chap 4 Flashcards
qu est ce qu une maladie genetique complexe?
déterminisme genetique mais transmission non mendélienne et non mitochondriale
de quoi dépendent les maladies multi factorielles?
- environnment
- aspect monogenique
- aspect polygénique
- -> effet minime de chaque facteur
maladies multi factorielle sont elles a transmission mendélienne?
non
quelle est la caractéristique des caractères oenotypiques polygéniques ?
discontinu ou dichotomique–> present ou absent
la susceptibilité de posséder le trait résultant de la maladie polygénique est elle continue ou discontinue?
continue
–> dépassement du seuil de susceptibilité–> caractère dichotomique
comment qualifie-t-on les traits continu ou quantitatifs des maladies polygéniques multi factorielles? quels loci sont impliqués?
chaque individu possède le trait mais a des degrés différents –> non mendélien
loci: QTL–> quantative trait loci (5% les plus extrêmes de la distribution )
qu est ce que le modele genetique mixte?
susceptibilité sous le contrôle d un gene majeur, dont l action est module par systeme polygénique et facteurs environnementaux
quelles sont les 4 étapes de l étude des maladies multifactorielles?
- montrer que phénotype/maladie est familiale
- montrer que la tendance familiale est due a des facteurs génétiques
- identifier ls gènes causatifs/ de susceptibilité
- identifier les variants
quels sont les trois critères a prendre en compte lors de la recherche d un facteur de risque indépendant via l histoire familiale?
- age de l apparition
- nombre de personne atteintes
- degré d apparenté de personnes atteintes
que mesure le risque relatif ? comment le calcul t on ?
–> risque de la reccurence de la maladie chez un apparenté du malade
lambda= ( prevalence de la maladie chez apparenté des personnes atteintes)/ ( prévalence de la maladie dans la population générale)
qu est ce qui nous permet de mesurer la contribution genetique chez des jumeaux monozygotes?
concordance pour un caractère qualitatif –> discontinu
corrélation pour un trait quantitatif –> continu
pourquoi une discordance chez des MZ est elle considérée comme environnementale?
–> car meme patrimoine genetique
pourquoi, chez les DZ, toute discordance est elle considérée comme environnementale ET genetique?
car partage de 50% du patrimoine genetique
que peut on calcule a partir de la corrélation?
l’héritabilité: formule de falconer ( o. pas de contribution génétique, 1: exclusivement genetique)
H^2= 2(Rmz-Rdz)
qu est ce qu une étude d’association cas contrôle?
comparer les freuence des alleles d un marqueur genetique chez malade et témoins appariés
–> peu de succès
comment un allèle directement impliqué dans la maladie est il nommé?
variant fonctionnel
qu est ce qu un desequilibre de liaison?
association statistique entre les allèles de plusieurs loci
qu est ce qu une analyse de paires germains atteints?
recherche une association genetique par analyse de liaison
que se passe t il chez une paire de germains si il y a indépendance entre maladie et marqueur?
chacun des germains atteints présente les 4 génotypes avec la meme fréquence
que se passe t il chez une paire de germains si le marqueur est proche du gene de susceptibilité?
exces d alleles du marqueur commun
quel groupe sanguin est le moins susceptible d avoir un infarctus du myocarde?
O
combien génome faut il analyser pour en examiner la structure? la variabilité?
- un seul
- tres grand nombre
combien de genomes une personnes possède-t-elle?
2, un maternel et un paternel
–> 6 milliards de bases a lire
quelles sont les bases a l origine des différences entre les individus?
les bases variables
comment définir t on un trait complexe?
mesure de plusieurs facteurs de ce trait complexe a different moments et endroits
quels sont les deux grands facteurs des traits complexes?
genetique et environnemental
->etiologie
quelle est la première chose qui nous permet de localiser les régions de contrôle du phénotype dans le genome?
connaitre les SNV–> structure des variation de nucleotides-> insertion, deletion…
les variations ne touchent qu une seule base?
non, elles peuvent en toucher plusieurs
que defini la fréquence d un allèle de SNV?
l age de la. mutation
quelle est la frequence d une mutation fréquente ?
0,5%
un phenotype continu peut il définir un phenotype discontinu?
oui, comme le diabète
qu est ce qu un haplotype?
transmission d’UNE meme version de chromosome que celui de nos parents, sur un car donné, un maternel et un paternel
–> si le chromosome n es pas le meme c est qu il y a eu recombinaison
comment defini t on un haplotype?
en fonction des régions variables
les variations allyliques sont elle toujours indépendantes?
non, parfois elles sont en relation avec d autres variations
qu est ce qu un trait phénotypique continu?
caractere pouvant prendre n importe quelle valeur dans un intervalle donné ( poids, taille…)
qu est ce qu une maladie complexe ?
maladie multi factorielle –> effet combine de genes de susceptibilité
quel est le but d’un GWAS?
analyse permettant de localiser les régions du genome impliquées dans les maladies complexes
quelle est la première étape d un GWAS?
dns une population donnée, séparation des cas et des témoins
quelle est la deuxième étape d un GWAS?
genotypage–> analyse de l ensemble du genome des individus
–> interrogation des SNV
quelle est la troisième étape d un GWAS?
analyse statistique pour trouver SNC
–> identification du SNV le plus significatif –> doit etre different entre groupes
pourquoi identifier les facteurs génétiques d une maladie complexe?
D’identifier les personnes avec un fort risque de développer une maladie
D’apporter des pistes d’investigation pour comprendre quel système biologique est perturbé
De mettre en place un traitement
qu est ce que l héritabilité?
part d’origine génétique de la variance d’un trait phénotypique.
comment peut on connaitre la SNV causatif?
en connaissant la correlation des SNV génotypes
qu est ce que la palette genetique ?
diverge selon les personne, présence de caractères, comme prédisposition a des maladies
comment definit on la variation d un haplotype?
par les termes équilibré/desequilibrés
qu est ce qu un haplotype equilibré?
pas de correlation entre les positions, on doit donc toutes les connaitre pour placer un nouveau nucleotide.
qu est ce qu un haplotype desequilibré?
on peut prédire la position d un nucleotide en connaissant la position de celui d avant –> non au hasard
