BM5 Flashcards
Quel est l’erreur la plus fréquente lors de l’appariement des bases?
L’incorporation de la mauvaise forme tautomérique de la base en question.
Dans quels sens se fait la réparation de l’ADN par la polymérase?
3’-5’ (c’est une 3’-exonucléase)
Lors de l’incorporation d’un mauvais nucléotide dans la chaîne d’ADN, pourquoi la synthèse de ce dernier stoppe-t-il?
Car cela change l’orientation du OH, inhibe les interraction avec la paume. = défavorise l’ajout d’un autre nucléotide.
Comment se passe l’excision d’un nucléotide mésaparié?
- Les ponts hydogènes sont rompus
- Les 3-4 dernier nucléotides ajouté se retrouvent simple brin
- L’ADN s’imple brin a plus d’affinité avec le site exonucléase que catalitique.
Qu’est-ce qu’un fragment d’Okazaki?
État transitoire des fragments d’ADN avant qu’ils soient reliées ensemble.
Qu’est-ce que la primase?
Une polymérase à ARN qui synthétise des amorces
Qu’est-ce qu’un site d’amorçage?
Des triplet particuliers de nucléotides surreprésenté dans le génome.
À quoi sert l’hélicase?
Elle sépare les brins parentaux
Que permettent les interactions entre l’hélicase et la primase?
Cela augmente considérablement l’efficacité de la primase. Cela permet aussi de réguler la longueur des fragments d’okasaki.
Comment peut-on retirer les amorces d’ARN lorsque le brin d’ADN est formé?
Grâce à la Rnase H qui reconnais les amorce et retire l’ARN apparié à de l’ADN (il laisse le dernier ribonucléotide). Puis à une 5’-exonucléase qui le retire.
Comment peut-on combler les troues laisser par les amorces?
Grâce à l’ADN pol puis a la ligase qui forme le dernier lien
Vrai ou faux. L’hélicase sépare l’ADN de 5’ vers 3’
Faux, elle sépare l’ADN peut importe le sens, peu importe le brin.
Quel est le diamètre de l’hélicase?
13A, donc plus grande que l’ADN monocaténaire mais plus petit que l’ADN bicaténaire.
Comment se lient les molécules SSB à l’ADN?
Elles se lient à l’exosquelette phosphate grâce à des interactions électrostatique et d’empilement hydrophobe.
Qu’est-ce que la Pol α / PRIMASE?
Chez l’humain, synthèse d’amorce ARN puis synthèse de l’ADN.
Qu’est-ce que la Pol δ?
Chez l’humain, synthèse du brin tardif.
Qu’est-ce que la Pol ε?
Chez l’humain, synthèse du brin précoce.
Qu’est-ce que Pol I?
Chez la bactérie, retrait d l’ARN (même le dernier ribonucléotide) (5’-exonucléase) et remplacement par l’ADN
Qu’est-ce que Pol III?
Chez la bactérie, réplication. (3’-exonucléase)
Où se place la pince coulissante? (PCNA) Comment?
Autour du complexe matrice-ADN
Le complexe gamma ouvre la pince grâce à l’hydrolyse de l’ATP, la place.
Chez E. Coli, de quoi est composé l’holoenzyme Pol III?
2 coeur d’ADN pol III et du complexe gamma
Comment est synthétiser le brin précoce?
Dès la séparation des deux brins, il est pris en charge par l’ADN Pol III qui synthétise un brin continue.
Comment est synthétiser le brin tardif?
L’ADN est débobiner et pris en charge par les SSB, La primase synthétise des amorces.
Celle-ci est reconnue par le compelxe gamma qui appose la pince coulissante. La pince recrute la pol. Synthétise le brin jsuqu’à l’amorce précédente. Pol III se décroche quand elle a fini. Même chose pour la pince coulissante.
Quelles est l’importance de l’intéraction hélicase-holoenzyme Pol III?
Cela augmente la vitesse de l’hélicase de 10X.