Chapitre 3 Flashcards
Quelles sont les 4 étapes du cycle cellulaires ?
Phase G1, S, G2 et M (mitose + cytokinèse)
Que se passe-t-ils avec le matériel génétique durant le cycle cellulaire ?
Disparition reconstitution du noyau, la réplication, la condensation et la séparation des chromatides soeurs
Que se passe-t-il durant la prophase ?
Condensation des chromosomes
Que se passe-t-il durant la prometaphase ?
Disparition du noyau
Que se passe-t-il durant la metaphase ?
Alignement des chromosomes
Que se passe-t-il durant l’anapahse ?
Chromatides soeurs se séparent
Que se passe-t-il durant la télophase ?
Décondensation de l’ADN
Que se passe-t-il durant la cytokinèse ?
Séparation des deux cellules filles
Quelle question est-ce que la cellule se pose entre le phase G1 (croissance) et phase S (réplication de l’ADN) ?
L’environnement est-il favorable
Quelles questions est-ce que la cellule se pose entre la phase S (réplication de l’ADN) et la phase G2 (croissance) ?
Est-ce que tout l’ADN est répliqué ? Tous les dommages à l’ADN sont-ils réparés ? Érosion des télomères ?q
Quelle question est-ce que la cellule se pose lorsque la cellule arrive au point de contrôle M ?
Tous les chromosomes sont-ils correctement attachés au fuseau mitotique ?
Quel type de protéines sont nécessaires à la signalisation durant le cycle cellulaire ?
Kinases cyclines dépendantes et cyclines
Quel est l’impact des protéines de signalisation du cycle cellulaire ?
Active des phosphatases qui vont phosphoryler des composantes essentielles pour le cycle cellulaire
À partir de quoi est-ce que l’ADN polymérase se base pour répliquer l’ADN et ce, tout le long du processus ?
Le brin matrice
Est-ce que l’ouverture de l’ADN se fait dans des régions spécifiques ?
Oui, dans les origines de réplication
Chez les procaryotes, comment reconnait on l’origine de réplication ?
Une séquence précise riche en AT
Comment appel-t-on ce le type de séquence permettant les origines de réplication ?
Séquence consensus
Est-ce que les humains ont des séquences consensus ?
NON
Pourquoi est-ce que le chromosome humain a plusieurs origines de réplications ?
Répliquer plus rapidement l’ADN
Combien de fourche de réplication y a-t-il chez les procaryotes ?
2
Comment se nomme la protéine qi reconnait une séquence spécifique pour lier une origine de réplication ?
La protéine initiatrice
Est-ce que toutes les protéines se lient à une séquence consensus des origines de réplication ?
Non, les autres utilisent plutôt des interactions protéines protéines et la reconnaissance de la forme générale de l’ADN
Quelles sont les 3 fonctions de la protéine initiatrice ?
1 : Trouver et lier l’ORI
2 : Recruter d’autres protéines nécessaires à la réplication
3 : Chez certains organismes (procaryotes) ouvrir la double hélice de l’ORI
Quelles protéines sont recrutées par la protéine initiatrice ?
2 hélicases, enzymes spécialisées dans l’ouverture de l’ADN
Qu’est-ce qu’un réplicateur ?
Ensemble complet des séquences suffisantes pour permettre l’initiation de la réplication
Qu’est-ce qu’une origine de réplication ?
Le site spécifique où commencent la séparation des deux brins et la réplication, l’ORI fait parti du réplicateur
La DnaA lie spécifiquement quel site du réplicateur ?
Les sites 9 mères
Que se passe-t-il après que la DnaA soit lié à une molécule d’ATP et aux sites 9-mères
Lorsque DnaA est liée à l’ATP, la protéine intéragit aussi avec un site 13-mère, et ainsi permet la séparation de la double hélice et la libération de l’ADNsb
Après l’interaction avec un site 13-mère, quelle est la fonction de DnaA durant toute la réplication de l’ADN ?
Positionner l’hélicase qui poursuivra la séparation du double brin d’ADN
Par quel complexe sont reconnus les origines de réplication chez les eucaryotes ?
Par le complexe de reconnaissance de l’origine de réplication ORC
Quelle est la différence majeure entre la DnaA et l’ORC ?
La liaison au réplicateur n’aboutit pas à la dénaturation de l’ADN adjacent
Comment passe-t-on du complexe pré-réplicatif au complexe réplicatif durant la phase S ?
Une augmentation de la quantité de CDK parce qu’il faut phosphoryler plusieurs protéines pour arriver au complexe actif
Que se passe-t-il au niveau des CDK entre la phase G1 (croissance) et S (réplication) ?
Ils sont activés
La présence d’un complexe réplicatif inhibe une partie de l’ADN, laquelle ?
Le réplicateur pour éviter la formation d’un nouveau pré-RC
Comment est-ce que les origines de réplications sont reconnues chez les eucaryotes ?
À cause des motifs structurels de l’ADN
Quels sont les motifs structurels qui peuvent être reconnu pour former des origines de réplication ?
1 : Les séquences riches en AT ou en îlots CpG
2 : Une structure d’ADN particulière
3 : Des régions libres de nucléosomes
4 : Des régions impliquées dans l’initiation de la transcription
De quoi dépendent les signaux qui régulent la réplication ?
Ils dépendent des signaux internes et externe de la cellule
Est-ce que toutes les ORI sont déclenchées en même temps ?
NON
Quelle forme prend les hélicases ?
C’est une enzyme hexamèrique en forme d’anneau qui entoure l’ADN simple brin et se déplace rapidement le long de la chaîne
Est-ce que l’hélicase requiert de l’ATP pour fonctionner ?
Oui, pour séparer les brins
L’hélicase a une haute processivité, qu’est-ce que cela signifie ?
Cela signifie qu’elle déroule le même brin en continu, sans arrêt, tant qu’elle a de l’ATP
Qu’est-ce que chaque unité de l’hélicase possède ?
Une boucle capable d’agripper la charpente d’un nucléotide (sucre-P)
Quel est le mode de fonctionnement de l’hélicase ?
Ces boucles fonctionnent comme 6 mains tirant sur une corde main par-dessus main et obligeant l’ADN à passer par un pore central
Pourquoi est-ce que ce pore central ne laisse passer qu’un brin d’ADN ?
Parce qu’il est très étroit
Quel est le rôle des protéines SSB ?
Elles empêchent la formation d’épingles par appariement de nucléotides complémentaires dans le même brin d’ADN
Quelle protéine est responsable de dérouler un brin qui se serait enrouler durant la réplication ?
Les topoisomérases coupent et ressoudent le double brin pour enlever les supertours
Laquelle de la topoisomérase I ou II sert à ressouder uniquement un simple brin d’ADN ?
1 : Coupe et ressoude un des brins d’ADN
2 : Coupe et ressoude les deux brins d’ADN
De quoi est-ce que l’ADN polymérase a besoin pour commencer sa prolifération ?
D’une amorce présentant un OH en 3’ libre
Quelle enzyme est responsable de la synthèse de l’amorce ?
La primase
De quoi est constitué l’amorce ?
De courtes séquences d’ARN
Par quoi est reconnu l’amorce d’ARN ?
Un chargeur de pince glissante (sliding clamp loader) qui y installe un anneau coulissant et une ADN polymérase
Quel est le rôle de l’ATP avec le chargeur de pince glissante (sliding clamp loader) ?
L’hydrolyse de l’ATP, il se dissocie du complexe
De quoi sont composés les clamps ?
De plusieurs sous-unités identiques en forme d’anneau. Le trou central est suffisamment gros pour encercler la double hélice
Quel est le rôle des clamps ?
Il lie l’ADN au niveau de l’amorce, s’associe ensuite avec la polymérase et glisse avec elle pour la maintenir en place
Même en présence de clamps, l’ADN polymérase se détache parfois de l’ADN, quel est l’utilité des clamps dans ce cas là ?
Empêcher l’ADN polymérase de s’éloigner
Pourquoi est-ce que de l’énergie est nécessaire pour lier les nucléotides ? (2)
1 :La rupture du lien avec le premier P pour former un lien phosphodiester avec la chaîne naissante
2 : La rupture du lien dans le pyrophosphate libéré par la pyrophosphatase
Est-ce que la réaction ajoutant les nucléotides est réversibles ou irréversibles ?
Irréversible
Comment est-ce que l’ADN polymérase différentie les rNTP des dNTP ?
Il y a une exclusion stérique au niveau du site actif de la polymérase
Pourquoi est-ce que seul le bon nucléotide peut s’apparier durant la réplication de l’ADN ?
Tous les nucléotides peuvent entrer dans le site actif de l’ADN polymérase, mais seul un nucléotide complémentaire est bien positionné pour permettre la réaction entre le phosphate et la sous unité 3’ OH.
Qu’est-ce que la paume de l’ADN polymérase ?
Le site catalytique et vérification de l’appariement via le sillon mineur (ralentissement si erreur)
Qu’est-ce que les doigts de l’ADN polymérase ?
Ils plient la matrice pour exposer 1 nt à la fois et referment la main en cas du bon nt dans la paume
Qu’est-ce que le pouce de l’ADN polymérase ?
Il aide à tout retenir ensemble en s’attachant à la charpente sucre-P ce qui joue un rôle dans la progressivité de l’enzyme
De quoi est formé la paume de l’ADN polymérase ?
D’ions métalliques Mg2+ et Zn2+
Qu’est-ce que la présence d’ions métalliques dans l’ADN polymérase permet ?
1 : Favorise l’interaction entre l’amorce et le nouveau nt en préparer l’O
2 : Stabilise le pyrophosphate produit en neutralisant les charges négatives
Quelle est l’étape limitante lors de la réplication de l’ADN ?
L’attachement de l’ADN polymérase sur l’ADN
Quel est le taux d’erreur de l’ADN polymérase ? (Haut ou bas)
Bas
Qu’est-ce que l’activité exonucléase de l’ADN ?
Permet d’éditer les nucléotides incorrect ajouté par le ralentissement de la paume (la polymérase clive le nouveau lien et retire ce nucléotide)
Pourquoi dit on que l’ADN polymérase a une activité exonucléase et non endonucléase ?
Parce qu’elle peut uniquement cliver l’ADN à partir d’une extrémité
Quelle est la différence entre le brin continu et le brin discontinu ?
1 : L’ADN pol avance en même temps et dans la même directement que la fourche de réplication
2 : La pol s’éloigne de la fourche en synthétisant des fragments d’Okazaki.
Quel est le rôle de la RNase H ?
Elle dégrade les hybrides ADN/ARN
Quelle est la particularité de la RNase H ?
Elle ne peut couper le dernier nucléotide parce qu’elle peut seulement couper les liens entre 2 nucléotides
Quelle enzyme retire le dernier hybride ADN/ARN ?
Une exonucléase 5’
Quelle enzyme comble la brèche qui était causé par des hybrides ADN/ARN ?
ADN polymérase elle même
Quelle enzyme permet d’attacher ensemble les jonctions entre deux fragments d’Okazaki ?
ADN ligase
Qu’est-ce qu’une holoenzyme ?
Terme général décrivant un complexe multiprotéique dans lequel une enzyme (noyau) est associée à des partenaires qui renforcent son activité. (travail d’équipe)
Le réplisome avant dans le sens directe ou inverse de la fourche de réplication ?
Dans le sens de la fourche de réplication
Qu’est-ce que l’ADN pol III holoenzyme chez E. Coli ?
2 ADN polymérases sont liées entre elles et forment un large complexe protéique
