C4. ARN Flashcards
En quoi consiste le capping?
Modification co-transcriptionnelle : ajout d’une coiffe guanosine méthylée en position N7 sur le premer nucléotide à l’extrémité 5’ –> lien 5’-5’ triphosphate
Quelles sont les étapes de formation de la coiffe de guanosine?
- Phosphohydrolase : hydrolyse du phosphate distal du 1er transcrit primaire
2.Guanyltransférase : catalyse le transfère d’une GMP sur le 1er nucléotide de l’ARNm par une liaison 5’-5’
3.Méthyltransférase : méthylation de la guanosine en N7
Rôles de la coiffe 7mG?
- Protection –> stabilité ARNm
- Export de l’ARNm mature vers le cytoplasme (liaison avec CBC reconnu par les pores nucléaires)
- Initiation de la traduction : recrute la petite SU de 40S
Mécanismes de capping viral
1) enzymes virales synthétisent leur propre coiffe
2) utilisation des enzymes cellulaires
3) subtilisation de la coiffe des ARNm cellulaire
La polyadénylation est cotranscriptionnelle
faut, post
Rôles de la polyadénylation
- Protection contre la dégradation des nucléases
- Export des ARNm
- Stabilité
- Initiation de la traduction –> liaison à 40S
Etapes de la polyadénylation
- Recrutement des facteurs de polyadénylation
- Reconnaissance du complexe AAUAAA par CPSF
- Séquence GU/U reconnue par CstF –> stimule CPSF qui clive 10 à 30 nucléotides avant AAUAAA = libération OH en 3’
- Recrutement PAP : ajoute les premiers adénosines
- Liaison de PABII : accélère la polysadénylation
Qu’est-ce que APA?
Polyadénylation alternative –> augmente la diversité des transcrits, impact la stabilité et l’efficacité de la traduction
En région 3’UTR –> affecte des sites de liaison de facteurs de régulation.
De quoi est composé de spliceosome ?
Complexe enzymatique ribonucléoprotéique composé de 4 ARN et de centaines de protéines
Quels sont les séquences conservées lors de l’épissage?
- site donneur d’épissage
- Site accepteur d’épissage
- Point de branchement adénine –> formation de la structure en lasso
- Séquence riche en pyrimidines
Ribozyme définition
Seule macromolécules porteuse d’information génétique et potentiellement dotée d’activité enzymatique –> molécule d’ARN capable de catalyser des réaction biochimique
En quel C le ribose de l’ADN est désoxy?
C2
Quels sont les avantages de la thymine et de l’uracile?
Thymine: plus résistant aux mutations photochimiques
uracile: moins coûteuse en énergie pour sa production
Que forme une cytosine désaminée ?
un uracile
Quels sont les acteurs nécessaires à la transcription ?
ARN polymérase ADN-dép + facteurs de transcription
Ribonucléotides triphosphates
Modèle ADN
Qui des ARN pol ou ADN pol font le plus d’erreur ?
ARN pol 1/10^4
Que fait l’ARN pol I ?
précurseur des ARNr 45S (sauf 5S) dans le nucléole + maturation en 5,8S, 18S et 28S
Rôles ARN pol II ?
pré-ARNm, snRNA, snoRNA, lncRNA dans le nucléoplasme
Que fait l’ARN pol III ?
ARNt, ARNr 5S et quelques snRNA dans le nucéoplasme
Où se situe le promoteur de transcription?
entre -35 et -10 (2 séquences consensus héxamérique)
Il existe plusieurs promoteurs mais tous étant la même séquence.
Faux, les séquences sont différentes
Pour l’ARN pol à quoi correspond l’holoenzyme?
enzyme coeur + facteur sigma
L’ARN pol s’assemble après localisation du promoteur?
Faux, elle s’assemble avant
Quelles sont les 2 parties du promoteurs?
UCE
Core promoter qui chevauche la partie transcrite
Quelles est l’ARN pol la plus spécialisée?
I (uniquement gènes ribosomiaux)
Qu’est-ce que la complexe de préinitiation ?
UBF Factor
SL1 Factor avec TBP
Les facteurs du promoteur proximal sont…. et ceux du distal sont ….
…généraux…spécifiques (enhancer/silencer)
Quels sont les facteurs proximaux et leurs rôles?
Aide au positionnement de l’ARN pol II
Initie la transcriptio, de ARNm, snRNA,miRNA et lncRNA
3 régions consensus: (pas toutes toujours ensemble)
- TATAbox (-25) : reconnu par TBP associée à TFIID –>positionnement
- CAAT box (-90) : reconnu par CFT ou C/EBPc–< maintien
- séquence GC (-50) : reconnu par Sp1 –> efficacité transcription
Terminaison chez les procaryotes et chez les eucaryotes.
Procaryotes: paires A-T structure en tige-boucle (épingle à cheveux qui se casse)
Eucaryotes: transcription du signal de polyadénylation reconnu par CPSF et CstF –> clivage. ARN pol continue sa synthèse et exonucléase rattrape.
Comment agit la rifamycine?
Se fixe sur l’une des SU de l’ARN pol et bloque le canal de sortie –> inhibition de l’élongation
Qu’est-ce que l’édition de l’ARN?
Modification de la séquence d’ARN pré-messasger sans affecter la séquence ADN. Mécanisme de régulation génique permettant d’augmenter le nombre de protéines produites à partir des gènes
Types d’édition par modification de bases
- Déamination de cytosine en uridine par APOBEC
- Déamination d’adénine en inosine par ADAR
L’édition est plus fréquente dans les tissus tumoraux
Vrai, mais peut aussi l’être moins, une dérégulation de l’édition mène à des pathologie
Quel fonction a-t’il était découvert pour ADAR?
Rôle oncogénique: lors de son inhibition les cellules meurent par apoptose et ne prolifèrent plus
A quoi servent les snRNA dans la maturation des gènes de type I?
Ce sont des guides pour les modifications
Quelles sont les modifications faites aux gènes de type I?
Chimiques et clivages
- 100 méthylation des 2’OH des sucres des nucléotides
- 100 isomérisations de nucléotides uridine en pseudo-uridine
Quelles sont les modifications faites aux gènes de type III pour arriver au ARNt?
RNase P clive en 5’ et Z en 3’, excision de la séquence intronique pas endonucléase, ajout CCA en 3’ par transférase terminale et modification de certaines bases.
Quel ARN ne subit pas de maturation?
ARN 5S
