Chapitre 4 Structures Primaires Flashcards
Différence entre peptides, polypeptides et proteines
Les protéines sont constitué de plus de 50 résidus d’acides aminés
Les peptides sont constitué de 2 à 50 résidus d’acides aminés
Généralement le nome polypeptide (plus de 20 résidus) est utilisé pour nommé les peptides et les proteines.
Est ce qu’un peptide peut avoir une activité biologique ?
Oui. Plusieurs peptides ont une activité biologique comme les proteines.
Par exemple, le glutathion est la molécule antioxydante majeure des cellules.
Les neuropeptides (endorphines) ont une fonction de neurotransmetteurs et de neuromodulateurs
Quels sont les 4 niveaux de structures d’une protéine ?
La structure primaire
La structure secondaire
La structure tertiaire
La structure quaternaire
Combien existe-t-il de possibilité de peptides ?
20^n peptides possible de n résidus
Décrire la structure primaire
La structure primaire correspond à la séquence en acide aminé dans une chaine 0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-…….
Il y a uniquement des liens covalents (liens peptidiques) entre les résidus d’acides aminés.
Le lien covalent se forme entre alpha carboxyle et alpha-amine de deux acides aminés.
Qu’est ce qu’une proteine multimérique et monomérique ?
Une proteine monomérique est constituée d’une seule sous-unité (chaine polypeptidique). Lorsque plusieurs chaines polypeptidiques s’associent entre elles, on parle de proteine multimériques ou oligomériques
Les protéines multimériques possèdents une structure quaternaire. La structure quaternaire décrit l’arrangement spatial de sous unité dans le’espace.
Qu’est ce qu’un homomultimère ? Et un hétéromultimère ?
Comment on fait pour distinguer les différentes sous unités
Un homomultimère est une proteine multimérique composé de la repétition d’une seul sous unité.
Un hétéromultimère est une proteine multmérique composé de la répétition d’au moins deux sous-unités différentes.
Pour indiquer le type de sous unité dans une proteine multimérique on utilise des lettre grecque avec un indice (l’indice référant au nombre d’une même sous unité)
Alpha3 -béta7 : hétéromultimère
Alpha12 : homomultimère
Pourquoi le pka des acides aminés ne permet seulement une approximation de la charge d’un polypeptide ?
L’interieur d’un polypeptide constitue un microenvironnement duquel les molécules d’eau sont exclue alors que les molécules d’eau sont responsable de l’ionisation des acides aminé.
Les valeurs de pka diffèrent légérèment lorsque les acides aminés se retrouvent à l’interieur d’un polypeptide.
Est ce qu’on peut connaitre le pi d’un polypeptide (proteine et peptide) en se basant sur les pka
Non. On peut déterminer leur pi en utilisant des méthodes expérimentales ou a l’aide de logiciels spécialisé si la structure primaire primaire de la proteine est connue
Pourquoi est-il possible de purifier des proteines ?
Chaque proteine possède des propriétés physico-chimiques qui lui sont propres.
Le choix de la méthode de purification se fait souvent de manière empirique (experimentale) afin de trouver LA méthode la plus EFFICACE
Sur quelle base se fait le choix d’une méthode de purification ?
Son coût, son efficacité et le temps requis pour la purification
Quelles sont les caractéristiques de la solution finale de proteines purifiés ?
La solution est pure et très concentré. Seulement il y a eu beaucoup de perte lors de la purification. Il faut prendre en compte les pertes pour obtenir la quantité de protéines desirée au final.
Différence entre composition et séquence
La composition réfère a la nature des acides aminés dans un polypeptide. On l’exprime par le pourcentage de chaque type d’acide aminé
La séquence réfère à l’ordre des acides aminés dans une chaine polypeptidique
Sans jamais purifier et manipuler une protéine, il est possible d’obtenir à l’aide de logiciel qui donne la structure primaire d’une proteine ………
Sa structure primaire
Sa masse moléculaire
Son point isoélectrique
On peut ne pas purifier une proteine en étudiant la sequence d’ADN qui est plus facile de purifier à l’aide de logiciel (bio-informatique)
Definissez proteines homologues, paralogues et orthologues
2 protéines homologues possèdent un degré significatif de similarité de séquence.
Les protéines paralogues sont des protéines homologues présentes dans un même organisme. Ils ont des fonctions différents. Ils proviennent de la duplication d’un gène et de sa spécialisation.
Les protéines orthologues sont des protéines homologues présentes dans des organismes différents. Ils ont les mêmes fonctions.
