BM3 Flashcards
Comment se forme la fibre de 30nm?
Une histone H1 (+) interagit avec l’ADN de liaison (-) (20pb) pour resserrer les nucléosome adjacent entre-eux. Les queue-N terminales stabilisent aussi les brins d’ADN en interragissant soit entre les 147pb du nucleosome, l’ADN de liaison ou avec les queues d’autre nucleosome.
Ou s’ancre H1?
-AU MILIEU DES 147 pb ASSOCIÉES
AU NUCLÉOSOME (AXE DE LA DYADE).
- ADN INTERNUCLÉOSOMIQUE À UNE
EXTRÈMITÉ DU NUCLÉOSOME
Quelles sont les caractéristiques de la fibre de 30nm?
- 6 nucleosome/tour
- 11nm de diamètre (diamètre d’un nucleosome)
- L’ADN de liaison est à l’intérieur de la fibre
- La surface des octamères se font face.
Que permettent les liaisons H (faible) entre les protéines d’histone et l’ADN?
Elle permettent une structure dynamique de la chromatine et ainsi permettre l’accès transitoire aux séquences d’ADN lorsqu’on en a besoin.
Qu’est-ce que les complexe de remodelage des nucléosome (SWI/SNF et ISWI)?
Ce sont des complexe protéiques qui contiennent une sous-unité capable d’hydrolyser l’ATP. Elles font la translocation de l’octamère d’histone sur l’ADN.
De quoi est composé le complexe de remodelage?
1- d’une pince de positionnement
2- du domaine ATPase
3-D’une pince de torsion
Comment se fait le remodelage du nucléosome?
1- L’ADN de liaison est tirer par la pince (grâce a E ATP)
2-Cela rompt les 5 sites de liaison en partant de la pince jusqu’à l’ADN de liaison.
3- Les liaisons se reforme mais cela forme un pli.
4-On recommence jusqu’à ce que le pli soit transmit par vague et que le nucléosome ait changé de position sur l’ADN.
Comment peut-on laisser des séquence d’ADN toujours disponible à la transcription?
Si des protéines de liaisons s’installent sur une portion d’ADN inférieur à 150pb, il n’y aura pas de nucléosome dans cette section .
Comment un nucléosome peut-il avoir une position spécifique?
En étant guidé par une protéine de liaison.
Le code des histone sont des modification _______
post-traductionnelle
Les lysines d’une queue N-terminale d’une histone peuvent être:
méthylée au acétylée.
Les sérines d’une queue N-terminale d’une histone peuvent être:
phosphorylées.
Comment peut-on qualifier le code des histone?
Site et histone spécifique
Comment peut-on méthyler une lysine qui a été acétylée?
En la désacétylant avec une désacétylase (HDA). Les modifications sont graduelles.
Comment se produit l’acétylation de la lysine de l’histone?
1- Le carboxyle de l’enzyme HAT attaque l’amine protonné de la lysine. Ce dernier devient très électronégatif.
2- Attaque nucléohpile du groupement amine de la lysine sur le carbonyle de l’acétyl-Coa
Quel est le résultats de l’acétylation de la lysine?
Elle perd sa charge + et perd du même coup son affinité pour le squelette sucre-phosphate de l’ADN
Autre que la modification des affinités avec l’ADN, a quoi peut servir l’acétylaton ou la méthylation de l’ADN?
Elles crée des site de liaison pour les molécules non-enzymatique de modification de la chromatine.
Avec quoi réagit le bromodomaine et quel en est le résultats?
Avec les queues N-terminale acétylées
Activation
Avec quoi réagit le chromodomaine et quel en est le résultats?
Avec les queues N-terminale méthylées
Répression
Quand àlieu l’assemblage des nucléosome?
Immédiatement après la réplication de l’ADN
Quand sont synthétiser les octamère d’histone manquant au nouveau brin d’AND répliqué?
Avant G1
Qu’advient-il si les octamères d’histone ne sont pas créer lors de la réplication de l’ADN?
- Les chromosomes ne sont plus capable de se compacter
- On obtient deux jeu de chromosome différents
Qu’arrive-t-il aux nucléosome à mesure que la fourche de réplication avance?
Ils sont clivées en tétramères H3-H4 et dimère H2A-H2B.
Nommez les chaperons d’histone.
CAF-1: se lie a H3-H4
NAP-1: se lie a H2A-H2B
Comment les chaperons se lient-ils aux histones?
Elle sont chargé négativement se lient ainsi aux histones chargées positivement
Lors de la réplication de l’ADN, est-ce que les anciennes histones se lient au protéines chaperonne?
Non, les protéines chaperonnes ne sont utiles qu’aux tétramères d’histone nouvellement formés.
Que fait CAF-1?
Elle dépose les tétramères H3-H4 sur l’ADN.
Elle opère à la fourche de réplication en se liant avec PCNA
Qu’ont de particulier les 2 motif de liaison à PCNA PIP1 et PIP2?
Elles sont bien concervées chez tous les eucaryote.
À quoi sert NAP-1?
- Elle empêche l’incorporation des deux dimères H2A-H2B
- Navette nucléo-cytoplasmique
De quoi est constituée la protéine NAP-1?
- domaine NAP très conservé et chargé négativement, qui se lie à l’histone
- queue N-terminale à séquence variable
- queue C-terminale très acide (chargée négativement), améliore l’affinité de NAP pour l’histone.
