BIOMOL.T4. PLEGAMIENTO, MODIFICACIONES, TRANSPORTE Y DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS Flashcards
El plegamiento, las modificaciones post-traduccionales, la unión a co-factores y el ensamblaje con otras subunidades proteicas vienen dictados por la propia secuencia de aminoácidos de la cadena polipeptídica
VERDADERO
Las características (polaridad, carga…) de los aminoácidos fomentan que interaccionen entre sí o con otras moléculas de la forma concreta en que lo hacen.
La proteína se va plegando, formando puentes de hidrógeno y otras interacciones intracatenarias de manera co-traduccional, que conducen directamente a la conformación definitiva incluso antes de que la proteína sea liberada del ribosoma .
FALSO
Es cierto que la proteína se va plegando a medida que es sintetizada. Pero no adopta su plegamiento completo hasta que es liberada del ribosoma.
Además, a menudo no se forma directamente el plegamiento completo, si no que las chaperonas median la formación de una estructura intermediaria: el “glòbul fos”, que presenta un plegamiento parcial.
A pesar de ser un proceso energéticamente favorable, (porque conduce a un estado de menor energía libre) el plegamiento de las proteínas requiere de la ayuda de chaperonas para dar con la conformación óptima y funcional
VERDADERO
Las proteínas mal plegadas no suponen un problema más allá de no ser funcionales, pero se degradan para poder reutilizar sus aminoácidos
FALSO
Las proteínas mal plegadas no solo no son funcionales, si no que además suponen un peligro debido a su toxicidad (pueden formar agregados e interferir en la función celular) por eso son tan importantes los mecanismos de reparación y degradación
Las chaperonas Hsp60 se unen co-traduccionalmente a las proteínas, junto a co-chaperonas, para favorecer su plegamiento dependiente de ATP
FALSO
Son las chaperonas Hsp70
Las Hsp70 intentan volver a plegar proteínas que hayan plegado incorrectamente, priorizando la reparación a la degradación, que es siempre el último recurso
VERDADERO
Las chaperoninas o chaperonas Hsp60 crean una cámara con las condiciones favorables para el correcto plegamiento co-traduccional de proteínas que están siendo sintetizadas
FALSO
Las chaperonas Hsp70 actúan de forma co-traduccional, pero las Hsp 60 actúan sobre proteínas ya sintetizadas pero no completamente plegadas o plegadas de forma errónea, es decir, actúan de forma post-traduccional.
Las chaperoninas o chaperonas Hsp60 consumen ATP para fomentar el correcto plegamiento de proteínas mal plegadas o parcialmente plegadas evitando así la formación de agregados proteicos
VERDADERO
Las chaperonas juegan un papel central en los procesos de plegamiento, corrección de errores conformacionales y degradación de las proteínas
VERDADERO
Los amiloides o agregados insolubles de proteínas mal plegadas que al acumularse causan enfermedades neurodegenerativas se forman por interacción entre hélices alfa
FALSO
Se forman por entrecruzamientos beta, es decir, interacciones entre láminas beta
Una vez sintetizadas, las proteínas pueden ser fragmentadas por proteólisis o modificadas mediante la adición covalente de grupos químicos a las cadenas laterales de los aminoácidos
VERDADERO
Las modificaciones post-traduccionales consisten en la adición de grupos químicos estrictamente inorgánicos (como fosfatos o hidroxilos) a las cadenas laterales de los aminoácidos
FALSO
Si bien pueden añadirse muchos grupos inorgánicos, hay muchas modificaciones post-traduccionales que suponen la adición de moléculas orgánicas: glicosilación, SUMOilación, lipidación…
El conjunto de modificaciones post-traduccionales constituye todo un código simplemente modulando la función de las proteínas actuando como activadores o represores de su centro activo.
FALSO
Las modificaciones post-traduccionales no solo varían el grado de actividad de las proteínas por activación o represión. Pueden modular sus niveles de actividad alterando su localización subcelular, su estabilidad o su capacidad de interacción con otras proteínas.
Proteínas con funciones muy importantes (p.ej. el factor de transcripción p53) presentan muchos puntos susceptibles de ser modificados post-traduccionalmente, de manera que sus modificaciones se combinan, permitiendo una regulación muy fina.
VERDADERO
Las proteínas tienen un destino predeterminado por una secuencia específica de reconocimiento para la maquinaria encargada de dirigirla a su localización
VERDADERO
Las principales rutas de transporte de proteínas se dan entre el citoplasma y los orgánulos; entre el citoplasma y la cara citosólica de la membrana; y el transporte vesicular por vía del retículo endoplasmático - trans-Glogi-Network - vesículas)
VERDADERO
La importación-exportación nuclear atravesando los complejos llamados importinas está regulado por las GTPasas llamadas Ran
FALSO
Las importinas no son los poros, si no los receptores que se unen a las secuencias de señal de importación nuclear (NLS) de las proteínas, y las guían en su transporte a través de los complejos de poro nuclear (NPCs).
El gradiente de Ran-GTP / Ran-GDP que mantiene la direccionalidad del transporte nuclear se consigue gracias a la acción de las Ran-GAP del nucleoplasma (GTPase Activating Protein) y las Ran-GEF citoplasmáticas (Guanosine-nucleotide Exchangge Factor)
FALSO
Las Ran-GAP son citoplasmáticas, pues inducen la hidrólisis del Ran-GTP al salir al citoplasma. Esto impide que aumente la [Ran-GTP] en el citoplasma y permite que continúe saliendo del núcleo.
La Ran-GEF se encuentra en el núcleo, y se encarga de mantener elevados los niveles nucleares de Ran-GTP al intercambiar el GDP de las Ran-GDP que regresan al núcleo por GTP.
Una vez en el núcleo, los receptores de importación unidos a la proteína con una NLS (Nuclear Localization Signal) interaccionan con Ran-GTP, liberando la proteína transportada al hacerlo.
VERDADERO
En el núcleo, los receptores de exportación unidos a la proteína con una NES (Nuclear Export Signal) interaccionan con Ran-GTP, liberando la proteína transportada al hacerlo.
FALSO
Ran-GTP siempre media el transporte de los receptores desde el nucleoplasma al citoplasma. Si el receptor es de exportación, al salir del núcleo debe llevar consigo a la proteína que transporta. Por tanto, la interacción Receptor de exportación - Ran-GTP induce la unión de la proteína con NES al receptor
El transporte de las proteínas con una señal de localización mitocondrial es co-traduccional, pues se mantienen desplegadas como proteínas precusoras mitocondriales durante el proceso, y solo adoptan su conformación como proteínas mitocondriales maduras una vez se encuentran en la matriz mitocondrial
FALSO
El plegamiento de la proteína y su síntesis (traducción) son procesos distintos. Es cierto que no adoptan la conformación final hasta que llegan a destino, pero se transportan de forma post-traduccional, pues ya han sido completamente sintetizadas previo al transporte.
La secuencia señal de todas las proteínas precusoras mitocondriales es reconocida primero por TOM (Translocator of the Outer Membrane) y posteriormente por TIM (Translocator of the Inner Membrane)
FALSO
TIM solo interviene en el transporte si son proteínas destinadas a la matriz mitocondrial. Si quedan unidas a una de las membranas o en el espacio intermembrana solo interviene TOM.
El transporte de proteínas al retículo endoplasmático se produce de forma co-traduccional, pues el complejo SRP (Signal Recognition Particle) estanca la traducción hasta que la unión del polipéptido al translocador de membrana induce la disociación de SRP y su receptor respecto del ribosoma y el polipéptido
VERDADERO
De forma genérica, las proteínas que son transportadas al retículo endoplasmático tienen este orgánulo como destino final
FALSO
El retículo endoplasmático es un orgánulo implicado en la biosíntesis y el posterior transporte de proteínas por la vía de transporte vesicular (fusión de vesículas del RE al cis-Golgi y finalmente distribución de estas desde el trans-Golgi)
Las proteínas con señales de transporte al retículo endoplasmático generalmente son proteínas de endomembranas, de membrana plasmática, o de secreción (tanto regulada como constitutiva)
VERDADERO
Pues del RE parten, vía transporte vesicular, hasta el Trans Golgi Network, que las dirige a su destino final
Durante su transporte desde el cis hasta el trans-Golgi las proteínas sufren modificaciones post-traduccionales dirigidas por secuencia que, una vez en el trans-Golgi, sirven como señales de localización que permiten el sorting/distribución correcto
VERDADERO
Entre las modificaciones post-traduccionales que se pueden producir en el aparato de Golgi se incluyen modificaciones de GTPasas para su localización en la membrana plasmática.
VERDADERO
En el proteasoma, la actividad desplegasa y los centros catalítcos se encuentran en cuatro anillos heptaméricos que constituyen un cilindro
FALSO
El proeasoma presenta 4 anillos heptaméricos con las actividades cataíticas y, además, 2 estructuras hexaméricas que reconocen e insertan los sustratos en el cilindro gracias a su actividad desplegasa
Las proteínas anómalas que deben ser degradadas proteolíticamente se marcan de manera específica por multi-ubiquitinizaciones para que el proteasoma las reconozca.
FALSO
Las proteínas para degradación se marcan por poli-ubiquitinización (múltiples ubiquitinas unidas a 1 misma lisina)
La mono-ubiquitinizaciones o multi-ubiquitinizaciones (1 sola ubiquitinización de varios residuos de Lys) son señales con otras finalidades.
En el proceso de poli-ubiquitinización, E1 y E2 interaccionan con la ubiquitina, por lo que hay pocos tipos de estas enzimas. En cambio E3 reconoce los sustratos a marcar, y ha de presentar especificidad por diversas señales específicas, y por ello hay muchos tipos distintos.
VERDADERO
Algunos fármacos antitumorales como Bortezomib o Carfilzomib porque son activadores proteasomales a los que las células tumorales son particularmente sensibles
FALSO
Son inhibidores proteasomales, y las células tumorales son especialmente sensibles a la inhibición del protasoma, lo que supone que acumulen proteínas mal plegadas, cosa que induce en ellas la apoptosis por UPR (Unfolded Protein Response)
La principal diferencia entre los sistemas Calpaína y Caspasa con respecto al proteasoma es que estos inducen proteólisis (cortes en puntos específicos), y no la degradación proteica (destrucción completa de la proteína como hace el proteasoma
VERDADERO
La calpaína es una cisteína-proteasa citosólica que participa induciendo procesos como la proliferación y la muerte celular ante disminuciones del Ca2+ intracelular
FALSO
La calpaína se activa ante un aumento del Ca2+ intracelular
Las caspasas iniciadoras tienen actividad proteolítica tanto sobre si mismas como sobre otras caspasas.
VERDADERO
Se activan por auto-proteólisis y una vez activas pueden proteolizar las caspasas ejecutoras de la apoptosis
La alta especificidad de las hidrolasas ácidas lisosomales permite una degradación altamente selectiva de moléculas captadas por endocitosis o bien procedentes de procesos de autofagia
FALSO
Los lisosomas son centros catabólicos que realizan una digestión celular general e inespecífica.
Respira y relaja el cuerpo, lo vas a hacer muy bien
VERDADERO
