Aktiv infektion Flashcards
Vad är skillnaden mellan aktiv och latent virusinfektion?
Aktiv virusinfektion → virusförökning
Latent virusinfektion → ingen virusförökning
Vad sker när virus tar sig in i cellen?
- Binder till cellmembranet
- Diffunderar omkring på cellmembranet
- Signalering sker → viruspartikeln ska tas upp
- Tas upp i en transportvesikel → transporteras in i cellen
- Kommer till endosomen → vesikel tas bort
- Transporteras mot cellkärnan längs mikrotubuli
- Tar sig in i cellkärnan genom en nuclear pore
I vilka faser delas virusreplikation?
- Adsorption
- Penetration
- Syntesfas
- Sammanfogningsfas
- Frigörelsefas
Vad är VAP?
Virala adsorptionsproteiner, finns på ytan av virionet och binder med hög specificitet till receptorer i värdcellens cellmembran. Dessa är de viktigaste målen för antikroppssvaret mot virus
Beskriv skillnad av VAP på höljebärande virus respektive icke-höljebärande virus.
Höljebärande virus → VAP är glykoproteiner som finns i höljet. Glykoproteinerna fungerar delvis som en “ligand” som binder viruset till den cellulära receptorn, men även som en “täckmantel” → får viruset att verka som något kroppseget i värden genom att ha likadana kolhydrater som värden själv
Icke-höljebärande virus → VAP är kapsomerer som finns i kapsiden, kallas för spikes
Vad är virusreceptor?
Protein eller glykolipid i cellmembranet som binder till VAP → gör att viruset kan gå in i cellen
Hur blockeras infektion?
Genom att förhindra virus-cell-interaktion. Neutraliserade antikroppar (vaccin) alternativt läkemedel riktade mot VAP eller receptorn kan användas.
Vad är co-receptor?
Ytterligare receptor som hjälper viruset binda in närmare värdcellens membran
Förklara vad attachment factor är.
Strukturer på cellmembranets yta som hjälper viruset att binda in relativt ospecifikt. Ofta är det kolhydrater (glykolipider). Fungerar alltså som en receptor med skillnaden att de ej stimulerar entry. Attachment factor påverkar endast inbindning och inte penetration.
Ge exempel på attachment factor.
Sialinsyra (typ av glykolipid) som binder till hemagglutinin (VAP) hos influensavirus.
Vad är multivalens?
Innebär att viruset binder till många receptorer samtidigt → bindning mellan virus och cell förstärks. Kan jämföras med irreversibel inbindning.
Vad är tropism?
Specificiteten för att ett virus ska infektera en viss cell eller vävnad.
Ge exempel på tropism: djurslag, organ, cellers differentieringsgrad.
Djurslag → t.ex. poliovirus kan endast binda till celler från människa eller schimpanser då receptorn kodas av kromosom 19
Organ → t.ex. Epstein-Barr-virus kan endast binda till C3d-receptorn på B-lymfocyter
Cellernas differentieringsgrad → t.ex. Coxsackie A-virus kan endast binda till muskelceller hos möss till och med myoblaststadiet, kan endast infektera nyfödda möss
På vilka tre sätt kan penetration av virus ske?
- Fusion
- Clahtrinmedierad endocytos
- Endocytos
Hur går penetration via fusion till?
Höljebärande virus binder till receptorer på cellmembranet, fusionsproteiner tvinnar sig som skruvar (likt SNARE-proteiner) → hölje och membran sammansmälter och viruskapsiden kan passera genom den por som bildas i processen.
Exempel: HIV-virus tar sig in i värdcellen genom fusion
Hur går penetration genom clahtrinmedierad endocytos till?
Höljebäranade virus binder till receptorer på cellmembranet i en clahtrin-coated pit, en del av plasmamembranet som har clahtrin på ytan. Plasmamembranet sammansmälter (fusionerar) sedan med virionets hölje → nukleokapsiden släpps fri inuti värdcellens cytoplasma
Hur går penetration med endocytos till?
Icke-höljebäranade virus binder in till receptorer på cellmembranet och kommer befinna sig på cellytan i några minuter → passerar sedan in i cellen i en vesikel → viruskapsiden släpps fri från vesikeln inuti cytoplasman
Hur sker intracellulär transport vid fusion?
Om kapsiden bär på DNA kommer detta behöva komma in i cellkärnan för att syntetisera nytt virusgenom; använder cellens transportmekanismer genom att binda till en mikrotubulus (via motorproteinet dynein) → färdas mot cellkärnan
Hur sker intracellulär transport vid clathrinmedierad endocytos?
Clathrintäckta vesikeln kommer transporteras till en mikrotubulus och clathrin kommer släppa → vesiklen sammansmälter med tidig endosom som transporteras längs mikrotubulus → tidig endosom utvecklas till sen endosom och sedan lysosom (farligt för viruspartikeln) → flesta virus nukleokapsider lämnar endosomen innan den utvecklas till en lysosom. Virionets nukleokapsid kan lämna endosomen tack vare att ett fusionsprotein i höljet genomgår konfirmationsförändringar pga förändring i pH under endosomens utveckling → lysosomens inre blir surt → bryter ned främmande partiklar → endosomens membran fusionerar med höljet
Hur sker intracellulär transport vid endocytos (icke-höljebärande virus)?
Fungerar till en början som vid clahtrinmedierad endocytos, endosomen blir mer och mer sur → konfirmationsförändringar i kapsidproteiner → viruspartikelns kapsid börjar falla isär → kapsidproteiner går in i endosom-membranet och lyserar det → den delvis “isärtagna” nukleokapsiden tar sig ut från endosomen och färdas längs mikrotubulus tills dess att den når cellkärnan. Här har olika virus olika strategier. Viruset kan lysera endosomen medan andra kan gör en liten por i endosomens membran.
Vad är avklädning?
Processen där kapsid (och eventuellt hölje) avlägsnas från viruset så att genomet kan kopieras och proteiner till nya virus kan syntetiseras
Hos DNA-virus → genomet transporteras oftast in i cellkärnan
Hos RNA-virus → genomet stannar oftast i cytoplasman
Var sker replikation av DNA-virus respektive RNA-virus?
DNA-virus → replikation på liknande sätt som cellulärt DNA, i cellkärnan. Värdcellens DNA-polymeras används ibland, ibland inte
RNA-virus → replikation sker vanligtvis i cytoplasman med egna enzymer
Var sker transkription av DNA-virus respektive RNA-virus?
DNA-virus → transkription sker oftast i cellkärnan mha värdcellens enzymer, ibland inkorporeras virusgenomet i värdcellens genom. DNA-virusets genom har ofta kraftfulla promotorer för att kunna konkurrera
RNA-virus → transkription sker oftast i cytoplasman, viruset måste koda för enzymer för att kunna utföra transkription
Hur sker translation av DNA-virus & RNA-virus?
Mha värdcellens ribosomer och posttranslationella modifieringar → får strukturella proteiner, dvs kapsomerer och höljeprotein
