Caractérisation et classification

Question 1

Qu’est ce que la taxonomie?

Answer 1

Établir des groupes naturels d’organismes présentant des caractères communs

Question 2

Vrai ou faux: un organisme peut faire partie de plusieurs taxons à un niveau donné de la hiérarchie.

Answer 2

Faux

Question 3

En quoi consiste la taxonomie?

Answer 3

Identification: description + caractérisation
Nomenclature
Classification systématique: arrangement et relations inter-groupes

Question 4

Que sont des souches (isolats)?

Answer 4

Tous les descendants d’une culture pure

Question 5

Qu’est ce qu’un espèce?

Answer 5

Groupes de souches dont les caractéristiques sont (presques) identiques

Question 6

Qu’est-ce qu’une souche-type?

Answer 6

Souche possédant toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce

Question 7

Qu’elle est le préalable à la description et la caractérisation?

Answer 7

Culture pure

Question 8

Donne les caractéristiques de l’identification par types de caractères.

Answer 8

Morphologie
Taille/forme/arrangement
Structures cellulaires/endospores (seulement 10%)
Réaction aux colorants (Gram)

Question 9

Donne les caractéristiques de l’identification par la composition biochimique.

Answer 9

Membrane: types de lipides/alcools

Parois cellulaires: polysaccharides/protéines

Question 10

Qu’est-ce qu’utilise les eubactéries pour former leur paroi cellulaire?

Answer 10

Peptidoglycane

Question 11

Qu’est-ce qu’utilise les archaebactéries pour former leur paroi cellulaire?

Answer 11

Pseudomuréine

Question 12

Qu’est-ce qu’utilise les mycètes/algues pour former leur paroi cellulaire?

Answer 12

Cellulose

Question 13

Donne les caractéristiques de l’identification physiologique.

Answer 13

Exigences nutritionelles: milieur de culture (sources de C/facteurs de croissance)
Conditions d’incubation (T/O2/lumière)

Question 14

Donne les caractéristiques de l’identification métabolique.

Answer 14

Produits finaux de fermentation (anaérobie stricte)

Enzymes extracellulaires

Question 15

Donne les caractéristiques de l’identification génétique.

Answer 15

Composition en G+C%
Nombre de chromosomes (eucaryotes)
Plasmides

Question 16

Donne les caractéristiques de l’identification par interaction avec l’hôte.

Answer 16

Pathogénicité
Capacité de provoquer une maladie chez différents hôtes
Symbiose

Question 17

Donne les caractéristiques de l’identification écologique.

Answer 17

Habitats

Niche écologique, rôle dans les cycles de la matière

Question 18

Donne les caractéristiques de l’identification moléculaire par comparaison de séquences.

Answer 18

Gènes conservés
Protéines conservées
Séquences signatures
Homologie des séquences (organismes apparentés)

Question 19

Donne les caractéristiques de l’identification moléculaire par hybridation ADN-ADN.

Answer 19

Plus l’hybridation est forte, plus les espèces sont apparentés
Complémentarité des séquences d’ADN chromosomiques

Question 20

Quelle est la condition pour nommer une nouvelle espèce?

Answer 20

Elle doit avoir de nombreuses caractéristiques différentes des autres espèces connus

Question 21

Comment fonctionne la classification naturelle?

Answer 21

Nature biologique des organismes
Anatomiques
Ex: plantes vs animaux

Question 22

Comment fonctionne la classification phénétique?

Answer 22

Similarités caractères phénotypiques (métaboliques, morphologiques, génétiques, …)

Question 23

Comment fonctionne la classification numérique?

Answer 23

Comparaison de plusieurs organismes (nb de caractères: min. 50)
% de similarité
Limite: pondération des caractères

Question 24

Comment fonctionne la classification phylogénétique?

Answer 24

Relations évolutives probables
Comparaison de séquences de gènes/protéines conservées
Mutations
Gène ARN ribosomal

Question 25

Que signifie un noeud dans l’arbre de la vie?

Answer 25

Un événement de divergence

Question 26

À quoi est proportionnelle la longueur des branches dans l’arbre de la vie?

Answer 26

Le nombre de changements moléculaire (longueur de l’évolution)

Question 27

Quels outils permettent de faire la classification phylogénétique?

Answer 27

Bio-informatiques

Question 28

En quoi consiste la classification polyphasique?

Answer 28

Informations phénétiques et phylogénétiques

Question 29

Quel a été la contribution de Linnaeus pour la classification des microorganismes?

Answer 29

Anatomie

2 règnes: plantes et animaux

Question 30

Quel a été la contribution de Haeckel pour la classification des microorganismes?

Answer 30

3e règne: protistes (bactéries, levures, protozoaires, algues)

Question 31

Quel a été la contribution de Whittaker pour la classification des microorganismes?

Answer 31

Nutrition + organisation cellulaire

5 règnes (évolution originelle unidirectionnelle)

Question 32

Quel a été la contribution de Woese pour la classification des microorganismes?

Answer 32

Approche phylogénétique/ARNr
3 domaines (eucarya, bacteria, archaea)
LUCA

Question 33

Quelles sont les caractéristiques des mitochondries et des chloroplastes?

Answer 33

Autoréplicatives
Chromosomes uniques circulaires
Gènes ARNr (semblables à eubactéries)
Théorie de l’endosymbiose