C3. Réplication et réparation de l'ADN Flashcards
Pour quelle occasion la réplication de l’ADN a-t-elle lieu?
Afin de préparer à une division cellulaire durant la phase S.
Quelles sont les 6 règles fondamentales de la réplications?
- semi-conservative
- origine de réplication
- synthèse directionnelle (5–>3)
- progresse de manière bidirectionnelle
- synthèse semi-discontinue
- besoin d’une amorce pour être initiée
procaryotes et eucaryotes possèdent un site unique d’initiation de la réplication
faux, eucaryotes ont des sites multiples
Les sites d’initiation de la réplication sont formés de séquences consensus
faux, uniquement chez S. cerevisiae (levure)
Sens de lecture ?
Sens de synthèse ?
Lecture 3–> 5
Synthèse 5–> 3
Quels sont les liens entre le OH du désoxyribose et le 1er groupement phosphate du dNTP entrant ?
Phosphodiester
Lors de la liaisons de 2 nucléotides, il y a …
… libération d’un pyrophosphate et d’énergie, la pyrophosphatase va cliver le pyrophosphate en 2 phosphates
Comment est appelé le brin où la synthèse est continue?
Brin précoce ou avancé
Comment est appelé le brin où la synthèse est discontinue?
brin retardé avec fragments d’Okazaki
Comment se fait la synthèse sur les brins anti-parallèles?
Grâce à la formation d’une boucle
ADN polymérase initie l’amorce pour la réplication
faux, c’est l’ARN polymérase qui initie l’amorce ADN pol incapable
Les facteurs protéiques et enzymatiques impliqués dans la réplication sont appelés…
Le réplisome
Fonction des protéines SSB ?
Liaison à l’ADN simple brin pour le stabiliser et empêché son rappariement et sa dégradation
Etapes de la réplication?
Eucaryotes: préinitiation / initiation / élongation / terminaison
Procaryotes: pareil sans la préinitiation
Chez les proca la séquence d’origine d’initiation est… et est détectée par…
… riche en -T, c’est un motif répété de 9 nucléotides
… par la protéine DnaA
Que comprend le primosome?
Hélicase + ARN pol (=ADN primase)
L’amorce fait une centaine de nucléotides
faux, une dizaine
Le réplisome comprend:
le primosome + polymérase III et protéines SSB
Action de l’ADN pol I
Dégradation de l’amorce et polymérisation
Comment se termine la réplication chez les proca?
A l’opposé d’OriC, présence de 10 séquences ter spécifiques reconnu par la protéine Tus qui bloque l’hélicase DnaB.
Puis séparation des 2 chromosomes par la topoisomérase IV
Qu’est ce que la processivité ?
nombre moyen de nucléotide ajoutés avant la dissociation de la polymérase d e son brin en cours de synthèse
Qu’est ce que la vitesse de polymérisation?
nombre de nucléotide incorporés par seconde
Lors d’un cycle cellulaire, il y a plusieurs réplication du génome.
Faux
La phase G1 du cycle cellulaire a un rôle dans la réplication
Vrai, formation du complexe de pré-initiation
Reconnaissance de l’ARS par le complexe initiatuer ORC
Recrutement du complexe de préinitiation avec cdc6 et cdt1
Recrutement de 2 mcm2-7
Qu’est ce mcm2-7?
Protéines à activité hélicase, l’activité n’a lieu qu’après G1
Rôle des cdk?
activation du complexe de préinitiation
inhibition de la formation de nouveaux complexes de préinitiation
Qui amorce la réplication?
ADN pol alpha + primase
Quelle ADN pol est responsable de quel brin?
Retardé: delta
Continu: epsilon
Qui maintient l’ADN pol a l’ADN?
l’eucaryote PCNA (sliding clamp)
Qu’est-ce que sont les télomères?
extrémités des chromosomes contenant des séquences hexamériques TTAGGG répétés en tandem, ce sont les horloges biologiques de nos cellules
Rôle de la télomérase
Ribonucléo- (TERC, molécule unique d’ARN) protéines (TERT, activité reverse transcriptase) à activité transcriptase inverse afin d’allonger les télomères –> empêche le raccourcissement du brin retardé à chaque cycle de révision
Pathologies liées à un défaut de fonctionnement de la télomérase
- cancers : réparation des télomères et réplication infinie
- dyskératose congénitale
- syndrome de Hoyeraal hreidarsson: associé à des microcéphalies
De quoi dépend la précision de l’ADN polymérase?
1) Liaison H entre bases complémentaires
2) Géométrie des paires de bases
A quoi est due l’anémie faliciforme?
Mutation ponctuelle dans le gène bêta globine provoquant le changement d’un seul aa
Exemples d’altération spontanées?
erreurs de réplication, tautomérisation, oxydation, désamination, dépurination,…
Le remplacement d’une purine par une pyrimidine s’apelle
une transversion
A–>G est une
transition
Quelles sont les types de mutation chromosomiques?
Délétion/insertion, inversion, duplication, translocation
Les dépurinations sont plus fréquentes que les dépyrymidations?
Vrai
Qu’induit la désamination d’un C
Un U
D’où vient l’hypoxanthine? et avec qui s’apparie t’elle?
De la désamination d’une adénine, elle s’apparie avec un C
Que donne la désamination d’une guanine?
La xanthine qui n’induit pas de changement
L’oxydation de la guanine induira lors de la réplication un brin TA
vrai, l’oxoguanine s’apparie avec l’adénine
Qu’est ce qu’un analogue de base?
Ce sont des composés chimiques qui ressemble aux bases azotées normales et sont incorporées lors de la réplication de l’ADN
Les alkylations touchent toutes les bases sauf la thymine
Faux, uniquement la thymine et la guanine (elle touche l’atome O).
La thymine est la seule base non touchée pour les désaminations
Les alkylations sont de mutations spontanées?
Faux, induite par des agents alkylants
Que font les agents intercalants ?
Ils se glissent entre les base ce qui induit une distorsion de l’ADN qui empêche la progression des enzymes
Quelles sont les conséquences des rayonnements UV?
Altération des liens H et création de liaison covalente entre 2 bases = distorsion de la structure
Les radiations ionisantes ont un effet qui peut être inversé
Faux, cassure simple ou double brin non réparable (en tout cas dans le cas de la radiothérapie des cancers)
La réparation directe est un mécanisme de réparation générale.
Faux, c’est un mécanisme associé à des altérations spécifiques
Comment se passe la réparation directe de dimères de pyrimidine induit par l’UV?
Réparation initiée par l’activation de la photolyase par la lumière visible –> se lie au dimère –>rompt les liens covalents
En quoi consiste la réparation par excision de base?
Fonctionne pour une seule base
- Reconnaissance de la lésion (ADN glycosylase)
- Excision de la base modifiée (AP-endonucléase)
- Réparation de la cassure par réplication
Dans la BER qui reconnait la lésion?
Des ADN glycosylase spécialisées
Décrire le mécanisme NER.
Réparation par excision d’un nucléotide en 4 étapes:
- Reconnaissance de la lésion
- Incision et enlèvement du fragment endommagé
- Synthèse d’ADN dans la partie incisée
- Ligation des fragments
Au moins 30 enzymes dans les différentes étapes
Quel est le mécanisme préférentiel pour réparer les lésions causés par les UV?
NER
Le système de mésappariement concerne notamment la réparation des mutations exogènes.
Faux, le plus souvent du à des erreurs de réplications
La réparation des mésappariements (MMR) c’est l’activité exonucléase
Faux, c’est le deuxième système le plus important après l’activité de relecture (exonucléase) pour la correction des mésappariements
Quels sont les mécanismes de réparation des cassures d’ADN double brin? + citer leur caractéristiques
Jonction d’extrémités non homologues:
- mécanisme rapide
- ne nécessite pas de séquence homologues
- par contre, perte de qqe nucléotides si nucléotides endommagés et excisé (potentiellement mutagène)
- en phase G1
Recombinaison homologue:
- mécanisme lent
- utilisation d’une séquence homologue pour une réparation fidèle
Quelles sont les 3 phases de la réparation par recombinaison homologue?
- Présynaptique: reconnaissance du site de cassure , dégradation partielle des extrémités, assemblage du complexe de recombinaison
- Synaptique: échange de brins avec une séquence d’ADN homologue intacte
- Postsynaptique: synthèse d’ADN au site d’échange du brin et résolution intermédiaires d’échange de brins
Quel système de réparation est altéré dans la xeroderma pigmentosum
NER
Qu’est ce que la maladie de Lynch?
Maladie autosomique dominante associée à un risque élevé de développer un cancer colorectal ou de l’endomètre , mutation dans les gène MSH2,3,6 - MLH1 - PMS2 (MMR)
Dans quoi sont impliquées BRCA1/2
Réparation par recombinaison homologue –> augmente le risque de développer un cancer du sein
