Aula 9 - Gene Regulation Beyond Transcription Flashcards
Quais os 3 tipos de regulação da expressão genética pós transcricionais?
-Regulação da degradação do mRNA
-Regulação da tradução
-Regulação pós trasdução
Diz 4 tipos de funções regulatórias do RNA bacterial.
Riboswitches,
sRNAs que modulam a atividade de proteínas,
Cis-Encoded Base Pairing sRNAs,
Trans-Encoded Base Pairing sRNAs
Diz alguns exemplos de funções associadas a mRNAs que se ligam a ligandos e proteínas.
Ligando: A ligação de ligandos ao RNA em riboswitches podem induzir a terminação, ser anti-terminação, impedir a tradução ou favorecer a tradução
Proteínas: RNA CsrB tem zonas de ligação ao CsrA, recrutando-o o que impede que este se ligue a mRNAs; 6S RNA recruta a RNA polimerase impedindo que esta se ligue ao DNA; GlmY (decoy) compete com a GlmZ recrutando YhbJ (enzima que degrada a GlmZ)
Como funciona a regulação do mRNA glmS?
este mRNA tem uma porção que funciona como ribozima (atividade enzimática) e, simultaneamente, codifica uma enzima GlmS (converte Fru6P em GlcN6P). Quando a concentração de GlcN6P aumenta vai induzir a clivagem do mRNA (por ativar a riboenzima) inibindo a produção da enzima GlmS
O que é um sRNA e qual é a sua função geral.
Small RNA - é um RNA regulador - funciona por antisense ao ser complimentar ao RNA alvo bloqueando a sua tradução, causam a terminação da transcrição ou sinalizam o mRNA como alvo de endonucleases
Qual a diferença entre cis-encoding e trans-encoding RNAs antisense?
cis-coding RNAs são transcritos nas ORFs dos genes (geralmente na direção contrária) e costumam ter complementaridade perfeita com o mRNA alvo, enquanto que os trans-coding são transcritos noutras zonas do cromossoma e a sua complementaridade com o mRNA alvo não é perfeita.
Como funciona a regulação do gene oxyS?
Peróxido de hidrogénio ativa o fator de transcrição OxyR que regula a expressão do vários genes incluindo o oxyS que codifica para um sRNA. Quando a expressão do OxyR é constitutiva, a expressão do oxyS torna-se constitutiva. o RNA oxyS inibe a tradução do mRNA flhA (ao se ligar upstream do codão AUG).
Diz algumns exemplos de regulação pós transcripcional nos eucariontes.
-alternative splicing
-existência de microRNAs que regulam mRNAs
-existência de regulação pós-traducional por remoção de aminoácidos ou adição de certos grupos
Dá dois exemplos de modificações pós-traducionais.
Fosforilação e ubiquitinação
micro RNAs estão presentes em que grupos de organismos?
Plantas e animais.
Como funcionam os micro RNAs?
Ligam-se a zonas complementares de mRNAs.
Qual o processo que permitiu a descoberta dos microRNAs?
A adição de um RNA e o seu complementar vai causar a inibição do gene complementar a estes em vez de aumentar a sua expressão. Isto porue estes dois RNAs complementares vão causar o silenciamento do RNA pelo sistema de RNA de interferência.
A maquinaria usada no RNA de interferência é endógeno da célula ou introduzido?
É endógeno e muito eficiente: poucas moléculas de dsRNA podem silenciar completamente um gene.
Quais os 3 processos pelo qual o RNAi atua?
Clivagem do mRNA, repressão da tradução do mRNA e silenciamento da cromatina.
Como se forma o complexo RISC?
-Existência de um RNA de cadeia dupla (por transcrição de um gene de miRNA ou a introdução de um dsRNA artificalmente ou por um vírus)
- Proteína Dicer cliva o RNA nas pontas
-proteína TRBP ajuda o loading do dsRNA na proteina Argonauta
-Proteína Argonauta fica com a cadeia de RNA que tem a ponta 5’ menos estável (mais As e Us) e a outra é degradada.
-Complexo RISC fica completo e degrada mRNAs complementares à cadeia
