Acides Aminés Et Proteines Flashcards
Quels sont les acides aminés utilisés principalement pour former des proteines
Acides aminés protéogéniques
Qui est le Carbone alpha
Carbone lier au Groupement carboxyle
Tous les acides aminés standards sont les acides…
Alpha-aminés
Qu’est ce qui cartérise les 20 acides aminés standards
Leur chaîne latérale (R)
Vrai ou faux
Tout les acides aminés standards ont une activité optique
Faux toutes sauf la glycine, deux H sur le carbone alpha, donc molécule chirale optiquement inactive
Caractéristique de la proline
Acides aminés circulaire, le carbone alpha est aussi attaché au Groupement amine
Deux type de classification des acides aminés
Nature chimique et polarité
Qu’est-ce que les acides aminés aliphatique
Juste du carbone et de l’hydrogène
Glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine,
Tous non polaires
Glycine: plus petit acide aminé, pas de carbone choral permet une grande flexibilité pour les protéines
Alanine: 2e plus petit mais le plus abondant!
Qu’est-ce qu’un alpha-iminoacide
La proline! Uniquement composé de carbone et hydrogène,anneau de pyrrolidine de forme circulaire, très rigide donc implication majeures dans la structure des protéines
Non polaire
Qu’est-ce que les acides aminés aromatique
Cycle aromatique de benzène ou dérivé
Phélynalanine : alanine+benzène
Non polaire
Tyrosine= phénylalanine+hydroxyde au bout, polaire!
Tryptophan= alanine +Groupement double cycle indole
Polaire
Qu’est-ce qu’un acides aminés beta-hydroxylés
Carbone bêta avec Groupement hydroxyle, acides aminés polaires
Serine et threonine
Qu’est-ce qu’un acides aminés soufrés
Présence de soufre
Methionine non polaire
Cysteine polaire
Qui sont les acides aminés portant une deuxième fonction acide et amide
Aspartate et aspargine
Glutamate et glutamine
Groupement -ate = acide dicarboxylique chargés négativement
Groupement -ine = Groupement amide polaires
Acides aminés a deuxième fonction basique
Histidine= cycle imidazole
Lysine = amine sur carbone Ɛ
Arginine = ion guanidium
Tous chargés positivement
Vrai ou faux
La solubilité dépend seulement de la polarité de l’acide aminé
Faux, dépend aussi de la taille
Différence entre peptides et protéines
Peptides 2 à 50 résidus d’acides aminés
Protéines: plus de 40 résidus (en majorité entre 100 et 1000
Nomenclature du polymère en fonction du nombre de résidus:
2:
4:
15:
25:
60:
Dipeptide
Tetrapeptide
Oligopeptide
Polypeptide
Protéine
Composantes d’un lien peptidique
Fonction amide et fonction carboxyle de deux acides aminés
Quelle configuration est la plus commune entre Cis et trans
Trans a 99,9%
Mais 6% cis quand la proline et présente
Qu’est-ce que l’encombrement stérique et le diagramme de ramachandran
Diagramme qui illustre les possibilités de rotations cis et trans dans une molécule
Quel sont les 4 types de structures
Primaire
Secondaire
Tertiaire
Quartenaire
Qu’est-ce que la structure primaire acides aminés
Séquence lineaire qui contient à une extrémité(N-terminale) le Groupement amine et à l’autre extrémité (C-terminale(le Groupement carboxyle
Qu’est-ce que la structure secondaire des acides aminés
L’arrangement spatiale des acides aminés adjacents, intéraction des liens H entre les atomes du Groupement peptidique.
Structure réguliaires en hélices et en feuillets, structures non répétitives comme les coudes et les boucles
Qu’est-ce que les brins et feuillets beta
Brin contien entre 6 et 15 résidus
Les brins s’associent pour faire des feuillets contenant entre 2 et 22 brins, en moyenne 6
Parallèles et antiparallèlles