C3. Réplication et réparation de l'ADN

Question 1

Pour quelle occasion la réplication de l’ADN a-t-elle lieu?

Answer 1

Afin de préparer à une division cellulaire durant la phase S.

Question 2

Quelles sont les 6 règles fondamentales de la réplications?

Answer 2

• semi-conservative
• origine de réplication
• synthèse directionnelle (5–>3)
• progresse de manière bidirectionnelle
• synthèse semi-discontinue
• besoin d’une amorce pour être initiée

Question 3

procaryotes et eucaryotes possèdent un site unique d’initiation de la réplication

Answer 3

faux, eucaryotes ont des sites multiples

Question 4

Les sites d’initiation de la réplication sont formés de séquences consensus

Answer 4

faux, uniquement chez S. cerevisiae (levure)

Question 5

Sens de lecture ?
Sens de synthèse ?

Answer 5

Lecture 3–> 5
Synthèse 5–> 3

Question 6

Quels sont les liens entre le OH du désoxyribose et le 1er groupement phosphate du dNTP entrant ?

Answer 6

Phosphodiester

Question 7

Lors de la liaisons de 2 nucléotides, il y a …

Answer 7

… libération d’un pyrophosphate et d’énergie, la pyrophosphatase va cliver le pyrophosphate en 2 phosphates

Question 8

Comment est appelé le brin où la synthèse est continue?

Answer 8

Brin précoce ou avancé

Question 9

Comment est appelé le brin où la synthèse est discontinue?

Answer 9

brin retardé avec fragments d’Okazaki

Question 10

Comment se fait la synthèse sur les brins anti-parallèles?

Answer 10

Grâce à la formation d’une boucle

Question 11

ADN polymérase initie l’amorce pour la réplication

Answer 11

faux, c’est l’ARN polymérase qui initie l’amorce ADN pol incapable

Question 12

Les facteurs protéiques et enzymatiques impliqués dans la réplication sont appelés…

Answer 12

Le réplisome

Question 13

Fonction des protéines SSB ?

Answer 13

Liaison à l’ADN simple brin pour le stabiliser et empêché son rappariement et sa dégradation

Question 14

Etapes de la réplication?

Answer 14

Eucaryotes: préinitiation / initiation / élongation / terminaison
Procaryotes: pareil sans la préinitiation

Question 15

Chez les proca la séquence d’origine d’initiation est… et est détectée par…

Answer 15

… riche en -T, c’est un motif répété de 9 nucléotides
… par la protéine DnaA

Question 16

Que comprend le primosome?

Answer 16

Hélicase + ARN pol (=ADN primase)

Question 17

L’amorce fait une centaine de nucléotides

Answer 17

faux, une dizaine

Question 18

Le réplisome comprend:

Answer 18

le primosome + polymérase III et protéines SSB

Question 19

Action de l’ADN pol I

Answer 19

Dégradation de l’amorce et polymérisation

Question 20

Comment se termine la réplication chez les proca?

Answer 20

A l’opposé d’OriC, présence de 10 séquences ter spécifiques reconnu par la protéine Tus qui bloque l’hélicase DnaB.
Puis séparation des 2 chromosomes par la topoisomérase IV

Question 21

Qu’est ce que la processivité ?

Answer 21

nombre moyen de nucléotide ajoutés avant la dissociation de la polymérase d e son brin en cours de synthèse

Question 22

Qu’est ce que la vitesse de polymérisation?

Answer 22

nombre de nucléotide incorporés par seconde

Question 23

Lors d’un cycle cellulaire, il y a plusieurs réplication du génome.

Answer 23

Faux

Question 24

La phase G1 du cycle cellulaire a un rôle dans la réplication

Answer 24

Vrai, formation du complexe de pré-initiation
Reconnaissance de l’ARS par le complexe initiatuer ORC
Recrutement du complexe de préinitiation avec cdc6 et cdt1
Recrutement de 2 mcm2-7

Question 25

Qu’est ce mcm2-7?

Answer 25

Protéines à activité hélicase, l’activité n’a lieu qu’après G1

Question 26

Rôle des cdk?

Answer 26

activation du complexe de préinitiation
inhibition de la formation de nouveaux complexes de préinitiation

Question 27

Qui amorce la réplication?

Answer 27

ADN pol alpha + primase

Question 28

Quelle ADN pol est responsable de quel brin?

Answer 28

Retardé: delta
Continu: epsilon

Question 29

Qui maintient l’ADN pol a l’ADN?

Answer 29

l’eucaryote PCNA (sliding clamp)

Question 30

Qu’est-ce que sont les télomères?

Answer 30

extrémités des chromosomes contenant des séquences hexamériques TTAGGG répétés en tandem, ce sont les horloges biologiques de nos cellules

Question 31

Rôle de la télomérase

Answer 31

Ribonucléo- (TERC, molécule unique d’ARN) protéines (TERT, activité reverse transcriptase) à activité transcriptase inverse afin d’allonger les télomères –> empêche le raccourcissement du brin retardé à chaque cycle de révision

Question 32

Pathologies liées à un défaut de fonctionnement de la télomérase

Answer 32

• cancers : réparation des télomères et réplication infinie
• dyskératose congénitale
• syndrome de Hoyeraal hreidarsson: associé à des microcéphalies

Question 33

De quoi dépend la précision de l’ADN polymérase?

Answer 33

1) Liaison H entre bases complémentaires
2) Géométrie des paires de bases

Question 34

A quoi est due l’anémie faliciforme?

Answer 34

Mutation ponctuelle dans le gène bêta globine provoquant le changement d’un seul aa

Question 35

Exemples d’altération spontanées?

Answer 35

erreurs de réplication, tautomérisation, oxydation, désamination, dépurination,…

Question 36

Le remplacement d’une purine par une pyrimidine s’apelle

Answer 36

une transversion

Question 37

A–>G est une

Answer 37

transition

Question 38

Quelles sont les types de mutation chromosomiques?

Answer 38

Délétion/insertion, inversion, duplication, translocation

Question 39

Les dépurinations sont plus fréquentes que les dépyrymidations?

Answer 39

Vrai

Question 40

Qu’induit la désamination d’un C

Answer 40

Un U

Question 41

D’où vient l’hypoxanthine? et avec qui s’apparie t’elle?

Answer 41

De la désamination d’une adénine, elle s’apparie avec un C

Question 42

Que donne la désamination d’une guanine?

Answer 42

La xanthine qui n’induit pas de changement

Question 43

L’oxydation de la guanine induira lors de la réplication un brin TA

Answer 43

vrai, l’oxoguanine s’apparie avec l’adénine

Question 44

Qu’est ce qu’un analogue de base?

Answer 44

Ce sont des composés chimiques qui ressemble aux bases azotées normales et sont incorporées lors de la réplication de l’ADN

Question 45

Les alkylations touchent toutes les bases sauf la thymine

Answer 45

Faux, uniquement la thymine et la guanine (elle touche l’atome O).
La thymine est la seule base non touchée pour les désaminations

Question 46

Les alkylations sont de mutations spontanées?

Answer 46

Faux, induite par des agents alkylants

Question 47

Que font les agents intercalants ?

Answer 47

Ils se glissent entre les base ce qui induit une distorsion de l’ADN qui empêche la progression des enzymes

Question 48

Quelles sont les conséquences des rayonnements UV?

Answer 48

Altération des liens H et création de liaison covalente entre 2 bases = distorsion de la structure

Question 49

Les radiations ionisantes ont un effet qui peut être inversé

Answer 49

Faux, cassure simple ou double brin non réparable (en tout cas dans le cas de la radiothérapie des cancers)

Question 50

La réparation directe est un mécanisme de réparation générale.

Answer 50

Faux, c’est un mécanisme associé à des altérations spécifiques

Question 51

Comment se passe la réparation directe de dimères de pyrimidine induit par l’UV?

Answer 51

Réparation initiée par l’activation de la photolyase par la lumière visible –> se lie au dimère –>rompt les liens covalents

Question 52

En quoi consiste la réparation par excision de base?

Answer 52

Fonctionne pour une seule base
- Reconnaissance de la lésion (ADN glycosylase)
- Excision de la base modifiée (AP-endonucléase)
- Réparation de la cassure par réplication

Question 53

Dans la BER qui reconnait la lésion?

Answer 53

Des ADN glycosylase spécialisées

Question 54

Décrire le mécanisme NER.

Answer 54

Réparation par excision d’un nucléotide en 4 étapes:
- Reconnaissance de la lésion
- Incision et enlèvement du fragment endommagé
- Synthèse d’ADN dans la partie incisée
- Ligation des fragments
Au moins 30 enzymes dans les différentes étapes

Question 55

Quel est le mécanisme préférentiel pour réparer les lésions causés par les UV?

Answer 55

NER

Question 56

Le système de mésappariement concerne notamment la réparation des mutations exogènes.

Answer 56

Faux, le plus souvent du à des erreurs de réplications

Question 57

La réparation des mésappariements (MMR) c’est l’activité exonucléase

Answer 57

Faux, c’est le deuxième système le plus important après l’activité de relecture (exonucléase) pour la correction des mésappariements

Question 58

Quels sont les mécanismes de réparation des cassures d’ADN double brin? + citer leur caractéristiques

Answer 58

Jonction d’extrémités non homologues:
- mécanisme rapide
- ne nécessite pas de séquence homologues
- par contre, perte de qqe nucléotides si nucléotides endommagés et excisé (potentiellement mutagène)
- en phase G1
Recombinaison homologue:
- mécanisme lent
- utilisation d’une séquence homologue pour une réparation fidèle

Question 59

Quelles sont les 3 phases de la réparation par recombinaison homologue?

Answer 59

• Présynaptique: reconnaissance du site de cassure , dégradation partielle des extrémités, assemblage du complexe de recombinaison
• Synaptique: échange de brins avec une séquence d’ADN homologue intacte
• Postsynaptique: synthèse d’ADN au site d’échange du brin et résolution intermédiaires d’échange de brins

Question 60

Quel système de réparation est altéré dans la xeroderma pigmentosum

Answer 60

NER

Question 61

Qu’est ce que la maladie de Lynch?

Answer 61

Maladie autosomique dominante associée à un risque élevé de développer un cancer colorectal ou de l’endomètre , mutation dans les gène MSH2,3,6 - MLH1 - PMS2 (MMR)

Question 62

Dans quoi sont impliquées BRCA1/2

Answer 62

Réparation par recombinaison homologue –> augmente le risque de développer un cancer du sein