Antigen variation

Question 1

Hur kan celler undvika att elimineras?

Answer 1

Celler: ytproteiner skannas
- Patogener måste känna igen ytproteinerna för att kunna infektera
- Undvika igenkänning och infektion:
○ Variera ytan
- Genetisk drift: mutationer –> ändra ytan
- Fasvariation: slå av/på genuttryck på reversibelt sätt
- Antigenisk variation: byter mellan medlemmar av multigen familj

Question 2

Vad är antigen variation?

Answer 2

Antigen variation:
- Switcha mellan olika medlemmar av multigenetisk familj
- Innefattar komplicerade mekanismer av aktivering och tystning
Denna mekanism kan vara:
- Genetiska: mutationer och/eller DNA rekombination –> förändring i nukleotidsekvens
- Epigenetisk: förändrat uttryck utan att sekvensen förändras
- Mutually exclusive expression = en medlem uttryck, en i taget

Question 3

Hur skapas variation hos virus?

Answer 3

Ytvariation i virus: HIV, influensa, covid…
- Ofta mutationer. Ytproteiner –> antikroppar. Punktmutation –> känns inte igen
- Influensavirus: Har segmenterat genom
Variation skapas genom två mekanismer:
- Antigenetisk drift: drift av sekvens –> nya varianter
- Antigenetisk shift: reassortment. Byter gener och segment –> ny typ

Question 4

Hur skapas variation hos bakterier?

Answer 4

Fasvariation: ta bort/lägg till baspar –> gener i av/på-läge –> modifierar läsramar
Transkriptionell nivå:
- Slippage –> excision repair –> uttryck
Fasvariation –> 2^n varianter
- Antalet gener =n

DNA-rekombination - genkonvertering
- Tysta kasetter –> dupliceras/translokeras –> nya gener: complete eller segmental conversion
- Reparera DNA brott –> laga –> olika varianter

Pili: tillgängliga för immunförsvar
Ex. N.meningtidis har kostanta och varierande delar i sitt genom
- Har tysta kassetter
- Kopierar in –> variation, potential att ‘virra’ bort immunförsvar