Chapitre 2 Flashcards
Pour quels liens sont unis les acides aminés qui forment la structure primaire d’une protéine ?
Des liaisons peptidiques
Par quoi commence et termine une protéine ?
Commence par la partie N terminale et termine par la partie C terminale
Quelles sont les parties qui composent une acide aminé ?
Un carbone asymétrique, un groupement amine (NH2), un groupement carboxyle, un atome d’hydrogène et une chaîne latérale R.
À quoi sert la chaîne R d’un acide aminé ?
À faire des liaisons qui lui sont propre (ex. lysine peut faire des liaisons ioniques, mais pas la glycine)
Quels sont les 2 structures secondaires des protéines ?
Hélice a (chaînes R vers l’extérieur) et feuillet B (chaînes R vers le haut et le bas)
Que veut on dire par les structures secondaires se forment spontanément ?
Presque immédiatement à cause d’un bilan énergétique favorable
Comment se forme les structures secondaires ?
Par des liens H au niveau des cœurs des acides aminés
Qu’est-ce que la structure tertiaire possède que la structure secondaire ne possède pas ?
Des domaines fonctionnels (régions ayant des activités enzymatiques/ ou des sites de liaisons pour d’autres molécules)
Est-ce que un domaine donné se replie toujours de la même façon ?
Oui
Qu’est-ce qui détermine la fonction d’un domaine fonctionnel ?
Sa forme
Est-ce qu’un même domaine peut se trouver plusieurs fois dans la même protéine ?
Oui
Est-ce que toutes les protéines ont une structure quaternaire ?
Non
Comment est formé la structure quaternaire ?
Elle est formée de l’interaction entre plusieurs chaînes peptidiques (structures tertaires)
Exemples 2 de protéines avec des structures quaternaires ?
Hémoglobines et actine
Combien de chromosomes possèdes les bactéries ?
Un chromosome circulaire
Combien de chromosomes possède l’humain ?
46
Dans quelle structure se situe le matériel génétique des bactéries ?
Nucléoïde
Vrai ou faux, des petites protéines aident à l’organisation spatiale de l’ADN bactérien, rôle similaire aux histones eucaryotes ?
Vrai
On dit du nucléoïde qu’il est…
dynamique
Qu’est-ce que H-NS ?
Histone-like nucleoid-structuring
Quel est le rôle des H-NS ?
Tenir l’ADN dans une position spécifique ou former un pont
Quels sont les deux autres façon de compacter l’ADN dans le nucléoïde ?
L’enrouler avec des protéines d’enroulement et plier l’ADN avec des protéines pliant l’ADN
Pourquoi est-ce que le nucléoïde est dynamique ?
Parce qu’il change de forme selon les besoins de la cellule
Combien de fois l’ADN doit être condensé chez les humains ?
200 000 fois
De quoi dépend la condensation de l’ADN d’une cellule ?
De son cycle cellulaire
Quels sont les 2 niveaux de condensation ?
Chromosome mitotique : ADN très condensé
Chromatine : ADN moins condensé
À l’interphase, à quel degré de condensation est la cellule ?
Chromatine
Durant la division cellulaire (mitose) à quel degré de condensation est l’ADN ?
Chromosomes mitotiques (les protéines représentent la moitié de la masse du chromosome)
Qu’est-ce qu’une chromatine ?
Un ensemble d’ADN et de protéines associés
La majorité des protéines de la chromatine sont…
Des histones
Quel est le rôle des protéines non histones dans la chromatine ?
Elles jouent des rôles de transcription, réplication, réparation et recombinaison de l’ADN
Qu’est-ce qu’un hétérochromatine ?
Région non transcrite, condensé à plus de 30 nm
Qu’est-ce qu’une euchromatine ?
Région active pour la transcription, entendu à 11 nm
Qu’est-ce que le nucléosome ?
Structure de base de la chromatine et le premier niveau de compaction
Quels sont les 8 histones qui font parties du nucléosome ?
2XH2A + 2XH2B + 2XH3 + 2xH4
Combien de fois l’ADN s’enroule-t-il sur lui-même autour du noyau du nucléosome ?
1,65 fois
Qu’est-ce que l’ADN intercalaire ?
L’ADN se situant entre deux noyaux de nucléosome
Pourquoi est-ce que les histones sont riches en lysines et arginines ?
Ce sont des acides aminés chargés positivement qui leur permet d’avoir de meilleures interactions avec l’ADN
Pourquoi est-ce que l’interaction avec les histones se situent principalement au niveau du sillon mineur ?
Parce qu’il est plus flexible que le sillon majeur, moins d’encombrement stérique
Pourquoi est-ce que le nucléosome a plus tendance à se lier avec les nucléotides A:t ?
Parce qu’ils sont plus petit que GC, plus tendance à s’enrouler facilement
Comment sont agencé les histones au sein d’un nucléosome ?
2 dimères H2A-H2B et un tétramère H3-H4
La queue N-Terminale des histones se situe vers l’intérieur ou l’extérieur ?
L’extérieur