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Biologie moléculaire > BM1 > Flashcards

BM1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui compose le squellette externe de l’ADN?

A

Des résidus sucre-phosphate

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Q

De quoi se compose un 2-désoxyribonucléotide?

A

D’une base, d’un désoxyribose et d’un phosphate.

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3
Q

Quelle liaison relie la base au sucre dans le nucléotide?

A

Une liaison glucosidique

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4
Q

Qu’est-ce qu’un nucléoside?

A

La base et le désoxyribose

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5
Q

Combien de cycle ont les pyrimidine?

A

Un cycle

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6
Q

Combien de cycle ont les purine?

A

Deux cycles

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7
Q

Qu’est-ce qu’un 2-desoxyribonucleoside-5-phosphate?

A

Un nucléotide

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8
Q

Késsé ça?!

A

Cytosine

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9
Q

Késsé ça?

A

Adénine

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10
Q

Késsé ça?

A

Guanine

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11
Q

Késsé ça?

A

La thymine

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12
Q

Est-ce que les bases aiment l’eau? Pourquoi?

A

Non elles sont hydrophobe à cause du groupement amine.

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13
Q

Comment les nucléotides sont-ils reliés entre-eux?

A

Grâce à une liaison phosphodiester.

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14
Q

Comment se forme la liaison phosphodiester qui relie les nucléotides entre-eux?

A

L’hydroxyle en en C3 du desoxyribose fait une attaque nucléophile sur le phosphate en C5 du nucléotide triphosphate. L’énergie est fournie par la libération du pyrophosphate.

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15
Q

Qu’est-ce qu’un attaque nucléophile?

A

LE DOUBLET LIBRE DU RÉACTIF NUCLÉOPHILE (O- ) CHERCHE À ENGAGER UNE LIAISON COVALENTE AVEC L’ATOME ÉLECTROPHILE ATTAQUÉ (P).

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16
Q

Qu’est-ce que la liaison Watson-Crickl?

A

C’est une laison faible produite entre des atomes ayant des polarité complémentaires au sein de leur base respective.

17
Q

Quelles parties des bases A et T font des liason Watson-Crick ensemble?

A

1 ENTRE RADICAUX CARBONYLE (C=O)- ET AMINE (-NH2)+

1 ENTRE UN AZOTE (N)- ET UN RADICAL AMINE (N-H)+.

18
Q

Quelles parties des bases G et C font des liason Watson-Crick ensemble?

A

2 ENTRE RADICAUX CARBONYLE (C=O)- ET AMINE (-NH2)+ LIAISONS WC

: 1 ENTRE UN AZOTE (N)- ET UN RADICAL AMINE (N-H)+.

19
Q

Énoncez les règles de Chargaff:

A
  1. Molécule double brin : n ADÉNINES = n THYMINES n ’ CYTOSINES = n ’ GUANINES (1) 2. Molécule simple brin : n ADÉNINES ~ n THYMINES n ’ CYTOSINES ~ n ’ GUANINES
  2. La liaison CYTOSINE-GUANINE est PLUS ROBUSTE que La liaison THYMINE-ADÉNINE.
  3. C’EST LA COMPLÉMENTARITÉ DES BASES QUI PERMET LA COMPLÉMENTARITÉ DES CHAINES NUCLÉOTIDIQUES.
20
Q

Sur l’ADN, combien y a-t-il de pb par tour?

A

10

21
Q

De combien est le pas de l’hélica d’ADN?

A

3.4nm

22
Q

Combien y a-t-il de distance entre les paires de bases de l’hélica d’ADN?

A

0.34nm (DAH! Crissement logique etant donné que le pas est de 34 et qu’il y a 10pb par tour….)

23
Q

Quelle est le diamètre de la double hélice et pourquoi est-il toujours constant?

A

2nm, parce que les différentes liaisons Watson-Crick des bases sont toutes de la même longueur.

24
Q

Pourquoin observe-t-on un sillon majeur et un sillon mineur sur l’ADN?

A

Car l’angle formée par la liaison glycosidique est de 120 dans l’angle aigue (=sillon mineur) et 240 dans l’angle complémentaire (=sillon majeur)

25
Q

Que permet le sillon majeur et pourquoi?

A

La reconnaissance spécifique des séquences d’ADN, car ces dernières présentent des codes d’affinité spécifique et différents selon quelle base est lié à laquelle.

Cela permet une économie d’énergie puisqu’il n’est pas nécessaire de brises les liaisons hydrogène.

26
Q

Comment peut-on dénaturer la double hélice d’ADN?

A

Avec un température supérieure à 90C

Avec un pH supérieur à 7

Avec une diminution de la concentration des ions Ca+

27
Q

Comment peut-on suivre le processus de dénaturation de la double hélice?

A

Grâce à un spectrophotomètre. La double hélice absorbe les UV (260nm), mais le simple brins absorbe deux fois plus les UV que la double.

28
Q

Comment sont enroulée l’ADN bactérien et eucaryote? (Quelle sens)

A

Négativement

29
Q

Comment peuvent servir les supertours lors de la réplication ou de la transcription de l’ADN?

A

Les supertours servent à conserver de l’énergie libre et facilite la séparation des deux brins grâce au torsion négative.

30
Q

Que font les topoisomérase?

A

Elles enlève des supertours

31
Q

Que fait la topoisomérase de type 1?

A
  1. Le résidu tyrosine de l’enzyme attaque le phophaste libre de la chaine d’ADN. Cela crée une liaison covalente
  2. Cette nouvelle liaison phosphotyrosine concerve l’énergie de l’ancienne liason phosphodiester qui a été coupé (=réserve d’E libre). Cette coupure libère une extrémité OH dans la chaîne de l’ADN
  3. L’enzyme change de conformation ce qui permet le passage du brin non coupé
  4. Le brin coupé est recollé grâce à l’attaque nucléophile de l’extrémité OH sur le lien phosphotyrosine. Le lien phosphodiester est ainsi reformé.

Elle n’a pas besoin d’ATP, cette Rx est réversible

32
Q

Que fait la topoisomérase de type II?

A
  1. Elle s’ouvre pour acceuillir un premier fragment d’ADN double brin, puis un autre
  2. elle accroche 2 molécules d’ATP
  3. Elle coupe le premier fragment
  4. Elle utilise l’ATP pour changer de conformation et laisser passer le deuxieme fragment
  5. Elle recolle le premier fragment et relache les deux fragment.
33
Q

Quelle est la principale différence entre l’ADN et l’ARN?

A

THE D. 8===­D

Il manque un OH au sucre de l’ADN

34
Q

POurquoi l’ARN est-elle moins stable que l’ADN?

A

à cause du deuxième OH très réactif

LORSQU’UNE BASE VIENT ARRACHER LE PROTON DU 2’-OH. L’OXYGÈNE ATTAQUE LE PHOSPHATE (ATTAQUE NUCLÉOPHILE), ENTRAÎNANT LA CYCLISATION DU NUCLÉOTIDE

35
Q

Qu’est-ce qu’une 5-méthyl-uracile?

A

Une thymine

36
Q

Quelles forment peut prendre l’ADN?

A

MONO OU BI CATÉNAIRE (III) ; LINÉAIRE OU CIRCULAIRE

37
Q

Qu’entraîne les liaison Watson-Crick dans les brin d’ARN monocaténaires?

A

L’ARN FORME DES STRUCTURES TRIDIMENTIONNELLES PARTICULIÈRES, EN SE REPLIANT SUR LUI-MÊME :

38
Q

Qu’est-ce quu’un ribozyme?

A

Un ARN ayant une activité catalytique semblable aux protéines.

39
Q
A

Biologie moléculaire (8 decks)

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