BIOSÍNTESIS DE AA Flashcards

1
Q

¿cuánto % de N2 representa la atmósfera?

A

80%

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2
Q

en seres humanos el N2 es:

A

inerte

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3
Q

bacterias con capacidad de fijar el N2 atmosférico:

A

bacterias simbióticas de los nódulos de las raíces de leguminosas

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4
Q

¿qué es el ciclo de nitrógeno?

A

procesos metabólicos de algunas especies permiten recuperar y re utilizar el N2 disponible biológicamente

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5
Q

tres fases del ciclo de nitrógeno:

A
  1. fijación de N2 atmosférico por bacterias para formar NH3 o NH4 (este se utiliza para sintesis de AA en plantas/microorganismos, y así los animales obtienen AA)
  2. nitrificación: oxidación del amoniaco a nitritito y después a nitrato por reductasas
  3. desnitrificación: bacterias convierten nitrato a N2 sin O2 para mantener el equilibrio del N2 fijado y atmosférico
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6
Q

¿qué pasa cuando los organismos mueren?

A

las bacterias degradan proteínas y liberan amoniaco al suelo, las bacterias nitrificantes lo convierten en nitrato/nitrito

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7
Q

aceptor final de é en CTE para las bacterias del suelo:

A

NO3-, al usarlo, devuelven N2 molecular a la atmósfera

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8
Q

rxn de producción de amoniaco es:

A

exergónica, espontánea e irreversible

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9
Q

condiciones de producción de amoniaco industrial y fijación biológica de N2:

A
  • extremas, 400-500 grados
  • biológicas, presión de 0.8 atm
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10
Q

¿qué es el complejo de nitrogenasas y cuales son sus componentes?

A

sirven para fijación de N2, es inestable en O2 y consta de:

dinitrogenasa reductasa: único centro redox de tipo 4Fe-4S y 2 sitio de unión de ATP/ADP
dinitrogenasa: hierro y molibdeno, centro redox con 2MO, 32 Fe y 30S

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11
Q

papel de glutamato y glutamina en síntesis de AA:

A

son críticos para la entrada..

glutamato: fuente de grupos amino de la mayor parte de los aa (rxns de transaminación).

glutamina: el N2 del grupo amida de la glutamina es fuente de grupos amino para muchos procesos
biosintéticos

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12
Q

síntesis de glutamina:

A

por glutamina sintetasa, cataliza rxn de glutamato y NH4+ +ATP… sirve para transportar amoniaco en sangre

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13
Q

síntesis de glutamato en plantas:

A

por glutamato sintasa, con alfa cetoglutarato y glutamina (NADPH)

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14
Q

síntesis de glutamato en mamíferos:

A

transaminación con alfa cetoglutarato, o por glutamato deshidrogenasa a partir de alfa cetoglutarato y NH4+ NADPH (vía minoritatia)

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15
Q

la síntesis de glutamato y glutamina son:

A

rutas biosintéticas sencillas (casi todos los pasos presentes en la mayoría de los organismos)

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16
Q

dos maneras de regulación de la glutamina sintetasa:

A

por retroinhibición acumulativa por los 8 productos finales del metabolismo de glutamina

alanina y glicina son inhibidores alostéricos, y son indicadores del estado general de metabolismo de aa

nucleótido de citosina inhibe

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17
Q

generalmente, como se forman los AA?

A

por intermediarios de glicólisis, CAC y ruta PPP, junto a N2 de glutamina y glutamato

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18
Q

capacidad de sintetizar 20 AA en mamíferos y plantas/bacterias:

A

solo la mitad… todos los 20

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19
Q

ruta más compleja de AA:

A

aromáticos

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20
Q

AA esenciales:

A

valina, leucina, isoleucina, triptófano, fenilalanina, histidina, metionina, treonina, lisina

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21
Q

familias precursoras de aminoácidos:

A

alfa cetoglutarato, piruvato, 3-fosfoglicerato, PEP + eritrosa 4 fosfato, ribosa 5 fosfato, y oxalacetato

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22
Q

intermediario en las vías de síntesis de AA y nucleótidos: ¿cómo se sintetiza? ¿la enzima cómo se regula?

A

PRPP (5-fosforribosil-1-pirofosfato)… por ribosa fosfato pirofosfoquinasa a partir de 5-ribosa-fosfato y ATP

se regula alostéricamente por biomoléculas formadas a partir de PRPP

23
Q

¿en quiénes se dan la mayoría de rutas sintéticas de AA? ¿por qué?

A

bacterias, porque son metabólicamente más sencillas

24
Q

AA sintetizados a partir de alfa-cetoglutarato:

A

glutamato — glutamina, prolina, arginina

25
síntesis de prolina en bacterias y mamíferos:
derivado cíclico de glutamato - ATP para formación de acil fosfato - acil fosfato se reduce por NADPH o NADH a glutamato y semialdehído - semialdehído se cicla rápido y se vuelve a reducir a prolina - en mamíferos puede sintetizarse también a partir de arginina obtenida de la dieta o de la proteína tisular
26
síntesis de arginina en bacterias
sintesís de novo de ortinina, y por lo tanto, arginina
27
¿cómo se podría sintetizar la ornitina en bacterias, pero por qué no?
a partir de glutamato y semialdehído por transaminación; pero ciclación del semialdehído en prolina impide suficiente intermediario para sintetizar ornitina
28
¿cómo sintetizan los animales la arginina, ornitina y prolina?
por ciclo de urea.. cuando hay insuficiente arginina, se forma ornitina por ornitina aminotransferasa, al igual que la prolina
29
AA sintetizados a partir de 3 fosfoglicerato:
serina --- glicina, cisteína
30
¿en qué se relaciona la serina con la glicina?
luego de la ruta principal de la serina (en todos los organismos) es un precursor de la glicina, por medio de serina hidroximetiltransferasa se forma la glicina (THF, PLP)
31
¿la glicina como se sintetiza en el hígado de vertebrados?
glicina sintasa
32
síntesis de cisteína en plantas y bacterias:
- producen sulfuro reducido necesario para sintetizar cisteína - sulfato se activa formando PAPS que se reduce a sulfuro con 8é - sulfuro se usa para la formación de cisteína a partir de serina y metionina
33
aa no esenciales sintetizados a partir de piruvato y oxoalacetato en todos los organismos:
alanina/aspartato = a partir de ambas, por transaminación de glutamato asparagina = amidación de aspartato (glutamina dador de NH4+)
34
aa esenciales sintetizados a partir de piruvato y oxoalacetato:
metionina, treonina, lisina, isoleucina, valina y leucina
35
precursor y punto de ramificación de metionina, treonina y lisina:
aspartato y asparato b semialdehído
36
precursor y punto de ramificación de treonina y metionina
homoserina
37
precursor de isoleucina:
treonina
38
¿a qué da lugar el piruvato? ¿cómo?
condensación de 2C de piruvato con: otro piruvato: valina alfa cetobutirato: isoleucina
39
¿como se forma el alfa cetobutirato? ¿que otro AA puede dar la ruta de valina?
se forma a partir de treonina con PLP leucina, intermediario alfa cetoisovalerato es su sustrato
40
AA formados a partir de PEP y eritrosa 4 fosfato:
femilalanina, tirosina y triptófano
41
¿qué ruta principal tienen las bacterias, hongos y plantas de AA aromáticos?
para la formación del anillo aromático
42
¿qué produce los primeros 4 pasos de síntesis de aromáticos? ¿cual es el primer punto de ramificación al que se convierte?
shiquimato (7C), se convierte a corismato
43
¿qué produce el corismato?
una rama a triptófano y otra a fenilalanina/tirosina
44
síntesis de triptófano:
el corismato se convierte en antranilato por transaminación con glutamina; el antranilato se condensa con PRPP y rxn final se cataliza por triptófano sintasa con PLP
45
síntesis de fenilalanina y tirosina en bacterias y plantas:
el corismato se convierte a prefenato (molécula común), y el último paso es una transaminación de glutamato
46
síntesis de fenilalanina y tirosina en mamíferos:
producen tirosina a partir de fenilalanina por hidroxilación del grupo fenilo por fenilalanina hidroxilasa
47
aa condicionalmente no esencial:
tirosina
48
precursores de histidina:
PRPP (ribosa 5P), anillo purínico de ATP y glutamina
49
¿cómo actúa el ATP como metabolito en síntesis de histidina?
proceso conectado con síntesis de purinas; remanente de ATP es AICAR, un intermediario de la biosíntesis de purinas... donde se recicla a ATP
50
control principal de síntesis de aa:
retroinhibición de la primera rxn por el producto final
51
¿la primera rxn de síntesis es normalmente... y se encuentra catalizada por...?
irreversible y enzima alostérica
52
inhibición concertada:
cuando varios productos actúan como moduladores de retroalimentación negativa de 1 enzima determinada, el efecto global de estos y otros moduladores es aditivo
53
¿cómo controlan las células la síntesis de AA y cómo? ¿qué tipo de células tienen buen control?
deben producir proporciones correctas de los 20 aa, por sistemas que controlan velocidad de la síntesis de aa individuales y su producción células bacterianas de rápido crecimiento usan bien estos sistemas