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ADN prot > ADN1 > Flashcards

ADN1 Flashcards

1
Q

faire de l’ADN a partir de l’ADN ca s’appelle?

A

reverse transcription

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Q

combien de % de prot dans l’ADN?

A

70

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3
Q

experience de Griffith

A

streptocoques pathogenes qui forment colonies lisse, parfois rugueuses. Lisse souris meurent, rugueux non.

  1. chauffe colonie lisse et injecte dans souris, meurt pas
  2. melange lisse et rugueux souris meurt
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4
Q

experience de Avery et McCarty

A

broie colonie lisse

  1. moitié lisse dont il elimine ADN, moitié rugueuse, souris meurt pas
  2. moitié lisse dont il elimine les prot, moitié rugeuse, souris meurt
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5
Q

experience de Heshey et chase?

A

experience du mixer

  1. met en evidence la prot du bacteriophage puis on infecte la bacterie, sulfure radioactif reste dehors
  2. met en evidence ADN du bacteriophage puis on infecte la bacterie, phosphore dans la cellule
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6
Q

nucléotide

A
  • sucre
  • 4 bases
  • groupement phosphate
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7
Q

ou est fixé le groupemen phosphate ?

A

sur le carbone 5’ et 3’ du sucre

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8
Q

purine? cycle aromatique?

A

adenine guanine

deux cycles aromatiques

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9
Q

pyrimidine? cycle aromatique?

A

cytosine thymine

un cycle aromatique

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10
Q

sucre contient

A

5 carbones

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11
Q

nucleoside

A

base + sucre

sans le phosphate

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12
Q

A fait face au?

combien de liaison hydrogene?

A

T

2

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13
Q

C fait face au ?

combien de liaisons hydrogene

A

G

3

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14
Q

les deux brins sont

A

antiparalleles

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15
Q

liaison qui unissent le phosphate et les molecule de desoxyribose?
hydrogene?

A

covalente

non covalente

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16
Q

diametre de la molecule d’ADN

A

2nm

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17
Q

combien de cellules dans le corps humain

A

10^13

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18
Q

1 tour = combien de paires de base = combien de nm

A

10pb = 3,4 nm

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19
Q

ADN enroulé à?

A

droite

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20
Q

Double helice B

A

ADN classiquement retrouvé in vivo, forme quon trouve dans les cellule

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21
Q

ADN forme A?

A

ressemble à ADN B mais moins hydratee, existe pas in vivo.

Plus aplatie et tourne vers la droite (dextrogyre)

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22
Q

ADN forme Z

A

forme transitoire in vivo, un seul sillon. Tourne vers la gauche (levogyre). Lors de transcription on peut passer de B a Z.

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23
Q

ADN peut etre circulaire, deux types.

A

Type I : circu super enroulé

Type II : circulaire relaxé

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24
Q

Chaque espece possede un ratio AT/GC different?

A

Oui

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25
Q

2 methodes pour separer les deux brins

A
  • par denaturation

- chimiquement

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26
Q

renaturation se fait sur la base de

A

la complementarité

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27
Q

ARN difference avec ADN

A
  • uracile a la place de thymine
  • peut former des structures
  • simple brin
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28
Q

Qui a une activité catalytique ADN ou ARN?

A

ARN

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29
Q

on trouve de l’ADN chez

A
  • bacteries
  • archees
  • noyau des cell eucaryotes
  • mito des cell eucaryotes
  • certains virus
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30
Q

enzymes de restriction

A

proteines qui reconnaissent des sequences specifiques et coupent ladn sur les deux brins

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31
Q

Nombre de coupure que fait l’enzyme de restriction depend?

A

du nombre de nucleotides impliqué dans la reconnaissance dune sequence specifique
+ il y a de nucleotides - cest frequent

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32
Q

clonage quest ce qui est utilisé? comment?

A 
ADN plasmique (circulaire) qui est le suport de linfo genetique des microorganises (bacteries, virus). 
On clive l'adn plasmique circulaire avec uje enzyme de restriction, on insere le fragment a cloner, formation dune liaison covalente par adn ligase.
On a un ADN recombinant
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33
Q

trois possibilités de simaginer la replication? laquelle est la bonne

A
  • modele conservatif (photocopie de l’ADN)
  • modele semi conservatif
  • modele dispersif (conserve aucun brin intacte)

2

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34
Q

quelle experience a montré que la replication est semi conservative? comment?

A

experience de meselon & stahl
cultive bacteries dans azote lourd ce qui marque ladn. Ils le transferent dans un milieu plus leger
1ere generation: seulement de ladn lourd-leger
2eme generation : melange adn lourd-leger et leger

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35
Q

experience de taylor

A

vu les orginines de replication qui synthetisaient l’ADN

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36
Q

que veut dire la replication est semi conservative?

A

chaque brin sert de matrice a la synthese d’un nouveau brin

37
Q

Que se passe t il a la premiere etape de la replication?

A
  1. helicase deroulent les deux brins en brisant les liaisons hydrogene. Les topoisomerase en aval defont les surrenroulements induit par lhelicase
    - -> formation de loeil de replication
38
Q

que se passe t il apres la formation de l’oeil de replication?

A

-ADN polymerase a besoin d’un amorce, primase (polymerase a ARN) qui forme une amorce d’ARN

39
Q

pourquoi la polymerase a ADN a besoin dune amorce

A

parce quelle commence a synthetiser que par une extremité 3’OH libre

40
Q

des que la primase a fait l’amorce d’ARN que se passe t il?

A

L’ADN polymerase (enzyme de replication) synthetise les brins continues, a partir de l’extremité 3’ de lamorce

41
Q

que forme aussi la primase des que l’ADN polymerase fabrique sont brin continu

A

-forme une amorce pour les brins discontinus

puis l’ADN polymerase synthetise le brin discontinu a partir de l’extremité 3’ de l’amorce

42
Q

Apres avoir synthetiser le brin discontinu que fait ladn polymerase?

A

remplace l’amorce d’ARN par de l’ADN a partir de lextremité 3’ du premier fragment dokasaki

43
Q

comment lier l’extremité 3’ de l’ADn et 5’ du brin continu

A

avec une ligase

44
Q

phosphodiester

A

liaison entre phosphate et sucre

45
Q

nucleotide arrive sous forme .. pour faire la liaison covalente

A

triphosphate

46
Q

3 problemes dans la replication de l’adn?

A
  • adn poly peut pas generer une extremité OH seule; solution : primase
  • synthese continue et discontinue
  • extremités
47
Q

synthese continue et discontinue pose 2 probleme

A

-multiples amorces
-deplacement de la fourche doit se faire dans la meme direction a cause de 5’-3’
solution : boucle

48
Q

replisome complexe?

A

au niveau de la fourche de replication, complexe proteique qui coordonne la replication
brin tardif lu plus lentement

49
Q

probleme des extremités?

A

a chaque fois qu’on replique l’ADN on perdrait de linformation coté brin discontinu

50
Q

solution de la perte des extremités

A

telomerase, enzyme avec sa propre matrice.

Elle allonge l’extremité 3’ de l’ADN maternel de sorte qu’une nouvelle amorce d’ARN puisse se former

51
Q

topoisomerase I

A

coupe temporairement un seul des deux brins d’ADN, relache la tension. Brise le lien dun phosphodiester et deenroule

52
Q

topoisomerase 2

A

coupe temporairement les deux brins d’adn, se fixe au point de jonction des molecules coupe les deux brins de lune dentre elle et passe la molecule intacte a travers la coupure et recolle finalement les extremités

53
Q

comment empecher l’extension?

A
  • enlever une extremité OH

- analogue de nucleotide/base

54
Q

analogues de bases peuvent etre utilisés :

A
  • contre certains virus (p.ex analogue de nucleotide a qui il y a un N3 a la place de OH sur l’extremité 3’)
  • pour le sequencage
55
Q

comment marche le sequencage?

A

principe di desoxy
di desoxy ne possede pas de 3’ OH
pour sequencer l’ADN on incorpore au melange des didesoxyribonucleides qui bloquent la croissance de la molecule.

56
Q

Mutation

A

alteration de la sequence de nucleotides

57
Q

types de mutation

A
  • mutation ponctuelle
  • substitution
  • deletion/insertion
58
Q

substitution 2 types

A

-Transition : purine par purine/pyri par pyri

Transversion : purine par pyri/pyri par purine

59
Q

trois categories de mutation? laquelle est la source de levolution?

A
  • mutation nefaste
  • mutation neutre
  • mutation benefique –> source evolution
60
Q

combien de paires de bases chez lhomme?

A

3 milliards

61
Q

une erreur tous les

A

milliards de base

62
Q

quest ce qui fait le taux si bas derreurs

A
  • mecanisme de correction

- mecanisme de reparation

63
Q

premiere source derreur

A

mesapariement, polymerase met mauvaise base complementaire

64
Q

1er mecanisme de correction

A

ADN polymerase a une activité auto correctrice, si une base vient a la place dune autre, elle va mal fonctionner et reculer

65
Q

pourquoi 5’ 3’

A

la correction le justifie, hydrolyse 3’ 5’ pourrait se faire, mais quand la polymerase reculerait elle n’aurait plus d’amorce, manque de phosphate

66
Q

correction secondaire des mesappariement (celle que ADN poly a oublié)

A

Une deformation est facilement detectable, mais quelle base est la fausse

67
Q

les deux sources derreur

A
  • mesappariement

- aggressions

68
Q

les aggressions

A
  • modification de la base
  • perte d’une base
  • mutation par radiation UV
  • cassure double brin
69
Q

agression : modification de la base

A

-desamination (enleve un groupe NH3) d’une cytosine mene a la formation d’un uracile
Uracile doit absolument etre eliminé, le system n’enleve que la base

70
Q

Pourquoi l’uracile est remplacé par thymine dans ADN

A

sinon lorsque desamination de uracile on ne repererait pas le dommage

71
Q

perte d’une base, aggression?

combien de purines perdues par jour par cellule?

A

la base s’en va et il reste seulement le sucre et phosphate, si on ne fait rien deletion
5000 purines perdues par jour par cellule

72
Q

mutation par radiation

A

les UV induisent des dimeres de pyrimidine, deux pyrimidines liées au niveau des bases. Il faut les reparer avant replication, on enleve le fragment malade

73
Q

cassure doublie brin, aggression provoqué par?

A

provoqué par radiations ionisantes, des erreurs de repli ou agents oxydants
faut recoller rapidement les morceaux

74
Q

2 methodes de reparation des cassures double brin

A
  1. liaison des bouts libres

2. recombinaison homologue

75
Q

liaison des bouts libres =

A

non homologoua end joining

76
Q

recombinaison homologue permet? comment?

A
  • restaurer les deux chromosomes sans perdre d’informatiom
    1. une exonuclease coupe les acides nucleique pour degager les 3’
    2. brin de secours
    3. polymerases avancent et reconstruisent les deux chromosomes abimés
77
Q

recombinaison homologue pendant la meiose

A

-pas une cassure accidentelle mais la coupure des deux brins et provoquee, endonuclease coupe.

78
Q

deux modes de coupures

A
  • sans crossing over

- avec crossing over

79
Q

etapes de la recombinaison homologue

A
  • coupure de l’ADN
  • appariement par homologie
  • synthese avec ADN polymerase et ligation avec ligase
  • resolution par coupure
  • religation
80
Q

recombinaison illegitime

A

ni basé sur homologue ni sur sequences specifiques

81
Q

2 types de recombi illegitime

A
  • Translocation

- Transposition, retrotransposition

82
Q

transposition

A

transposons (elements genetiques mobiles) se deplacent et s’inserent ailleurs grace a une transposase

83
Q

retrotransposition

A

sequence au niveau de l’ADN qui est retranscrite sous forme d’ARN lui memee retranscrit en ADN et inséré dans le genome

84
Q

combien de % de transposons dans le genome?

et de retrotransposons?

A
  • 3

- 40

85
Q

recombinaison site specifique, 3 reactions

A
  • reaction d’integration
  • reaction d’excision
  • reaction d’inversion
86
Q

reactiom dintegration (recombi site spe)

A

molecule d’ADN circulaire est integre dans une molecule d’ADN

87
Q

reaction dexcision (recombi site spe)

A

molecule d’ADN sort et forme un ADN circulaire

88
Q

reaction dinversion (recombi site spe)

A

-inverse un segment d’ADN dans un chromosome

89
Q

Premiere molecule de la vie ADN ou ARN?

A

ARN

ADN prot (6 decks)

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