BIOCHIMIE - AA, Protéines Flashcards

1
Q

Structure des AA

A

Groupement amine primaire NH2
Groupement carboxyle COOH
Atome H
Chaîne latérale R

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Q

Carbone asymétrique c’est quoi?

A

Carbone alpha portant 4 groupements différents

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3
Q

AA chirales ou non chirales?

A

Chirales

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4
Q

Qu’est-ce qu’une molécule chirale?

A

Composé qui n’est pas superposable à son image dans un miroir plan

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5
Q

Est-ce que les AA ont une activité optique?

A

Oui sauf la glycine

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6
Q

Mélange racémique c’est quoi?

A

Quantités égales des 2 isomères ( D et L)

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7
Q

Les AA ont-ils une configuration D ou L?

A

L

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8
Q

Définition énantiomérie

A

Propriété de certaines molécules stéréoisomères, dont 2 des isomères sont l’image l’un de l’autre dans un miroir plan, mais pas superposables

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9
Q

Définition isomères

A

Composés qui ont la même formule moléculaire

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10
Q

Formation de liens peptidiques

A

Polymérisation AA
Déshydratation (sortie H2O)
Lien peptidique CO-NH

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11
Q

Formation pont disulfure

A

Réaction de 2 groupes thiol (SH) permet déshydratation = pont disulfure

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12
Q

Projection de Fisher

A

L vers la gauche (S)
D vers la droite (R)

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13
Q

2 types de protéines

A

De fonction
De structure

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14
Q

Structure primaire c’est quoi?

A

Séquence d’acides aminés d’une protéine

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15
Q

Structure secondaire c’est quoi?

A

Torsion et interférence stérique

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16
Q

Types de structure secondaire

A

Hélice alpha
Feuillet bêta

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17
Q

Hélice alpha (forme + définition)

A

En forme de spirale
Arrangement de la chaîne peptidique

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18
Q

Les helices alpha sont stabilisées par quoi?

A

Les ponts H

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19
Q

Chaque hélice contient combien d’AA par tour?

A

3.6 AA

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20
Q

Les feuillets bêta sont stabilisés par quoi?

A

Ponts H entre les AA distants

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21
Q

Quelles sont les 2 configurations des feuillets bêta?

A

Parallèle
Anti parallèle

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22
Q

Comment les structures secondaires peuvent former les motifs (structures supersecondaires)?

A

En combinant des structures secondaires

= fonction précise

23
Q

Structure tertiaire c’est quoi?

A

Arrangement tridimensionnel de tous les AA de la protéine

24
Q

La structure tertiaire est stabilisée par quoi?

A

Liaisons hydrophobes
forces électrostatiques
Ponts disulfures
Liaisons peptidiques

25
Les domaines sont formés par quelle structure?
Tertiaire
26
Qu’est-ce le domaine protéique?
Les proteines de + de 200 AA en forment. Exercent des fonctions indépendantes
27
La structure quaternaire c’est quoi?
Assemblage de plusieurs chaînes de polypeptides
28
Qu’est-ce qui confère à la protéine sa fonction?
Ses repliements, sa structure
29
Protéines de structure
Protéines fibreuses Collagene Kératine
30
Rôle des protéines fibreuses + caractéristiques
Maintien de l’intégrité tissulaire Insolubles dans l’eau
31
Rôle du collagène + caractéristiques
Protéine résistante qui compose les os, peau, tendons, cartilage, dents… Hélice alpha 3AA/tour Triple hélice
32
Rôle de la kératine + caractéristiques
Compose le cytosquelette Répétions en heptade (7 AA) : 2 hélices droites enroulées et une super hélice gauche
33
Propriétés d’une enzyme
Catalyse les réactions (accélère) Restent inchangées Spécificité enzymatique (site de liaison de l’enzyme spécifique a son substrat)
34
Quelles enzymes requiert un cofacteur pour être activées?
Holoenzyme
35
Pour compléter la réaction, le coenzyme ___________
Doit reprendre sa forme
36
2 types de fonctionnement des coenzymes
Co-substrat Groupement prosthétique
37
Le co-substrat est associé de quelle façon à l’enzyme?
Transitoire
38
Le groupement prosthétique est associé de quelle façon à l’enzyme?
Liaison covalente
39
Facteurs qui influencent les réactions enzymatiques
-concentration d’un substrat -température -pH
40
Si la concentration en substrat augmente, comment se comporte la réaction enzymatique?
Elle se fait plus rapidement, jusqu’à l’obtention d’un plateau (qte enzyme pas infinité)
41
Qu’est-ce qui se passe si la température est plus élevée que celle optimale pour les enzymes (+40ºC)?
Dénaturation des enzymes
42
Km reflète quoi?
L’affinité de l’enzyme pour son substrat
43
Si Km est petit, l’enzyme a une _______ affinité pour son substrat
Grande (et vice versa)
44
Mécanismes des réactions à 2 substrats
Réactions séquentielles (ordonnées ou aléatoires) Réactions ping-pong
45
2 mécanismes d’inhibition enzymatique
Empêche formation complexe ES Empêche séparation E+P
46
2 types d’inhibition enzymatique
Compétitive Non compétitive
47
Caractéristiques inhibition compétitive
Inhibiteur en compétition avec le substrat (ressemblance) Il bloque le site actif de l’enzyme Réversible
48
Paramètres inhibition compétitive
Pas d’effet sur Vmax ([substrat] élevée) Km augmente (on doit augmenter la qte de substrats afin datteindre Vmax)
49
Caractéristiques inhibition non compétitive
Inhibiteur et substrat sur différents sites de l’enzyme
50
Paramètres inhibition non compétitive
Vmax diminue (enzyme inactive, donc augmentation qte substrat = aucun effet) Pas d’effet sur Km (le substrat peut se lier même si inhibiteur car différents sites)
51
Régulation allostérique régulée par quoi?
Un effecteur
52
2 types d’effecteurs?
Inhibiteur (enzyme forme inactive) Activateur (enzyme forme active
53
Régulation par modification covalente (phosphorylation)
Addition ou soustraction groupement phosphate sur l’enzyme (Soit par kinases qui ajoutent ou phosphatases qui enlèvent)