biocell cours 3

Question 1

Comment on organise les prot dans la cellule ?

Answer 1

o l’énergie (transport actif)
o l’étiquette (peptide signal et parfois sucre)
o destination (récepteur)

Question 2

Explique l’importation

Answer 2

karyophérine lié à ran-gtp avec gap active gtpase on perd un p donc ran-gtp pars et prot se lie (prot à importer) une fois prot importé sur k ds noyau= GEF permet détachement prot et liaison ran-GTP(noyau)

Question 3

c’est quoi un compartiment cellulaire ?

Answer 3

compartiments délimités par des membranes.

Question 4

Selon le cas, que doivent franchir les protéines?

Answer 4

-un pore formé d’un gros complexe protéique (CPN)
-une membrane (RER, peroxysome)
- deux membranes (mitochondrie et chloroplaste).
- sortir de la cellule (voie de sécrétion).

Question 5

Quel est le chemin des protéines ? (en gros)

Answer 5

La synthèse protéique (traduction) commence toujours dans le cytoplasme et, par la suite, les protéines doivent trouver leur chemin (pr sortir au bon endroit)

Question 6

Qu’est ce qui différencient les organites ?

Answer 6

le nb de membranes qui les entourent cela
impacte sur le type de mécanisme de passage des protéines vers ces organites

Question 7

Particularités de l’enveloppe nucléaire du noyau

Answer 7

2 membranes et 1 espace intermembranaire (continuité avec lumière RER). Les pores nucléaires permettent une continuité entre nucléoplasme (intérieur du noyau)et cytoplasme : les protéines autorisées peuvent passer de part et d’autre ( sous certaines conditions)

Question 8

Hypothèse sur la naissance du RE

Answer 8

l’invagination de la membrane plasmique

Question 9

à quoi sert le CPN et le transport nucléaire se fait comment ?

Answer 9

bidirectionnel à travers pores nucléaires. Ces derniers ont un centre protéique qui fait varier la taille de l’ouverture.

Question 10

Comment sont transporté les petites et les grosses protéines ?

Answer 10

petites: 9 nm de diamètre et facilement passer (diffuser) à travers le pore diffusion simple (transport passif).
Grosses: besoin énergie t.actif 9nm- 40 nm de diamètre ( grosses prot et s-u ribosomales)

Question 11

Signal d’importation c’est quoi?

Answer 11

Signal de Localisation Nucléaire (SLN) est nécessaire pour
entrer dans le noyau par le t.actif. Ce signal est un petit peptide avec une forte charge + située dans la protéine

Question 12

Signal d’exportation c’est quoi?

Answer 12

Un Signal d’Exportation Nucléaire (SEN) pour sortir du noyau. Il s’agit d’une hélice α amphiphile avec plusieurs résidus Leucine (la partie hydrophobe).

Question 13

Quels récepteurs permettent de se lier au SEN, lier au SLN?

Answer 13

karyophérines lie avec SEN ou SLN et transportent les prot à travers les pores+ ont la capacité
d’ouvrir le CPN davantage:
SLN (karyophérines importines)
SEN (karyophérines exportines)

Question 14

Sites de liaison de la karyophérine ?

Answer 14

2 sites
o 1 pour le signal (SLN ou SEN), situé sur la
prot à importer ou exporter
o 1 pour la Ran-GTP (GTPase monomérique de la
famille Ras).

Question 15

C’est quoi CPN et ses différentes parties ?

Answer 15

Le complexe du pore nucléaire (CPN) structure modulaire construite à partir des nucléoporines (Nups).

o Poms (Pore Membrane proteins, en bleu) : ancrent
CPN dans enveloppe nucléaire
o Nups de liaison (Linker Nups, en vert) : relient les
deux anneaux (rose et jaune)
o Nups asymétriques : attachées aux deux anneaux (les
filaments et le panier)
o FG Nups (Phenylalanine-Glycine Rich repeat
containing nups , en violet) : forment le canal central
et interagissent avec les karyophérines

Question 16

Quels sont les membres de la famille RAS et comment fonctionne les RAS

Answer 16

Membres de la famille RASEF-Tu, EF-G = Traduction
Ran = Transport dans le noyauRab, Arf, Sar = Transport vésiculaire
La structure RAS-GTP interagit avec d’autres prot et a une activité de GTPase en présence de la prot GAP.
o Le GDP qui résulte de l’hydrolyse est libérée à l’aide d’une autre prot ,
une GEF (change GDP en GTP).

Question 17

importines?

Answer 17

peuvent lier Ran-GTP et SLN :
- Les 2 liaisons sont mutuellement exclusives: La c exploite cette propriété en
favorisant la Ran-GDP dans cytoplasme
Ran-GTP dans le noyau.

Question 18

Comment est régulé les proportions de Ran-GTP et de Ran-GDP

Answer 18

La proportion de Ran-GTP et Ran-GDP dépend des activités
de GAP (hydrolyse de GTP) et GEF (facteur d’échange).

Question 19

comment exportines lient les signal SEN et Ran-GTP?

Answer 19

lient le signal SEN et Ran-GTP en même temps.

Question 20

Voies alternatives de transport ?

Answer 20

A ≡ Modèle de diffusion-rétention
B ≡ Modèle du facteur de transport
C ≡ Modèle de séquence signal
D ≡ Modèle médié par la vésicule

Question 21

Comment se déroule l’importation des protéines

Answer 21

L’exportine lie le signal SEN (protéine à exporter) + Ran-GTP et ds le cytosol on libère après que gap ait hydrolysé GTP=GDP et dissocié complexe

Question 22

Comment le transport des protéines à travers les mc et les chloroplastes est particulier ?

Answer 22

On traverse 2 membranes; pas de pores assez grands pour laisser passer les prot tridimensionnelles.
Soit garde en structure primaire ou on dénature (déroule les prots)
il faut étiquette, un ou des récepteurs et énergie.

Question 23

Comment les récepteurs et les translocateurs opèrent ensembles ?

Answer 23

sous forme de complexes TOM: transport outer membrane TIM: transport inner membrane

Question 23

Quel est le signaux le plus commun dans les mitochondries?

Answer 23

une série de a.a en N terminal du précurseur (future protéine MC) formant hélice α amphiphile (hydrophobe & chargé +). La partie hydrophobe reconnue par un récepteur sur la membrane externe

Question 24

Comment se fait l’importation des protéines mitochondriales ?

Answer 24

1.Récepteur (fait partie de TOM) passe le signal au translocateur
2. prot rentrent qd chaperones (Hsp70 cystoliques) hydrolysent ATP
3. Tom transfert signal à TIM qui fait passer les prot dans la matrice
4. Le signal est coupé

Question 25

Qu’est-ce qui arrivent après l’incorporation des protéines mitochondriales à l’endroit désiré ?

Answer 25

le peptide signal (hélice α en N-terminal) est coupé par peptidases. Si signaux internes, ces derniers ne sont pas coupés

Question 26

Comment se fait l’importation des protéines chloplastiques?

Answer 26

mêmes principes que MC mais les protéines sont différentes
TOC = Transport Outer Chloroplaste
TIC = Transport Inner Chloroplaste
Dans les choroplastes il y a une 3e membrane (thylakoïdes) donc un signal supplémentaire

Question 27

Comment sont reconnues les protéines avec les chaperones Hsp70 et celles qui n’en n’ont pas ?

Answer 27

a) avec chaperone: Hsp 70 reconnue par s-u TOM
b) helice alpha amphiphile reconnue par TOM