Begreper Flashcards
Evolusjon
Evolusjon er endringer i allelfrekvens over tid/generasjoner
Seleksjon
Seleksjon er en evolusjons mekansime sqom baserer seg ut på at ett allel har bedre relativ fitness en andre og blir dermed selektert for i populasjonen ettersom det gir økt overlevelse og reproduksjon.
Genflyt
Genflyt er også en evolusjonsmekanisme som fører til at populasjoner blir likere genetisk, men kan også gi fordelsaktige allel fra en lokal tilpasset populasjon til en annen som gjør at de kan spesialisere/lokalt tilpasse seg.
Genetisk markør:
En genetisk markør er en gensekvens som er tilknyttet karaktertrekk og brukes til å identifisere individer.
Lokus:
En bestemt plass på genet i arvematerialet.
SNP (single nucleotide polymorphism)
når forskjellen mellom et strekk av DNA hos to ubeslektede individer kun består i at én nukleotid er byttet ut med en annen nukleotid.
I populasjonsgenetikk benyttes ofte SNP-er som markører for å undersøke forskjellen mellom populasjoner, eller for å undersøke evolusjonære prosesser i og mellom populasjoner.
Finnes i synonym og ikke synonym form
Mikrosatelitt
Mikrosatelitt er en gjentagende repiterende DNA sekvens etter hverandre
Alell
Utgave av et gen/ egenskap/fenotypisk trekk
Genotype:
infoen som ligger i DNAet
Haplotype
Rekombinasjon
Skjer under meiosen og skaper utveksling av gener i/ nye kombinasjon av gener i kjønnscellene.
Diploid:
2 kromosomsett
Polyploid:
Flere en 2 kromosomsett
Punktmutasjon
Skjer en endring i DNAet på ett punkt/base. Altså bare en base endres.
Strukturelle mutasjoner
kromsomet får endret struktur som kan ha skjedd gjennom delesjon, translokasjon og inversjon. bit går tapt (delesjon), en bit blir fordoblet, en bit snur seg (inversjon), en bit flytter seg fra ett sted til et annet eller utbytting av deler mellom ulike kromosomer (translokasjon).
Synonyme substitusjoner
Nonsence mutasjon
Non-synonyme substitusjoner
Pleiotropiske effekter
Når et gen virker inn på mer en en egenskap.
Epistasis
effekten av et gen på organismens karaktertrekk (fenotype) er avhengig av hvilke andre gener som er til stede i organismen.
Germ line celler (kjønnscelle)
Ved mutasjoner i kjønnsceller så vil disse kunne nedarves til avkom og dermed bidra til nye egnskaper i populasjonen.
Gameter
Gameter er modne kjønnsceller som egg og sperm.
Evolusjonskrefter
Krefter som bidrar til evolusjon. Dette inkluderer genflyt, seleksjon, drift og mutasjon
Rekombinasjonsrate
Genetisk rekombinasjon, en prosess der genetisk materiale byttes mellom kromosomer under celledelingen og dannelsen av reproduktive celler (sæd- eller eggceller) gjennom meiose. Rekombinasjon bidrar til å generere genetisk variasjon i avkommet.
LD (linkage disequilibrium / koplingsulikevekt)
Koplingsulikevekt oppstår når gener eller markører ligger i nærheten av hverandre på samme kromosom, og de ikke blir segregert uavhengig av hverandre under rekombinasjon. I stedet forventes genetisk materiale i nærliggende regioner å være koblet sammen og overføres sammen i større grad enn forventet.
Naturlig seleksjon
Når det skjer en rettet endring i allelfrekvensen som er knyttet opp mot økt fitness
Fitnesskomponenter:
Fertiliseringssuksess, overlevelse, fekunditet og parringssuksess
Fertiliseringssuksess
Overlevelse:
Fekunditet:
Paringssuksess:
Absolutt fitness:
Relativ fitness:
Fitnessen ett individ opplever sammenlignet/relativ til et annet individ.
Seleksjonskoeffisient (s)
Positiv seleksjon:
Konserverende (purifying) seleksjon:
Selective sweep:
en bestemt genetisk variant eller mutasjon blir raskt utbredt og erstatter andre genetiske varianter i en populasjon. Dette skjer som et resultat av positivt naturlig utvalg, der den genetiske varianten gir en selektiv fordel for individene som bærer den
Overdominans:
når heterozygote individer i en populasjon blir favorisert
Underdominans:
Når homozygote individer i en populasjon blir favorisert.
Frekvensbasert seleksjon:
Fenotypisk varians:
Normalfordeling
Miljøvariasjon:
Kvantitative trekk:
Polygene trek:
Arvbarhet:
Seleksjonsgradient:
Breeders equation:
Retningsbestemt seleksjon:
Stabiliserende seleksjon:
Disruptiv seleksjon:
Adaptivt landskap:
Additiv genetisk variasjon:
Evolusjonære begrensninger (“constaints”):
Genetiske korrelasjoner:
Pleiotropi
Koplingsulikevekt:
Fiksering av allel:
Genetisk divergens mellom populasjoner:
Populasjonsstørrelse (N):
Effektiv populasjonsstørrelse (Ne)
Adaptive valley
Nøytral-teorien
Molekylær klokke
molekyler som brukes til å datere slektskap mellom grupper av organismer, eller tid som er gått fra en gitt hendelse.
Klinal variasjon
Gradvise endringer i egenskaper eller genetiske trekk i en populasjon over et geografisk område. Disse endringene oppstår som et resultat av tilpasning til forskjellige miljøforhold eller habitatvariasjoner over en kontinuerlig geografisk skala.
Migrasjons rate
Migrasjonsraten defineres ved en formel som beskriver hvor mange generasjoneer det vil ta fø den genetiske forskjellen mellom populasjoner forsvinner. Faktorer i formelen er antal migranter, allefrekvensen til populasjonen som de migrerer fra, allelfrekvensen til populasjonen som de migrerer til.
Genetisk differensiering
Isolasjon ved distanse
genetisk mønster som beskriver hvordan genetisk variasjon endres geografisk på grunn av begrenset spredning og genetisk utveksling mellom populasjoner. IBD-modellen antyder at genetisk avstand mellom populasjoner øker proporsjonalt med geografisk avstand. Med andre ord, jo lengre avstand det er mellom to populasjoner, desto større er den genetiske forskjellen mellom dem.
gene swamping
Genetisk oversvømmelse hvor en art blander seg med en annen og danner hybrider, deres genetisk materiale tar litt over i den andre populasjonen. Genetisk flyt ødelegger den lokale tilpasningen i en populasjon.
Spenningssoner (tension zones)
Spenningssoner er soner hvor separerte arter møtes igjen og det kan forekomme hybrider.
Allelfrekvens
Antall ganger et allel forekommer i en populasjon
Additiv genetisk effekt
Den additive genetiske effekten er den arvelige delen av genene. Men hvilke gener som kommer til uttrykk kan påvirkes av dominans og epistasi.
