BM7 Flashcards
Quels sont les deux principales sources d’erreurs lors de la réplication?
1- Le manque de fidelité lors de la réplication
2-Lésions de la double hélice
Quels sont les conséquences des erreurs et des lésions?
1-Les séquences d’ADN sont en évolution permanente
2-Modification de l’ADN (inhibition des machinerie de transcription et de réplication)
Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de transcription est altérée?
Incidence immédiate sur la cellule
Qu’est-ce qui arrive si la machinerie de RÉPLICATION est altérée?
Incidence sur les cellules filles
Afin d’éviter les conséquences négatives des mutation, que dois faire la cellule?
1-Examiner le génome
2-Restaurer la molécule originale avec fidélité
Nommer les erreurs de réplication:
1-Substitution
2-Insertion/délétion
Nommer les processus d’altération de l’ADN
1-hydrolyse
2-Alkylation, oxydation, radiation
3-Molécule analogue
4-Agent intercallant
Qu’est-ce que la substitution?
Changement d’une base pour une autre.
Quel est l’erreur de réplication la plus commune?
La substitution
Qu’est-ce que la transition?
substituer A pour T ou C pour G (vice-versa)
Qu’est ce que la transversion?
Substituer purine pour purimidine ou vice versa
Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?
Mutation d’un seul nucléotide.
Qu’entraîne une délétion?
Décalage du cadre de lecture des codon. Cela aura une incidence sur la protéine finale.
Qu’entraine l’insertion?
La même chose que la délétion
Quels gène évoluent le plus vite? (microsatellite ou séquences codante)
Les microsatellites (10^-5 vs 10^-8)
Quel facteur influence la taux de mutation?
1-Les contrainte sélective des gènes
2-Leur facilité à être répliqué fidèlement
Qu’arrive-t-il si une erreur n’est pas réparer avec le prochain cycle de réplication?
Elle devient permanente
Que comprend le système de réparation MutS?
1 Dimère qui reconnais les distorsion dans l’ADN.
Comment MutS répare l’ADN?
1- MutS s’installe sur l’ADN distordue
2- Charge 2ATP = change de conformation (change aussi la conformation de la double hélice)
3- Hydrolyse un ATP pour recruter MutL
3-MutL active MutH
4-MutH fait une césure (insise le brin avec le méchant nucléotide)
5-Une hélicase (UvrD) sépare les deux brin de l’insision a MutS
6-Une exonucléase 5’-3’ digère
7-L’hydrolyse du 2ieme ATP permet probablement a MutS de se décrocher
8-ADN pol III synthetise le brin et ligase attache le 3’
Pourquoi MutS est-il capable de courber l’ADN ?
Car le mésapariment rend l’ADN plus flexible
Ou MutH effectue t-elle la césure?
à partir des séquences GATC non-méthylés
GATC revient tous les x paire de base
x=256
Qu’est-ce qui méthyle les adénine?
Les méthylase DAM
Vrai ou faux. La MutH fait seulement des incision en amont de MutS.
Faux.
Quels les deux endonucléase qui digère l’ADN incisé dépendamment de l’orientation de la césure?
Exonuclase VII si 5-3
Exonucléase I si 3-5
Qu’est-ce qui sert à marquer le brin néoformé sur l’ADN eucaryote?
Les pont phosphodiester manquant entre chaque fragment d’Okazaki
Qu’est-ce que l’hydrolyse ?
Dégradation spontanée de l’ADN par hydrolyse
Donner un exemple d’hydrolyse?
La désamination: C -> U, A-> hypoxantine(s’apparie avec C), G -> Xantine (s’apparie avec C mais avec 2 liaison W-C)
Dépurination
POurquoi l’ADN n’a pas d’uracile?
Parce qu’un U provenant de la désamination d’un C serait difficile a détecter.
Qu’est ce que la dépurination?
Hydrolyse de la liaison glycosidique= ntp sans base ( plus rare). Cela donne des base artificielle
Quelle est la seule dépurination qui résulte en une base naturelle?
La désamination du 5-méthyl-cytosine = tyrosine
Qu’est-ce que l’alkylation?
Des groupement éthyl ou méthyl sont transféré au site réactif des bases. G s’apparie avec T
Qu’est-ce que l’oxydation?
Les radiation ionisante et des agents chimiques favorise l’attaque par des radicaux libres qu’elles génères. G peut s’apparier aussi bien avec C qu’avec A
Qu’est-ce la radiation?
Rayon UV absorbé par les bases, = dimère de thymine qui empêche les liaisons W-C.
Nommer deux technique utiliser en chimiothérapie et en radiothérapie?
Radiation ionisante , bléomycine
Qu’entraîne les rayons X et les rayons gamma?
Des cassures double brin
Que se passe-t-il lorsqu’on rencontre une molécule analogue aux bases?
Ils sont incorporé lors de la réplication mais s’apparient mal
Qu’est-ce qu’un agent intercallant?
Une molécule plane qui s’Insère dans l’ADN. Elle peut causer une insertion si la polymérase y apparie un nucléotide ou une délétion si la polymérase glisse dessus
Les dégradation de l’ADN peuvent être classé en deux type. Nommez les.
1- obstacle à la réplication (ex. dimère de T ou cassure double brin)
2-Altération de la séquence d’ADN (tout ce qui change bases)
Quels sont les 4 type de réparation de l’ADN?
1-Enzyme inversant le processus
2-réparation par excision
3- réparation par recombinaison
4-polymérase trans-lésion
Pourquoi les mécanisme de réparation doivent-il opéré avant la réplication?
Car apres la réplication, on perd l’erreur.
Comment briser un dimère de T?
Avec la photolyase, elle utilise l’energie lumineuse pour briser le l’anneaux cyclobutane
Comment peut-on enlever un méthyle de G?
La méthyltransférase le met sur son résidu cystéine (elle devient inutilisable = très couteux pour la c)
Comment se fait l’excision des bases?
1-La glycosylase longe le sillon mineur a la recherche d’une distorsion dans la double hélice
2-la basse fautive est appé par la glycosylase
3- le lien glycosidique est est hydrolysé
4-le sucre sans base est retiré par une rx endonucléotique.
Comment peut-on réparer l’ADN même après la réplication?
La glycosylase de sécurité retire le A apparié à l’oxoG et le remplace par C
Comment se fait l’excision des nucléotides?
1) UvrA-UvrB BALAIE L’ADN
POUR IDENTIFIER UNE
UNE DÉFORMATION
2) UvrA QUITTE LE COMPLEXE UvrA-UvrB ET UvrB OUVRE LOCALEMENT LA DOUBLE HÉLICE AUTOUR DE LA DÉFORMATION.
3) UvrB RECRUTE 2X UvrC
POUR FORMER UN COMPLEXE
UvrC-UvrB-UvrC
4) LES 2 UvrC EXCISENT UN
12-13 MÈRE COMPRENANT
LE NUCLÉOTIDE CAUSANT
LE MÉSAPARIEMENT
5) L’HÉLICASE UvrD EST ALORS
RECRUTÉE POUR RETIRER
LES 2 UvrC,
6) L’ADN POL I REMPLACE LE BRIN EXCISÉ ET LA LIGASE SYNTHÉTISE LE DERNIER PONT PHOSPHODIESTER APRÈS LE DERNIER NUCLÉOTIDE AJOUTÉ PAR L’ADN POL I .
Chez l’humain, quel système est analogue à Uvr?
XPC-XPA-XPD
Qu’a de particulier la réparation chez l,humain?
La réparation est couplé à la transcription
Qu’est-ce que la synthèse de translésion?
ADN pol (UmuC et UmuD) qui polymérise l’ajout de nucléotide en face du site endommagé sans se soucier de l’ordre
Qu’est-ce qu’un polymérase Y spécifique?
Un polymérase qui ajoute deux A lorsqu’elle rencontre un dimère de thymine.
Qu’entraîne une cassure double brin pour la cellule?
Elle empeche la réplication et entraine la mort de la cellule
Comment peut-on réparer un ADN cassé avant la réplication
Avec le système JENH
Comment fonctionne JENH?
1-Ku70/80 stabilise les extrémité de l’ADN
2-Ku70/80 recrute AND-PK qui recrute artémis
3-Le complexe apparie les nucleotides simple brin et enleve les orphelins
