BIOMOL.T1.TRANSCRIPCIÓN Y PROCESAMIENTO DEL RNA Flashcards
El acoplamiento de transcripción y traducción permite una regulación fina
FALSO
Ambos procesos están acoplados en procariotas.
En eucariotas el desacoplamiento debido a la separación espacial (núcleo-citoplasma) permite la maduración del mRNA lo que permite un mayor control
El desacoplamiento de transcripción y traducción permite una regulación fina
VERADERO
El tRNA transfiere aminoácidos de forma inespecífica para el proceso de traducción
FALSO
Lo hace de forma específica
En los ribosomas, el rRNA realiza el papel catalítico mientras que las proteínas realizan la función estructural
FALSO
El rRNA también tiene un papel estructural
El rRNA es una parte estructural y catalítica de los ribosomas
VERDADERO
El RNA es un intermedio estable de vida media corta que se sintetiza a partir de un molde de DNA para traducirse posteriormente a proteína
FALSO
Todos los RNAs se sintetizan a partir de un molde del DNA, pero el mRNA es el único que se traduce a proteína
Además, la vida media del mRNA es, en efecto, corta, lo que significa que es inestable.
La RNA polimerasa lee la cadena molde en dirección 3’ a 5’
VERDADERO
La RNA polimerasa cataliza la formación de enlaces fosfodiéster 5’ a 3’ dando lugar a una cadena de RNA complementaria a la cadena codificante
FALSO
Da lugar a una cadena de RNA complementaria a la cadena molde
En la RNA polimerasa procariota, las subunidades alfa y beta tienen una afinidad genérica por el DNA, pero es la subunidad sigma la que asegura la especificidad reconociendo al promotor
VERDADERO
En la RNA polimerasa eucariota, las subunidades alfa y beta tienen una afinidad genérica por el DNA, pero es la subunidad sigma la que asegura la especificidad reconociendo al promotor
FALSO
Es la RNA polimerasa procariota
En la RNA polimerasa procariota, la subunidad beta interacciona con el DNA mientras que la beta prima lo hace con los rNTPs
FALSO
La subunidad beta prima interacciona con el DNA mientras que la beta lo hace con los rNTPs
Además de mRNA, la RNA polimerasa II cataliza la síntesis de otros RNAs como el rRNA
FALSO
RNA polimerasa I: en el nucleol, cataliza la síntesis de rRNAs
RNA polimerasa II: cataliza la síntesis de mRNAs, miRNA, siRNA i algunos snRNAs
RNA polimerasa III: cataliza la síntesis de tRNAs, otros rRNAs i snRNAs
Las RNA polimerasas eucariotas están formadas por 12 subunidades, de las cuales 5 son no homólogas a ninguna subunidad procariota pero comunes entre las tres polimerasas eucariotas
VERDADERO
La RNA polimerasa es una enzima dependiente de DNA que no necesita primer (cebador), pues sintetiza la cadena de RNA de novo
VERDADERO
Una vez la primasa ha sintetizado un cebador de RNA, la RNA polimerasa II completa la transcripción del mRNA de forma absolutamente procesiva
FALSO
La RNA polimerasa no necesita primer, inicia la transcripción completamente de novo
El OH del extremo 3’ de la cadena de RNA naciente ataca el PO4 α (interno) del rNTP entrante, formando el enlace fosfodiéster y liberando un pirofosfat o
VERDADERO
Cuanto más fuerte es un promotor más se parece a la secuencia consenso, por lo que la subunidad sigma tiene más afinidad por la secuencia y se ancla más fuerte, ralentizando la transcripción
FALSO
Una mayor afinidad de la subunidad sigma por el promotor estabiliza la unión, lo que permite que de tiempo a que se ensamble toda la maquinaria y por tanto la tasa de transcripción sea mayor
Mutaciones en las secuencias consenso de los promotores pueden suponer una alteración e incluso una supresión de la transcripción génica
VERDADERO
La asimetría de la secuencia promotora (no palindrómica) establece cuál es la cadena molde y la dirección de transcripción
VERDADERO
DNase protection hace referencia a la capacidad de la RNA polimerasa de proteger los promotores de la actividad de nucleasas gracias a su elevada afinidad por estas secuencias
VERDADERO
Una vez la subunidad sigma ha reclutado al resto de subunidades de la RNA polimerasa se desprende para que pueda empezar la síntesis del RNA
FALSO
El RNA se empieza a sintetizar (se añaden unos 10-12 nucleótidos) antes de que se desprenda la subunidad sigma
La RNA polimerasa avanza añadiendo 50 rNTPs/s a la vez que va desenrollando y rebobinando el DNA
VERDADERO
En la terminación independiente de rho el factor de elongación NusA interacciona con la polimerasa y el hairpin para promover la terminación
VERDADERO
En la terminación independiente de rho se forma un hairpin por interacción entre Gs y Cs que favorece la disociación del mRNA respecto del DNA y la RNA polimerasa II
FALSO
La terminación independiente de rho tiene lugar en procariotas, en los que hay una única RNA polimerasa, la RNA polimerasa II es eucariota
En la terminación dependiente de rho, la secuencia de terminación consiste en repeticiones invertidas de GCs seguidas de Us
FALSO
Es la secuencia señal de la terminación INdependiente de rho
La proteína homohexamérica rho, gracias a su actividad helicasa, rompe el híbrido DNA-RNA sobre una secuencia rica en Cs llamada “rut”
FALSO
Rho reconoce la secuencia rut, por la que se une al tránscrito, y luego avanza hasta dar con la secuencia de terminación, que es dónde introduce el corte.
Gracias a su alta afinidad por rut, la proteína rho ejerce su actividad helicasa sin consumo de energía
FALSO
La actividad de rho es ATP-dependiente
Los poliribosomas son estructuras que permiten traducir varios tránscritos de mRNA de forma simultánea
FALSO
Se trata de varios ribosomas que se unen secuencialmente a un mismo tránscrito, traduciendo varias proteínas a partir de un solo mRNA
Aunque el grado de empaquetamiento debido a histonas es el mismo para el material genético procariota y eucariota, este último se encuentra más inaccesible a la maquinaria de transcripción debido a su localización en el núcleo
FALSO
La compactación del DNA eucariota es bastante superior a la procariota debido a que el cromosoma bacteriano, aunque presenta proteínas de anclaje, no está unido a histonas
Las histonas, clave para la regulación transcripcional y su modulación, constituyen la base molecular de la epigenética
VERDADERO
La CAAT box y la Pribnow box se corresponden con las secuencias consenso de los promotores procariotas
FALSO
CAAT es una secuencia eucariota.
Los promotores procariotas cuentan con:
La Región -35 (TTGACA)
La Pribnow box, a -10 (TATAAT)
Situado, -25 del inicio de transcripción, TATA box es uno de los core promoters eucariotas más frecuentes
VERDADERO
Compartimentos GC y/o CAAT box son necesarios, además de la Hogness box, para que haya una tasa basal de transcripción de genes eucariotas
VERDADERO
Además de repressors e insulators, encontramos enhancers como CAAT box entre las secuencias reguladoras distales
FALSO
CAAT es unna secuencia proximal
Los GTFs requeridos por la RNA polimerasa II funcionan de forma colectiva como lo hace la subunidad sigma procariota
VERDADERO
La unión de TBP a la TATA box genera una distorsión física en el DNA que sirve como señal para reclutar factores adicionales como TFIIA
FALSO
Recluta factores adicionales como TAF; TFIIA es un GTF que estabiliza las uniones de TBO y TAF con el DNA
TFIIH es una proteína multifuncional que cataliza el desenrollamiento de la doble cadena de DNA y fosforila la cola carboxi-terminal de la RNA polimerasa II
FALSO
TFIIH es un complejo multiproteico, no una proteína multifuncional
La subunidad quinasa de TFIIH fosforila el extremo 3’ del tránscrito de mRNA, lo que es esencial para la transición a la elongación
FALSO
Fosforila la cola carboxi-terminal de la RNA polimerasa II
Durante la formación del complejo de pre-iniciación, el GTFs TFIIF recluta la helicasa TFIIH para dar comienzo a la transcripción
FALSO
TFIIF rectulta la RNA polimerasa II
TFIIH es reclutado por TFIIE
Gracias a la intervención de todos los GTFs de forma secuencial y ordenada en la formación del PIC (Complejo de Pre-Iniciación) se consigue optimizar la tasa de transcripción
FALSO
Los GTFs son necesarios para una taasa basal de transcripción, pero realmente in vivo el inicio de la transcripción es mucho más complejo, incluyendo FTs distales (enhancers…)
TFIID facilita la unión de TFIIA y TFIIB que contribuyen a estabilizar el PIC (complejo de pre-iniciación) y a facilitar el reclutamiento de la RNA polimerasa II vía TFIIF
VERDADERO
El patrón dinámico de metilación de los residuos de Ser y Pro del dominio carboxi-terminal de la RNA polimerasa II permite regular el proceso de transcripción
FALSO
Los residuos de Ser y Pro se fosforilan, no se metilan
Las fosforilaciones del CTD (dominio carboxi-terminal) de la RNA polimerasa II permiten liberar algunos GTFs. Estos en ocasiones permanecen en el promotor para iniciar una nueva transcipición
VERDADERO
La cola CTD (carboxi-terminal domain) fosforilada recluta factores que permiten desacoplar la transcripción del pre-mRNA de su maduración
FALSO
La cola CTD fosforilada recluta factores para el procesamiento y maduración del RNA que tendrán lugar de forma íntimamente acoplada en espacio y tiempo a la transcripción
Una vez fuera del nucleoide, el mRNA maduro se identifica en el citoplasma por su 5’-cap, una larga cola poliA y la ausencia de secuencias no codificantes (itrones)
FALSO
El mRNA solo es procesado y madurado en eucariotas, el nucleoide es un “orgánulo no membranoso” procariota
El procesamiento del mRNA tiene lugar de manera en parte co- y en parte post-transcripcional
VERDADERO
La función del 5’-cap es proteger el mRNA de la degradación por parte de endonucleasas 5’, muy abundantes en el citoplasma
FALSO
Protege del ataque de exonucleasas 5’
Además de una función de protección frente a la degradación por exonucleasas, el 5’cap añadido co-transcripcionalmente juega un papel importante en el inicio de la traducción
VERDADERO
Una fosfatasa, una guanil transferasa y una metil transferasa catalizan la adición del 7-metil-GTP al mRNA mediante la formación de un enlace 3’ a 5’
FALSO
Se incorpora mediante un enlace 5’ a 5’
Durante la adición del 5’-cap, también se metilan los -OH en posición 2’ de los 2 primeros nucleótidos
VERDADERO
Una vez se llega a las secuencias AAUAAA y una región rica en Us o GUs el pre-mRNA es escindido del DNA. Tras esto se añade la cola poliA de forma post-transcripcional
VERDADERO
Cuando la RNA polimerasa sintetixa las secuencias de escisión, los complejos CstF y CPSF se unen a la cadena molde para catalizar la escisión del tránscrito
FALSO
Ambos factores se unen al propio tránscrito
La unión de CstF y CPSF a las secuencias de escisión del tránscrito promueve el reclutamiento de factores adicionales así como la escisión del pre-mRNA respecto del complejo de transcripción
VERDADERO
Una vez escindido el pre-mRNA, la polimerasa continúa transcribiendo hasta llegar a un codón de stop, que induce la disociación de dicha polimerasa
FALSO
La RNA polimerasa continúa transcribiendo, pero como el RNA no cuenta con 5’-cap su degradación contribuye a la disociación de la polimerasa
PAP (Poli-A Polimerasa añade la cola de poliA a partir de ATP sin necesidad de primer o de cadena molde
VERDADERO
La totalidad de los genes eucariotas incluyen secuencias no codificantes eliminadas durante el splicing: los intrones
FALSO
Hay genes que no presentan intrones, como los de las histonas
A diferencia de los exones, los intrones son secuencias muy largas y heterogéneas que no codifican para ninguna proteína
VERDADERO
La aparición de isoformas proteicas ha sido posible gracias al splicing alternativo, que consiste en eliminar diferentes intrones de un mismo gen para dar lugar a distintos tránscritos
FALSO
Los intrones siempre son eliminados, lo que varía es si se procesan o no todos los exones
El ataque nucleófilo del 2-OH de la A del sitio de ramificación al fosfato del punto de corte 3’ supone la formación del lariat intermedio
FALSO
El 2-OH de la A del sitio de ramificación ataca al fosfato del punto de corte 5’
Tras dos ataques nucleofílicos consecutivos de OHs a fosfatos el intrón forma un lariat y los exones que lo flanqueaban quedan unidos
VERDADERO
Los microRNAs con actividad ribozimática del spliceosoma están asociados a proteínas, formando snRNPs (snurps) en el núcleo del complejo.
FALSO
Las snRNPs estñan constituidas por 7-10 proteínas y 1 de los 5 snRNAs (NO microRNAs) que forman parte del complejo
Las snRNPs reconocen los splicing sites gracias a la complementariedad entre estos y el snRNA
VERDADERO
U1 snRNP reconoce el punto de corte 5’, mientras que U2AF y BBP reconocen el punto de corte 3’
FALSO
U”AF y BBP reconocen el sitio de ramificación
En el complejo de snRNPs U4/U6-U5, U4 se escinde de U6 debido a interacciones con el centro activo del spliceosoma
VERDADERO
El splicing tiene lugar in vivo gracias a que la actividad ribozimática de los snRNAs es independiente de ATP
Falso, los reordenamientos RNA-RNA requieren del consumo de ATP
La homogeneidad de los intrones es esencial durante el ensamblaje de la maquinaria de splicing, pues esta permite la unión de hnRNPs cerca de los puntos de corte
FALSO
Los intrones son secuencias heterogéneas (hnRNP stands for heterogeneous nuclear riboproteins)
La unión de proteínas SR a secuencias específicas que promueven la maduración (Exonic Splicing Enhancers, ESE) ayudan a reclutar a snRNP U1 y U2AF
VERDADERO
La A del sitio de ramificación de los intrones actuales deriva por mutación de la G de los primeros intrones que sustituyeron su actividad autocatalítica por la maquinaria del spliceosoma
FALSO
Los intrones que son eliminados mediante spliceosoma evolucionaron a partir de intrones auto-catalíticos que presentaban A y formaban un lariat.
Es cierto que existen intrones autocatalíticos con G en el sitio de ramificación que no forman un lariat, pero no son un “antepasado” de nuestros intrones
El mRNA maduro se caracteriza por su patrón de proteínas asociadas, algunas de las cuales (los receptores de de transporte/exportación nuclear) interaccionan con los complejos de poro nuclear (NPCs), permitiendo la salida del mRNA al citoplasma
VERDADERO
¡Tú puedes!
VERDADERO
