargo libéré dans le Golgi ?
Un signal de recapture reconnu par le manteau de COP1 du transport rétrograde.
Quelle est la conséquence d’une mutation de la protéine dans son signal de sortie vers le Golgi ?
La protéine va rester dans le RE et ne pourra pas faire son action biologique (par exemple : facteur de coagulation muté = absence dans le plasma sanguin = le sang de coagule pas comme il faut).
Qu’est ce qu’un agrégat vésiculaire ?
Le résultat de la fusion de plusieurs vésicules émergeants du RE vers le Golgi qui ont perdu leur manteau de COP2.