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ADN prot > 4 controler lexpression genique > Flashcards

4 controler lexpression genique Flashcards

1
Q

comment controler l’expression genique, les points de controle?

A

dans la plupart des cas pendant la transcription, a la premiere etape

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Q

la premiere etape de la transcription (ou seffectue le controle de la transcription)?

A

liaison de l’ARN polymerase au site d’initiation de la transcription

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3
Q

2 probleme pour l’ARN polymerase

A
  1. genes sont disperses dans le genome, comment localiser le debut du gene
  2. adn relativement innaccessible car sous forme de chromatine
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4
Q

chromatine

A

complexe constitué à 50-50 d’adn et de prot (histones)

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5
Q

comment permettre a l’ARN poly d’atteindre le gene, deux types de signaux?

A
  • promotteur

- elements regulateurs

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6
Q

promoteur en bref

A

courte region de l’adn (dizaine de bases) situee au debut du gene et qui indique a larn poly ou elle doit commencer la transcription + sa direction

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7
Q

les elements du promoteur

A
  • une sequence TATA (à ~25nucl du point de demarrage de la trans)
  • une sequence INR (initiateur), courte sequence riche en pyrimidine (C T) au point de demarrage de la trans
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8
Q

sequence consensus?

A

sequence idealisee dans laquelle chaque position represente la base rencontree la plus frequement dans le brin d’ADN sup(convention)

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9
Q

ARN poly peut reconnaitre un promoteur et sy lier?

besoin de?

A

Non

facteurs generaux de trancription (proteines) qui s’assemblent au niveau du promoteur pour que poly puisse sattacher.

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10
Q

Un jeu de facteur generaux de transcription different pour chacue des 3 ARN poly ?

A

Oui

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11
Q

2 facteurs generaux de trancription

A

TFIID

TBP

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12
Q

TFIID

A

une de ses sous unités reconnait la boite TATA

une autre de ses sous unités est TBP (deplace les brins d’adn pour voir tata)

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13
Q

TFIID sert de repere à ?

A
  • 100 prot differentes dont facteurs generaux de transcription
  • ARN poly
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14
Q

que fait TPB?

A

deplace legerement les deux brins d’ADN pour voir l’element TATA

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15
Q

assemblage du complexe d’initiation de transcription est assemblé sur le promoteur ou avant?

A

avant

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16
Q

fonction des facteurs generaux de transcription?

A
  • positionnent bien l’arn poly sur le promoteur
  • separent les deux brins dadn pour que larn poly puisse commencer
  • aide poly a quitter le promoteur
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17
Q

certains facteurs generaux de transcription sont aussi impliqué dans

A

le couplage entre la transcription et la maturation des transcrits primaires (coiffage, epissage)

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18
Q

les elements regulateurs en bref

A

courts elements d’adn (6-20pb sequence tres variable) qui permettent

  • accessibilité du promoteur
  • determinent le nb de copies de genes
19
Q

elements regulateur fonctionnent par eux meme?

A

Non, ils sont des sites de liaison pour des facteurs regulateurs de transcription.

20
Q

Activateurs contiennent 3 domaines

A
  • domaine de liaison (fixation de l’activateur sur lelement regulateur donc sur l’adn)
  • domaine d’activation, permet de stimuler la transcription
  • domaine de dimerisation, conduit 2 molecules a former un dimere.
21
Q

a quoi sert la dimerisation?

A

a doubler la surface de contact entre activateur et adn, augmente force et specificité de l’interaction

22
Q

sequence nucleotide des elements est ….? pourquoi?

A

palindromique (mm seqence quand tourne de 180 degres)

activateurs se lient a l’adn sous forme de dimere

23
Q

est ce que les domaines d’activation et de liaison a l’adn de l’activateur doivent etre ensemble?

A

oui

24
Q

quelle partie de l’activateur determine quel gene est activé?

A

le domaine de liaison

25
Q

quels signaux peuvent controler un activateur

A

hormone, kinase, facteurs de croissance, cytokines

26
Q

dimerisation de certains activateurs necessite la presence de

A

cytokines
ou
facteurs de croissances

27
Q

activateur peut etre sequestre dans le cyto, quest ce qui lui permet de passer au noyau?

A

hormone

28
Q

les activateurs se fixent sur quel sillon de l’ADN? pourquoi?

A

le grand

points de contacts asymetriques, discrimination entre paires de base plus facile

29
Q

mode d’activation des activateurs 2 modes

A
  • certains activateurs activent direct la transcription

- dautres ont besoin dune autre prot : coactivateur

30
Q

comment les activateurs/coactivateurs facilitent lassemblage du complexe d’initiation

A
  1. modifient les nucleosomes et structure de la chromatine, meilleure accessibilité du promoteur
  2. certains peuvent recruter la machinerie eux meme ce qui facilite lassemblage du complexe
31
Q

comment les activateurs/coactivateurs modifient les nucleosomes?

A
  1. acti modifie extremités des nucleosomes grace a des enzymes qui ajoutent des acetyles sur les N terminaux, relache la fibre
  2. recrute des complexes enzymatiques qui utilisent lenergie liberee par hydrolyse de l’ATP pour deplacer les nucleosomes
32
Q

quand les activateurs recrutent eux meme la machinerie de transcription, ca implique?

A

un contact physique entre activateur et machinerie, adn forme donc une boucle

33
Q

bien qune partie des genes sont exprimés de maniere constantes, la plupart montrent un profil dexpression unique, ils peuvent etre exprimés :

A
  • a differents moments du developpement
  • a des niveaux differents (nombre d’arnm)
  • dans differentes cellules
  • en reponse a differents signaux
34
Q

est ce quon pourrait avoir un activateur different pour les 25 000 genes? ca impliquerait quoi?

A

Non, ca impliquerait davoir le meme nombre de gene qui code les activateurs, … nombre de genes infini

35
Q

Un activateur controle plusieurs genes grace a une

A

combinaison d’activateurs pour chaque gene

36
Q

combien de genes codants des activateurs

A

3000

37
Q

enhancer?

A

amplificateur

segment d’adn regroupant plusieurs element regulateurs reconnus par differents activateurs

38
Q

conditions au fonctionnement du controle combinatoire?

A
  • seul un jeu complet d’activateur stimule efficacement la transcription
  • si jeu incomplet, transcription pas optimale
39
Q

synergie d’activation

A

phenomene par lequel l’effet de deux activateurs est bien plus grand que la somme des effets de chaque activateurs

40
Q

point de controle de l’expression genique peut se faire ailleurs que lors de la 1ere etape de la transcription? ou?

A 
Oui
points de controles post transcriptionnels
-maturation du transcrit (coiffe,...)
-transport de larnm
-stabilité de larnm 
-synthese de la prot
-activité de la prot
41
Q

comment reguler la stabilité des arnm ? un arnm stable? instable?

exemple de proteine regulatrice

A

proteine regulatrice peut se lier a l’arnm pour l’empecher detre traduit

est protégé contre la degradation

rapidement degradé

transferine

42
Q

syndrome des lymphocytes nus, coactivateur muté donc

A

l’empeche detre recruté sur le enhancer et donc dactiver la transcription de certains genes

43
Q

regulation de l’expression genique

A

controle la production ou non des genes et en quelle quantité

ADN prot (6 decks)

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