Biochimie Flashcards
Qu’est-ce qu’un changement de configuration dans les protéines ?
Pour passer d’un stéréoisomère à un autre, il faut casser au moins une liaison chimique.
Qu’est-ce qu’un changement de conformation dans les protéines ?
C’est le déplacement spatial d’une partie de la molécule sans cassure de liaison chimique.
Combien d’acides aminés standard composent les peptides et protéines ?
20 acides aminés standard.
Qu’est-ce qu’un acide aminé semi-essentiel ?
Un acide aminé que l’organisme peut fabriquer uniquement à partir d’un acide aminé essentiel.
Quelle est la différence entre une réaction chimique avec et sans catalyseur ?
La réaction avec un catalyseur a une énergie d’activation plus basse que sans catalyseur.
Quelle est la forme de la courbe de saturation d’une enzyme allostérique ?
Sigmoïde
Que représente l’équation de Hill ?
Elle décrit la coopérativité entre les sous-unités des protéines oligomériques.
Quels sont les principaux types de modifications covalentes réversibles qui modulent les enzymes ?
Phosphorylation, acétylation, ubiquitination, ADP ribosylation, méthylation.
Qu’est-ce que la glycolyse ?
Un processus métabolique qui transforme le glucose en pyruvate.
Qu’est-ce que l’acétyl-CoA ?
Un composé important qui entre dans le cycle de Krebs pour l’oxydation.
Quelle est la principale différence entre catabolisme et anabolisme ?
Le catabolisme dégrade des macromolécules en micromolécules (oxydation), tandis que l’anabolisme construit des macromolécules à partir de micromolécules (réduction).
Qu’est-ce qu’un acide gras saturé ?
Un acide gras sans double liaison, bien rangé en bloc.
Qu’est-ce qu’un acide gras insaturé ?
Un acide gras avec une ou plusieurs doubles liaisons, en désordre moins compact.
Quels sont les avantages des triglycérides par rapport aux polysaccharides ?
Ils libèrent plus d’énergie par gramme et par oxydation, et sont hydrophobes.
Qu’est-ce que la béta-oxydation des acides gras ?
Un processus de dégradation des acides gras qui produit des équivalents réducteurs et de l’acétyl-CoA.
Où commence la digestion des protéines chez l’homme ?
Dans l’estomac avec l’action de l’HCl et du pepsinogène.
Quels enzymes du pancréas participent à la digestion des protéines ?
Des zymogènes qui seront activés pour hydrolyser les peptides.
Quelle enzyme est clé dans la régulation de la biosynthèse du cholestérol ?
HMG-CoA réductase.
Quels facteurs régulent la biosynthèse du cholestérol ?
La concentration intracellulaire en cholestérol, le glucagon, et l’insuline.
Quel est le rôle des HDL dans le métabolisme du cholestérol ?
Transport inverse du cholestérol vers le foie.
Quels sont les principaux devenirs du cholestérol hépatique ?
Intégration dans les membranes, synthèse des sels biliaires, sécrétion dans la bile, et exportation sous forme de cholestéryl-esters.
Pourquoi le rapport LDL/HDL est-il important ?
Il devrait être inférieur à 4 pour une bonne santé cardiovasculaire.
Qu’est-ce que la voie anaérobie lactique ?
Une voie métabolique qui produit de l’énergie rapidement sans oxygène, générant du lactate.
Qu’est-ce que la voie aérobie ?
Une voie métabolique qui utilise l’oxygène pour produire de l’énergie à partir des glucides et des lipides.
Quels sont les effets de l’entraînement sur les enzymes métaboliques ?
Augmentation de l’activité enzymatique et de la capacité oxydative des muscles.
Quelle est la fonction des kinases ?
Ajouter un phosphate à une molécule.
Quelle est la fonction des phosphatases ?
Retirer un phosphate d’une molécule.
Qu’est-ce que la coopération entre les sous-unités des protéines oligomériques ?
Interaction entre sous-unités qui affecte l’affinité de l’enzyme pour son substrat.
Qu’est-ce qu’une enzyme allostérique ?
Une enzyme dont l’activité est modulée par la fixation d’une molécule à un site autre que le site actif.
Qu’est-ce qu’une inhibition allostérique ?
Régulation de l’activité enzymatique par la fixation d’un inhibiteur sur un site allostérique.
Sous quelle forme les triglycérides sont-ils transportés dans le sang ?
Principalement sous forme de chylomicrons.
Quels sont les principaux types de transporteurs de cholestérol dans le sang ?
LDL et HDL
Quel est le rôle de l’insuline dans le métabolisme lipidique ?
Stimuler la synthèse des lipides et inhiber leur dégradation.
Quels sont les produits finaux de la glycolyse ?
Pyruvate, ATP et NADH.
Qu’est-ce que le cycle de Krebs ?
Une série de réactions chimiques utilisées par toutes les cellules aérobies pour générer de l’énergie via l’oxydation de l’acétyl-CoA.
Quel est le rôle de l’acétyl-CoA dans le métabolisme énergétique ?
Entrer dans le cycle de Krebs pour produire ATP, CO2 et équivalents réducteurs.
Qu’est-ce que l’oxydation des acides gras ?
La dégradation des acides gras en acétyl-CoA dans les mitochondries pour la production d’énergie.
Qu’est-ce que la lipolyse ?
La dégradation des triglycérides en acides gras et glycérol.
Quelle est la fonction de la myoglobine ?
Stocker et transporter l’oxygène dans les muscles.
Que signifie un Km faible pour l’affinité entre enzyme-substrat
Km faible : forte affinité de l’enzyme pour son substrat
Quels sont les deux principaux homopolysaccharides de réserve et leurs origines ?
L’amidon (graines de plante, céréales) et le glycogène (origine animale).
Quels types de liaisons retrouve-t-on dans l’amidon et le glycogène ?
Liaisons α1 → 4 en linéaire et liaisons α1 → 6 en ramifications.
Quels sont les deux grands types de saccharides constituant l’amidon ?
L’amylose et l’amylopectine.
Quelles sont les caractéristiques de l’amylose ?
Linéaire, provoque peu de désordre, et est donc difficile à digérer.
Quelles sont les caractéristiques de l’amylopéctine ?
Ramifiée, provoque beaucoup de désordre, et est donc facile à digérer.
Quel est le principal homopolysaccharide de structure ?
La cellulose.
Quelle est la structure chimique de la cellulose ?
C’est un polymère de glucose avec des liaisons β1 → 4.
Quelle est la fonction principale de GLUT1 et où est-il exprimé ?
Assure le transport basal du glucose ; ubiquitaire.
Quel est le rôle spécifique de GLUT4 et dans quels tissus est-il exprimé ?
Spécifiquement exprimé dans les muscles squelettiques et le tissu adipeux
Dans quels types de cellules trouve-t-on GLUT2 ?
Exprimé dans les hépatocytes, les entérocytes et les cellules béta du pancréas endocrine.
Quelle est la fonction de GLUT3 et où est-il principalement actif ?
Transport basal du glucose au niveau des neurones.
Quel transporteur de glucose est impliqué dans le co-transport du glucose et du Na+ et où est-il situé ?
SGLT1 ; situé dans les entérocytes.
Combien d’ATP sont consommés pendant la phase préparatoire de la glycolyse ?
2 ATP.
Quel est l’objectif principal de la phase préparatoire dans la glycolyse ?
Préparer les molécules, les exciter et les rendre plus réactionnelles pour former du triose phosphate.
Quelles enzymes de la glycolyse travaillent uniquement dans un sens pendant la phase préparatoire ?
L’hexokinase (étape 1) et la phosphofructokinase-1 (PFK1, étape 3).
Combien d’ATP sont produits pendant la phase de remboursement de la glycolyse ?
4 ATP
Combien de NADH sont produits pendant la phase de remboursement de la glycolyse ?
2 NADH.
Quelles enzymes de la glycolyse travaillent uniquement dans un sens pendant la phase de remboursement ?
La pyruvate kinase (étape 10).
À quelles étapes de la glycolyse sont produits les ATP ?
À l’étape 7 et à l’étape 10.
À quelle étape de la glycolyse sont produits les NADH ?
À l’étape 6
Qu’est-ce que le NADH et quel est son rôle dans la glycolyse ?
Le NADH est un coenzyme qui se fixe sur l’enzyme 6. Il participe à l’oxydation en transportant des équivalents réducteurs.
Quelle est la différence entre la forme oxydée et la forme réduite du NAD+ ?
NAD+ est la forme oxydée, et NADH est la forme réduite.
Quel est le bilan net en ATP de la glycolyse ?
2 ATP (4 ATP produits et 2 ATP consommés).
Quel est le bilan net en NADH de la glycolyse ?
2 NADH
Combien de molécules de pyruvate sont produites par une molécule de glucose à la fin de la glycolyse ?
2 Pyruvates
Quelle est l’étape initiale de la glycolyse et quelle enzyme y est impliquée ?
La phosphorylation du glucose par l’hexokinase.
Quelle est l’importance de la phosphofructokinase-1 (PFK1) dans la régulation de la glycolyse ?
La PFK1 est une enzyme clé de régulation, contrôlant la vitesse de la glycolyse.
Comment se produit l’oxydation du NAD+ en NADH pendant la glycolyse ?
Lorsqu’il se fixe à l’enzyme 6 avec le substrat, le NAD+ accepte 2 équivalents réducteurs pour former du NADH.
Pourquoi la pyruvate kinase ne fonctionne-t-elle que dans un sens pendant la glycolyse ?
Elle catalyse la dernière étape de la glycolyse, convertissant le phosphoénolpyruvate en pyruvate et produisant de l’ATP, ce qui est un processus exergonique irréversible dans les conditions cellulaires.
Quels sont les produits finaux de la glycolyse pour une molécule de glucose ?
2 pyruvates, 2 ATP nets, et 2 NADH.
Quelle est la fonction principale de la glycolyse dans le métabolisme cellulaire ?
Fournir de l’énergie sous forme d’ATP et de NADH, et produire des intermédiaires métaboliques pour d’autres voies biosynthétiques.
Que devient le pyruvate dans les globules rouges ?
Il est converti en lactate car il n’y a pas de mitochondrie dans les globules rouges.
Que se passe-t-il avec le pyruvate dans les muscles en cas d’excès ?
Il est transformé en acide lactique lorsque la capacité d’accueil des mitochondries est dépassée.
Quel est le devenir du pyruvate dans les conditions aérobies ?
Il est transporté dans la mitochondrie et converti en acétyl-CoA par oxydation, avec perte d’un CO2.
Quelle est la destination de l’acétyl-CoA formé à partir du pyruvate ?
Il entre dans le cycle de Krebs.
Quel est le bilan global de l’oxydation complète du glucose en CO2 ?
Tous les carbones du glucose sont convertis en CO2, et tous les équivalents réducteurs possibles sont arrachés, donc le glucose est oxydé au maximum.
Comment le fructose est-il métabolisé dans le foie ?
Il est converti en trioses phosphates (glycéraldéhyde-3-phosphate).
Comment le tréhalose entre-t-il dans la glycolyse ?
Il est converti en deux molécules de glucose.
Comment le lactose entre-t-il dans la glycolyse ?
Il est hydrolysé par la lactase en glucose et galactose.
Comment le galactose entre-t-il dans la glycolyse ?
Il est converti en glucose-1-phosphate via des enzymes particulières.
Qu’est-ce que le glucose-1-phosphate et comment est-il formé sans consommation d’ATP ?
C’est un intermédiaire glycolytique formé en incorporant un phosphate inorganique sans consommer d’ATP.
Combien d’ATP sont consommés lors de la conversion du fructose-6-phosphate en fructose 1,6-bisphosphate ?
1 ATP
Quel est le rendement net en ATP à partir du glycogène de réserve hépatique ou musculaire ?
3 ATP.
Quel est le rendement net en ATP à partir du glycogène alimentaire
2 ATP
Quel est l’effet des ADP et AMP sur la PFK-1 ?
ADP et AMP agissent comme stimulateurs allostériques, levant l’inhibition exercée par l’ATP.
Quel est le rôle du citrate dans la régulation de la PFK-1 ?
Le citrate augmente l’effet inhibiteur de l’ATP sur la PFK-1.
Quels sont les inhibiteurs allostériques de la PFK-1 ?
ATP et citrate.
Quels sont les stimulateurs allostériques de la PFK-1 ?
ADP, AMP et fructose-2,6-bisphosphate (F2,6BP).
Pourquoi l’ATP inhibe-t-il la PFK-1 ?
Parce qu’une concentration élevée d’ATP indique que la cellule a suffisamment d’énergie et n’a pas besoin d’accélérer la glycolyse.
Comment le fructose-2,6-bisphosphate affecte-t-il la PFK-1 ?
Il augmente l’affinité de la PFK-1 pour le fructose-6-phosphate (F6P) et réduit son affinité pour les inhibiteurs allostériques ATP et citrate.
Pourquoi l’AMP inhibe-t-il la FBPase-1 ?
Parce que l’AMP signale un manque d’énergie dans la cellule, indiquant qu’il n’est pas opportun de fabriquer du glucose frais via la gluconéogenèse.
Comment la glycolyse et la gluconéogenèse sont-elles régulées de manière coordonnée et réciproque ?
PFK-1 (glycolyse) est activée par des signaux de faible énergie (ADP, AMP), tandis que FBPase-1 (gluconéogenèse) est inhibée par ces mêmes signaux, coordonnant ainsi les deux voies pour répondre aux besoins énergétiques de la cellule.
Quel est le rôle du fructose-2,6-bisphosphate dans la régulation de la glycolyse et de la gluconéogenèse ?
Il stimule la glycolyse en activant la PFK-1 et inhibe la gluconéogenèse en inhibant la FBPase-1.
Comment le fructose-2,6-bisphosphate affecte-t-il l’affinité de la PFK-1 pour ses substrats et inhibiteurs ?
Il augmente l’affinité de la PFK-1 pour le F6P et réduit l’affinité pour les inhibiteurs allostériques ATP et citrate.
Quelles enzymes régulent la concentration de fructose-2,6-bisphosphate ?
Phosphofructokinase-2 (PFK-2) et fructose bisphosphatase-2 (FBPase-2).
Comment les activités enzymatiques de PFK-2 et FBPase-2 sont-elles régulées ?
Par la phosphorylation et la déphosphorylation. PFK-2 est active lorsqu’elle est déphosphorylée, et FBPase-2 est active lorsqu’elle est phosphorylée.
Quel est l’effet de l’insuline sur PFK-2 et FBPase-2 ?
L’insuline stimule une phosphatase qui déphosphoryle PFK-2, l’activant et augmentant la concentration de fructose-2,6-bisphosphate, ce qui stimule la glycolyse.
Quel est l’effet du glucagon sur PFK-2 et FBPase-2 ?
Le glucagon augmente l’AMP cyclique (AMPc) qui active une protéine kinase, phosphorylant PFK-2 et activant FBPase-2, ce qui favorise la gluconéogenèse.
Comment le xylulose-5-phosphate influence-t-il la glycolyse après un repas riche en hydrates de carbone ?
Il stimule la phosphoprotéine phosphatase 2A, qui active la PFK-2, augmentant ainsi le fructose-2,6-bisphosphate et stimulant la glycolyse.
Par quoi est régulé la forme hépatique de la pyruvate kinase?
Le glucagon
Comment sont synthétisés les acides gras plus longs à partir du palmitate?
Les acides gras plus longs sont synthétisés à partir du palmitate par des élongases et des désaturases.
Où se fait l’élongation des acides gras saturés (SFA)?
L’élongation des acides gras saturés (SFA) se fait dans le réticulum endoplasmique (RE) ou dans la mitochondrie.
Quelle est l’action de la D-9 désaturase sur les acides gras monoinsaturés (MUFA)?
La D-9 désaturase (fatty acyl-CoA désaturase) permet une double liaison entre le carbone 9 et le carbone 10 des acides gras monoinsaturés (MUFA).
Quels sont les produits obtenus à partir du palmitate par une désaturase?
À partir du palmitate, on peut obtenir du stéarate par une élongase, de l’oléate par une désaturase, ainsi qu’une autre série d’acides gras par une élongase et du palmitoléate par une désaturase.
Quels sont les produits obtenus à partir du linoléate par désaturation et élongation?
À partir du linoléate, on peut obtenir du gamma-linolénate par désaturation et de l’eicosatriénoate par élongation, puis de l’arachidonate par désaturation.
Pourquoi est-il nécessaire de trouver le linoléate et l’alpha-linolénate dans notre alimentation?
Le linoléate et l’alpha-linolénate sont des acides gras essentiels que nous devons obtenir de notre alimentation car notre organisme ne peut les synthétiser et ils sont indispensables pour notre fonctionnement.
Quels sont les trois grands précurseurs des acides gras?
Les trois grands précurseurs des acides gras sont l’acide oléique (W-9), l’acide linoléique (W-6), et l’acide alpha-linolénique (W-3).
Quelle est l’importance de l’oléate dans la synthèse des acides gras?
L’oléate est un précurseur des acides gras de la série W-9.
Comment la synthèse de DHA est-elle stimulée chez les femmes?
La synthèse de DHA est stimulée par les œstrogènes chez les femmes.
Quel est le rôle du DHA dans le développement cérébral et de la rétine?
Le DHA est important pour le développement cérébral, de la rétine, et des spermatozoïdes. Il est présent dans les produits de la mer.
Quelles sont les propriétés des eicosanoïdes cycliques?
Les eicosanoïdes cycliques ont des propriétés de type hormonal et des effets physiologiques importants à très faible concentration.
Quels sont les précurseurs des eicosanoïdes?
Les précurseurs des eicosanoïdes sont principalement l’acide arachidonique, l’acide eicosapentaénoïque, et l’acide eicosatriénoïque.
Quels sont les principaux effets physiologiques des prostaglandines?
Les prostaglandines ont des propriétés telles que la stimulation des contractions utérines et la diminution de la pression sanguine.
Quel est le principal précurseur des eicosanoïdes chez l’humain?
Le principal précurseur des eicosanoïdes chez l’humain est l’acide arachidonique.
Comment les corticostéroïdes agissent-ils sur la phospholipase A2?
Les corticostéroïdes inhibent la phospholipase A2, ce qui explique leur action anti-inflammatoire.
Quels sont les effets de l’aspirine et de l’ibuprofène sur la COX?
L’aspirine et l’ibuprofène inhibent la COX, l’enzyme responsable de la synthèse des prostaglandines.
Quelle est la voie de synthèse des leucotriènes?
La synthèse des leucotriènes se fait via une voie impliquant une lipoxygénase.
Quels sont les rôles des leucotriènes dans l’organisme?
Les leucotriènes sont des médiateurs de réactions inflammatoires et allergiques, impliqués dans la contraction des muscles lisses et l’augmentation de la sécrétion de mucus.
Comment se fait la synthèse des triglycérides et des glycérophospholipides?
La synthèse des triglycérides et des glycérophospholipides se fait à partir de glycérol-3-P et d’acyl-CoA.
Quels sont les enzymes impliquées dans la synthèse des triglycérides et des glycérophospholipides?
Les enzymes impliquées dans la synthèse des triglycérides et des glycérophospholipides sont l’acide phosphatidique phosphatase et l’acyl transférase.
Saccharose = … + …
Glucose + fructose
Lactose= … + …
Glucose + galactose
