C4 : Système endomembranaire Flashcards
Nommer les 3 manteaux qui peuvent recouvrir les vésicules.
- Clathrine
- COPI
- COPII
Les vésicules avec un manteau de type COPII sont associées avec quelle GTPase?
Sar1
Les vésicules avec un manteau de type COPI sont associées avec quelle GTPase?
Arf
Les vésicules avec un manteau de type clathrin sont associées avec quelle GTPase?
Arf
Nommer les 2 GTPases qui sont des facteurs clés pour l’initiation du bourgeonnement.
Sar1 et Arf
La phase précoce de la voie sécrétoire se passe entre quels 2 organites?
Le RE et le golgi.
Nommer les 3 voies de transport du système endomembranaire.
- Biosynthèse-sécrétion (exocytose)
- Endocytose
- Voie de recapture (transport rétrograde)
La clathrin doivent être en complexe avec quelles protéines?
Des protéines adaptrices.
Nommer les 5 différentes familles de GTPases.
- Ran family
- Rab family
- Rho/Rac/Cdc42 family
- Ras family
- Sar1/Arf family
Les protéines Sar et Arf peuvent avoir 2 conformations. Celles-ci dépendent de quoi?
De si la protéine est liée au GDP (éteinte) ou au GTP (allumée).
Dans les protéines Sar/Arf, qu’est-ce qui permet l’interaction avec les membranes?
Il y a une hélice alpha amphipathique qui peut interagir avec la membrane. Cette hélice est cachée lorsqu’il y a du GDP lié à la protéine et devient exposée en présence de GTP.
Qu’est-ce qui permet la libération de l’hélice alpha des protéines Sar?
À proximité sur la membrane, il y a la protéine Sec12 (Sar-1-GEF) qui va permettre la libération du GDP pour son remplacement en GTP et ainsi changer la conformation pour libérer l’hélice alpha.
Expliquer en détails les étapes nécessaires pour la formation du manteau de COPII (4)
- Liaison de Sar1 à la membrane, remplacement du GDP par du GTP. La GTPase Sar1-GDP se fixe à son GEF. Sec12 va échanger son GDP pour GTP. La liaison avec GTP expose une chaîne amphiphilique qui s’insère dans la membrane du RE.
- Assemblage du manteau. Les protéines COPII, Sec23 et Sec24, sont recrutées par Sar1-GTP. Sec24 peut interagir avec plusieurs récepteurs de chargement. D’autres protéines du complexe COPII (Sec13 et Sec31) sont recrutées.
- Croissance de la vésicule naissant jusqu’au point que la déformation mène à un pincement et au bourgeonnement.
- Le complexe Sec23/24 agit comme GAP pour Sar1. L’activité GAP est inhibée jusqu’à ce que les vésicules soient matures; elle est stimulée par la courbature de la membrane. L’hydrolyse du GTP cause Sar1 à retirer son hélice amphilique et à la désagrégation du manteau.
Pour la formation de vésicules avec un manteau COPII, quelle protéine est chargée de recruter COPII, Sec23 et Sec24?
Sar1-GTP
Quel signal va donner le signal pour la désagrégation du manteau des vésicules COPII?
Lorsqu’une certaine courbature est atteinte.
Expliquer comment se fait la désagrégation du manteau COPII.
Quand la membrane de la vésicule a une certaine courbature, l’activité GAP ne sera plus inhiber et hydrolyser le GTP, ce qui va retirer l’hélice amphiphilique et mener à la désagrégation du manteau.
Pourquoi est-ce important que le manteau des vésicules soit détruit à un moment?
Pour que la vésicule puisse se fusionner à d’autres membranes.
Le bourgeonnement des vésicules est initié par quel GEF de la membrane?
Sec12
Comment est appelé le signal sur les protéines produites dans le RE qui indique que ces protéines doivent sortir?
Exit signal
Pour sortir du RE, les protéines doivent interagir avec COPII. Comment est-ce que les protéines solubles le font sachant que COPII est dans le cytoplasme?
Ces protéines interagissent avec des protéines transmembranaires ayant un Exit signal qui elles interagissent avec COPII directement.
Que signifie ERES?
ER exit sites (sites de sortie)
Quelle est la séquence du signal KDEL qui permet la rétention des protéines dans le RE? (4 aa)
Lys-Asp-Glu-Leu
K D E L
Lorsqu’un mannose-6-P est intégré dans une protéine, où doit-elle aller?
Vers le lysosome.
Les signaux de sortie du RE solubles interagissent avec quel type de manteau?
COPII (directement ou indirectement)