Bakteriologi: Diagnostiske modaliteter Flashcards
Hvordan kan MRSA diagnosticeres?
- PCR
- MALDI-ToF
- Bakteriologisk dyrkning på Brilliance MRSA2 agar plade.
Er det vigtigt at lave antibiotikafølsomhedstest på multiresistente bakteriestammer?
Ja!
På trods af at mange antibiotika kan være ineffektive imod bakterier som MRSA, så er der forskel imellem stammer på resistens overfor nogle antibiotika.
Hvad er MALDI-ToF?
MALDI-ToF står for Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization Time-of-Flight.
Det er en teknik som tager udgangspunkt i cellekultur af bakterier som blandes med en matrix-substans. Denne matrix opløser cellerne og sætter sig fast på proteiner.
I maskinen får en laser bakterie-matrix blandingen til at fordampe og en mekanisme tæller derefter hvor mange og af hvilken størrelse proteiner med matrixkomponent som flyver forbi. Letteste proteiner først, derefter de største og tungeste.
En graf over dette sammensættes og sammenlignes med en database over kendte bakteriers grafer.
Ideen er, at hver enkel bakteriespecies efterlader en unik graf.
Hvad er PCR og qPCR?
Polymerase Chain Reaction og Quantitative (Real Time) Polymerase Chain Reaction er diagnostiske modaliteter som bygger på at identificere genomisk materiale.
Først foretages en opformering af det genomiske materiale som skal analyseres. Dette gøres sammen med udvalgte primers, som er sammensat efter forventet agens (unik primer for hver bakterie).
På standard PCR udføres en gel-elektroforese og der sammenlignes bånd med en negativ og positiv prøve.
Ved kvantitativ real-time PCR analyserer en maskine antallet af opformerede DNA/RNA strenge via en flouriserende markør.
Hvilke faktorer spiller ind på om en prøve er god eller dårlig?
- At vide hvornår der skal, og hvornår der ikke behøves, at blive foretaget en prøve.
- At opsamle det korrekte testmateriale.
- At bruge den korrekte teknik til at opsamle testmateriale.
- At opbevare sit testmateriale i et passende medium.
- At prøven bliver opbevaret, afsendt og analyseret på den korrekte måde.
Hvor kan man finde oplysninger om hvordan/hvornår prøver tages og behandles korrekt?
- vet.dtu.dk; alle dyr
- vsp.lf.dk; produktionsdyr
- Antibiotikavejledningen til familiedyr; familiedyr
Hvordan forandre grænseværdierne for diagnostiseret infektiøs cystitis sig, ved hhv.
- Cystocentese
- Kateterurin hos handyr
- Spontant afsat urin/kateterurin hos hundyr
… for hhv. hund og kat
- Cystocentese hund + kat: > 1.000 CFU/mL
- Kateter, hanhund: > 10.000 CFU/mL
- Kateter, hankat: > 1.000 CFU/mL
- Spontan/kateter tæve: > 100.000 CFU/mL
- Spontan/kateter hunkat: > 10.000 CFU/mL
Hvordan foretages bedst prøveudtagning fra hhv. øvre og nedre luftveje?
- Ved prøveudtagning i øvre luftveje er det vigtigt ikke at involvere ydre nares, og gerne med brug af et rhinoskop.
- Ved nedre luftveje er BAL (Broncho-Alveolær Lavage) bedst og TA (Trans-tracheal lavage) et godt alternativ.
Hvad er MacConkey agar (MAC) selektiv og indikativ for?
- MAC selekterer primært for Enterobacteceae familien, da disse stort set er de eneste som kan vokse herpå.
Det inkluderer E. Coli, Salmonella, Klebsiella, Proteus, Yersinia, Enterobacter og Pseudomonas. - MAC indeholder laktose og laktose-postive bakterier vil give en lilla baggrund og pink kolonier. Laktose-negative bakterier giver gul baggrund og hvide/gennemsigtige kolonier.
Hvilke former for hæmolyse af blodagar har Staphylococcus spp.
Alpha: Bred zone med total opklaring og uklar kant.
Beta: Bred, mørk opklaring med uklar kant.
Delta: Snæver, zone med total opklaring og skarp kant.
Beta-delta (gamma): Double-hæmolyse med komplet hæmolyse skarprendet omkring kolonien og bredere ukomplet hæmolyse længere fra kolonien.
Hvilke former for hæmolyse af blodagar har Streptococcus spp.?
Alpha: Grønlig zone omkring kolonien.
Beta: Total opklaring med sløret kant.
Hvad er standard dyrkningsprocedure ved bakteriologisk undersøgelse af mælkeprøver?
Aerob inkubation på hhv. blodagar med esculinsyre og blodagar med penicillin.
Hvis ingen vækst, så anaerob inkubation i 24 timer.
Hvordan kan det bestemmes om en bakterie er gram negativ eller gram positiv?
Gram-farvning eller KOH-test
Hvornår er en KOH-test positiv? Og er den så gram positiv eller negativ?
En KOH-test er positiv når der er trådtrækning efter blanding.
Ved positiv test, er bakterien gram-negativ.
Prøver fra alle organer udstryges på blodagar og inkuberes aerobt ved 37 grader, men hvornår inkuberes der også anaerobt?
Ved abdominale aspirater, synovialvæske, organer og abscesser/sår.