Biologie moléculaire 2 Flashcards
Qu’est-ce que l’ADN polymérase?
Une ADN polymérase est une enzyme faisant partie du complexe enzymatique intervenant dans la réplication de l’ADN au cours du cycle cellulaire lors de la phase S, mais aussi dans des processus de réparation et de recombinaison de l’ADN.
Que sont des amorces?
En biologie moléculaire, l’amorce est une courte séquence d’ARN ou d’ADN, complémentaire du début d’une matrice, servant de point de départ à la synthèse du brin complémentaire de cette dernière matrice par une ADN polymérase.
Que sont des oligonucléotides?
Les oligonucléotides sont de courts segments de chaines d’acides nucléiques de quelques dizaines de nucléotides. Ils sont en général obtenus par synthèse chimique, sous forme de simple brin se composant de groupes fonctionnels choisis pour leur intérêt.
Qu’est-ce que l’appariement/hybridation des bases?
L’appariement des bases est la liaison hydrogène spécifique entre les purines et les pyrimidines dans les acides nucléiques double brin.1
Qu’est-ce que le polymorphisme?
Le polymorphisme correspond aux variations de la séquence nucléotidique de l’ADN d’un gène dans une population. Un gène est dit polymorphe s’il existe au moins deux allèles à une fréquence égale ou supérieure à 1 %.
Les variations des séquences parmi les individus d’une population (fréquence d’au moins 1%) sont appelées des polymorphismes génétiques. En moyenne, il y a une variation tous les 1000 nucléotides.
Qu’est-ce qu’une allèle?
Un allèle est une version variable d’un même gène, c’est-à-dire une forme variée qui peut être distinguée par des variations de sa séquence nucléotidique. Il existe généralement quelques allèles pour chaque gène, mais certains gènes possèdent plusieurs dizaines d’allèles.
Qu’est-ce que le génotype?
Le génotype est une partie donnée de l’information génétique d’un individu. Le génotype d’un individu est donc la composition allélique de tous les gènes de cet individu.
Qu’est-ce que le phénotype?
En génétique, le phénotype est l’ensemble des traits observables d’un organisme.
Qu’est-ce que permet la PCR?
La PCR permet de choisir un segment d’ADN particulier dans un génome et d’amplifier cette séquence cible de manière exponentielle afin d’en obtenir des millions de copies.
Quel est le facteur clé du succès de la PCR?
C’est l’utilisation de l’ADN polymerase Taq, enzyme résistante à la chaleur. La polymérase Taq permet de générer des fragments d’ADN ne dépassant pas généralement 4 kb.
Quelle est la température optimale de la Taq?
72°C, mais elle peut aussi résister à des températures de 95°C (pas de façon prolongée).
Comment calculer le nombre de molécule en fonction du cycle lors d’une PCR?
Le nombre de molécule est égal à 2^n (n=nb de cycle)
Quel est le nombre maximal de cycle qu’on peut faire avec une PCR?
35, car après il y a dégradation / épuisement.
Avec quelle équation prédire le nombre total de copies de la séquence cible?
y = x 2^n
y = nombre final de copies x = nombre initial de copies n = nombre de cycles
Quelles sont les 3 grandes étapes d’une réaction cyclique d’amplification?
1 : Dénaturation (séparation des deux brins d’ADN) qui a lieu à 95°C
2 : Hybridation (fixation d’un couple d’amorces) à 40 à 65°C
3 : Élongation (synthèse d’un brin par la Taq polymérase) à 72°C
