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Biologie moléculaire > chapitre 1 > Flashcards

chapitre 1 Flashcards

1
Q

de quoi est composé la cellule?

A
  • eau
  • ions inorganiques
  • molécule organiques
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Q

eau polaire ou non polaire (et ce que ça implique)?

A

polaire: O attire plus les atomes que H, la molécule est donc dipôle

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3
Q

dans l’eau, à quoi servent les liens H?

A
  • permettent forte stabilité (peut rester à état liquide de T pièce)
  • permettent à l’eau intéragir avec les ions (solubles) et molécules hydrophiles (soluble)
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4
Q

qu’est-ce qui arrive aux molécules hydophobes dans l’eau?

A

sont repoussées et souvent s’Associent être elles

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5
Q

de quoi est composé la membrane plasmatique et qu’est-ce qui maintient le double feuillet lipidique?

A
  • molécules amphipatiques
  • le double feuillet compose les membrane CR et est maintenu par les partie hydophobes les unes vers les autres, cela permet aux parties hydrophiles d’intéragir avec le milieu aqueux
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6
Q

à quoi servent les ions inorganiques?

A

essentiels à +s aspects du métabolisme CR (pH, dépolarisation CR, facteur essentiel aux enzymes)

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7
Q

quelles sont les 4 classes principales des molécules organiques?

A
  • sucres
  • lipides
  • acides nucléiques
  • protéines
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8
Q

qu’est-ce qui est formé à partir des mol org., AA et acides nucléiques?

A

macromolécules

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9
Q

qu’est-ce que le glucose et ses rôles (5)

A
  • est une macromolécule
  • source énergie cellule
  • sous forme de polymère, stocké dans foie/muscles ou amidon des graines (réserve É)
  • marqueur pour le transport et repliment des prots
  • marqueur de la surface CR
  • reconnaissance et intéractions entre C et tissus
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10
Q

qu’est -ce qu’un monosaccharide? et quelles sont ses formes les plus communes?

A

1 sucre
- hexoses 6C
- trioses 3C
- pentoses 5C

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11
Q

qu’est-ce qu’un lien glycosidiques?

A

pour former disaccharide
deux monosaccharides qui sont lier par un lien covalent formé par une rx de déshydratation

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12
Q

3 polysaccharides et leurs rôles

A
  • amidon: formé de chaine de Glu liées par les liaisons glycosidiques entre C 1 et 4 des Glu voisins
  • glycogène: principale réserve de glucose chez animaux, formé de chaine semblable , mais + ramifiées
  • cellulose: forme fibre végétale, les Glu sont attachés ensemble par liens glyco entre C 1 et 4, mais configuration bêta 1 (chaque mol est inversée à sa voisine, rend +++ stable, donc animaux digèrent pas
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13
Q

qu’est-ce qu’un lipide et ses rôles?

A
  • formés de longues chaines d’hydrocarbures
  • importante réserve d’énergie
  • pas des polymères ni des macromol (car formé d’un nombre limité de group)
  • composant principal de la membrane plasmatique
  • rôle important dans siganilisation CR (ex.: impliqué dan shormone stéroïdienne, messager interCR)
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14
Q

qu’est-ce qu’un acide gras et de quoi est-il composé?

A
  • composé d’une longue chaine d’hydrocarbures (seulement C et H, souvent 1 unique group polaire)
  • constitué d’un group carboxyle (COOH) (acide org)
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15
Q

quelle es la différence entre un acide gras saturé et insaturé?

A
  • saturé: aucune liaison double, tous les C sont comblés de H
  • insaturé: liaison double entre C ( mono saturé: 1 liaison double, polysaturé: +s liaisons doubles)
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16
Q

qu’est-ce qu’un triglycéride?

A

composé de 3 acides gras relié par un glycérol (via le group COOH)
lien ester

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17
Q

qu’est-ce qu’une liaison ester?

A

implique la fonction hydroxyle (OH) d’un acide et un group hydroxyle d’une autre molécule, une molécule d’eau est libérée

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18
Q

qu’est-ce qu’un phospholipide?

A
  • acides gras lié à glycérol, mai sle 3e C du glycérol est lié à un phosphate et le phosphate est lié à une petite molécule
  • molécule - et forment tête hydrophile (cela permet de s’aligner dans la bicouche
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19
Q

qu’est-ce qu’un glycolypide, et où se trouve-t-il?

A
  • 2 acides gars liés par un group sérine lié à un sucre
  • dans couche externe des membranes lipidiques
  • rôle dans reconnaissance des C
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19
Q

qu’est-ce que le cholestérol et de quoi est-il précurseur?

A
  • 4 cycles (à la place d’une chaineà) très hydrophobes
  • son group OH rend son extrémité hydrophile
  • précurseur de +s hormones stéroïdiennes (estradol et testostérone)
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19
Q

qu’est-ce qu’un spingomyéline?

A
  • seul phospholipide sans glycérol
  • c’est une sérine qui relie les deux acides gras (group polaire)
  • principale composante de la gaine de myéline (entoure axones des neurones)
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20
Q

quels sont les deux types de sucres et quand sont-ils utilisés?

A
  • ribose: ARN (OH)
  • désoxyribose: ADN (H)
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20
Q

de quoi est formé un nucléotide?

A
  • sucre à 5C
  • lié à une base azoté par un lien glycosidique (C 1’)
  • et à goup phosphate lié par lien ester (C 5’)
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20
Q

qu’est-ce qu’un acide nucléique? quels sont les 6 types?

A
  • polymères de nucléotiques
  • ARN messager
  • ARN transfert
  • ARN ribosomaux
  • régulation de l’expression des gènes
  • transport des ARN et prot
  • activité catalytique (enzymes protéiques)
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21
Q

quelles sont les 4 bases et dans quels groupes?

A

purine: adénine et guanine
pyrimidine: cytosine, tymine et uracile

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22
Q

comment appelle-t-on lorsque la base est lié à un sucre?

A

nucléoside

23
Q

comment appelle-t-on lorsque la base est lié à un sucre et à un phosphate?

A

nucléotide

24
Q

que veut dire NTP et dNTP

A

NTP désigne tous les nucléotides et le d veut dire que le sucre est le désoxyribose

25
Q

comment se fait la polymérisation des nucléotides?

A

par la formation d’un lien phosphodiester entre le OH en 3’ d’un nucléotide et le phosphate en 5’ du nucléotide suivant

26
Q

comment sont les AA non polaires? et dans quoi sont-ils impliqués?

A
  • ont R hydrophobe ( composé uniquement d’hydrure de C (C et H)
  • impliqués dans intéractions hydrophobes à l’int de la structure d’une prot, ou à l’interface entre prot formant un complexe multimétrique
27
Q

quels sont les 4 groupes d’AA?

A
  • non polaire
  • neutre polaire
  • basique +
  • acide -
    selon leur chaine variable
27
Q

qu’est-ce qu’un acide aminé et de quoi est-il composé?

A

précurseur des prots (AA relié par lein peptidique)
- carbone central (alpha)
- group acide (COOH)
- group amine (NH2)
- group variable (R)

28
Q

de quoi sont composés les AA neutres polaires?

A
  • group polaire à l’extrémité de leur chaine latérale ( OH ou amine)
29
Q

cas spécial de la cystéine

A

est polaire et non polaire, car son group SH est très faiblement polaire

30
Q

de quoi sont composés les AA acides - ?

A

groupement carboxyle sur leur chaine latérale et possèdent donc une charge nette -

30
Q

de quoi sont composés les AA basiques +?

A

group amine à l’extrémité de leur chaine latérale
- à pH physio, ces group attirent un proton en leur donnant une charge +

31
Q

où se retrouvent souvent les AA neutres polaires et chargés? et pourquoi?

A

à la surface des prot et dans les sites actifs des enzymes car sont hydrophiles (donc soluble dans l’eau)

32
Q

qu’est-ce qu’un lien peptidique?

A

unie group carboxyle d’un AA au group de l’AA suivant
- liaison covalente qui libère une molécule d’eau
- a une structure plane à cause du double lien entre O et N, crée rigidité

33
Q

qu’est-ce que l’ossature?

A
  • acide nucléiques et prot sont constitués par assemblage de molécules similaires ( car sont des polymères)
  • l’ossature est la structure répétitive de ces macromolécules
34
Q

de quoi est composé l’ossature des 1. acide nucléiques 2. bases 3. protéines?

A
  1. enchainement de sucre et phosphate
  2. variable et leur alternance = leur id
  3. amine-carbone, alpha-carboxyle-anine- carbone
35
Q

qu’est-ce qu’un lien fort et qu’est-ce que cela implique au niveau énergétique?

A

lien fort = lien covalent (atomes liés sont de la même molécule)
- plus le lien est fort, plus l’énergie libéré ou nécessaire est grande

36
Q

à quoi servent les liens faibles?

A

importants pour maintenir les molécules ensemble
efficace ++ lorsque nombreux

37
Q

quel impact à la chaleur sur la probabilité de briser les liens entre atomes?

A

la chaleur aug les collisions et donc aug les chances de briser le lien

38
Q

à quoi sert l’énergie libre de Gibbs?

A
  • utile pour exprimer les changements moléculaires CR
  • permet d’évaluer la spontanéité d’un processus
  • relie variation enthalpie (H) et la variation d’entropie (S) (G=H-TS) (T: temp)
39
Q

qu’est-ce qui arrive lorsque plus un lien est fort?

A

plus le changement d’énergie libre accompagnant sa formation est grand, et plus la proportion d’atomes sous forme lié est grande

40
Q

est-ce qu’un lien covalent à un delta G + ou - et qu’est-ce que ça implique?

A

delta G très -
- donc sont pratiquement indestructible à conditions physio car équilibre tend vers forme liée)

41
Q

quels sont les 4 types de liens faibles?

A
  • van der waals (toutes les mol peuvent en former)
  • hydrogènes (mol doivent être polaires pour en former)
  • hydrophobes
  • ionique (mol doivent être polaires pour en former)
42
Q

est-ce qu’une molécules peut former +s liens?

A

oui mais le plus fort à tendance à gagner

43
Q

de quoi dépendent les intéractions Van der waals?

A
  • des fluctuations de charges entre les atomes les plus proches
  • de la distance entre les atomes et donc de la forme des molécules
  • structure compatible ex.: Ac et Ag spécificité
44
Q

quand sont formés les liens H?

A

peuvent se former entre des atomes engagées dans des liens covalents avec des atomes d’électro- diff
- typiquement un donneur d’H est un O ou un N en lien avec un H (charge résiduelle +)
- un accepteur de H à une charge -

45
Q

qu’est-ce qui cause la polarité?

A

l’électronégativité qui est différente entre les atomes réunis dans la même molécule
dipôle permanent dans eau donc polaire

46
Q

pourquoi l’orientation de la liaison H par rapport au lien covalent dans lequel les atomes sont engagés est importante?

A

parce que permet de déterminer la force du lien
- lien H fort: liaison plate
- lien H faible: liaison peut avoir un angle jusqu’à 30°

47
Q

pourquoi l’eau à un haut point d’ébulition?

A

car peur former 4 liaisons H donc avec 4 molécules voisines

48
Q

de quoi dépend la solubilité d’une subs?

A

de sa capacité à intéragir avec les molécules d’eau en établissant des ponts H avec des molécules d’eau
- la formation de liens entre l’eau et la molécules soluble interrompent les intéractions des mol d’eau

49
Q

comment est la solubilité d’une molécule très polaire?

A

solubilité limité, en haut de la conc limite, pas possible de créer assez de liens entre soluté et solvant pour assurer solubilité

50
Q

qu’est-ce que l’énergie d’activation?

A

énergie nécessaire pour briser un lien covalent et permettre la création d’un nouveau lien
- énergie nécessaire est assez grande pour pas que les liens ne peuvent pas spontanement se détruire à 25°C

51
Q

à quoi servent les enzymes dans des rx? comment affectent-elles l’É d’activation?

A

servent de catalyseur
- ne change rien à l’équilibre d’une rx
- abaissent énergie d’activation pour que l’É thermique existante sois suffisante pour qu ele rx se produise

52
Q

qu’est-ce qu’un lien à haute énetgie? exemple de molécules à haute É

A

un lien dont l’hydrolyse se produit avec un delta G -
- ATP ( 1 glucose = 36 ATP)
- implique souvent phosphate (ATP, 2 liens phosphates)

53
Q

qu’est-ce que le couplage de rx?

A

trait fondamental des liens à haute énergie est leur capacité à être couplés à d’autres rx pour permettre biosynthèse

54
Q

exemple de rx avec 1. deltaG + 2. deltaG -

A
  1. rx biosynthétiques exigent un apport d’É
  2. coupler la synthèse avec l’hydrolyse de liens à haute énergie
55
Q

les rx couplées peuvent-elles ou non être complètement séparées?

A

non

56
Q

qu’arrive-t-il lorsqu’un lien à haute énergie est transféré à une autre mol?

A

il y est attaché par un autre lien à haute énergie
- les trasnferts du groupe pyrophosphate à haute énergie active le GTP

57
Q

comment sont activés lesAA?

A
  • par le transfert d’un AMP sur le groupe carboxyle de l’AA ( lien haute É)
  • ce lien est hydrolysé pour permettre de transférer l’AA sur l’ARN de transfert, créant un autre lien haute É
58
Q

pourquoi l’activation des AA et des ARN transfert est-elle nécessaire?

A

pour que la rx de synthèse des prot soit possible

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