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BIOQUI PARCIAL NO.3 > BIOSÍNTESIS DE AA > Flashcards

BIOSÍNTESIS DE AA Flashcards

1
Q

¿cuánto % de N2 representa la atmósfera?

A

80%

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2
Q

en seres humanos el N2 es:

A

inerte

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3
Q

bacterias con capacidad de fijar el N2 atmosférico:

A

bacterias simbióticas de los nódulos de las raíces de leguminosas

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4
Q

¿qué es el ciclo de nitrógeno?

A

procesos metabólicos de algunas especies permiten recuperar y re utilizar el N2 disponible biológicamente

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5
Q

tres fases del ciclo de nitrógeno:

A
  1. fijación de N2 atmosférico por bacterias para formar NH3 o NH4 (este se utiliza para sintesis de AA en plantas/microorganismos, y así los animales obtienen AA)
  2. nitrificación: oxidación del amoniaco a nitritito y después a nitrato por reductasas
  3. desnitrificación: bacterias convierten nitrato a N2 sin O2 para mantener el equilibrio del N2 fijado y atmosférico
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6
Q

¿qué pasa cuando los organismos mueren?

A

las bacterias degradan proteínas y liberan amoniaco al suelo, las bacterias nitrificantes lo convierten en nitrato/nitrito

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7
Q

aceptor final de é en CTE para las bacterias del suelo:

A

NO3-, al usarlo, devuelven N2 molecular a la atmósfera

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8
Q

rxn de producción de amoniaco es:

A

exergónica, espontánea e irreversible

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9
Q

condiciones de producción de amoniaco industrial y fijación biológica de N2:

A
  • extremas, 400-500 grados
  • biológicas, presión de 0.8 atm
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10
Q

¿qué es el complejo de nitrogenasas y cuales son sus componentes?

A

sirven para fijación de N2, es inestable en O2 y consta de:

dinitrogenasa reductasa: único centro redox de tipo 4Fe-4S y 2 sitio de unión de ATP/ADP
dinitrogenasa: hierro y molibdeno, centro redox con 2MO, 32 Fe y 30S

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11
Q

papel de glutamato y glutamina en síntesis de AA:

A

son críticos para la entrada..

glutamato: fuente de grupos amino de la mayor parte de los aa (rxns de transaminación).

glutamina: el N2 del grupo amida de la glutamina es fuente de grupos amino para muchos procesos
biosintéticos

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12
Q

síntesis de glutamina:

A

por glutamina sintetasa, cataliza rxn de glutamato y NH4+ +ATP… sirve para transportar amoniaco en sangre

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13
Q

síntesis de glutamato en plantas:

A

por glutamato sintasa, con alfa cetoglutarato y glutamina (NADPH)

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14
Q

síntesis de glutamato en mamíferos:

A

transaminación con alfa cetoglutarato, o por glutamato deshidrogenasa a partir de alfa cetoglutarato y NH4+ NADPH (vía minoritatia)

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15
Q

la síntesis de glutamato y glutamina son:

A

rutas biosintéticas sencillas (casi todos los pasos presentes en la mayoría de los organismos)

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16
Q

dos maneras de regulación de la glutamina sintetasa:

A

por retroinhibición acumulativa por los 8 productos finales del metabolismo de glutamina

alanina y glicina son inhibidores alostéricos, y son indicadores del estado general de metabolismo de aa

nucleótido de citosina inhibe

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17
Q

generalmente, como se forman los AA?

A

por intermediarios de glicólisis, CAC y ruta PPP, junto a N2 de glutamina y glutamato

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18
Q

capacidad de sintetizar 20 AA en mamíferos y plantas/bacterias:

A

solo la mitad… todos los 20

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19
Q

ruta más compleja de AA:

A

aromáticos

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20
Q

AA esenciales:

A

valina, leucina, isoleucina, triptófano, fenilalanina, histidina, metionina, treonina, lisina

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21
Q

familias precursoras de aminoácidos:

A

alfa cetoglutarato, piruvato, 3-fosfoglicerato, PEP + eritrosa 4 fosfato, ribosa 5 fosfato, y oxalacetato

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22
Q

intermediario en las vías de síntesis de AA y nucleótidos: ¿cómo se sintetiza? ¿la enzima cómo se regula?

A

PRPP (5-fosforribosil-1-pirofosfato)… por ribosa fosfato pirofosfoquinasa a partir de 5-ribosa-fosfato y ATP

se regula alostéricamente por biomoléculas formadas a partir de PRPP

23
Q

¿en quiénes se dan la mayoría de rutas sintéticas de AA? ¿por qué?

A

bacterias, porque son metabólicamente más sencillas

24
Q

AA sintetizados a partir de alfa-cetoglutarato:

A

glutamato — glutamina, prolina, arginina

25
Q

síntesis de prolina en bacterias y mamíferos:

A

derivado cíclico de glutamato

  • ATP para formación de acil fosfato
  • acil fosfato se reduce por NADPH o NADH a glutamato y semialdehído
  • semialdehído se cicla rápido y se vuelve a reducir a prolina
  • en mamíferos puede sintetizarse también a partir de arginina obtenida de la dieta o de la proteína tisular
26
Q

síntesis de arginina en bacterias

A

sintesís de novo de ortinina, y por lo tanto, arginina

27
Q

¿cómo se podría sintetizar la ornitina en bacterias, pero por qué no?

A

a partir de glutamato y semialdehído por transaminación; pero ciclación del semialdehído en prolina impide suficiente intermediario para sintetizar ornitina

28
Q

¿cómo sintetizan los animales la arginina, ornitina y prolina?

A

por ciclo de urea..

cuando hay insuficiente arginina, se forma ornitina por ornitina aminotransferasa, al igual que la prolina

29
Q

AA sintetizados a partir de 3 fosfoglicerato:

A

serina — glicina, cisteína

30
Q

¿en qué se relaciona la serina con la glicina?

A

luego de la ruta principal de la serina (en todos los organismos) es un precursor de la glicina, por medio de serina hidroximetiltransferasa se forma la glicina (THF, PLP)

31
Q

¿la glicina como se sintetiza en el hígado de vertebrados?

A

glicina sintasa

32
Q

síntesis de cisteína en plantas y bacterias:

A
  • producen sulfuro reducido
    necesario para sintetizar cisteína
  • sulfato se activa formando PAPS que se reduce a sulfuro con 8é
  • sulfuro se usa para la formación de cisteína a partir de serina y metionina
33
Q

aa no esenciales sintetizados a partir de piruvato y oxoalacetato en todos los organismos:

A

alanina/aspartato = a partir de ambas, por transaminación de glutamato

asparagina = amidación de aspartato (glutamina dador de NH4+)

34
Q

aa esenciales sintetizados a partir de piruvato y oxoalacetato:

A

metionina, treonina, lisina, isoleucina, valina y leucina

35
Q

precursor y punto de ramificación de metionina, treonina y lisina:

A

aspartato y asparato b semialdehído

36
Q

precursor y punto de ramificación de treonina y metionina

A

homoserina

37
Q

precursor de isoleucina:

A

treonina

38
Q

¿a qué da lugar el piruvato? ¿cómo?

A

condensación de 2C de piruvato con:

otro piruvato: valina

alfa cetobutirato: isoleucina

39
Q

¿como se forma el alfa cetobutirato? ¿que otro AA puede dar la ruta de valina?

A

se forma a partir de treonina con PLP

leucina, intermediario alfa cetoisovalerato es su sustrato

40
Q

AA formados a partir de PEP y eritrosa 4 fosfato:

A

femilalanina, tirosina y triptófano

41
Q

¿qué ruta principal tienen las bacterias, hongos y plantas de AA aromáticos?

A

para la formación del anillo aromático

42
Q

¿qué produce los primeros 4 pasos de síntesis de aromáticos? ¿cual es el primer punto de ramificación al que se convierte?

A

shiquimato (7C), se convierte a corismato

43
Q

¿qué produce el corismato?

A

una rama a triptófano y otra a fenilalanina/tirosina

44
Q

síntesis de triptófano:

A

el corismato se convierte
en antranilato por transaminación con glutamina; el antranilato se condensa con PRPP y rxn final se cataliza por triptófano sintasa con PLP

45
Q

síntesis de fenilalanina y tirosina en bacterias y plantas:

A

el corismato se convierte a prefenato (molécula común), y el último paso es una transaminación de glutamato

46
Q

síntesis de fenilalanina y tirosina en mamíferos:

A

producen tirosina a partir de fenilalanina por hidroxilación del grupo fenilo por fenilalanina hidroxilasa

47
Q

aa condicionalmente no esencial:

A

tirosina

48
Q

precursores de histidina:

A

PRPP (ribosa 5P), anillo purínico de ATP y glutamina

49
Q

¿cómo actúa el ATP como metabolito en síntesis de histidina?

A

proceso conectado con síntesis de purinas; remanente de ATP es AICAR, un intermediario de la biosíntesis de purinas… donde se recicla a ATP

50
Q

control principal de síntesis de aa:

A

retroinhibición de la primera rxn por el producto final

51
Q

¿la primera rxn de síntesis es normalmente… y se encuentra catalizada por…?

A

irreversible y enzima alostérica

52
Q

inhibición concertada:

A

cuando varios productos actúan como moduladores de retroalimentación negativa de 1 enzima determinada, el efecto global de estos y otros moduladores es aditivo

53
Q

¿cómo controlan las células la síntesis de AA y cómo? ¿qué tipo de células tienen buen control?

A

deben producir proporciones correctas de los 20 aa, por sistemas que controlan velocidad de la síntesis de aa individuales y su producción

células bacterianas de rápido crecimiento usan bien estos sistemas

BIOQUI PARCIAL NO.3 (5 decks)

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