chapitre 1 Flashcards
de quoi est composé la cellule?
- eau
- ions inorganiques
- molécule organiques
eau polaire ou non polaire (et ce que ça implique)?
polaire: O attire plus les atomes que H, la molécule est donc dipôle
dans l’eau, à quoi servent les liens H?
- permettent forte stabilité (peut rester à état liquide de T pièce)
- permettent à l’eau intéragir avec les ions (solubles) et molécules hydrophiles (soluble)
qu’est-ce qui arrive aux molécules hydophobes dans l’eau?
sont repoussées et souvent s’Associent être elles
de quoi est composé la membrane plasmatique et qu’est-ce qui maintient le double feuillet lipidique?
- molécules amphipatiques
- le double feuillet compose les membrane CR et est maintenu par les partie hydophobes les unes vers les autres, cela permet aux parties hydrophiles d’intéragir avec le milieu aqueux
à quoi servent les ions inorganiques?
essentiels à +s aspects du métabolisme CR (pH, dépolarisation CR, facteur essentiel aux enzymes)
quelles sont les 4 classes principales des molécules organiques?
- sucres
- lipides
- acides nucléiques
- protéines
qu’est-ce qui est formé à partir des mol org., AA et acides nucléiques?
macromolécules
qu’est-ce que le glucose et ses rôles (5)
- est une macromolécule
- source énergie cellule
- sous forme de polymère, stocké dans foie/muscles ou amidon des graines (réserve É)
- marqueur pour le transport et repliment des prots
- marqueur de la surface CR
- reconnaissance et intéractions entre C et tissus
qu’est -ce qu’un monosaccharide? et quelles sont ses formes les plus communes?
1 sucre
- hexoses 6C
- trioses 3C
- pentoses 5C
qu’est-ce qu’un lien glycosidiques?
pour former disaccharide
deux monosaccharides qui sont lier par un lien covalent formé par une rx de déshydratation
3 polysaccharides et leurs rôles
- amidon: formé de chaine de Glu liées par les liaisons glycosidiques entre C 1 et 4 des Glu voisins
- glycogène: principale réserve de glucose chez animaux, formé de chaine semblable , mais + ramifiées
- cellulose: forme fibre végétale, les Glu sont attachés ensemble par liens glyco entre C 1 et 4, mais configuration bêta 1 (chaque mol est inversée à sa voisine, rend +++ stable, donc animaux digèrent pas
qu’est-ce qu’un lipide et ses rôles?
- formés de longues chaines d’hydrocarbures
- importante réserve d’énergie
- pas des polymères ni des macromol (car formé d’un nombre limité de group)
- composant principal de la membrane plasmatique
- rôle important dans siganilisation CR (ex.: impliqué dan shormone stéroïdienne, messager interCR)
qu’est-ce qu’un acide gras et de quoi est-il composé?
- composé d’une longue chaine d’hydrocarbures (seulement C et H, souvent 1 unique group polaire)
- constitué d’un group carboxyle (COOH) (acide org)
quelle es la différence entre un acide gras saturé et insaturé?
- saturé: aucune liaison double, tous les C sont comblés de H
- insaturé: liaison double entre C ( mono saturé: 1 liaison double, polysaturé: +s liaisons doubles)
qu’est-ce qu’un triglycéride?
composé de 3 acides gras relié par un glycérol (via le group COOH)
lien ester
qu’est-ce qu’une liaison ester?
implique la fonction hydroxyle (OH) d’un acide et un group hydroxyle d’une autre molécule, une molécule d’eau est libérée
qu’est-ce qu’un phospholipide?
- acides gras lié à glycérol, mai sle 3e C du glycérol est lié à un phosphate et le phosphate est lié à une petite molécule
- molécule - et forment tête hydrophile (cela permet de s’aligner dans la bicouche
qu’est-ce qu’un glycolypide, et où se trouve-t-il?
- 2 acides gars liés par un group sérine lié à un sucre
- dans couche externe des membranes lipidiques
- rôle dans reconnaissance des C
qu’est-ce que le cholestérol et de quoi est-il précurseur?
- 4 cycles (à la place d’une chaineà) très hydrophobes
- son group OH rend son extrémité hydrophile
- précurseur de +s hormones stéroïdiennes (estradol et testostérone)
qu’est-ce qu’un spingomyéline?
- seul phospholipide sans glycérol
- c’est une sérine qui relie les deux acides gras (group polaire)
- principale composante de la gaine de myéline (entoure axones des neurones)
quels sont les deux types de sucres et quand sont-ils utilisés?
- ribose: ARN (OH)
- désoxyribose: ADN (H)
de quoi est formé un nucléotide?
- sucre à 5C
- lié à une base azoté par un lien glycosidique (C 1’)
- et à goup phosphate lié par lien ester (C 5’)
qu’est-ce qu’un acide nucléique? quels sont les 6 types?
- polymères de nucléotiques
- ARN messager
- ARN transfert
- ARN ribosomaux
- régulation de l’expression des gènes
- transport des ARN et prot
- activité catalytique (enzymes protéiques)
quelles sont les 4 bases et dans quels groupes?
purine: adénine et guanine
pyrimidine: cytosine, tymine et uracile
comment appelle-t-on lorsque la base est lié à un sucre?
nucléoside
comment appelle-t-on lorsque la base est lié à un sucre et à un phosphate?
nucléotide
que veut dire NTP et dNTP
NTP désigne tous les nucléotides et le d veut dire que le sucre est le désoxyribose
comment se fait la polymérisation des nucléotides?
par la formation d’un lien phosphodiester entre le OH en 3’ d’un nucléotide et le phosphate en 5’ du nucléotide suivant
comment sont les AA non polaires? et dans quoi sont-ils impliqués?
- ont R hydrophobe ( composé uniquement d’hydrure de C (C et H)
- impliqués dans intéractions hydrophobes à l’int de la structure d’une prot, ou à l’interface entre prot formant un complexe multimétrique
quels sont les 4 groupes d’AA?
- non polaire
- neutre polaire
- basique +
- acide -
selon leur chaine variable
qu’est-ce qu’un acide aminé et de quoi est-il composé?
précurseur des prots (AA relié par lein peptidique)
- carbone central (alpha)
- group acide (COOH)
- group amine (NH2)
- group variable (R)
de quoi sont composés les AA neutres polaires?
- group polaire à l’extrémité de leur chaine latérale ( OH ou amine)
cas spécial de la cystéine
est polaire et non polaire, car son group SH est très faiblement polaire
de quoi sont composés les AA acides - ?
groupement carboxyle sur leur chaine latérale et possèdent donc une charge nette -
de quoi sont composés les AA basiques +?
group amine à l’extrémité de leur chaine latérale
- à pH physio, ces group attirent un proton en leur donnant une charge +
où se retrouvent souvent les AA neutres polaires et chargés? et pourquoi?
à la surface des prot et dans les sites actifs des enzymes car sont hydrophiles (donc soluble dans l’eau)
qu’est-ce qu’un lien peptidique?
unie group carboxyle d’un AA au group de l’AA suivant
- liaison covalente qui libère une molécule d’eau
- a une structure plane à cause du double lien entre O et N, crée rigidité
qu’est-ce que l’ossature?
- acide nucléiques et prot sont constitués par assemblage de molécules similaires ( car sont des polymères)
- l’ossature est la structure répétitive de ces macromolécules
de quoi est composé l’ossature des 1. acide nucléiques 2. bases 3. protéines?
- enchainement de sucre et phosphate
- variable et leur alternance = leur id
- amine-carbone, alpha-carboxyle-anine- carbone
qu’est-ce qu’un lien fort et qu’est-ce que cela implique au niveau énergétique?
lien fort = lien covalent (atomes liés sont de la même molécule)
- plus le lien est fort, plus l’énergie libéré ou nécessaire est grande
à quoi servent les liens faibles?
importants pour maintenir les molécules ensemble
efficace ++ lorsque nombreux
quel impact à la chaleur sur la probabilité de briser les liens entre atomes?
la chaleur aug les collisions et donc aug les chances de briser le lien
à quoi sert l’énergie libre de Gibbs?
- utile pour exprimer les changements moléculaires CR
- permet d’évaluer la spontanéité d’un processus
- relie variation enthalpie (H) et la variation d’entropie (S) (G=H-TS) (T: temp)
qu’est-ce qui arrive lorsque plus un lien est fort?
plus le changement d’énergie libre accompagnant sa formation est grand, et plus la proportion d’atomes sous forme lié est grande
est-ce qu’un lien covalent à un delta G + ou - et qu’est-ce que ça implique?
delta G très -
- donc sont pratiquement indestructible à conditions physio car équilibre tend vers forme liée)
quels sont les 4 types de liens faibles?
- van der waals (toutes les mol peuvent en former)
- hydrogènes (mol doivent être polaires pour en former)
- hydrophobes
- ionique (mol doivent être polaires pour en former)
est-ce qu’une molécules peut former +s liens?
oui mais le plus fort à tendance à gagner
de quoi dépendent les intéractions Van der waals?
- des fluctuations de charges entre les atomes les plus proches
- de la distance entre les atomes et donc de la forme des molécules
- structure compatible ex.: Ac et Ag spécificité
quand sont formés les liens H?
peuvent se former entre des atomes engagées dans des liens covalents avec des atomes d’électro- diff
- typiquement un donneur d’H est un O ou un N en lien avec un H (charge résiduelle +)
- un accepteur de H à une charge -
qu’est-ce qui cause la polarité?
l’électronégativité qui est différente entre les atomes réunis dans la même molécule
dipôle permanent dans eau donc polaire
pourquoi l’orientation de la liaison H par rapport au lien covalent dans lequel les atomes sont engagés est importante?
parce que permet de déterminer la force du lien
- lien H fort: liaison plate
- lien H faible: liaison peut avoir un angle jusqu’à 30°
pourquoi l’eau à un haut point d’ébulition?
car peur former 4 liaisons H donc avec 4 molécules voisines
de quoi dépend la solubilité d’une subs?
de sa capacité à intéragir avec les molécules d’eau en établissant des ponts H avec des molécules d’eau
- la formation de liens entre l’eau et la molécules soluble interrompent les intéractions des mol d’eau
comment est la solubilité d’une molécule très polaire?
solubilité limité, en haut de la conc limite, pas possible de créer assez de liens entre soluté et solvant pour assurer solubilité
qu’est-ce que l’énergie d’activation?
énergie nécessaire pour briser un lien covalent et permettre la création d’un nouveau lien
- énergie nécessaire est assez grande pour pas que les liens ne peuvent pas spontanement se détruire à 25°C
à quoi servent les enzymes dans des rx? comment affectent-elles l’É d’activation?
servent de catalyseur
- ne change rien à l’équilibre d’une rx
- abaissent énergie d’activation pour que l’É thermique existante sois suffisante pour qu ele rx se produise
qu’est-ce qu’un lien à haute énetgie? exemple de molécules à haute É
un lien dont l’hydrolyse se produit avec un delta G -
- ATP ( 1 glucose = 36 ATP)
- implique souvent phosphate (ATP, 2 liens phosphates)
qu’est-ce que le couplage de rx?
trait fondamental des liens à haute énergie est leur capacité à être couplés à d’autres rx pour permettre biosynthèse
exemple de rx avec 1. deltaG + 2. deltaG -
- rx biosynthétiques exigent un apport d’É
- coupler la synthèse avec l’hydrolyse de liens à haute énergie
les rx couplées peuvent-elles ou non être complètement séparées?
non
qu’arrive-t-il lorsqu’un lien à haute énergie est transféré à une autre mol?
il y est attaché par un autre lien à haute énergie
- les trasnferts du groupe pyrophosphate à haute énergie active le GTP
comment sont activés lesAA?
- par le transfert d’un AMP sur le groupe carboxyle de l’AA ( lien haute É)
- ce lien est hydrolysé pour permettre de transférer l’AA sur l’ARN de transfert, créant un autre lien haute É
pourquoi l’activation des AA et des ARN transfert est-elle nécessaire?
pour que la rx de synthèse des prot soit possible
