Chap 2 Technique D'etude En Biocell Flashcards

1
Q

Caractéristique du microscope optique

A
Faisceau lumineux 
Limité par la diffraction 
Échantillon coloré mais vivant 
Possède 2 lentilles:
1.l’objectif = pour agrandir l’objet 
2.l’oculaire= pour que les rayons arrivent à l’œil de manière parallèle 

Possède un diaphragme= régler la quantité de lumière

0,2 micromètre (limité par la diffraction de la lumière)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Caractéristiques du microscope à contraste de phase (microscope optique)

A
  • échantillon pas colore
  • cellules isolées ou fines couches cellulaires
  • Transforme les indices de réfraction de la lumière en différents niveaux de contraste
  • Possède deux anneaux de phase: pour filtrer les rayons déphasés

La lumière se déplace plus lentement dans un milieu avec un indice élevé

DIC: permet de voir les détails, définit bien les contours, objets plus épais
Semble projeter une ombre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Caractéristiques du microscope à fluorescence (photonique-champ large)

A

Possède 2 sources de lumière:

  1. Halogène =pour les échantillons à transmission (classique)
  2. lampe à arc= le filtre d’excitation sélectionne les radiations spécifiques du fluorochrome qui sont réfléchis par le miroir dichroide et éclairent l’échantillon. Celui ci émet les radiations de fluorescence qui seules passe au travers du filtre d’émission et atteignent l’oculaire

*épifluorescence= plusieurs filtres

Fluorochrome: possède 2 spectres, absorption (lumière incidente) et émission (fluorescence)
*substance chimique est fluorescente si elle absorbe la lumière à une longueur d’onde plus petite que la longueur d’onde de la lumière émise
TRITC ROUGE
FITC VERT
DAPI BLEU se fixe sur adn

Les capteurs sont en noir et blanc donc il faut colorer les images par ordinateur.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Décrire le microscope confocal

A

Objectif = améliorer la résolution de l’image en observant la fluorescence uniquement dans un plan focal de l’échantillon.
nos cellules sont sphérique, en 3d
Pinhole = (diaphragme qui ne laisse passer qu’un point lumineux ) permet d’éliminer tous les signaux fluorescents situés en dehors du plan focal
Laser= (source lumineuse monochromatique) permet d’exciter les fluochromes donc pas de lampe
Photodetecteur: amplifie et transforme les photons en signal électrique qui sera numérisé en un niveau de gris

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pourquoi la microscopie électronique

A

Permet de voir les organites les plus petits et même certaines molécules (plus petit que 200nm)
*échantillons ne peuvent pas être vivant, demande une préparation, coupe très fine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Fonctionnement microscope électronique

A

Utilise un faisceau d’électrons plutôt que la lumière
0,4 a 20 nm
2 types:
1.met = (a transmission) seuls les électrons traversant la préparation sont analysés
2.meb =(a balayage) les électrons secondaires et rétro diffusés sont détectés
Besoin d’échantillons très mince afin d’être le plus possible transparent aux électrons
Pour meilleur contraste: métaux lourds pour mieux absorber et disperser les électrons. MAXIMISER les collisions avec les électrons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

3 types d’électrons à la sortie de l’échantillon d’un microscope électronique

A
  1. Electrons transmis n’ayant pas interagi avec l’échantillon
  2. les électrons diffusés elastiquement (sans perte d’énergie) résultant de l’interaction des électrons incidents avec les atomes de l’échantillon
  3. les électrons diffuse inélastiquement (avec perte d’énergie)provenant de l’interaction des électrons incidents avec les cortèges électronique des atomes de l’échantillon
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Pourquoi le meb fournit des images en noir et blanc

A

Principe: l’échantillon est balayé par un faisceau électronique et on vient détecter les électrons secondaires de très faibles energie qui sont produits suit au bombardement
Ces derniers sont sont amplifiés et interprété en produisant une image en fonction de l’intensité du courant électrique produit.

Donc différentes nuance de gris= intensité du courant détectée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

2 contrainte pour la microscopie à lumière

A
  1. Épaisseur: les rayons lumineux doivent pourvoir traverser l’objet pour former image/ éviter les superpositions
    Max 2 a 5 um
    Méthode de là microtomie : confection de coupes
  2. Contrastes: ex photonique ou à transmission:
    Montage optique: utilise nature ondulatoire de la lumière (microscope à contraste de phase)
    Colorations
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Pourquoi il faut faire étape de fixation avant l’inclusion

A

Altération de l’organisation cellulaire

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

4 étapes de préparation pour la microscopie à lumière

A
1. Fixation = consolider
Traitement chimique (formaldéhyde)
Traitement thermique (azote liquide-limite la formation de cristaux)
2.inclusion= durcir 
Remplace l’eau par de la paraffine avec étapes de déshydratation successive à éthanol et toluène 
Pas toujours nécessaire si congélation 
3.microtomie= couper 
5 a 10 um 
Sur paraffine= 2 a 5 um
4.coloration= contraster
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Décrire le colorant utilise comme méthode de préparation

A

Définition: molécule qui a la propriété d’absorber certaines longueurs d’onde de la lumière et de conférer une couleur au composant qui l’a lié
Groupement chromophore: absorbe certaines longueurs d’onde et confère la couleur
Groupement auxochrome: permet la liaison a certains constituants cellulaires

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

2 techniques permettant de colorer les composants cellulaires

A

A l’aide d’anticorps: techniques immunohistochimiques
A l’aide de sondes d’acides nucléiques: hybridation in situ ou fish
(cytogénétique): permet de visualiser la chromatine grâce à leur affinité pour l’adn et où les protéines qui lui sont associés
Exemple: *giemsa (rose)=colorant de base de toutes les techniques de marquage en bandes des chromosomes
*la moutarde de quinacrine
*le dapi bleu noyau
*l’iodure de propidium

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Définition hybridation in situ

A

Appariement d’une séquence marquée connue d’acides nucléiques simple brin (sonde) à une ou plusieurs séquences complémentaires sur une préparation chromosomique ou des cellules fixées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Principe de l’hybridation in situ

A

Une sonde moléculaire est mise en contact avec les chromosomes d’une mitose et vas d’hybrider (se fixer) spécifiquement au niveau de la séquence complémentaire
On peut alors visualiser la sonde au microscope, ce qui identifie la région chromosomique dont elle est complémentaire

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quelles sont les 4 sondes d’ADN simple brin ou d’arn marqué par des fluochromes

A
  1. sondes de peinture chromosomique
  2. sondes telomeriques
  3. sondes centromeriques
  4. sonde a séquence unique
17
Q

Décrire la sonde de peinture chromosomique

A
  • constitué d’un ensemble de sondes de petite taille qui couvrent l’ensemble du chromosome
  • séquence d’ADN spécifique de chaque chromosome
  • utiles pour interpréter certaines translocations complexes, mettre en évidence des échanges de petite taille, identifier précisément l’origine d’un fragment non identifié
18
Q

Décrire les sondes centromeriques

A
  • hybridation au niveau des centromeres
  • utile pour dénombrer les chromosomes en métaphase et en interphase

Avantage: permet de compter le nombre de chromosome car seulement à centromere

Adn:ioduré de propidium
Centromeres: fitc

19
Q

Décrire les sondes telomeriques

A
  • hybridation au niveau des telomere
  • utile pour dénombrer les chromosomes en métaphase et en interphase

*vieillissement = rapetissement des telomeres

ADN: dapi bleu
Telomere: fitc jaune

20
Q

Décrire les sondes à séquence unique

A
  • sondes de petites tailles qui permettent d’identifier une région très précise du génome
  • mise en évidence rapide de remaniement impliquant une région précise
21
Q

Décrire les sondes fish

A

Peuvent être employés seules ou combiné pour obtenir un marquage multi couleurs permettant une interprétation plus aise de certains remaniements chromosomiques

  • permet de localiser n’importe quel gène sur un chromosome
  • permet d’allumer des régions spécifiques des chromosomes comme les centromeres ou telomeres
22
Q

3 grandes contraintes de la microscopie électronique

A
  1. L’eau est volatile: il faut retirer l’eau par déshydratation donc il faut la fixer
  2. Doit résister à augmentation de température (échauffement sous vide) du au bombardement d’électrons
  3. l’épaisseur des échantillons ne doivent pas dépasser le dixième de micromètre car le pouvoir de pénétration des électrons est faible
23
Q

Quelle sont les étapes de préparation pour microscope électronique Quelles sont les trois étapes de préparation supplémentaire pour le microscopie électronique met

A
  1. Fixation (glutaraldehyde, teroxyde qui préservent les structures cellulaire)
  2. Déshydratation (acétone)
  3. Durcissement (enrobage avec resine)
  4. Coupes (outil: ultramicrotome)
  5. Obtention de contraste (met échantillon sur grille de cuivre et plonge dans solution de métaux lourds) pour meb on recouvre d’or ou platine pour empêcher la traversée des électrons

3 techniques supplémentaires pour met car manque de contraste pour les échantillons qui ne nécessitent pas de coupe:
A.coloration négative
B.ombrage métallique
C.cryofracture et cryodecapage

24
Q

Décrire la coloration négative (préparation met supplémentaire pour échantillon ne nécessitant pas de coupe)

A

Plonger l’échantillon dans une solution de sel de métal lourd, qui est drainée et les traces de solution qui restent se concentrent sur les angles ou les bords de l’échantillon

  • l’es structures apparaissent claires sur un fond sombre
  • permet de contraster le contour de petits objets
25
Q

Décrire l’ombrage métallique (préparation met pour échantillon ne nécessitant pas de coupe )

A

Exposer l’échantillon à des vapeurs métalliques (obtenue en vaporisant sous vide une électrode métallique) et ceci sous incidence pour avoir une ombre formée

26
Q

Décrire la cryofracture ou cryodecapage (préparation met pour échantillon ne nécessitant pas de coupe)

A
  1. congélation de l’échantillon dans l’azoté liquide et fracture **tres basse température. Étape la plus importante ** pour obtenir une surface irrégulière (cryofracture)
  2. décapage de la surface de l’échantillon pour augmenter les reliefs des structures (cryodecapage)
  3. termine avec un ombrage métallique pour renforcer les reliefs. Obtient un vrai moulage précis de la surface de l’échantillon (la réplique )
27
Q

Décrire la résonance magnétique nucléaire RMN

A

Étude de la structure de protéines dans l’espace

  1. orientation dès spin nucléaire des atomes avec un champ magnétique
  2. exciter l’es spin par une onde radio à fréquence de résonance
  3. L’es spin reviennent à leur été initial

Les points sont l’énergie mesurée

28
Q

Décrire la cristallographie à rayon x

A

Étude de la structure de la protéine pure sous forme cristalline
De cette manière qu’on a découvert la double hélice alpha

L’autre technique à haute résolution pour analyse de structure de protéines est: résonance magnétique nucléaire (rmn) étude de la structure de protéine dans l’espace (molécules en solution)