Bio Cell Examen 2 Flashcards
Dans le noyau on retrouve (4):
- Les chromosomes (chromatine en interphase)
- Un ou plusieurs nucléoles
- Nucléoplasme
- Matrice nucléaire (réseau fibrillaire riche en protéines)
Quelles bases sont des purines et quelles bases sont des pyrimidines?
Purines:
- Adénine et Guanine
Pyrimidines:
- Thymine et Cytosine
Quelle type de liaison maintient les deux brins ensembles (intéraction entre les bases)?
Des ponts hydrogènes
Quelles bases ont une complémentarité Watson-Crick ensemble?
Adénine est complémentaire au Tyrosine
Cytosine est complémentaire au Guanine
Rôle de l’ADN
stoquer l’information génétique
Que veut dire “exprimer les gènes”?
Contrôle l’activité de la cellule par régulation de la transcription et traduction
Quelle sont les 4 étapes nécessaires pour passer de l’ADN à une protéine
ADN→préARN→ARNm→Protéines
so…
1. transcription
2. maturation
3. traduction
Définition d’un génome
totalité de l’information génétique (ADN) d’une cellule/organisme
Définition d’un protéome
Ensemble des protéines produites à partir de l’expression des gènes d’un génome
C’est quoi un gène?
une section de l’ADN qui contient de l’information qui code pour une protéine.
Définition d’une chromosome:
Molécule d’ADNdb associé à des protéines
Définition du chromatine:
Ensemble de l’ADN associée aux protéines de compactage
Chromosome vs chromatine
Chromosome est une niveau de compaction plus élevée que la chromatine
Définition de chromosomes homologues
Paire de chromosomes d’un même type chez une cellule diploïde.
(un de la mère, l’autre du père.)
qu’appelle-t-on une partie de la génome qui régule l’expression
une région régulatrice (promoteur)
est-ce que le nombre de chromosomes est constante pour chaque espèce?
Non
C’est quoi l’interphase
C’est la phase de repos, ou on n’a pas de mitose
C’est quoi la réplication de l’ADN?
Formation d’un nouveau brin d’ADN double brin en se basant sur de l’ADN existante
dans quelle sens est-ce que l’ADN polymérase lit-il?
5’ vers 3’
Lors de la réplication d’ADN, c’est quoi le Brin avancé vs Brin retardé
Dû au fait que la synthèse du nouveau brin se fait de 5’ vers 3’. Lors de la réplication de l’ADN, on a deux brins antiparallèles. On doit faire la synthèse graduellement au fur et a mesure que l’hélicase ouvre la fourche de réplication.
Il y aura toujours un brin qui va être synthétisé dans le sens de l’ouverture de la fourche (brin avancé) et un brin qui est synthétisé dans le sens inverse qui doit utiliser des fragments réguliers (brin retardé).
Rôle de la Topoisomérase lors de la réplication de l’ADN
Il relâche la tension produit par l’ouverture de la fourche de réplication
Rôle de la Primase lors de la réplication de l’ADN
Synthétiser un amorce d’ARN qui donne l’ADN polymérase un point de départ
Rôle de l’hélicase lors de la réplication de l’ADN
Il va ouvrir la fourche de réplication (sépare la double hélice)
C’est quoi la centromère?
Séquence d’ADN de 171 paires de bases répétées en tandem qui maintient ensemble les chromatides soeurs
Le noyau est formé de combien de membranes et quelle est ses 2 rôles?
deux,
Leur roles:
- Empêche le passage des ions et des molécules
- Membrane interne unie à la lame nucléaire (support structural)
Que nomme-t-on les protéines qui traversent la double membrane du noyau qui permettent les échanges entre le noyau et le cytoplasme?
Les pores nucléaires
donner la structure et la rôle d’un histone
L’histone est une protéine qui condense l’ADN autour de lui. Il est un octamère qui contient…
- 2 sous unités H2A
- 2 sous unités H2B
- 2 sous unités H3
- 2 sous unités H4
(Ainsi que le sous-unité H1 qui n’est pas inclut dans l’octamère. Son rôle est de maintenir le tout ensemble.)
C’est quoi une nucléosome :
un histone avec de l’ADN entouré
C’est quoi la chromatine :
l’ensmble d’ADN et de protéines associées (collier de perles)
Hétérochromatine vs Euchromatine
Hétérochromatine : section contenant très peu de gènes très denses.
Euchromatine : Grande montant de gènes moins denses
comment condensé est la chromosome?
ex: Condensation de x fois
Condensation de 10 000 fois
Nommer les niveaux d’organisation de l’ADN (8)
- ADN libre
- Nucléosome
- Chromatine
- Filament de 30nm (solénoïde)
- formation de boucle avec condensine
- Euchromatine ou Hétérochromatine
- Chromatide
- Chromosome
c’est quoi une chromatide?
la demi d’une chromosome
Entre l’Euchromatine et l’Hétérochromatine, quelle est plus actif au niveau de la transcription et pourquoi?
L’hétérochromatine est dense et inaccessible aux facteurs de transcription, elle est donc silencieuse sur le plan de la transcription.
L’euchromatine est moins condensée, plus accessible pour les facteurs de transcriptions et donc, plus active sur le plan de la transcription.
Que fait le complexe de remodelage?
Il rend l’ADN accessible pour l’expression des gènes à l’aide de l’ATP.
Quelles acides aminées retrouve-t-on en grande quantité dans les histones? (2)
Arginine et Lysine
Que-fait la Méthylation, l’Acétylation et la Phosphorylation des histones
Méthylation : compacte plus la chromatine
Acétylation/Phosphorylation: Décondense le chromatine à cause que le phosphate et l’acétyl ont une charge négatif comme l’ADN (donc, les charges vont se reposser et s’éloigner)
Ou retrouve-t-on l’hétérochromatine sur une chromosome
Généralement proche des télomères et de la centromère.
pourqoui est-ce que l’Hétérochromatine est dite “pauvre en gènes”
La grande majorité de sa séquence consiste des répétitions
plus l’adn est méthylé, _____ qu’il est exprimé
a.plus
b.moins
moins qu’il est exprimé
pas de CRISPR sur l’examen
cool
cohésine vs condensine?
- cohésine maintient les chromatides ensemble au niveau du centromère
- condensine compacte l’ADN pour former les boucle de 30 nm
Est-ce que la niveau de compaction change selon le phase de mitose/interphase?
- moins compacte pendant l’interphase pour l’expression
C’est quoi une télomère
Segments répétés des extrémités des chromosomes, utile pour la protection des nucléases.
Ces segments raptissent à chaque division.
C’est quoi le rôle de la paroi cellulaire chez les plantes? (2)
- Protection
- Source de signaux qui modifient les activités des cellules
Lamelle centrale (végétale), what is that?
un tas de polysaccharides (mostly pectine), entre les parois des cellules végétales adjacentes
Qu’est-ce que la Paroi cellulaire primaire (végétale) est formé de?
Fait de mostly le cellulose,
et de protéines: kinases et expansines
Qu’est-ce que la Paroi cellulaire secondaire (végétale) est formé de?
formé d’un réseau de lignine
Quelle enzyme va catalyser la synthèse de cellulose (végétale)?
Cellulose synthétase
Quelle shape est la cellulose synthétase (végétale)?
shape de rosette
Trois protéines de la matrice extracellulaire:
Fibronectine, collagène, laminine
C’est quoi une integrine?
C’est un récepteur d’adhésion cellulaire sur le membrane d’une cellule
C’est quoi une protéoglycane
Complexes protéines-polysaccharides
chaine peptidique avec un tas de ramifications de polysaccharides
Collagène, :
3 chaînes (α) qui forment une triple hélice
combien de types de collagène?
27 types
Le collagène est retrouvé uniquement dans la ______________
matrice extracellulaire
Quelles protéines de la collagène sont souvent hydroxylées?
Pro et Lys
Quelle type de liaison stabilise la collagène?
pont H
L’acide ascorbique est aussi connu sous le nom de ___
Vitamine C
C’est quoi le scorbut?
Carence en Vitamine C.
Le vitamine C est essentiel à l’hydroxylation de la collagène
Nommez deux autres structures du corps humain qui utilise le collagène
Les tendons(structure en parallèle)
Le cornée(structure stratifiée)
Structure du Laminine
Glycoprotéines extracellulaires formées de 3 chaînes polypeptidiques reliées par des liaisons disulfures
(15 types)
Composant majoritaire de la lame basale
Laminine
C’est quoi la Fibronectine?
Une protéine qui relie la cellule aux composantes de la matrice extracellualire, permettant la communication entre ces deux.
Donne le structure de l’integrine
Protéine intrinsèque qui peut prendre deux conformations
Courbée ou Droite
Qu’est-ce qui va dire à l’integrine de changer de conformation
l’intégrine va changer de conformation quand il est activé par la liaison à d’autres molécules, soit dans son extrémité cytosolique ou son extrémité extracellulaire.
Sous quelle forme est-ce que l’intégrine est active, courbée ou droite?
Forme droite = activé et capable d’intéragir avec le matrice extracellulaire
Forme courbée= inactivé et incapable d’intéragir avec le matrice extracellulaire
Quelle acide va réunir les protéoglycanes?
l’acide hyaluronique
Que sont les métalloprotéinases? Nommer ses 3 rôles
Des enzymes qui sont activé en présences de métal qui vont dégrader la matrice extracellulaire.
- un rôle dans la prolifération et la différenciation des cellules qui leur sont associées
- un rôle de signalisation entre la cellule et son environnement immédiat.
- un rôle crucial dans les migrations cellulaires
À quelles cellules est-ce que la membrane basale va se lier?
C’est une composant de la matrice extracellulaire qui supporte les cellules épithéliaux, adipeuses, musculaires, et endothéliales(vaisseaux sanguins)
Quel sont les 5 rôles de la membrane basale?
- Support mécanique
- À l’origine des signaux de la survie des cellules
- Substrat pour la migration des cellules
- Séparent les tissus
- S’opposent au passage des macromolécules
Fonction du jonction serrée:
Scelle ensemble les cellules voisines dans un feuillet épithélial pour prévenir les fuites de molécules entre elles
Fonction du Jonction adhérente:
Unit un faisceau d’actine d’une cellule à un faisceau similaire d’une cellule voisine
Basically, il wrap les cellules qui sont de nature épithéliaux afin de lier les cellules ensemble.
Fonction du Desomosome:
Réunit les filaments intermédiaires d’une cellule à ceux de sa voisine
Fonction du jonction communicante:
Forme des canaux permettant le passage des petites molécules et des ions hydrosolubles dans le cytosol
fonction du hémidesmosome
Fixent les filaments intermédiaires d’une cellule à la membrane basale
Quelles deux protéine vont constituer les jonctions serrées
Mostly les claudines and some occludine
Les jonctions adhérantes sont formé de quelle protéine?
Des cadhérines
Quelle ion doit se lier aux cadhérines (jonctions adhérantes) afin de d’attacher à des autres cellules?
Le Calcium
Qu’est-ce qui va arriver à une cellule suivant le détachement de la membrane basale?
Vu que la membrane basale est résponsable pour dire au cellule de continuer à survivre, il va déclencher l’apoptose afin de défavoriser la métastase.
Que-font les CATÉNINES?
Ils se fixent les CADHÉRINES au cytosquelette pour permettre sa communication entre la cytoplasme
Différence entre desmosomes et jonctions adhérantes (2 grandes différences)
Jonctions adhérantes relient les filaments intermédiares
Desmosomes relient les fibres d’actine
Jonctions adhérantes font le tour du cellule
Desmosomes sont plutôt dans des points
Similarités entre desmosomes et jonctions adhérantes (2 grandes similitudes)
Ils connectent la cytosquelette d’une cellule à l’autre
Ils sont constitué de cadhérines (but different cadhérines)
Comment différencient les hémidesmosomes des regular desmosomes
desmosome : lie les cellules aux cellules avec des cadhérines.
hémidesmosome : lie les cellules à la lame basaleé avec des intégrines.
Les jonctions communicantes sont composées de quelles protéines?
la connexine
Quelle type de jonction cellulaire comprende les nanotubules en tunnel chez les neuroendocrines?
Des jonctions communicantes
Quelle jonction est unique aux cellules végétales?
1.Nom
2.Fonction
1.Les plasmodesmes
2.Traverser le paroi cellulaire afin de connecter deux cellules. Cette jonction est capable de se dilater
Centrifugation différentielle
vs
Centrifugation en gradient de densité
Centrifugation différentielle:
- Séparation des particules en fonction de leurs tailles
Centrifugation en gradient de densité
- Séparation de particules de tailles semblables en fonction de leurs densités
Protéome vs Protéomique
Protéome:
- Ensemble de toutes les protéines présentes dans un organisme, un tissu, une cellule ou un organite particulier.
Protéomique:
- Étude de l’ensemble des protéines formant un protéome.
Que fait le RE?
Synthèse commune de lipides et cholestérol
qu’appelle-ton les Saccules aplaties interconnectées du RER?
Les citernes
à quelle organite se colle le RE
le noyau
Qu’est-ce que la REL synthétise?(1)
Synthèse d’hormones stéroïdes
Qu’est-ce que la RER synthétise? (4)
- Protéines membranaires
- Protéines de sécrétion
- Chaînes hydrocarbonées
- Phospholipides
trois méthodes d’importation de protéines dans les organites
- TRANSPORT PAR LES PORES NUCLÉAIRES
- TRANSPORT À L’AIDE DE PROTÉINES DE TRANSLOCATION
- TRANSPORT PAR VÉSICULES
Comment est-ce que les protéines savent quelle compartiment qu’ils sont destinées pour?
Ils ont une séquence signal qui va leur dire
Donner un exemple de protéines qui vont avoir la séquence de signal pour entrer dans le noyau?
Les histones, les polymérases, facteurs de transcriptions
Par quel bias est-ce que les protéines vont rentrer dans le noyau?
Les pores nucléaires
que font les importines
Ils vont accompagner les protéines du cytoplasme au noyau
que font les exportines?
Ils vont accompagner les protéines du noyau au
cytoplasme
Qu’est-ce qui va fournir l’énergie necessiare à la transport nucléaire?
Le GTP
C’est quoi le rôle du Ran-GTP
Quand il est fixé à l’importine, il va libérer la protéine “cargo” qu’il portait.
Nomme les 4 étapes de la fonctionnement de l’importine
- L’importine se fixe à son protéine “cargo”
2.Traverse de la membrane nucléaire (on est dans le noyau) - Ran-GTP se colle à l’intégrine afin de libérer la protéine “cargo”
- retour à l’extérieur de la noyau et hydrolyse de Ran-GTP
Comment est-ce que les protéines vont entrer dans le mitochondrie/chloroplaste?
Il va se déplier
Il va rentrer via
Il va se replier et perdre son séquence de signal
Quelles types de protéines sont synthétiser au niveau des ribosomes du RER
- Protéines de sécrétion
- Protéines membranaires intrinsèques
- Protéines solubles résidant dans le RE, complexe de Golgi, lysosome, endosomes, vésicules et vacuoles des plantes
Quelles types de protéines sont synthétiser au niveau des ribosomes du RER
- Protéines libérées dans le cytosol
- Enzymes de la glycolyse
- Protéines du cytosquelette
- Protéines périphériques de la surface interne de la membrane plasmique
- Protéines transportées vers le noyau (facteurs de transcription)
- Protéines incorporées aux peroxysomes, chloroplastes et mitochondries
ou est-ce que les protéines qui sont synthétisé sur le RER vont être libéré?
dans la lumière du RE
Ou
Ils vont rester poingé dans la membrane du RE comme protéine transmembranaire
quelle protéines vont déplacer les vésicules de transport
les protéines motrices
those ones that be W A L K I N on the microtubules
ou est-ce que les vésicules sont produits
le RE ou le golgi
portion cis du golgi pointe vers le _____
RE/noyau
portion cis du golgi pointe vers le _____
Membrane plasmique
Comment se-fait la bourgeonnement (formation de vésicules)
- les molécules qui vont être inclut dans la vésicule vont se lier sur les récépteurs dans la face interne de la membrane.
- la complexe adaptine-clathrine vont entourer la partie du membrane qui va devenir la vésicule
- La dynamine va cliver et séparer le vésicule de la membrane.
4.finalement, les clathrines et les adpatines vont se dissocier du vésicule
C’est quoi l’arrimage d’un vésicule
C’est quand une vésicule dans le cytosol rencontre sa membrane cible afin de lui donner son cargo.
La membrane du vésicule va fusionner avec la membrane cible.
Ceci est facilité par les protéines SNARE, the vésicule has one and the membrane has one and they kinda hold hands and then they’re able to fuse after that
exemple de modification covalente dans le RE
Glycosylation
Que-font les protéines chaperones
Ils vont empècher les protéines malrepliées à sortir du RE
ou se fait la glycosylation des protéines et des lipides?
Le golgi
V ou F
Le coté trans de l’appareil de golgi a des différentes enzymes que le coté cis de l’appareil de golgi.
Vrai, c’est le facteur qui va déterminer la séquence en sucres
Endocytose définition:
Incorporation de matériel dans une cellule par invagination de la membrane plasmique.
Pinocytose vs Phagocytose
Le pinocytose laisse entrer des matériaux solubles (liquides) de l’environnement
Le phagocytose englobe plutôt des matériaux particulaires de l’environnement
c’‘est quoi une phagosome
C’est une vésicule qui entre dans le cellule de l’extérieur. Celle-ci peut fusionner avec une lysosome pour former un phagolysosome qui digère le contenu des phagosomes
C’est quoi la différence entre l’exocytose constitutive et l’exocytose régulée
l’exocytose constitutive n’est pas régulée
c’est quoi la transcytose?
Transfert d’une cargaison d’un espace
extracellulaire à un autre
Pourquoi les lysosomes ont des contenues acides?
Leurs H+ATPases sur leurs membranes
Cette acidité permet aux enzymes à l’intérieur à worker à leur pH optimale.
pourquoi est-ce que quand un lysosome brise dans le cellule, les enzymes du lysyome ne vont pas dégrader la cellule?
Quand un lysosome brise, l’acidité du lysosome fusionne avec l’acidité du cellule. Ceci va stabiliser à pH~7. Les enzymes sont fonctionnel à un pH plus acide (4,6)
C’est quoi l’Autophagie:
c’est quand un lysosome fusionne avec la membrane d’un lysosome
Quand est-ce qu’on effectue l’autophagie
après la lysosome fusionne avec un phagosome/organite à membrane
C’est quoi le rôle des cavéoles
ils sont impliquée dans la transcytose sans faire repère aux endosomes/lysosomes.
Legit une portion du membrane plasmique turned into a vésicule
Quelles ARNs est-ce que l’ARN pol I va synthétiser?
Grands ARN
Quelles ARNs est-ce que l’ARN pol II va synthétiser?
ARNm, most ARN nucléaires, miARN et ARN du télomérase
Quelles ARNs est-ce que l’ARN pol III va synthétiser?
Petits ARN, comme les ARNt, ARNr et ARNsn
L’ARN pol IV est seulement retorouvé chez les cellules __1__ et ils synthétisent les ARN __2__
- végétales
- Les ARNsi (small interfering ARN)
Que-font les ARNm?
ils codent pour des protéines
Les ARNr font quoi?
ils font partie des ribosomes. Ils catalysant la synthèse des protéines
Que-font les miARNs
Ils se fixent aux ARNm afin d’inhiber leur traduction
Que-font les ARNt
Ils amène les AAs au ribosome pour apparier l’AA au séquence d’ADN.
Que font les facteurs de transcriptions
ils régulent la transcription
Quelles sont les deux classes de facteur de transcription?
Deux classes
- Facteurs généraux de transcription
- Facteurs spécifiques de transcription
Est-ce que tout les facteurs de transcriptions activent la transcription?
Non, on peut avoir à la fois des activateurs et des répresseurs
C’est quoi la boite TATA?
qu’est-ce qu’il fait?
C’est une séquence promoteur pour l’ARNpol II en amont de la site d’initiation
Que fait e TFIID (facteur de transcription)
La sous unité TBF(TATA binding factor) va reconnaître la boîte TATA afin d’aider l’ARN pol II de transcrire la bonne séquence.
Qu’est-ce qu’est un région amplificatrice “enhancer”?
ils favorisent la recrutement des FTs
Quel est l’intérêt des introns?
Protection contre les mutations qui peuvent être néfastes
si on a un mutation chez un organisme sans introns, il va 100% muter sur une séquence qui code pour une protéine
C’est quoi une splicososme?
une complexe protéique avec des RNPsn qui catalyse l’épissage
de quoi est formé l’RNPsn
formés de ARNsn et protéines
épissage alternatif
you know what it is
role du pore nucléaire dans la régulation d’expression des gènes
si on ne laisse pas sortir l’ARN, il ne peut pas être traduit.
si on ne laisse pas les FTs entrer, ils ne vont pas transcrire l’ADN en ARN
combien de codons possibles?
4x4x4=64
codon start
AUG
Codon stop
UAA, UAG et UGA
Structure d’un ARNt
ARN en frome de trefle avec le feuille centrale ayant un anticodon qui va s’apparier au codon de l’ARNm. Le codon code pour l’AA connecté à l’ARNt
quelle enzyme est-ce qui va être utilisé pour unir l’ARNt à son protéine complémentaire?
L’aminoacyl-ARNt synthétase
4 étapes de la traduction:
(initiation)
1.AA1 colle sur Les site P et AA2 se colle au site A
2.Liaison du AA1 au AA2
3.Grand sous-unité décale pour mettre l’AA1 dans le site E et l’AA2 dans le site P
4.Petit sous-unité décale, liaison de l’AA3 dans la site A
((etc.. cest un cycle unitl on arrive au stop))
intérêt des polyribosomes
Big quick traduction POWER!
v ou f
les hormones peuvent modifié l’expression des gènes
vrai
Une cellule différenciée exprime en moyenne __% de l’ensemble de ses gènes
30%
Comment on active la voie de PKC
- Activation du récépteur membranaire par un hormone soluble
- Gaq active la phospholipase C
- Formation de IP3 et DAG à partir de PIP2
- IP3 entraîne la libération cytosolique de calcium
- DAG active la PKC (protéine kinase C (like PKA) )
6 places ou on peut réguler l’expression des gènes
régulation au niveau du…
1.ADN —> préARN
2.préARN —> ARNm
3.sortie de l’ARNm du noyau
4.l’ARNm est dégradé avant le traduction
5.miARN inhibe l’ARNm
6.inactivation de la protéine
