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Biomol > C4. ARN > Flashcards

C4. ARN Flashcards

1
Q

En quoi consiste le capping?

A

Modification co-transcriptionnelle : ajout d’une coiffe guanosine méthylée en position N7 sur le premer nucléotide à l’extrémité 5’ –> lien 5’-5’ triphosphate

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Q

Quelles sont les étapes de formation de la coiffe de guanosine?

A
  1. Phosphohydrolase : hydrolyse du phosphate distal du 1er transcrit primaire
    2.Guanyltransférase : catalyse le transfère d’une GMP sur le 1er nucléotide de l’ARNm par une liaison 5’-5’
    3.Méthyltransférase : méthylation de la guanosine en N7
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3
Q

Rôles de la coiffe 7mG?

A
  • Protection –> stabilité ARNm
  • Export de l’ARNm mature vers le cytoplasme (liaison avec CBC reconnu par les pores nucléaires)
  • Initiation de la traduction : recrute la petite SU de 40S
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4
Q

Mécanismes de capping viral

A

1) enzymes virales synthétisent leur propre coiffe
2) utilisation des enzymes cellulaires
3) subtilisation de la coiffe des ARNm cellulaire

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5
Q

La polyadénylation est cotranscriptionnelle

A

faut, post

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6
Q

Rôles de la polyadénylation

A
  • Protection contre la dégradation des nucléases
  • Export des ARNm
  • Stabilité
  • Initiation de la traduction –> liaison à 40S
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7
Q

Etapes de la polyadénylation

A
  • Recrutement des facteurs de polyadénylation
  • Reconnaissance du complexe AAUAAA par CPSF
  • Séquence GU/U reconnue par CstF –> stimule CPSF qui clive 10 à 30 nucléotides avant AAUAAA = libération OH en 3’
  • Recrutement PAP : ajoute les premiers adénosines
  • Liaison de PABII : accélère la polysadénylation
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8
Q

Qu’est-ce que APA?

A

Polyadénylation alternative –> augmente la diversité des transcrits, impact la stabilité et l’efficacité de la traduction
En région 3’UTR –> affecte des sites de liaison de facteurs de régulation.

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9
Q

De quoi est composé de spliceosome ?

A

Complexe enzymatique ribonucléoprotéique composé de 4 ARN et de centaines de protéines

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10
Q

Quels sont les séquences conservées lors de l’épissage?

A
  • site donneur d’épissage
  • Site accepteur d’épissage
  • Point de branchement adénine –> formation de la structure en lasso
  • Séquence riche en pyrimidines
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11
Q

Ribozyme définition

A

Seule macromolécules porteuse d’information génétique et potentiellement dotée d’activité enzymatique –> molécule d’ARN capable de catalyser des réaction biochimique

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12
Q

En quel C le ribose de l’ADN est désoxy?

A

C2

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13
Q

Quels sont les avantages de la thymine et de l’uracile?

A

Thymine: plus résistant aux mutations photochimiques
uracile: moins coûteuse en énergie pour sa production

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14
Q

Que forme une cytosine désaminée ?

A

un uracile

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15
Q

Quels sont les acteurs nécessaires à la transcription ?

A

ARN polymérase ADN-dép + facteurs de transcription
Ribonucléotides triphosphates
Modèle ADN

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16
Q

Qui des ARN pol ou ADN pol font le plus d’erreur ?

A

ARN pol 1/10^4

17
Q

Que fait l’ARN pol I ?

A

précurseur des ARNr 45S (sauf 5S) dans le nucléole + maturation en 5,8S, 18S et 28S

18
Q

Rôles ARN pol II ?

A

pré-ARNm, snRNA, snoRNA, lncRNA dans le nucléoplasme

19
Q

Que fait l’ARN pol III ?

A

ARNt, ARNr 5S et quelques snRNA dans le nucéoplasme

20
Q

Où se situe le promoteur de transcription?

A

entre -35 et -10 (2 séquences consensus héxamérique)

21
Q

Il existe plusieurs promoteurs mais tous étant la même séquence.

A

Faux, les séquences sont différentes

22
Q

Pour l’ARN pol à quoi correspond l’holoenzyme?

A

enzyme coeur + facteur sigma

23
Q

L’ARN pol s’assemble après localisation du promoteur?

A

Faux, elle s’assemble avant

24
Q

Quelles sont les 2 parties du promoteurs?

A

UCE
Core promoter qui chevauche la partie transcrite

25
Q

Quelles est l’ARN pol la plus spécialisée?

A

I (uniquement gènes ribosomiaux)

26
Q

Qu’est-ce que la complexe de préinitiation ?

A

UBF Factor
SL1 Factor avec TBP

27
Q

Les facteurs du promoteur proximal sont…. et ceux du distal sont ….

A

…généraux…spécifiques (enhancer/silencer)

28
Q

Quels sont les facteurs proximaux et leurs rôles?

A

Aide au positionnement de l’ARN pol II
Initie la transcriptio, de ARNm, snRNA,miRNA et lncRNA
3 régions consensus: (pas toutes toujours ensemble)
- TATAbox (-25) : reconnu par TBP associée à TFIID –>positionnement
- CAAT box (-90) : reconnu par CFT ou C/EBPc–< maintien
- séquence GC (-50) : reconnu par Sp1 –> efficacité transcription

29
Q

Terminaison chez les procaryotes et chez les eucaryotes.

A

Procaryotes: paires A-T structure en tige-boucle (épingle à cheveux qui se casse)
Eucaryotes: transcription du signal de polyadénylation reconnu par CPSF et CstF –> clivage. ARN pol continue sa synthèse et exonucléase rattrape.

30
Q

Comment agit la rifamycine?

A

Se fixe sur l’une des SU de l’ARN pol et bloque le canal de sortie –> inhibition de l’élongation

31
Q

Qu’est-ce que l’édition de l’ARN?

A

Modification de la séquence d’ARN pré-messasger sans affecter la séquence ADN. Mécanisme de régulation génique permettant d’augmenter le nombre de protéines produites à partir des gènes

32
Q

Types d’édition par modification de bases

A
  • Déamination de cytosine en uridine par APOBEC
  • Déamination d’adénine en inosine par ADAR
33
Q

L’édition est plus fréquente dans les tissus tumoraux

A

Vrai, mais peut aussi l’être moins, une dérégulation de l’édition mène à des pathologie

34
Q

Quel fonction a-t’il était découvert pour ADAR?

A

Rôle oncogénique: lors de son inhibition les cellules meurent par apoptose et ne prolifèrent plus

35
Q

A quoi servent les snRNA dans la maturation des gènes de type I?

A

Ce sont des guides pour les modifications

36
Q

Quelles sont les modifications faites aux gènes de type I?

A

Chimiques et clivages
- 100 méthylation des 2’OH des sucres des nucléotides
- 100 isomérisations de nucléotides uridine en pseudo-uridine

37
Q

Quelles sont les modifications faites aux gènes de type III pour arriver au ARNt?

A

RNase P clive en 5’ et Z en 3’, excision de la séquence intronique pas endonucléase, ajout CCA en 3’ par transférase terminale et modification de certaines bases.

38
Q

Quel ARN ne subit pas de maturation?

A

ARN 5S

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