Chapitre 3 Flashcards
Quel type de lien font les molécules à haute énergie ?
Liens covalents
Est-ce que les enzymes changent l’équilibre chimique ?
Non
Est-ce vrai que la plupart des molécules sont instables ?
Oui
Que faut-il afin de former un dipeptide?
La formation d’un lien entre un acide aminé et une molécule à haute énergie
Est-ce vrai que les liens forts ne se défont pas à température physiologique?
Oui
Les liens faibles se défont plus facilement, mais sont plus stables lorsqu’ils sont groupés?
Oui
Le nombre de liens que peut faire un atome dépend de la _______.
Valence
Comment appelle-t-on l’angle entre deux liens partant du même atome ?
L’angle de liaison
Les liens diffèrent selon quoi ?
La liberté de rotation
Vrai ou faux : La formation d’un lien chimique implique un changement dans la forme d’énergie.
Vrai
Vrai ou faux : Plus le lien est fort, plus la quantité d’énergie libérée est élevée
Vrai
Vrai ou faux : L’équilibre est souvent atteint en milieu cellulaire
Faux
Vrai ou faux : Le concept d’équilibre pousse plusieurs réactions à se produire.
Vrai
De quoi dépendent les forces de Van der Waals?
La distance entre les atomes
Quel est le plus puissant interaction non-covalent?
Complexe anticorps-antigène
Quels sont les atomes donneurs de H ?
O-H et N-H
Quels sont les atomes récepteurs de H ?
O et N
Vrai ou faux : La force d’un lien hydrogène dépend de son orientation.
Vrai
La seconde loi de la thermodynamique stipule qu’un réaction spontannée est toujours accompagnée d’une _________________.
Perte d’énergie libre
Puisque le relâchement du NaCl libère de la chaleur dans l’eau, pourquoi est-ce que la réaction de dissolution est tout de même favorisée ?
Car il y a augmentation de l’entropie.
Nommez les différents types de liens chimiques faibles rencontrés dans les systèmes biologiques :
Lien de Van der Waals
Lien hydrophobe
Lien hydrogène
Lien ionique
On dit qu’un lien chimique est faible lorsqu’il détient une énergie qui varie entre __ et ___ Kcal/mole
1 et 7
Vrai ou faux: L’énergie de liaison est inversement proportionnel à la sixième puissance de la distance.
Vrai
La distance idéale pour que la force de VDW soit optimale se situe _____________.
À mi-chemin entre la distance de répulsion et celle d’attraction.
Quelle est l’une des plus forte attraction non-covalente ?
Attraction anticorps-antigène
Vrai ou faux: Dans l’eau, les molécules inorganiques formant des liaisons ioniques n’ont pas vraiment d’influence sur la structure des molécules inorganiques.
Vrai
Des liens ioniques précisément positionnés peuvent se former si ils impliquent des __________.
Liens hydrogènes
Les liens hydrophobes sont en fait des ______________________.
Interaction de Van der Waals
Les liens hydrophobes peuvent représenter ___% de l’énergie associée au repliement des protéines.
50
Vrai ou faux: L’extérieur d’une protéine est stabilisée par des interactions hydrophobes.
Faux, c’est l’intérieur de celle-ci.
Les liens chimiques faibles dans les systèmes biologiques permettent les interactions transitoires suivantes:
Enzyme-substrat
*Protéines-protéines (ex. Anticorps-antigène)
*Protéines-ADN
*Protéines-ARN
Est-ce que les molécules qui donnent de l’énergie sont stables ou instables ?
Instables. (la qté d’énergie libre = inversement proportionnelle à la force des liens covalents) C’est pour ça que le sucre (beaucoup de liens instables) donne plus d’énergie que de l’eau (liens très stables)
Comment appelle-t-on l’énergie nécessaire pour briser les liaisons covalentes?
Énergie d’activation
Vrai ou faux : La thermodynamique nous dit que toute réaction chimique doit être
accompagnée d’une perte d’énergie libre
Vrai
Est-ce que toute l’énergie est libérée sous forme de chaleur et en enthropie ?
Non
Est-ce vrai de dire qu’une grande partie de l’énergie (40%) est stockée sous forme de lien à haute énergie ?
Vrai
Dans un lien à haute énergie, comment l’énergie est-elle libérée?
L’énergie est libérée lors du bris de cette liaison par hydrolyse.
Quel signe symbolise les liens à haute énergie ?
~
Est-ce que les liens à haute énergie sont nécessairement forts ?
Non, puisque ce ne sont pas les liens qui libèrent de l’énergie, mais bien leur hydrolyse.
La différence d’enthalpie (ΔG) est la même pour chaque lien à haute énergie :
Vrai
Comment peut-on dire qu’un lien est à haute énergie ou non?
L’hydrolyse du lien à haute énergie doit générer assez d’énergie pour permettre son couplage à une autre réaction dans une étape de biosynthèse.
Quelle est la molécule à haute énergie la plus important?
L’adénosine triphosphate.
Dans plusieurs voies métaboliques (dégradation ou biosynthèse) certaines réactions
sont associées à un ΔG > 0 . Pourquoi ?
C’est une étape obligatoire afin que la réaction principale (ΔG)
réaction non spontanée et nécessite de l’énergie
Vrai ou faux : La formation d’un dipeptide et d’une molécule d’eau à partir de deux acides aminés possède une différence d’enthalpie fortement négative.
Faux, ΔG = +1 à +4 kcal/mol
Quel est le truc afin de faire un dipeptide ?
Coupler la réaction à l’hydrolyse d’un lien à haute énergie.
Vrai ou faux : L’énergie sous forme de chaleur ne peut pas servir à l’élaboration d’un lien covalent.
Tout à fait vrai, d’ailleurs :
Une réaction couplée n’est donc pas le résultat de deux réactions séparées, l’une avec un ΔG
positif et l’autre avec un ΔG négatif, mais plutôt le transfert de l’énergie libre (en une ou plusieurs
étapes) pour l’activation de précurseurs par transfert de groupements impliquant des enzymes
appelées ‘transférases’
Décrivez comment se passe l’activation d’un acide aminé :
Activation d’un acide aminé
1.
AA + Adénosine—O— P ~ P ~ P ——>
AA ~ P—O—Adénosine + P ~ P
2.
AA~AMP + ARNt —> AA ~ARNt + AMP
Est-ce vrai de dire que les acides nucléiques proviennent de la même réaction de couplage effectuée chez les acides aminés ?
OUI! En effet, le ∆G du couplage de deux nucléosides mono-phosphate est d’environ + 6kcal/mole
Vrai ou Faux? L’hydrolyse du pyrophosphate est associé à la plupart des réactions de biosynthèse
Vrai
Qu’elle est l’énergie d’une liaison ionique?
5 kcal/mole
Quel est l’énergie de la force de Van der Waals?
1 kcal/mole
Quel lien hydrogène aide au repliement des protéines?
Le lien hydrogène entre le groupement carboxyle chargé et le groupement amino chargé, car il combine le lien H et l’interaction ionique
Quel lienhydrogène aide à stabilisé la structure des protéines?
Le lien hydrogène entre le groupement carboxyle chargé et le groupement hydroxyle d’une tyrosine.
Qu’est-ce que l’énergie d’activation?
La quantité minimum d’énergie pour qu’une réaction chimique se produit
Quel est l’énergie d’une énergie d’activation?
20~30 kcal/mole
À quoi sert un enzyme?
- Accèlère la formartion de l’état activé
- L’énergie de départ et de fin ne sont pas modifié
- L’équilibre n’est aps modifié (delta G)
- Stabilise l’état de transition
