Chapitre 12 Flashcards
Quels sont les deux types d’acides nucléiques?
L’acide désoxyribonucleique (ADN) et l’acide ribonucleique (ARN)
Quelle est la fonction principale de l’ADN?
Gardienne des caractères héréditaires
Quels sont les monomères d’acides nucléiques?
Nucléosides et nucléotides
Comment sont formés les nucléosides?
D’une base azotée et d’un ose reliés par un lien β-N-glycosidique
Qu’est-ce qu’un nucléotide?
Un ester phosphorique de nucléosides
Quels types de bases azotées trouve-t-on dans les nucléotides?
- Purines (adénine, guanine)
- Pyrimidines (cytosine, uracile, thymine)
Quel est le rôle de l’AMP cyclique (AMPc)?
Messager intracellulaire (second messager) dans certaines voies de transduction du signal
Quel est le rôle de l’adénosine?
Agit comme une hormone dans la régulation du sommeil
Quel nucléotide est considéré comme la principale source d’énergie chimique dans la cellule?
ATP (nucléoside triphosphate)
Comment s’appelle le lien entre les nucléotides dans un polynucléotide?
Liaisons phosphodiester 3’-5’
Qu’est-ce qu’un polynucléotide?
Un polymère dont les résidus sont réunis par des liaisons phosphodiester
Quelle est la différence entre l’ADN et l’ARN?
L’ADN est constitué de désoxyribonucléotides, tandis que l’ARN est constitué de ribonucléotides
Où se trouve principalement l’ADN dans les cellules eucaryotes?
Dans le noyau, mais aussi dans les mitochondries et les chloroplastes
Qu’est-ce qu’un génome?
L’ensemble du matériel génétique d’un organisme vivant ou d’un virus
Comment est exprimée la taille des molécules d’ADN?
En nombre de paires de bases (pb), kilopaires de bases (kb), mégapaires de bases (Mb), gigapaires de bases (Gb)
Qu’est-ce que la dénaturation de l’ADN?
Le processus par lequel les 2 brins d’ADN se séparent complètement
Quels agents peuvent provoquer la dénaturation de l’ADN?
- Chaleur
- pH élevé
- Agent chaotropique (comme l’urée)
Qu’est-ce que la température de fusion (Tm) de l’ADN?
La température à laquelle 50% de l’ADN est dénaturé
Quel est l’effet hyperchrome?
L’augmentation d’absorbance de l’ADN lors de l’augmentation de température
Qu’est-ce qui influence la température de fusion (Tm) de l’ADN?
Le contenu en bases G+C
Vrai ou faux: L’ADN est toujours sous forme monocaténaire.
Faux
Quelle est la structure secondaire de l’ADN?
La double hélice
Quel est le rôle des nucléosomes dans le noyau?
Emballer l’ADN pour le compacter
Qu’est-ce que la dénaturation locale de l’ADN?
La séparation locale des brins d’ADN dans certains processus biologiques
Quel est le dogme central de la biologie moléculaire ?
L’ADN est transcrit en ARN, puis cet ARN est traduit en protéine.
Qu’est-ce que la réplication ?
Le processus par lequel l’ADN est dupliqué avant la division cellulaire.
Qu’est-ce que la transcription ?
Le processus permettant de copier différents segments de l’ADN en ARNs.
Qu’est-ce que la traduction ?
Le processus par lequel les molécules d’ARNm sont converties en protéines.
Qu’est-ce que la rétrotranscription ?
La capacité de certains organismes à transformer leurs ARNs en ADN.
Les séquences d’ARN sont-elles produites à partir d’une matrice protéique ?
Non, c’est une caractéristique très importante du dogme central.
Qu’est-ce que le code génétique ?
Il permet de traduire la séquence primaire d’une molécule d’ARNm en protéine.
Qu’est-ce qu’un codon ?
Un triplet de nucléotides sur l’ADN ou l’ARNm qui correspond à un acide aminé.
Combien de codons spécifient les 20 acides aminés ?
61 codons.
Qu’est-ce que des codons synonymes ?
Deux ou plusieurs codons codant pour le même acide aminé.
Qu’est-ce que signifie que le code génétique est dégénéré ?
Plus d’un codon peut coder pour le même acide aminé.
Quel est le codon d’initiation de la traduction ?
AUG, codant pour la méthionine.
Qu’est-ce qu’un codon STOP ?
Un codon qui entraîne l’arrêt de la synthèse de la chaîne polypeptidique.
De quoi est constitué l’ARN ?
De ribonucléotides.
Quelle est la structure de l’ARN par rapport à l’ADN ?
L’ARN est monocaténaire, tandis que l’ADN est bicaténaire.
Quelle est la taille des molécules d’ARN par rapport à l’ADN ?
Les molécules d’ARN sont beaucoup plus courtes que l’ADN.
Quels types d’ARN existent dans la cellule ?
- ARNs ribosomaux (ARNr)
- ARNs de transfert (ARNt)
- ARNs messagers (ARNm)
Quel est le rôle des ARNm ?
Contenir l’information requise pour fabriquer une protéine particulière.
Quel est le rôle des ARNr ?
Composants structuraux et fonctionnels des ribosomes.
Quel est le rôle des ARNt ?
Établir la concordance entre l’ARNm et la séquence en acides aminés de la protéine.
Que représentent les ARNs non-codants ?
Un groupe hétérogène d’ARN ayant des fonctions variées, comme la régulation de l’expression génétique.
Les ARNr sont-ils des ribozymes ?
Oui, l’une des molécules d’ARNr a une activité catalytique.
Quels types d’oses sont présents dans les nucléosides et nucléotides?
Ribose et désoxyribose
Le désoxyribose est un dérivé du ribose dépourvu de groupement hydroxyle en C2.
Quelles sont les différences entre l’ADN et l’ARN au niveau de l’ose?
L’ADN contient du désoxyribose, l’ARN contient du ribose.
Quels sont les deux types de bases azotées dans les acides nucléiques?
Pyrimidines et purines.
Quelles sont les trois principales pyrimidines?
- Cytosine
- Thymine
- Uracile
Comment la thymine diffère-t-elle de l’uracile?
La thymine possède un groupement méthyle en position 5.
Quelle base azotée est principalement trouvée dans l’ARN?
Uracile.
Quelles sont les deux purines majeures?
- Adénine
- Guanine
Quelle est la différence de structure entre l’adénine et la guanine?
La guanine porte un groupement carbonyle en position 6 et un groupement amine en position 2.
Qu’est-ce qu’une base rare ou mineure?
Des bases azotées modifiées présentes dans l’ADN ou l’ARN.
Vrai ou Faux: Les bases azotées sont des bases faibles.
Vrai.
Les nucléosides sont formés par la liaison de quelle type de liaison?
Liaison β-N-glycosidique.
Comment les nucléosides sont-ils nommés?
Selon la base azotée qu’ils contiennent.
Quel suffixe est ajouté aux ribonucléosides contenant une pyrimidine?
-idine.
Quel préfixe est ajouté pour indiquer un désoxyribonucléoside?
Désoxy-.
Qu’est-ce qu’un nucléotide?
Un nucléoside avec au moins un groupement phosphoryle.
Quelles positions peuvent être phosphorylées dans le ribose?
- 2’
- 3’
- 5’
Quelles positions peuvent être phosphorylées dans le désoxyribose?
- 3’
- 5’
Comment un nucléotide est-il nommé?
Selon le nucléoside dont il dérive, suivi de la position phosphorylée et du nombre de groupements phosphate.
Qu’est-ce que l’ATP?
Le nucléotide le plus fréquemment utilisé comme coenzyme.
Quel est le rôle de l’ATP dans le transfert de groupes?
Il peut donner un groupement pyrophosphoryle ou nucléotidyle.
Qu’est-ce que l’UDP-glucose?
Un sucre nucléotidique important dans le métabolisme des sucres.
Quelles sont les différences entre NAD+ et NADP+?
La phosphorylation du groupement hydroxyle en position 2’ de l’AMP.
Quel est le rôle des coenzymes comme NAD+ et NADP+?
Utilisées dans les réactions d’oxydoréduction.
Qu’est-ce qui différencie le FMN du FAD?
Le FMN est un mononucléotide, tandis que le FAD est un dinucléotide formé d’un AMP lié à un FMN.
Quel est le centre réactif de la coenzyme A?
Le groupement thiol à l’extrémité de la molécule.
Qu’est-ce qu’un acyle?
Le groupement fonctionnel obtenu en enlevant l’hydroxyle d’un acide carboxylique.
Qu’est-ce que l’acétyle-CoA?
Une molécule formée lorsque la coenzyme A est liée à un groupement acétyle.
Quelles sont les caractéristiques de la double hélice d’ADN?
Les brins sont antiparallèles et complémentaires.
Quelle est la conformation la plus fréquente de l’ADN?
ADN-B.
Quelles sont les deux autres conformations de l’ADN?
- ADN-A
- ADN-Z
Qu’est-ce qui favorise l’existence de la conformation ADN-Z?
Une alternance de purines et de pyrimidines.
Les bases azotées dans l’ADN forment des structures _______.
Plates.
Les paires de bases dans l’ADN sont empilées à l’intérieur de la double hélice, formant une région _______.
Hydrophobe.
What is the structure of ADN-Z?
An elongated left-handed helix that exists at very low humidity
ADN-Z is characterized by an alternating pattern of purines and pyrimidines, promoting interactions with regulatory proteins.
What is the effect of low humidity on ADN-Z?
It favors the formation of the left-handed helix structure
ADN-Z is primarily found in regions with specific base compositions.
What stabilizes the double helix structure of DNA?
Cumulative effects of several forces
Key forces include hydrophobic interactions, base stacking, hydrogen bonds, and ionic interactions.
Where are the nitrogenous bases located in the DNA helix?
Inside the helix
This positioning creates hydrophobic interactions that contribute to stability.
What is ‘base stacking’?
The arrangement of planar bases that maximizes proximity within the helix
Base stacking enhances stability by increasing Van der Waals forces.
How does base stacking affect water interaction?
It makes the interior of the helix inaccessible to water molecules
This hydrophobic environment is crucial for the stability of the DNA structure.
What role do hydrogen bonds play in DNA stability?
They connect the bases and are more stable in the hydrophobic interior
Hydrogen bonds formed in the double helix are less affected by competing water molecules.
What ensures the solubility of DNA?
Hydrogen bonds between the sugar-phosphate backbone and the aqueous environment
These interactions help maintain DNA’s solubility in biological systems.
What charge do the phosphate groups in DNA carry?
Negative charge
This negative charge can lead to repulsion, but is neutralized by ionic interactions.
What ions neutralize the negative charges of DNA’s phosphate groups?
Magnesium ions
These ions interact with the negatively charged phosphates, stabilizing the DNA structure.