Chapitre 5 - Microbiologie et infections Flashcards
Qu’est ce qu’un microorganisme?
Tout organisme vivant visible seulement au microscope ou à l’ultramicroscope, 4 principaux groupes : bactéries, virus, parasites et champignons (levures et moisissures)
Qu’est qu’un vecteur?
Agent qui transmet un pathogène
Qu’est ce qu’un réservoir?
Lieu dans lequel des microorganismes survivent ou se multiplient entre les infections et à partir duquel s’effectue la contamination (ex : un animal peut servir de réservoir, un humain aussi)
Qu’est ce qu’une infections endogènes et exogènes?
Se dit d’une infection qui est due à un agent infectieux provenant de l’intérieur de l’organisme (endogène) ou de l’extérieur (exogène)
Qu’est ce que la période d’incubation?
Temps qui s’écoule entre l’entrée de l’agent infectieux dans l’organisme et l’apparition des premiers signes cliniques
Qu’est ce qu’une épidémie?
Une infection qui se propage rapidement et qui affecte un grand nb d’individus dans une région ou une population donnée au même moment
Qu’est ce qu’une pandémie?
Une épidémie qui s’étend à travers le monde (sur étendue du globe)
Qu’est ce qu’un porteur sain?
Individu capable de transmettre un agent infectieux sans toutefois présenter des symptômes de la maladie
Qu’est ce qu’une bactérie?
Organisme unicellulaire (une seule cellule) dont les dimensions sont d’ordre du micromètre, utiliser un microscope pour les observer
Quelles sont les principales composantes des bactéries?
Membrane plasmique
Cytoplasme : contient ribosomes essentiels à la synthèse protéique
Matériel génétique : sous forme de chromosome unique, libre dans le cytoplasme
Paroi : entoure la membrane plasmique, certains en ont pas
Quelles sont les composantes secondaires des bactéries?
Capsule : entoure la paroi et empêche la phagocytose des bactéries qui la possèdent par les phagocytes de l’hôte
Flagelle : structure protéique permettant la mobilité (déplacement) de certaines bactéries
Pilus : structure qui permet adhésion des bactéries sur les surfaces, certains sexuels (permettent échange du matériel génétique entre 2 bactéries comme la résistance aux antibio), les pili sont + courts et + fins que flagelles, aussi appelé fimbriae
Spore : pas une composante, état de certaines bactéries, dans les conditions défavorables de survie, formation de spores, sporulation, si spore remis dans conditions favorables, retournent dans état végétatives, germination, spores –> forme de résistance des bactéries et sont cause de certaines contaminations (tétanos, charbon)
Quelles sont les différentes formes, morphologie des bactéries?
Ronde : coques ou cocci
Allongées : bâtonnets ou bacilles
Intermédiaire entre coque et bacille : cocobacille
+/- spiralée : spirochète
Bâtonnet recourbé : vibrion
Comment est effectué l’identification bactérienne?
Le Gram : bactéries Gram + VS Gram -
Coloration basée sur propriétés de composition de la paroi
2 groupes de bactéries : Gram+ (violet) paroi principalement consituée principalement de peptidoglycanes et faible portion de lipides ainsi que les bactéries Gram- (en rose), paroi possède peu de peptodoglycane et ++ de lipides
Différences entre composition de leur paroi procurent une sensibilité différente à l’action des colorants et décolorants, permettant de les colorer différemment
Quelles sont les principales caractéristiques des bactéries?
Procaryotes et pas de noyau
ADN : forme de chromosome unique et circulaire
ADN : support des info transmises pour la synthèse des nombreuses protéines bactériennes responsables de leur survie et leur multiplication
Méthode de reproduction particulière : divisent par 2 et méthode exponentielle
Nuisibles ou bénéfiques
Peuvent causer infection dans les plaies
Rôle fondamental : décomposition des organismes vivants, dans système digestif pour accomplir son travail, dans processus de fermentation pour la fabrication de différents alcools, yogourts, fromages, …
Qu’est ce que la flore normale?
Naissance –> bébé se contamine, colonisation ou établissement d’une flore microbienne normale
Humain état normal : héberge ++ microorganismes (surtout bactéries), + de cellules bactériennes que cellules humaines, produisent pas de maladie dans des conditions normales (niveau nez, bouche, gorge, peau, vagin, tube digestif)
Niveau intestinal : [ ] et population flore varient, - bact. estomac et dans intestin grêle, + bact. fin intestin grêle et côlon
Sang : pas de bactéries car milieu stérile
Environnement adapté pour croissance bactérie : corps leur fournit nutriments, chaleur et humidité
Quelle est l’importance de la flore normale pour l’hôte?
- Préviennent croissance d’organismes nuisibles par compétition pour l’espace, les nutriments
- Produisent différentes substances toxiques pour ces derniers
- Réduisent oxygène dispo pour certains pathogènes aérobies
- Essentielles pour la production de certains nutriments essentiels (ex : vitamine K)
Peut causer des infections, lorsqu’il change de localisation, peut devenir pathogène à ce moment
Traitement prolongé avec des antibio à large spectre peut être néfaste, s’attaquent aux bactéries de la flore aussi, dérèglement quantitatif occasionnée pour engendrer des infections
Quelle est le processus d’infection?
Facteurs favorisants : source d’infection, présence agent pathogène actif, vecteur, porte d’entrée et porte de sortie
Qu’est ce qu’une porte d’entrée?
Porte d’entrée : voie d’accès introduisent microorganismes dans organisme, dépend du microorganisme impliqué et du vecteur impliqué, différentes portes :
- Peau (coupure, égratignure, plaie)
- Muqueuses : système resp. (nez. gorge, bronches, poumons), yeux (conjonctive), bouche, tube gastro-intestinal, voie urogénitale
Chemin des microorganisme à l’int. compliqué et variable, chaque type possède son organe préférentiel
Qu’est ce que le vecteur dans le processus d’infection?
Vecteurs : 2 types
1. Vecteurs inanimés : aliments, excréments (selles, salive, pus), eau, bandages, instruments, aiguilles
2. Vecteurs animés : arthropodes, mammifères, mains des patients, techniciens, médecins, infirmières
Qu’est ce qu’une porte de sortie?
Sortent pas par l’endroit où ils sont entrés, pour réinfecter un nouvel hôte
Quels sont les facteurs de la susceptibilité de l’hôte?
Importante pour apparition de la maladie : Âge, état physiologique, état hormonal, facteurs génétiques, état nutritionnel, facteurs environnementaux, facteurs émotionnels
Comment peut-on prévenir les infections?
En bloquant chacun des éléments :
- Porte d’entrée : masque, gants, désinfection, bandage
- Vecteurs : insecticides, médicaments préventifs, stérilisation, nettoyage et désinfection, hygiène
- Porte de sortie : masque, nettoyage et désinfaction (surface inanimées)
Quels sont les éléments importants pour la croissance bactérienne?
Eau, température, pH, oxygène
Comment agit l’eau sur la croissance bactérienne?
Indipensable au développement des microorganisme, représente 80% de tous les consistants cellulaires, sans eau, peut pas survivre, peut pas se multiplier
Gonocoque très sensibles à la dessiccation survivent juste sur les muqueuses (humidifié suffisante), c’est pourquoi elles ne sont pas transmis par contact direct
Autres comme tuberculose résistent à la dessiccation et peuvent survivre dans le pus, les expectorations, le sang ou les selles
Comment agit la température sur la croissance bactérienne?
Agit directement sur le développement microbien, tous les mécanismes de croissance dépendent des réactions chimiques du métabolisme, influencé par la température, déroulement réactions dépend de l’activité des enzymes cellulaires
Chaque espèce microbienne possède sa propre température optimale de développement et les limites de température sont très étroites
Chaque espèce : définir échelle de température
T min : T + basse à laquelle un microorganisme comme à se développer
T optimale : taux de croissance max
T max : multiplication microorganisme impossible
Comment agit la pH sur la croissance bactérienne?
pH optimum de croissance pour chaque espèce microbienne, surtout développement à la neutralité, pH de 7
Comment agit l’oxygène sur la croissance bactérienne?
Différence réactions à l’oxygène moléculaire selon espèces, existe relation entre différences comportement et activités métaboliques des microorganismes, diviser en 4 groupes
Quels sont les 4 groupes selon leur comportements à l’égard de l’oxygène?
Aérobie strict : développement juste en présence oxygène (en haut)
Anaérobie strict : développement juste en absence totale oxygène moléculaire (au fond)
Anaérobie facultatif : développement avec ou sans oxygène (partout)
Microaérophiles : bactéries aérobies qui ne se développent qu’à des pressions partielles d’oxygène inférieures à celle de l’atmosphère (faible qté oxygène) (proche du haut)
Comment on fait croitre les bactéries?
Besoin d’éléments nutritifs
Utilise milieu de culture afin fournir éléments essentiels et leur permet la reproduction, support qui permet la culture des cellules, de bactéries, de levures et de moisissures pour les étudier
Milieu de culture (base, agar et nutriments, solide) ou bouillon de culture sans agar : multiplication rapide en grand nb mais permet de privilégier un genre ou une famille
But culture : placer dans conditions optimales ou défavorables
Quels sont les caractéristiques des virus?
Parasites intracellulaires obligatoires
Reproduction : infecter une cellule hôte
En dehors de l’hôte : juste survivre
Prolifération (multiplication) entraine des modifications pathologiques chez cellule hôte
Très petite taille, ordre nanomètre, peut juste les voir au microscope électronique
Quels sont les composantes des virus?
Pas d’organisation cellulaire : pas de cytoplasme, pas de membrane cytoplasmique ni de métabolisme propre, dépendent donc des mécanismes de la cellule hôte pour se reproduire
Possède acide nucléique ADN ou ARN, monocaténaire (1 brin) ou bicaténaire (2 brins), linéaire ou circulaire, couche protéique entourant ce chromosome qu’on appelle le capside, parfois une enveloppe externe
Quels sont les modes de transmission d’un virus
Contact direct de personne à personne : toux, air (ex : grippe (influenza), rougeole, variole)
Tractus intestinal : nourriture, fèces, … (ex : hépatite A)
Transmission par morsure (ex : la rage)
Transmission par arthropode : insecte (ex : fièvre jaune –> moustique)
Contact sanguin (ex : sida, hépatite B)
Expliquer c’est quoi la propriété de latence?
Certains virus (rétrovirus et herpèsvirus) capables s’intégrer génome cellulaire et reste en dormance et persistent dans l’individu sans occasionner de symptômes, reste organisme sous forme de latence et peuvent avec conditions se réactiver et provoquer symptômes comme zona qui vient de la réactivation de la varicelle
Varicelle : virus pénètre et multiplie dans voies aériennes supérieures, passe dans sang puis peau, cible, éruption vésiculaire forme petite goutelettes, éruption disparue virus s’installe dans nerfs sensitifs où va y demeurer
Réaction dépend facteurs comme principal : âge et diminution des défenses immunitaires lors cancer, infection ou maladie neurologique, survenir après traitement chimio ou radio, prend toujours la même forme, éruption localisée (varicelle sur toute le corps)
Qu’est ce qu’un parasite?
Organismes omniprésents dans environnement, vivent aux dépens hôte et peuvent porter préjudice, très résistants hivers dure autres zone tropicale ou semi-tropicale
Parasitose : toute infection causée par parasite
Quels sont les 2 catégories de parasites?
Endoparasites : parasite qui vit à l’int de son hôte, tube digestif, poumons, foie, vessie, sang, lymphe (ex : ver du coeur (chien), ver solitaire)
Ectoparasite : parasite qui vit sur surfaces externes de l’hôte ou enfoui superficiellement sous la surface (ex : pou)
Quels sont les modes de transmission des parasites?
Ingestion du parasite (consommation aliments insuffisamment cuits ou d’eau contaminée, mauvaise hygiène, …)
Injection du parasite par insecte piqueur
Passage transplacentaire (mère à son bébé)
Contact physique (ex : poux)
Par relation sexuelle non protégée (ex : trichomonas vaginalis)
Comment sont classé les différents parasites?
- Protozoaires : unicellulaires et invisibles à l’oeil nu (ex : amibes, sarcocystis, toxoplasma, trichomonas, giardia …)
- Vers : organismes pluricellulaires au corps cylindriques ou plat, + ou - allongé et sans pattes
- Trématodes : vers aplatis en forme de feuille ovale (ex : schistosoma)
- Cestodes : vers aplati et rubanés formés de plusieurs segments attachés ensemble, taille peut dépasser plusieurs m (ex : taenia, echinococcus)
- Nématodes : vers ronds et allongés, souvent effilés aux 2 bouts (ex : ascaris, toxocara, ancylostoma, trichuris …) - Arthropodes : organismes invertébrés munis de pattes articulées, vivent sur l’eau, dans le sol et dans l’air, comprennent les insectes (pediculus, pulex), les arachnides (araignées, scorpions et acariens) et crustacés, parmi acariens, on a les mites (sarcoptes) et tiques (ixodes)
Quel est le cycle évolutif d’un parasite?
Ensemble des transformations obligatoires que doit subir parasites pour pouvoir passer à génération suivante, certains un cycle direct avec un seul hôte, d’autres cycle indirect comportant 2 hôtes ou + qui se succèdent
Qu’elles sont les différents types d’hôtes pour les parasites?
Hôte définitif : celui qui abrite forme sexuée (capable reproduction) du parasite
Hôte intermédiaire : hôte dans lequel parasite développe, mais sans atteindre maturité sexuelle
Hôte paraténique : hôte inhabituel où s’effectue aucun développement mais parasite demeure vivant et infectieux pour hôte définitif, non obligatoire
Comment est fait le diagnostic des parasites?
Diagnostic d’orientation : anamnèse, principaux signes cliniques
Imagerie, pertubations biologiques, pertubations hématologiques
Diagnostic direct ou parasitologique = mise en évidence parasite, nécessite connaissance cycle évolutif (savoir quelle forme chercher dans quel prélèvement)
Diagnostic indirect ou immunologique = détection anticorps (leur présence indique que hôte héberge ou a hébergé le parasite)
Quels sont les 4 différentes méthodes d’analyse?
- Analyse de sang : permettent détection certains parasites, diagnostic direct (cherche parasites microscopes, frottis sanguin et colore (plasmodium, trypanosoma)) ou indirect (recherche anticorps dans sérum de différentes façons : agglutination, ELISA, immunofluorescence (ex : toxoplasma, toxocara)
- Analyse de selles : permettent déceler la présence de nbreux parasites intestinaux, débute examen macroscopique (vers adultes, sang mucus, pus, couleur, consistance) qui aide à établir diagnostique, enchaine avec examen microscopique pour déceler des oeufs ou des kystes
- Analyses des urines : surtout pour détecter oeufs de Schistosoma haematobium, observe urine microscopique
- Analyses des tissus, organes ou sécrétions : pour détection certains parasites développant dans les tissus, organes ou sécrétions
Qu’est ce que la mycologie et mycose?
Étude des champignons
Mycose : infection causée par un champignon
Qu’est ce que renferme les champignons?
Moisissures et levure
Règne des Fungi et origine nbreuses infection (ex : infection vaginale à la levure Candida albicans) mais peut très bénéfiques comme production pénicilline par moisissure Penicillium notatum
Qu’est ce qu’un champignon?
Organismes nucléés, dépourvus de chlorophylle qui produisent spores (dormance en milieu défavorable ou dans but de se disperser
Reproduisent selon modes sexué (fusion caractères sexuels opposés) et asexué (pas de fusion cellules, noyaux ou gamètes compatibles et de sexe opposé)
Présentent aussi paroi cellulaire glucidique (chitine + cellulose)
Quel est le mode de nutrition des champignons?
Absorption à travers paroi cellulaire, entreposent substances de réserve sous forme de glycogène et matières grasses
Quel est l’aspect macroscopique des moisissures?
Aspect sur gélose : disque coloré convexe d’aspect feutré ou ouaté, diamètre d’agrandit par la périphérie, disque constitué masse d’éléments tubulaires avec des ramifications latérales qui poussent dans toutes les directions
Quel est l’aspect macroscopique des levures?
Aspect sur gélose : forment colonie + ou - colorée et + ou - aplatie ou convexe dont surface est mate ou luisante
Colonie ressemble beaucoup à 1 colonie bactérienne (macroscopiquement)
Quel est l’aspect microscopique des moisissures?
Tubules segmentés ou non, portant des ramifications, d’aspect filamenteux
Quel est l’aspect microscopique des levures?
Éléments unicellulaires, arrondis ou ovoïdes, levures peuvent être en bourgeonnement (mode de reproduction)
Quels sont les caractéristiques des moisissures et les principaux genres?
Champignons microscopiques filamenteux, existe milliers variétés différentes
Principaux genres sont : Penicillium, Aspergillus, Fusarium