ADN1 Flashcards
faire de l’ADN a partir de l’ADN ca s’appelle?
reverse transcription
combien de % de prot dans l’ADN?
70
experience de Griffith
streptocoques pathogenes qui forment colonies lisse, parfois rugueuses. Lisse souris meurent, rugueux non.
- chauffe colonie lisse et injecte dans souris, meurt pas
- melange lisse et rugueux souris meurt
experience de Avery et McCarty
broie colonie lisse
- moitié lisse dont il elimine ADN, moitié rugueuse, souris meurt pas
- moitié lisse dont il elimine les prot, moitié rugeuse, souris meurt
experience de Heshey et chase?
experience du mixer
- met en evidence la prot du bacteriophage puis on infecte la bacterie, sulfure radioactif reste dehors
- met en evidence ADN du bacteriophage puis on infecte la bacterie, phosphore dans la cellule
nucléotide
- sucre
- 4 bases
- groupement phosphate
ou est fixé le groupemen phosphate ?
sur le carbone 5’ et 3’ du sucre
purine? cycle aromatique?
adenine guanine
deux cycles aromatiques
pyrimidine? cycle aromatique?
cytosine thymine
un cycle aromatique
sucre contient
5 carbones
nucleoside
base + sucre
sans le phosphate
A fait face au?
combien de liaison hydrogene?
T
2
C fait face au ?
combien de liaisons hydrogene
G
3
les deux brins sont
antiparalleles
liaison qui unissent le phosphate et les molecule de desoxyribose?
hydrogene?
covalente
non covalente
diametre de la molecule d’ADN
2nm
combien de cellules dans le corps humain
10^13
1 tour = combien de paires de base = combien de nm
10pb = 3,4 nm
ADN enroulé à?
droite
Double helice B
ADN classiquement retrouvé in vivo, forme quon trouve dans les cellule
ADN forme A?
ressemble à ADN B mais moins hydratee, existe pas in vivo.
Plus aplatie et tourne vers la droite (dextrogyre)
ADN forme Z
forme transitoire in vivo, un seul sillon. Tourne vers la gauche (levogyre). Lors de transcription on peut passer de B a Z.
ADN peut etre circulaire, deux types.
Type I : circu super enroulé
Type II : circulaire relaxé
Chaque espece possede un ratio AT/GC different?
Oui
2 methodes pour separer les deux brins
- par denaturation
- chimiquement
renaturation se fait sur la base de
la complementarité
ARN difference avec ADN
- uracile a la place de thymine
- peut former des structures
- simple brin
Qui a une activité catalytique ADN ou ARN?
ARN
on trouve de l’ADN chez
- bacteries
- archees
- noyau des cell eucaryotes
- mito des cell eucaryotes
- certains virus
enzymes de restriction
proteines qui reconnaissent des sequences specifiques et coupent ladn sur les deux brins
Nombre de coupure que fait l’enzyme de restriction depend?
du nombre de nucleotides impliqué dans la reconnaissance dune sequence specifique
+ il y a de nucleotides - cest frequent
clonage quest ce qui est utilisé? comment?
ADN plasmique (circulaire) qui est le suport de linfo genetique des microorganises (bacteries, virus). On clive l'adn plasmique circulaire avec uje enzyme de restriction, on insere le fragment a cloner, formation dune liaison covalente par adn ligase. On a un ADN recombinant
trois possibilités de simaginer la replication? laquelle est la bonne
- modele conservatif (photocopie de l’ADN)
- modele semi conservatif
- modele dispersif (conserve aucun brin intacte)
2
quelle experience a montré que la replication est semi conservative? comment?
experience de meselon & stahl
cultive bacteries dans azote lourd ce qui marque ladn. Ils le transferent dans un milieu plus leger
1ere generation: seulement de ladn lourd-leger
2eme generation : melange adn lourd-leger et leger
experience de taylor
vu les orginines de replication qui synthetisaient l’ADN
que veut dire la replication est semi conservative?
chaque brin sert de matrice a la synthese d’un nouveau brin
Que se passe t il a la premiere etape de la replication?
- helicase deroulent les deux brins en brisant les liaisons hydrogene. Les topoisomerase en aval defont les surrenroulements induit par lhelicase
- -> formation de loeil de replication
que se passe t il apres la formation de l’oeil de replication?
-ADN polymerase a besoin d’un amorce, primase (polymerase a ARN) qui forme une amorce d’ARN
pourquoi la polymerase a ADN a besoin dune amorce
parce quelle commence a synthetiser que par une extremité 3’OH libre
des que la primase a fait l’amorce d’ARN que se passe t il?
L’ADN polymerase (enzyme de replication) synthetise les brins continues, a partir de l’extremité 3’ de lamorce
que forme aussi la primase des que l’ADN polymerase fabrique sont brin continu
-forme une amorce pour les brins discontinus
puis l’ADN polymerase synthetise le brin discontinu a partir de l’extremité 3’ de l’amorce
Apres avoir synthetiser le brin discontinu que fait ladn polymerase?
remplace l’amorce d’ARN par de l’ADN a partir de lextremité 3’ du premier fragment dokasaki
comment lier l’extremité 3’ de l’ADn et 5’ du brin continu
avec une ligase
phosphodiester
liaison entre phosphate et sucre
nucleotide arrive sous forme .. pour faire la liaison covalente
triphosphate
3 problemes dans la replication de l’adn?
- adn poly peut pas generer une extremité OH seule; solution : primase
- synthese continue et discontinue
- extremités
synthese continue et discontinue pose 2 probleme
-multiples amorces
-deplacement de la fourche doit se faire dans la meme direction a cause de 5’-3’
solution : boucle
replisome complexe?
au niveau de la fourche de replication, complexe proteique qui coordonne la replication
brin tardif lu plus lentement
probleme des extremités?
a chaque fois qu’on replique l’ADN on perdrait de linformation coté brin discontinu
solution de la perte des extremités
telomerase, enzyme avec sa propre matrice.
Elle allonge l’extremité 3’ de l’ADN maternel de sorte qu’une nouvelle amorce d’ARN puisse se former
topoisomerase I
coupe temporairement un seul des deux brins d’ADN, relache la tension. Brise le lien dun phosphodiester et deenroule
topoisomerase 2
coupe temporairement les deux brins d’adn, se fixe au point de jonction des molecules coupe les deux brins de lune dentre elle et passe la molecule intacte a travers la coupure et recolle finalement les extremités
comment empecher l’extension?
- enlever une extremité OH
- analogue de nucleotide/base
analogues de bases peuvent etre utilisés :
- contre certains virus (p.ex analogue de nucleotide a qui il y a un N3 a la place de OH sur l’extremité 3’)
- pour le sequencage
comment marche le sequencage?
principe di desoxy
di desoxy ne possede pas de 3’ OH
pour sequencer l’ADN on incorpore au melange des didesoxyribonucleides qui bloquent la croissance de la molecule.
Mutation
alteration de la sequence de nucleotides
types de mutation
- mutation ponctuelle
- substitution
- deletion/insertion
substitution 2 types
-Transition : purine par purine/pyri par pyri
Transversion : purine par pyri/pyri par purine
trois categories de mutation? laquelle est la source de levolution?
- mutation nefaste
- mutation neutre
- mutation benefique –> source evolution
combien de paires de bases chez lhomme?
3 milliards
une erreur tous les
milliards de base
quest ce qui fait le taux si bas derreurs
- mecanisme de correction
- mecanisme de reparation
premiere source derreur
mesapariement, polymerase met mauvaise base complementaire
1er mecanisme de correction
ADN polymerase a une activité auto correctrice, si une base vient a la place dune autre, elle va mal fonctionner et reculer
pourquoi 5’ 3’
la correction le justifie, hydrolyse 3’ 5’ pourrait se faire, mais quand la polymerase reculerait elle n’aurait plus d’amorce, manque de phosphate
correction secondaire des mesappariement (celle que ADN poly a oublié)
Une deformation est facilement detectable, mais quelle base est la fausse
les deux sources derreur
- mesappariement
- aggressions
les aggressions
- modification de la base
- perte d’une base
- mutation par radiation UV
- cassure double brin
agression : modification de la base
-desamination (enleve un groupe NH3) d’une cytosine mene a la formation d’un uracile
Uracile doit absolument etre eliminé, le system n’enleve que la base
Pourquoi l’uracile est remplacé par thymine dans ADN
sinon lorsque desamination de uracile on ne repererait pas le dommage
perte d’une base, aggression?
combien de purines perdues par jour par cellule?
la base s’en va et il reste seulement le sucre et phosphate, si on ne fait rien deletion
5000 purines perdues par jour par cellule
mutation par radiation
les UV induisent des dimeres de pyrimidine, deux pyrimidines liées au niveau des bases. Il faut les reparer avant replication, on enleve le fragment malade
cassure doublie brin, aggression provoqué par?
provoqué par radiations ionisantes, des erreurs de repli ou agents oxydants
faut recoller rapidement les morceaux
2 methodes de reparation des cassures double brin
- liaison des bouts libres
2. recombinaison homologue
liaison des bouts libres =
non homologoua end joining
recombinaison homologue permet? comment?
- restaurer les deux chromosomes sans perdre d’informatiom
1. une exonuclease coupe les acides nucleique pour degager les 3’
2. brin de secours
3. polymerases avancent et reconstruisent les deux chromosomes abimés
recombinaison homologue pendant la meiose
-pas une cassure accidentelle mais la coupure des deux brins et provoquee, endonuclease coupe.
deux modes de coupures
- sans crossing over
- avec crossing over
etapes de la recombinaison homologue
- coupure de l’ADN
- appariement par homologie
- synthese avec ADN polymerase et ligation avec ligase
- resolution par coupure
- religation
recombinaison illegitime
ni basé sur homologue ni sur sequences specifiques
2 types de recombi illegitime
- Translocation
- Transposition, retrotransposition
transposition
transposons (elements genetiques mobiles) se deplacent et s’inserent ailleurs grace a une transposase
retrotransposition
sequence au niveau de l’ADN qui est retranscrite sous forme d’ARN lui memee retranscrit en ADN et inséré dans le genome
combien de % de transposons dans le genome?
et de retrotransposons?
- 3
- 40
recombinaison site specifique, 3 reactions
- reaction d’integration
- reaction d’excision
- reaction d’inversion
reactiom dintegration (recombi site spe)
molecule d’ADN circulaire est integre dans une molecule d’ADN
reaction dexcision (recombi site spe)
molecule d’ADN sort et forme un ADN circulaire
reaction dinversion (recombi site spe)
-inverse un segment d’ADN dans un chromosome
Premiere molecule de la vie ADN ou ARN?
ARN
